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Per studiare il coordinamento delle diverse vie di sintesi dei lipidi durante la biogenesi della membrana è utile lavorare con un sistema sperimentale in cui la biogenesi della membrana avviene rapidamente e in modo inducibile. Abbiamo scoperto che la fagocitosi di sfere di lattice è pratico per questi scopi, come le cellule in rapida sintesi di lipidi di membrana per riempire piscine membrana perso come materiale per il confezionamento durante fagocitazione delle particelle. Qui si descrivono le modalità per lo studio delle variazioni di fagocitosi indotta espressione del gene luciferasi con un approccio basato giornalista gene utilizzando il Dual-Glo sistema luciferasi di analisi da Promega.
Colture delle risorse umane di rene embrionale 293 (HEK293), le cellule sono coltivate in 10 cm di piatti della cultura in 'medium A', composto da Media Dulbecco Modified Eagle (DMEM) integrato con un cocktail di antibiotici (100 unità per ml di penicillina e 100 mg per ml di solfato di streptomicina) e il 10% di siero fetale bovino (FBS).
Per impostare le celle di un esperimento, il mezzo è succhiare, e le cellule vengono lavate due volte con 5 ml di tampone fosfato (PBS) soluzione.
La PBS è poi rimosso e sostituito con 0,6 ml di una soluzione contenente 0,25% tripsina.
Il piatto viene incubata a 37 ˚ C per circa 2 min finché le cellule hanno cominciato a staccare.
5,5 ml di terreno A è aggiunto per neutralizzare la tripsina e le celle sono contate con un emocitometro.
Le cellule sono diluite a 320.000 cellule per ml e dispensati a 0,1 ml per bene in un polilisina rivestite da 96 pozzetti piastra di coltura.
Porre la capsula in un tessuto culturale incubatore a 37 ˚ C con un'atmosfera contenente 8,8% di CO2 e far crescere per 24 ore.
Trasfezioni
Nella preparazione per trasfezioni, dovrebbe essere considerato quanti replica devono essere eseguite per condizioni sperimentali e quali quantità di plasmide saranno transfettate. Noi di routine eseguire tutte le condizioni in triplice copia e trasfezione un totale di 50 a 100 ng di DNA plasmidico per bene. Mescola plasmide deve includere almeno un giornalista che esprime costruire lucciola luciferasi e un plasmide luciferasi Renilla controllo esprimendo da un promotore costitutivo.
Le soluzioni plasmide vengono aggiunti nei tubi da 1,5 ml microcentrifuga ed integrata con 10 microlitri per ogni campione di siero e senza antibiotici senza DMEM. Per esempio, se 20 pozzi sono tutti di essere transfettate con 50 mg di DNA, aggiungere 200 ul DMEM a 1 mg di DNA.
Per il DMEM / DNA soluzione aggiungere 3 ml 'TransIT 293 reagente' (Mirus) per DNA mcg. Mescolare pipettando up & down e lasciare che i campioni a temperatura ambiente per almeno 10 min.
Durante questo periodo, rimuovere il supporto dal-96 e piastra di coltura e sostituire con 90 ml di A. mezzo fresco
Per ogni pozzetto aggiungere 10 microlitri della DMEM / DNA / transito 293 miscela.
Porre la capsula in un tessuto culturale incubatore a 37 ˚ C con un'atmosfera contenente 8,8% di CO2 e far crescere per 24 ore.
Fagocitosi
Preparare sospensioni contenenti mezzo B (una miscela 1:1 di DMEM e Ham F12 medium più antibiotici e il 10% FBS) più 0,75 micron sfere di lattice a zero a 1 mg per ml.
Rimuovere il supporto dal-96 pozzetti cultura e sostituirlo con 0,1 ml di sospensioni tallone in media B.
Spin la piastra per 2 min a 1000 x g.
Le cellule sono poi coltivate a 37 ˚ C per 6 a 16 ore. A seconda delle condizioni e il promotore usato per guidare luciferasi, un aumento dell'espressione del gene reporter può essere rilevato dopo 1 a 3 ore.
In alcuni casi può essere necessario per incubare le cellule con perline da 30 a 60 minuti, poi fare 2 lavaggi con PBS per rimuovere perle prive di personalità giuridica, e aggiungere mezzi freschi prima incubando le cellule per ulteriori periodi di tempo.
Dual-GloTM saggio luciferasi
Nota: il nostro protocollo per l'utilizzo di questo kit si differenzia per alcuni aspetti da quello consigliato dal produttore. E 'stato modificato per ridurre la quantità di reagenti necessari per campione.
Preparare una soluzione di 1 M DTT, dividere in più piccole aliquote e conservare a -20 ˚ C.
Preparare un buffer di lisi contenente 20 mM Tris-HCl (pH 7,8), il 10% (v / v) glicerolo, e 0,5% (v / v) Triton X-100. Prima dell'uso, aliquota una quantità necessaria per l'esperimento e aggiungere 1 ml per ml di 1 M DTT, più cocktail inibitore della proteasi per una concentrazione finale di 0,5 a 1x. Non riutilizzare la soluzione rimanente DTT.
