The Journal of Visualized Experiments (JoVE) is a peer reviewed, PubMed-indexed video journal. Our mission is to increase the productivity of scientific research.

Recommend to Librarian

Automatic Translation

This translation into Hebrew was automatically generated through Google Translate.
English Version | Other Languages

 JoVE General

השימוש מוטאנטים eceriferum ארבידופסיס לחקור לציפורן ביוסינתזה הצמח

1, 1, 1, 1, 1,2, 1

1Department of Botany, University of British Columbia - UBC, 2Department of Chemistry, University of British Columbia - UBC

You must be subscribed to JoVE to access this content.

This article is a part of   JoVE General. If you think this article would be useful for your research, please recommend JoVE to your institution's librarian.

Recommend JoVE to Your Librarian

Current Access Through Your IP Address

You do not have access to any JoVE content through your current IP address.

IP: 184.73.7.143, User IP: 184.73.7.143, User IP Hex: 3091793807

Current Access Through Your Registered Email Address

You aren't signed into JoVE. If your institution subscribes to JoVE, please or create an account with your institutional email address to access this content.

 

Video Article Chapters

Cite this Article: השימוש מוטאנטים eceriferum ארבידופסיס לחקור לציפורן ביוסינתזה הצמח

Samuels, L., DeBono, A., Lam, P., Wen, M., Jetter, R., Kunst, L. Use of Arabidopsis eceriferum Mutants to Explore Plant Cuticle Biosynthesis. J. Vis. Exp. (16), e709, doi:10.3791/709 (2008).

Abstract: השימוש מוטאנטים eceriferum ארבידופסיס לחקור לציפורן ביוסינתזה הצמח

לציפורן המפעל היא הכיסוי החיצוני דונגי על צמחים שיש לו תפקיד עיקרי חיסכון במים, אך היא גם מחסום חשוב נגד כניסתם של מיקרואורגניזמים פתוגניים. לציפורן מורכב מפולימר crosslinked קשוח בשם "cutin" לבין שכבת שעווה מגן חותמות משטח המפעל. שכבת השעווה של לציפורן ברור על צמחים רבים, המופיעים כסרט נוצץ על עלה הקיסוס או כיסוי חיצוני מאובקים על פני השטח של ענבים או עלה כרוב בזכות אור גבישים פיזור נוכח השעווה. מכיוון לציפורן הוא עיבוד חיוני של צמחים לסביבה יבשתי, הבנה גנים המעורבים ביצירת לציפורן צמח יש יישומים בחקלאות וייעור. כיום, אנו נציג את ניתוח לציפורן מוטנטים צמח שזוהה על ידי קדימה הפוכה גישות הגנטיקה.

Protocol: השימוש מוטאנטים eceriferum ארבידופסיס לחקור לציפורן ביוסינתזה הצמח

אני מסכים חזותית גישות גנטיות הפוך כדי לזהות מוטציות לציפורן.

מוטנטים לציפורן של thaliana צמח המודל ארבידופסיס נקראים "eceriferum" מוטנטים, שפירושו "שעווה לא הנושא". הם יכולים להיות מסכי חזותית, כלומר, רק מלהסתכל מוטציה, ניתן לראות כי גבעול תפרחת של wild-type צמחים הוא לבנבן בעוד מוטציות יש נובעת מבריק בצבע ירוק כהה. אחד מוטנטים כי היה מבודד זה סוג של מסך החזותי הזה, שנקרא eceriferum4 או cer4.

דרך נוספת של גילוי מוטציות לציפורן מעניין עם גישה גנטיקה הפוכה: גנים מועמדים בבחירת הריבית ולאחר מכן קווי צמח ללמוד עם הגן משתבש. מוטנטים אלו TDNA לשבש את הגן של עניין, במקרה זה, ציטוכרום P450 שאנו מכנים כיום MAH1.

תוצאות ה-PCR (כמו זה המוצג בסרטון) יכול לאשר כי ההכנסה TDNA הוא הגן של עניין. כאשר שני גנים ספציפיים primers משמשים כדי להגביר wild-type-DNA, אנחנו רואים מוצר, אבל אם TDNA קוטע אותו, כמו זו מוטציה, אין מוצר שם. לעומת זאת, באמצעות פריימרים ספציפיים עבור TDNA ואת הגן, המוצר נתפס רק מוטציה. אנחנו מחפשים קווים מוטנטים הומוזיגוטים, שם הן עותקים אימהי ואבהי של הגן הם שיבשו. אם עותק אחד של הגן מופרת על ידי TDNA והעותק השני עדיין wild-type, התוצאות PCR מעורבבים.

השנייה. באמצעות גז כרומטוגרפיה לקבוע את ההרכב הכימי של שעווה Cutlicle.

אנו מנתחים את ההרכב הכימי של השעווה באמצעות גז כרומטוגרפיה. ראשית, תרכובות השעווה מסיסים יוסרו מן משטח המפעל על ידי טבילה אותו כלורופורם.

ואז, דגימות מוזרקים בעמודה גז כרומטוגרפיה, איפה הם יהיו מחוממת נשלח על ידי זרם של גז. תרכובות שונות מקל פחות או יותר על הקירות של הטור, הפרדת תרכובות, והם יצאו אחד אחרי השני בקצה השני של העמודה. ואז, כמו תרכובות לעבור מעל גלאי יינון להבה, אנו רואים את פסגות. זמן השמירה של שיא כל מאפיין עבור תרכובות שונות, החל ספקטרומטריית מסה, זיהינו כל המרכיבים של שעווה ארבידופסיס. הפסגות הגדולות כיום הן של alkane C29, C29 ו קטון האלכוהול C29 משנית. פסגות קטין הם כהלים משני, חומצות שומן, אלדהידים ו אסטרים. השטח מתחת הפסגות, יחסית סטנדרטי, מספר לנו עד כמה מתחם זה הוא ההווה.

