The Journal of Visualized Experiments (JoVE) is a peer reviewed, PubMed-indexed video journal. Our mission is to increase the productivity of scientific research.
This translation into Hebrew was automatically generated through Google Translate.
English Version | Other Languages
1Department of Botany, University of British Columbia - UBC, 2Department of Chemistry, University of British Columbia - UBC
This article is a part of JoVE General. If you think this article would be useful for your research, please recommend JoVE to your institution's librarian.
Recommend JoVE to Your LibrarianCurrent Access Through Your IP Address
Current Access Through Your Registered Email Address
Samuels, L., DeBono, A., Lam, P., Wen, M., Jetter, R., Kunst, L. Use of Arabidopsis eceriferum Mutants to Explore Plant Cuticle Biosynthesis. J. Vis. Exp. (16), e709, doi:10.3791/709 (2008).
אני מסכים חזותית גישות גנטיות הפוך כדי לזהות מוטציות לציפורן.
מוטנטים לציפורן של thaliana צמח המודל ארבידופסיס נקראים "eceriferum" מוטנטים, שפירושו "שעווה לא הנושא". הם יכולים להיות מסכי חזותית, כלומר, רק מלהסתכל מוטציה, ניתן לראות כי גבעול תפרחת של wild-type צמחים הוא לבנבן בעוד מוטציות יש נובעת מבריק בצבע ירוק כהה. אחד מוטנטים כי היה מבודד זה סוג של מסך החזותי הזה, שנקרא eceriferum4 או cer4.
דרך נוספת של גילוי מוטציות לציפורן מעניין עם גישה גנטיקה הפוכה: גנים מועמדים בבחירת הריבית ולאחר מכן קווי צמח ללמוד עם הגן משתבש. מוטנטים אלו TDNA לשבש את הגן של עניין, במקרה זה, ציטוכרום P450 שאנו מכנים כיום MAH1.
תוצאות ה-PCR (כמו זה המוצג בסרטון) יכול לאשר כי ההכנסה TDNA הוא הגן של עניין. כאשר שני גנים ספציפיים primers משמשים כדי להגביר wild-type-DNA, אנחנו רואים מוצר, אבל אם TDNA קוטע אותו, כמו זו מוטציה, אין מוצר שם. לעומת זאת, באמצעות פריימרים ספציפיים עבור TDNA ואת הגן, המוצר נתפס רק מוטציה. אנחנו מחפשים קווים מוטנטים הומוזיגוטים, שם הן עותקים אימהי ואבהי של הגן הם שיבשו. אם עותק אחד של הגן מופרת על ידי TDNA והעותק השני עדיין wild-type, התוצאות PCR מעורבבים.
השנייה. באמצעות גז כרומטוגרפיה לקבוע את ההרכב הכימי של שעווה Cutlicle.
אנו מנתחים את ההרכב הכימי של השעווה באמצעות גז כרומטוגרפיה. ראשית, תרכובות השעווה מסיסים יוסרו מן משטח המפעל על ידי טבילה אותו כלורופורם.
ואז, דגימות מוזרקים בעמודה גז כרומטוגרפיה, איפה הם יהיו מחוממת נשלח על ידי זרם של גז. תרכובות שונות מקל פחות או יותר על הקירות של הטור, הפרדת תרכובות, והם יצאו אחד אחרי השני בקצה השני של העמודה. ואז, כמו תרכובות לעבור מעל גלאי יינון להבה, אנו רואים את פסגות. זמן השמירה של שיא כל מאפיין עבור תרכובות שונות, החל ספקטרומטריית מסה, זיהינו כל המרכיבים של שעווה ארבידופסיס. הפסגות הגדולות כיום הן של alkane C29, C29 ו קטון האלכוהול C29 משנית. פסגות קטין הם כהלים משני, חומצות שומן, אלדהידים ו אסטרים. השטח מתחת הפסגות, יחסית סטנדרטי, מספר לנו עד כמה מתחם זה הוא ההווה.
כאשר מסתכלים chromatograms גז אלה מוטציות לציפורן, ניתן להבחין כיצד cer4 חסרה את כהלים ראשוניים אסטרים, בעוד mah1 חסר כהלים משני קטונים. פנוטיפים אלה יכולים לספר לנו הרבה על הפונקציה של הגן של עניין במפעל. לדוגמה, לפני שידענו מה היה מוטציה בגן בתור cer4, פנוטיפ אמרו לנו שיש בעיה בענף אלכוהול העיקרי של מסלול biosynthetic. אחרי זהות מולקולרית של הגן, כי נחקרה במעבדה Kunst, התגלה כי הוא חלק ממשפחה של גנים reductases acyl שומן, אשר עולה בקנה אחד עם פנוטיפ זה כימיים.
ג. שימוש cryo-SEM כדי לקבוע את המבנה של גבישים לציפורן
כאשר אנו בוחנים את מוטנטים לציפורן ארבידופסיס, אנו יכולים לראות אם יש להם פנוטיפ בצבע ירוק כהה, מבריק או את המראה wild-type לבנבן על גזע. אנו משתמשים מיקרוסקופ אלקטרונים סורק להסתכל לציפורן על פני השטח של הצמח ולזהות את הבסיס של פנוטיפ החזותי. אנו משתמשים cryo-SEM, הקפאת צמחים הצגתם בטמפרטורת חנקן נוזלי כדי לשמור לציפורן שלם כי SEM דורש ואקום לפעול מבלי לשמור אותם קפואים, דגימות היו להתייבש קריסה.
הנה cer4 ו mah1 דגימות, יחד עם wild-type שולטת, הם גזור קפואים על בדל SEM. כאשר דגימות מועברים הבמה בקור של המיקרוסקופ, ניתן לראות את פני השטח של לציפורן wild-type גזע ארבידופסיס מכוסה גבישי. זהו אור כי הוא מפזר את אלה גבישים שנותן את גזע מראה לבנבן שלה. הנה גזע cer4; לזכור שזה נראה מבריק? היא חסרה את גבישי על פני השטח.
אנשים עשו ניסויים שבהם הם לבודד תרכובת דונג טהור מן לציפורן של צמח וכשהם recrystallize זה במעבדה, הגבישים בצורת צורות כמו אלה שנמצאו על הצמחים. ב ארבידופסיס, אנו מאמינים כי את הגבישים עשויים מתערובת של תרכובות המצב מסובך יותר. לדוגמה, ניתוח כימי מראה לנו כי cer4, רק מרכיב קטן של כהלים ראשוניים אסטרים נגזרת שלהם חסרים, אך הגבישים על cer4 גזע נעלמו. במקרה של mah1, ההשפעה של המוטציה של אנזים ציטוכרום P450 היא כי צמחים מוטנטים חוסר שני המרכיבים העיקריים של, כהלים שעווה קטונים משנית, אך הגבישים על mah1 צמחים בצורה נורמלית.
כדי ללמוד עוד על מוטנטים לציפורן ארבידופסיס בבקשה ללכת סקירה שנתית לביולוגיה הצמח .
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
I can't say enough how much I love what you have done. This work is extremely beneficial for generating interest in the research and the benefits of the research techniques involved. I hope this is shown in highschools and undergraduate programs all around the world (what a great teaching tool). Kudos to the foresight and the insight the authors have in taking the time to produce and publish this. Good luck in your future endeavours.
PS. I love Allan's hair and impeccable sense of direction.
1
ReplyPosted by: Stephen GreerJune 14, 2008, 1:32 PM