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1Department of Evolutionary Biology of Invertebrates, University of Tubingen, 2European Synchrotron Radiation Facility
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Heethoff, M., Helfen, L., Cloetens, P. Non-invasive 3D-Visualization with Sub-micron Resolution Using Synchrotron-X-ray-tomography. J. Vis. Exp. (15), e737, doi:10.3791/737 (2008).
리틀은 1mm 아래의 신체 크기와 많은 마이크로 arthropods의 내부 조직에 대한 알려져있다. 에 대한 이유는 작은 크기와 어려운 클래식 조직학의 프로토콜을 사용할 수 있습니다 하드 표피입니다. 또한, histological sectioning는 샘플을 파괴하기 때문에 독특한 소재에 대해 사용할 수 없습니다. 따라서 비파괴 방법 sectioning의 필요없이 작은 샘플 안에서 볼 수 있습니다하는 것이 바람직하다.
우리는 비 invasively 0.7μm의 픽셀 해상도와 3D 단층 데이터 세트를 생성 그르노블 (프랑스)의 유럽 싱크로 트론 방사선 시설 (ESRF)에 싱크로 트론 X - 선 tomography를 사용했습니다. 볼륨 렌더링 소프트웨어를 사용, 이것은 우리 histological sectioning 제작한 공예품없이 자연 상태에서 내부 조직을 재구성 할 수 있습니다. 이 날짜는 숨겨진 신체 부위의 구조를 이해하고 예제를 통해 전체 기관의 시스템이나 조직에 따라 정량 형태, 랜드마크, 또는 애니메이션 영화의 시각화를 위해 사용할 수 있습니다.
이 연구에 사용된 동물
parthenogenetic oribatid 마이트 Archegozetes longisetosus (Acari, Oribatida)의 표본은 우리의 연구실 문화에서 찍은. 문화가 20-23에서 지속적인 어둠 속에서, 파리 / 플라스틱 항아리에 숯 믹스 (9시 1분)의 석고의 성장 ° C 공기 습도 약 90 %를.
샘플 준비
싱크로 트론 X - 선 tomography
X - 선 tomography는 beamline ID19 (ESRF, 그르노블, 프랑스, 실험 SC - 2127)에서 수행되었다.
샘플과 검출기 사이에 일정한 거리를 사용하면 (샘플은 검출기의 바로 앞에 위치 흡수 이미징에 충분한 대비를 생성 낮은 X - 선 감쇠 계수 (Cloetens, 외. 1996)과 재료의 차등 이미징을 가능하게 ). 대부분의 생물 학적 문제는 낮은 흡수 및 / 또는 원자 번호에만 작은 차이 (베츠, 외. 2007)과 재료의 구성 단계 개체입니다. 그러나, 위상 강화 tomography은 단일 X - 선 빔 높은 공간적 일관성이 필요합니다. 따라서, 싱크로 트론 방사는 더 나은 측정 이러한 종류의 데스크탑 스캐너보다 적합합니다.
데이터 분석
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이 프레 젠 테이션에서, 우리는 chelicerate 마이크로 arthropod의 내부 해부의 3D - 시각화에 초점을 맞추었습니다. 싱크로 트론 X - 선 측정은 샘플의 크기에 따라, 0.3μm로의 픽셀 해상도를 허용합니다. 여기, 우리는 픽셀 해상도 0.7μm 데이터를 표시합니다. 일반적으로, 싱크로 트론 X - 선 tomography 낮은 X - 선 감쇠와 함께 작은 생물 학적 물질 (또는 조직)를 분석하는 데 유용할 수 있습니다. 픽셀 해상도는 거의 전통적인 조명 현미경의 도달합니다. 이 기술은 내부 조직이 관심하는과 sectioning에 의해 파괴되지해야하는 자료의 종류에 적용할 수 있습니다. Histological sectioning 그러나, 조직은 X - 선 tomography 가능 아니지만 differentially 스테인드 수있다는 장점이 있습니다. 하지만 여기, 다른 회색 값이 서로 다른 X - 선 감쇠와 조직에 해당하며, 회색 값 분포는 양적 위상 tomography 사용하여 확장 가능한 (holotomography;. Cloetens 외, 1999; Heethoff & Cloetens, 2008). 싱크로 트론 X - 선 tomography의 기술로 인해 다음과 같은 이유로 특별한 가치가있다 :
작은 샘플이나 (예 : 호박 또는 형식 - 표본의 화석) 파괴해서는 안 샘플 자연 상태에서 내부 구조 분석을 때마다 우리는이 기술을 고려하는 것이 좋습니다. 물론,이 기술은 생물 학적 물질에 국한되지 않고 있지만, 여기서는 가장 큰 이점의 낮은 X - 선 감쇠를 X - 레이와 자료를 분석의 가능성 때문입니다.
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우리는 ESRF에서 자신의 도움을 파보 누르 버그만, 마이클 라우먼, 그리고 세바스찬 Schmelzle 감사드립니다. 이 작품은 빔 시간의 배분을 통해 유럽 싱크로 트론 방사선 시설 사업 SC - 2127에 의해 지원되었다.
1. Betz, O., U. Wegst, D. Weide, M. Heethoff, L. Helfen, W. -K. Lee & Cloetens, P. Imaging applications of synchrotron X-ray phase-contrast microtomography in biological morphology and biomaterial science. I. General aspects of the technique and its advantages in the analysis of millimetre-sized arthropod structure. J. Microscopy 22, 51-71 (2007).
2. Cloetens, P., R. Barrett, J. Baruchel, J. P. Guigay & M. Schlenker. Phase objects in synchrotron radiation hard X-ray imaging. J. Phys. D: Appl. Phys. 29, 133-146 (1996).
3. Cloetens, P., Pateyron-Salome, M., Buffiere, J.Y., Peix, G., Baruchel, J., Peyrin, V., Schlenker, M. Observation in microstructure and damage in materials by phase sensitive radiography and tomography. J. Apll. Phys. 81, 5878-5886 (1997).
4. Clotens, P., Ludwig, W., Baruchel, J., van Dyck, D., van Landyut, J., Guigay, J.P., Schlenker, M. Holotomography: quantitative phase tomography with micrometer resolution using hard synchrotron radiation X-rays. Appl. Phys. Lett. 75, 2912-2914 (1999).
5. Heethoff, M., Cloetens, P. A Comparison of aynchrotron X-ray phase contrast tomography and holotomography for non-invasive investigations of the internal anatomy of mites. Soil Organisms, in press (2008).
It is fantastic! Congratulations. pi
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ReplyPosted by: prazsiAugust 6, 2008, 2:17 PM