The Journal of Visualized Experiments (JoVE) is a peer reviewed, PubMed-indexed video journal. Our mission is to increase the productivity of scientific research.
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Department of Biological Sciences, University of Alabama
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Berkowitz, L. A., Hamamichi, S., Knight, A. L., Harrington, A. J., Caldwell, G. A., Caldwell, K. A. Application of a C. elegans Dopamine Neuron Degeneration Assay for the Validation of Potential Parkinson's Disease Genes. J. Vis. Exp. (17), e835, doi:10.3791/835 (2008).
Miglioramenti per la diagnosi e il trattamento della malattia di Parkinson (PD) dipendono le conoscenze sui fattori di suscettibilità che rendono le popolazioni a rischio. Nel processo di tentare di identificare nuovi fattori genetici associati a PD, gli scienziati hanno generato molte liste di geni candidati, polimorfismi, e le proteine che rappresentano importanti passi avanti, ma questi cavi rimangono meccanicisticamente indefinito. Il nostro lavoro si rivolge in modo significativo restringimento verso tali elenchi, sfruttando i vantaggi di un sistema semplice modello animale. Mentre gli esseri umani hanno miliardi di neuroni, il microscopico verme Caenorhabditis elegans ha precisamente 302, di cui solo otto producono dopamina (DA) in hemaphrodites. Espressione di un gene umano che codifica per il PD-proteina associata, l'alfa-sinucleina, in C. elegans DA risultati neuroni nel dosaggio e dipendente dall'età neurodegenerazione.
Worm che esprimono umano alfa-sinucleina nei neuroni DA vengono isogeniche ed esprimono sia la GFP e umano alfa-sinucleina sotto il promotore trasportatore DA (Pdat-1). La presenza di GFP serve come marcatore per seguire facilmente visualizzati neurodegenerazione DA in questi animali. Inizialmente abbiamo dimostrato che l'alfa-sinucleina indotta neurodegenerazione DA potrebbe essere salvato in questi animali da torsinA, una proteina con attività di chaperone molecolare 1. Inoltre, candidato PD-correlati geni identificati nel nostro laboratorio attraverso grandi sforzi di screening RNAi con un alfa-sinucleina saggio misfolding sono stati poi sovra-espresso in C. elegans DA neuroni. Abbiamo determinato che cinque dei sette geni testati rappresentato modulatori candidato significative del PD in quanto salvato alfa-sinucleina indotta DA neurodegenerazione 2. Inoltre, il Laboratorio Lindquist (questo numero di Giove) si è esibito schermi lievito per cui alfa-sinucleina-dipendente tossicità è usato come una lettura di geni che possono aumentare o sopprimere citotossicità. Abbiamo poi esaminato i geni di lievito candidato nel nostro C. elegans alfa-sinucleina indotta saggio neurodegenerazione e convalidato correttamente molti di questi obiettivi 3, 4.
La nostra metodologia prevede la generazione di C. elegans DA neurone specifico vettore di espressione tramite la clonazione di ricombinazione cDNA gene candidato sotto il controllo del Pdat-1 promotore. Questi plasmidi sono poi microiniettati nel wild-type (N2) vermi, insieme a un marcatore per la trasformazione di successo. Più linee transgeniche stabili produrre la proteina nei neuroni DA candidato si ottengono e poi attraversato in modo indipendente l'alfa-sinucleina ceppo degenerative e valutati per la neurodegenerazione, sia l'animale e il livello di singolo neurone, nel corso del tempo.
A. Costruzione Espressione plasmidi
Due plasmidi sono obbligatori: uno per l'espressione tessuto-specifica del gene di interesse e un secondo come marcatore trasformazione selezionabili (anche se il marcatore plasmide è solitamente disponibile all'interno della comunità di ricerca).
Sperimentale plasmidi
Marker selezionabile plasmidi
Un indicatore transgenico plasmide è costituito da un vettore con un promotore di guida l'espressione di una proteina fluorescente in un tessuto ovvio. In questa particolare procedura, l'unc-54 promotore unità espressione ciliegia proteina nel muscolo del corpo parete (Punc-54:: ciliegio).