Quando si utilizza il Dual-GloTM kit per la prima volta, preparare l'(lucciola) Reagente luciferasi, trasferendo l'intero contenuto di un flacone di doppio buffer GloTM luciferasi (fornito con il kit) per una bottiglia di Dual-GloTM substrato luciferasi (a condizione con il kit). Dividere il reagente utilizzato luciferasi in 10 ml aliquote e conservare a -20 ˚ C.
Rimuovere la piastra a 96 pozzetti dal tessuto cultura incubatore e posizionarlo sul ghiaccio. Rimuovere il supporto per aspirazione, aggiungere 40 microlitri per pozzetto di tampone di lisi, e poi lasciare la piastra in ghiaccio per 30 min.
In un bianco opaco a 96 pozzetti (OptiplateTM-96, Perkin Elmer numero di catalogo 6005290) aliquota 15 microlitri per pozzetto di reagente luciferasi, e poi aggiungere 15 ml di lisato cellulare.
Incubare la piastra a temperatura ambiente per 10 minuti e quindi leggere la luminescenza in un lettore di micropiastre.
Immediatamente prima dell'uso, preparare una quantità appropriata di Renilla soluzione di substrato della luciferasi con l'aggiunta di 1 parte Dual-GloTM Stop & Glo ®; Reagente (fornito con il kit) per 100 parti Dual-GloTM Stop & Glo ® Buffer (fornito con il kit).
Per ogni pozzetto aggiungere 15 microlitri per pozzetto della soluzione di substrato Renilla luciferasi, incubare a temperatura ambiente per 10 minuti e quindi misurare la luminescenza di nuovo.
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I am currenlty using the same reporter assay kit to test the effect of promoter polymorphisms on luciferase expression. The polymorphims under investigation were assessed statistaclly in a previous experiment and found to significantly associated with variation in muscularity. Due to their location, I thought a reporter assay was the most suitable method for providing some biological evidence for the statistacal assaociation.
However, I have run the assays a number of times and my results are the opposite to what I expected, based on the statistical analysis. Upon closer inspection, I observed my plasmid preps (4 reporter constructs) varied greatly in the amount of supercoiled plasmid present. From my luciferase results there is a trend where i observe greater expression in the preps with more supercoiled DNA compared to preps with a greater quantity of the relaxed plasmid form.
I am currently repeating the assay with linear plasmid to standardise plasmid form for each construct. I will have these results soon, but not sure how much the linear DNA will compromise transient transfection. An alternative would be to repeat my plasmid preps and ensure cultures have not reached stationary phase to ensure a greater proportion of supercoiled plasmid (because gyrase is not/less active in stationary phase culture). My concern with this apporach is that it would be difficult to quantify the amount of supercoiled plasmid in each prep and slight differences between each reporter construct could have a large impact on luciferase results.
For your reporter gene application did you find it necessary to standardise the plasmid form for each reporter construct (control plasmid not essential since this is consistent in each well)? How did you standardise?
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Dear Brendon,
A representative from the Journal of Visualized Experiments requested that Promega Technical Services respond to your question.I am a Technical Service Scientist at Promega and would be happy to answer your question about dual-reporter assays.
For transient reporter gene assays, most researchers use supercoiled plasmid DNA as there is no apparent advantage to using linearized plasmid.A more important consideration for optimal results in a transient reporter assay is the quality of the plasmid DNA.The purified plasmid preparation should be free of protein, RNA and chemical contamination (as indicated by an A260/A280 ratio of 1.8-1.9).It should also contain a relatively low percentage of nicked and/or damaged DNA.If the quality of the firefly plasmid preparation is suspect, it may be worthwhile to prepare new plasmid stocks and repeat your experiments with the new preparations.
There may be other variables that should be considered when performing and analyzing dual-luciferase assays.Without more specific information about the vectors being used and your experimental design, it is difficult to identify other potential issues.If you would like more assistance or have any other questions, please feel free to contact us directly.
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Hi Dr Zhang,
I am currenlty using the same reporter assay kit to test the effect of promoter polymorphisms on luciferase expression. The polymorphims under investigation were assessed statistaclly in a previous experiment and found to significantly associated with variation in muscularity. Due to their location, I thought a reporter assay was the most suitable method for providing some biological evidence for the statistacal assaociation.
However, I have run the assays a number of times and my results are the opposite to what I expected, based on the statistical analysis. Upon closer inspection, I observed my plasmid preps (4 reporter constructs) varied greatly in the amount of supercoiled plasmid present. From my luciferase results there is a trend where i observe greater expression in the preps with more supercoiled DNA compared to preps with a greater quantity of the relaxed plasmid form.
I am currently repeating the assay with linear plasmid to standardise plasmid form for each construct. I will have these results soon, but not sure how much the linear DNA will compromise transient transfection. An alternative would be to repeat my plasmid preps and ensure cultures have not reached stationary phase to ensure a greater proportion of supercoiled plasmid (because gyrase is not/less active in stationary phase culture). My concern with this apporach is that it would be difficult to quantify the amount of supercoiled plasmid in each prep and slight differences between each reporter construct could have a large impact on luciferase results.
For your reporter gene application did you find it necessary to standardise the plasmid form for each reporter construct (control plasmid not essential since this is consistent in each well)? How did you standardise?
Kind regards,
Brendon
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ReplyPosted by: Brendon O'RourkeSeptember 10, 2008, 10:54 PM