כאשר מסתכלים chromatograms גז אלה מוטציות לציפורן, ניתן להבחין כיצד cer4 חסרה את כהלים ראשוניים אסטרים, בעוד mah1 חסר כהלים משני קטונים. פנוטיפים אלה יכולים לספר לנו הרבה על הפונקציה של הגן של עניין במפעל. לדוגמה, לפני שידענו מה היה מוטציה בגן בתור cer4, פנוטיפ אמרו לנו שיש בעיה בענף אלכוהול העיקרי של מסלול biosynthetic. אחרי זהות מולקולרית של הגן, כי נחקרה במעבדה Kunst, התגלה כי הוא חלק ממשפחה של גנים reductases acyl שומן, אשר עולה בקנה אחד עם פנוטיפ זה כימיים.

ג. שימוש cryo-SEM כדי לקבוע את המבנה של גבישים לציפורן

כאשר אנו בוחנים את מוטנטים לציפורן ארבידופסיס, אנו יכולים לראות אם יש להם פנוטיפ בצבע ירוק כהה, מבריק או את המראה wild-type לבנבן על גזע. אנו משתמשים מיקרוסקופ אלקטרונים סורק להסתכל לציפורן על פני השטח של הצמח ולזהות את הבסיס של פנוטיפ החזותי. אנו משתמשים cryo-SEM, הקפאת צמחים הצגתם בטמפרטורת חנקן נוזלי כדי לשמור לציפורן שלם כי SEM דורש ואקום לפעול מבלי לשמור אותם קפואים, דגימות היו להתייבש קריסה.

הנה cer4 ו mah1 דגימות, יחד עם wild-type שולטת, הם גזור קפואים על בדל SEM. כאשר דגימות מועברים הבמה בקור של המיקרוסקופ, ניתן לראות את פני השטח של לציפורן wild-type גזע ארבידופסיס מכוסה גבישי. זהו אור כי הוא מפזר את אלה גבישים שנותן את גזע מראה לבנבן שלה. הנה גזע cer4; לזכור שזה נראה מבריק? היא חסרה את גבישי על פני השטח.

אנשים עשו ניסויים שבהם הם לבודד תרכובת דונג טהור מן לציפורן של צמח וכשהם recrystallize זה במעבדה, הגבישים בצורת צורות כמו אלה שנמצאו על הצמחים. ב ארבידופסיס, אנו מאמינים כי את הגבישים עשויים מתערובת של תרכובות המצב מסובך יותר. לדוגמה, ניתוח כימי מראה לנו כי cer4, רק מרכיב קטן של כהלים ראשוניים אסטרים נגזרת שלהם חסרים, אך הגבישים על cer4 גזע נעלמו. במקרה של mah1, ההשפעה של המוטציה של אנזים ציטוכרום P450 היא כי צמחים מוטנטים חוסר שני המרכיבים העיקריים של, כהלים שעווה קטונים משנית, אך הגבישים על mah1 צמחים בצורה נורמלית.

כדי ללמוד עוד על מוטנטים לציפורן ארבידופסיס בבקשה ללכת סקירה שנתית לביולוגיה הצמח .

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures: השימוש מוטאנטים eceriferum ארבידופסיס לחקור לציפורן ביוסינתזה הצמח

Ask the Author: השימוש מוטאנטים eceriferum ארבידופסיס לחקור לציפורן ביוסינתזה הצמח

8 Comments

I can't say enough how much I love what you have done. This work is extremely beneficial for generating interest in the research and the benefits of the research techniques involved. I hope this is shown in highschools and undergraduate programs all around the world (what a great teaching tool). Kudos to the foresight and the insight the authors have in taking the time to produce and publish this. Good luck in your future endeavours.

PS. I love Allan's hair and impeccable sense of direction.

1

Reply

Posted by: Stephen GreerJune 14, 2008, 1:32 PM

Nice work! This is the perfect introduction to cuticle research for people that are new to it and it's great to see all the different techniques being used. Looking good UBC cuticle people!

2

Reply

Posted by: TrevorSeptember 2, 2008, 4:44 PM

Good work! Thanks much. It was very helpful for someone like me who do not have much idea about plant and/or metabolites.

3

Reply

Posted by: Young-Jin LeeOctober 9, 2008, 10:37 AM

Thanks for this work!!! very interesting this approach to communicate scientific discoveries.

Martin Tiznado, Ph.D.

CIAD, A.C., Mexico.

4

Reply

Posted by: AnonymousDecember 14, 2008, 12:10 PM

I do not how to say what my feelings about this NICE IDEA and WORK!!!!!!

Martin Tiznado, Ph.D.

CIAD, A.C. Mexico.

5

Reply

Posted by: Martin TiznadoDecember 14, 2008, 12:14 PM

Thank you so much for letting me know this!I just know that the GC-MS is useful in identifying the chmeical composition of leaf wax !Wow,thanks again!~~~~~~~

Hope we can see more about your research !

6

Reply

Posted by: JingjingDecember 16, 2008, 12:50 AM

Thank you all for letting me know  this !Really aweful !

I just know that GC-MS is useful in identifying the chemical comoposition of leaf wax !Aha~~~ really good !

Best wishes !

Let us know more about your interesting research !:>

7

Reply

Posted by: JingjingDecember 16, 2008, 12:54 AM

How much is n-tetracosane added as internal standard?

8

Reply

Posted by: Xiang MingSeptember 13, 2010, 6:39 AM

Post a Question / Comment / Request

You must be signed in to post a comment. Please or create an account.

Waiting
simple hit counter