B. Generazione di transgenici C. elegans tramite microiniezione
Vedi relativi JOVE articolo: http://www.jove.com/index/details.stp?ID=833
C. per l'analisi genetica attraversa neurodegenerazione DA
D. dopaminergici Neuron Analisi
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L'età-dipendente la perdita dei neuroni dopaminergici è una caratteristica clinica del morbo di Parkinson ed è stata associata con l'accumulo o misfolding di una proteina chiamata alfa-sinucleina. Qui mostriamo come etichettare, attraverso un transgene fluorescente, i neuroni dopaminergici di C. elegans e imitare la neurodegenerazione nella malattia di Parkinson da coexpressing umano alfa-sinucleina in queste cellule.
Questo video illustra la metodologia per la crescita, incrocio genetico, montaggio, e il punteggio di nematodi transgenici per valutare i fattori genetici che o migliorare neurodegenerazione o fornire neuroprotezione nel corso dell'invecchiamento. Si ha cura di utilizzo di indicatori per la manutenzione transgene opportunamente messa in scena di sesso maschile e ermafroditi per assicurare il successo incroci genetici, e la coerenza nel notare la perdita dei neuroni o protezione. In questo modo, C. elegans facilita la rapida valutazione di fattori genetici e che possono contribuire alla neurodegenerazione o rappresentare bersagli terapeutici per migliorare la sopravvivenza dei neuroni.
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Vogliamo riconoscere lo spirito di cooperazione di tutti i membri Lab Caldwell. Disturbi del movimento di ricerca in laboratorio è stato sostenuto dalla Bachmann-Strauss Fondazione Parkinson e distonia, Regno Parkinson Foundation, American Parkinson Disease Association, il morbo di Parkinson Associazione dell'Alabama, Michael J. Fox Foundation for Parkinson Research, e una ricerca di laurea
| Name | Type | Company | Catalog Number | Comments |
| Agarose | Ultrapure | Invitrogen | 15510-027 | |
| Coverglass 20x30 mm | Fisher Scientific | 12-548-5A | ||
| Microscope Slides | Plain, 3x1" | Fisher Scientific | 12-549 | |
| Dissecting with Fluorescence | Microscope | Nikon Instruments | SMZ800 | |
| Dissecting | Microscope | Nikon Instruments | SMZ645 | |
| Epifluorescent | Microscope | Nikon Instruments | Model E-800 | |
| Filter Cube, GFP HYQ | Endow Bandpass | Chroma Technology Corp. |
1. Cao, S., Gelwix, C.C., Caldwell, K.A., Caldwell, G.A. Torsin-mediated neuroprotection from cellular stresses to dopaminergic neurons of C. elegans. J Neurosci 25, 3801-3812 (2005).
2. Hamamichi, S., Rivas, R.N., Knight, A.L., Cao, S., Caldwell, K.A. and Caldwell, G.A. Hypothesis-based RNAi screening identifies neuroprotective genes in a Parkinson’s disease model. PNAS 105, 728-733 (2008).
3. Cooper, A.A., Gitler, A.D., Cashikar, A., Haynes, C.M., Hill, K.J., Bhullar, B., Liu, K., Xu, K., Strathearn, K.E., Liu, F., Cao, S., Caldwell, K.A., Caldwell, G.A., Marsischky, G., Kolodner, R.D., Labaer, J., Rochet, J.C., Bonini, N.M., and Lindquist, S. alpha-synuclein blocks ER-golgi traffic and Rab1 rescues neuron loss in Parkinson’s models. Science 313, 324-328 (2006).
4. Gitler, A.D., Bevis, B.J., Shorter, J., Strathearn, K.E., Hamamichi, S., Su, L.J., Caldwell, K.A., Caldwell, G.A., Rochet, J-C., McCaffery, J.M., Barlowe, C., and Lindquist, S. The Parkinson’s disease protein alpha-synuclein disrupts cellular Rab homeostasis. PNAS 105, 145-150 (2008).
5. Caldwell, G. Integrated Genomics: A Discovery-Based Laboratory Course. : John Wiley and Sons. West Sussex, England, (2006).
6. Brenner, S. The genetics of Caenorhabditis elegans. Genetics 77, 71-94 (1974).
7. Gandhi, S., Santelli, J., Mitchell, J.D.H., Stiles, J.W., and Sanadi, D.R. A simple method for maintaining large, aging populations of Caenorhabditis elegans. Mechanisms of Ageing and Development 12, 137-150 (1980).
Thank you for your research. My husband has Parkinson's. It's so good to know that young people are doing research which may ultimately help stem the onslaught of this disease, not in our lifetime, but perhaps in the near future. Where does your study go from here? Good luck with your work. (reader from Vancouver, Canada)
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ReplyPosted by: JanetOctober 10, 2008, 2:08 PM