نفذت جميع الخطوات جمع الأنسجة البشرية تحت البروتوكولات المعتمدة مؤسسياً.
1-ثيوليشن حمض الهيالورونيك
ملاحظة: يتم ذكر نسب المولى فيما يتعلق بالعدد الإجمالي لمجموعات كاربوكسيلات ما لم يحدد خلاف ذلك.
- حل 500 ملغ من الصوديوم hyaluronate (هكتار، كاتشين 500-750) في 10 ملغ/مل في الماء المقطر، منزوع (DiH2س) في اﻷوتوكﻻف تعقيمها، 250 مل قارورة Erlenmeyer. إثارة الحل (~ 200 لفة في الدقيقة) في درجة حرارة الغرفة لمدة 2 ساعة بالكامل حل ها. استخدام شريط إثارة ولوحة إثارة المغناطيسية للحفاظ على رد فعل التحريك أثناء إجراء ثيوليشن.
- استخدام حمض الهيدروكلوريك 0.1 M (HCl)، ضبط الأس الهيدروجيني حل 5.5 هكتار. تزن بملغ 69.6 (0.25 × نسبة المولى) 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl) كاربودييميدي (EDC).
ملاحظة: على الرغم من أن تنمية الصادرات أونديسولفيد يمكن أن تضاف مباشرة إلى الحل هكتار، أنه من الأسهل عادة بحل المؤسسة أولاً في 1 مل من DiH2س وثم إضافة الحل تنمية الصادرات بسرعة إلى حل ها. قبل انحلال في 1 مل DiH2س يمكن أيضا أن يتم مع N-هيدروكسيسوكسينيميدي (NHS) وديهيدروتشولوريدي سيستاميني قبل إضافة إلى رد الفعل في خطوات 1.3 و 1.4.
- إضافة 17.9 مغ (0.125 × نسبة المولى) لدائرة الصحة الوطنية لرد الفعل. ضبط الأس الهيدروجيني للحل رد فعل إلى 5.5 باستخدام 0.1 M HCl واحتضان التفاعل في درجة حرارة الغرفة لمدة 45 دقيقة.
- إضافة مغ 70.0 (0.25 × نسبة المولى) من هيدروكلوريد سيستاميني إلى حل رد فعل. استخدام هيدروكسيد الصوديوم 0.1 M (هيدروكسيد الصوديوم) لضبط الأس الهيدروجيني إلى 6.25. تبني رد الفعل في درجة حرارة الغرفة بين عشية وضحاها مع التحريك.
- اليوم التالي، استخدم 1 م هيدروكسيد الصوديوم لضبط درجة حموضة حل رد فعل حوالي 8. إضافة مغ 192 (4 × نسبة المولى) من ديثيوثريتول (DTT) إلى رد فعل. ضبط درجة الحموضة إلى 8 بعد إضافة القيمة وترك إثارة لمدة 1-2 ساعة في درجة حرارة الغرفة.
- استخدم 1 M HCl لضبط الأس الهيدروجيني إلى 4. نقل الخليط رد كامل في الغشاء غارقة قبل الغسيل الكلوي (الوزن الجزيئي الوقف حول كاتشين 13) ودياليزي ضد DiH2س قبل تعديلها لدرجة الحموضة 4.
ملاحظة: يجب أن يكون حجم DiH2س للغسيل الكلوي على الأقل 40 مرة حجم الحل ها ريكتيد (مثلاً، عينة 50 مل في 2 لتر من DiH2س، الأس الهيدروجيني 4).
- استبدال الحل الغسيل الكلوي (DiH2س، ودرجة الحموضة 4) مرتين يوميا لمدة 3 أيام في درجة حرارة الغرفة.
- تصفية حل دياليزيد عن طريق غشاء 0.22 ميكرومتر، فراغ يحركها عامل التصفية. فلاش تجميد حل ثيولاتيد هكتار في نيتروجين سائل. استخدام ليوفيليزير لتجميد العينات الجافة أكثر من 2 يوما. ثيولاتيد ها في شكل الجافة يمكن تخزينها في مجفف فاكوومسيليد في-20 درجة مئوية لمدة 6 أشهر على الأقل.
- لتحديد درجة ثيوليشن، استخدم الاختبار ل Ellman و/أو بروتون الرنين المغناطيسي الطيفي30،31.
2-إعداد مواد كروسلينكينج
- حل ثيولاتيد هكتار في التركيز المطلوب (في هذا المثال، 13.3 مغ/مل) في حبيس مخزنة المالحة (20 مم حبيس هانك في المحلول الملحي ملح متوازن (حبس) المخزن المؤقت، وتعديلها لتندرج ضمن الرقم الهيدروجيني من 8-9) في قنينة العنبر لتقليل التعرض للضوء المحيط. يبقى الحل مع التحريك باستمرار.
ملاحظة: قد تحدث تشكيل ثنائي كبريتيد السندات بين ثيولس مترافق لهكتار إذا كان pH فوق 8، الحل تركيز مرتفع للغاية، أو الحل هو ترك إثارة لفترة طويلة جداً قبل جيليشن. لتجنب هذه المشكلة، استخدم أدناه 15 ملغ/مل ثيولاتيد هكتار ويحل ثيولاتيد هكتار خلال ساعتين من تشكيل الهلاميات المائية.
- حل 4-الذراع-شماعة-ماليميدي (شماعة-القانون النموذجي للتحكيم، كاتشين 20) و 4-الذراع-شماعة-ثيول (شماعة-ثيول, كاتشين 20) في الفوسفات مخزنة المالحة (PBS)، الرقم الهيدروجيني 7.4، لإعداد 50 ملغم/مل شماعة-القانون النموذجي للتحكيم وشماعة-ثيول حلول الأسهم.
ملاحظة: يستغرق على الأقل 1 ساعة بالكامل حل الكواشف الوتد.
- في حالة إضافة الببتيدات المشتقة من إدارة المحتوى في المؤسسة، حل الببتيدات المحتوية على سيستين في برنامج تلفزيوني أن يعد حلاً أسهم.
ملاحظة: استخدم تركيز مخزون من 2-4 مم.
- قوالب مطاط السيليكون نقع في الإيثانول عن 20 دقيقة على الأقل لتنظيف لهم، ومن ثم اﻷوتوكﻻف لهم للتعقيم.
3-Hydrogel Crosslinking وتغليف خلية
ملاحظة: على سبيل مثال هنا، هو التغليف أربع فرد والهلاميات المائية ميليلتر 80 مع 0.5% (w/v) هكتار ومعامل ضاغطة للجيش الشعبي الكوري 1 وصف3. يرجى الاطلاع على الجدول 1 للمثال الوصفات التي تسفر عن الهلاميات المائية مع خصائص مختلفة: الهلاميات المائية هما إدراج الببتيد إنتغرين-ربط إدارات والهلاميات المائية هما إدماج قبعات سيستئين كعنصر تحكم سلبية للنشاط الببتيد. بذر تركيز الخلايا GBM المستمدة من المريض 500,000 خلايا/مل.
- تمييع الحل الأسهم شماعة-القانون النموذجي للتحكيم (50 ملغ/مل، من الخطوة 2، 2) إلى 12.5 ملغ/مل بإضافة 40 ميليلتر من الحل المخزون إلى 120 ميليلتر PBS. تقسيم الحل المخفف إلى 1.5 مل ميكروسينتريفوجي أنبوبين حيث يحتوي كل أنبوب ميليلتر 80.
- إضافة 16 ميليلتر للأوراق المالية حل إدارات (2.8 مم، من الخطوة 2، 3) بأنبوب واحد وميليلتر 16 حل سيستين الأسهم (2.8 مم، من الخطوة 2، 3) للأنبوب الثاني. دوامة المزيج. وضع الحلول شماعة-القانون النموذجي للتحكيم-إدارات أو شماعة-القانون النموذجي للتحكيم-CYS على الجليد حتى استخدامها في الخطوة 3، 9.
ملاحظة: الإجراء كما هو موضح هنا غلة الهلاميات المائية مع ميكرومتر ~ 140 من الببتيد. وهذا يعادل تقريبا 1 من كل الأسلحة شماعة المتاحة 8 محتلا مع ببتيد. وهذا يمكن أن تختلف عن طريق تغيير نسبة الببتيدات سيستين منتهية إلى المجموعات المتاحة ماليميدي المولى. وبصفة عامة، يمكن تحقيق أقصى تركيز ميكرومتر 280 من الببتيد بينما لا يزال يترك أعدادا كافية من ماليميدي المجموعات المتوفرة ل crosslinking المائية.
- تمييع الحل ثيول شماعة الأسهم (50 ملغ/مل، من الخطوة 2، 2) إلى 5 ملغ/مل بخلط 4 ميليلتر من 50 ملغم/مل الحل الأسهم مع 36 ميليلتر من برنامج تلفزيوني. إضافة 120 ميليلتر من المذاب، ثيولاتيد هكتار من الخطوة 2، 1 إلى الخليط.
ملاحظة: الحلول "حمو ها" لزجة جداً. وبالتالي، نوصي باستخدام تلميح ميكروبيبيتي الفوهة واسعة لنقل الحلول. ماصة ببطء لتجنب حل الخلاف على الجدران من نصيحة ميكروبيبيتي وتحسين دقة القياس.
- وضع قوالب نظيفة وجافة (أعد في الخطوة 2، 4) في كل بئر من صفيحة 12-جيدا-ثقافة الأنسجة المعالجة. استخدام نهاية نظيفة وحادة من طرف ماصة، اضغط على جل العفن وختم الاختيار المزدوجة بين قوالب وأسفل اللوحة جيدا.
ملاحظة: التحقق من الختم مرة أخرى الحق قبل التغليف لمنع التسرب.
- ممر مثقف GBM الخلايا وتنأى إلى الخلايا المفردة وتحديد تركيز الخلية كما تم وصفه سابقا3.
ملاحظة: لا يمكن فصل بعض خطوط الخليج للحاسبات الآلية إلى الخلايا المفردة. في هذه الحالة، يمكن أن يتم تغليف جليوماسفيريس كله. ومع ذلك، تعد خلايا مفردة معزولة بعد عد الخلايا المحددة تحسين إمكانية تكرار نتائج. بروتوكول باساجينج جليوماسفيري يختلف بين مختبرات مختلفة والعديد من هؤلاء يحتمل متوافقة مع تغليف المائية.
- (مستحسن) جليوماسفيريس الطرد المركزي في 500 غرام x 5 كحد أدنى لإزالة المادة طافية وإضافة 1 مل إنزيم تفكك خلية إلى خلية بيليه. ثم احتضانها لمدة 5 دقائق، التنصت على أنبوب تحرض بلطف.
- إضافة 4 مل من إكمال الثقافة المتوسطة (50 نانوغرام/مل مماثلة، 20 نانوغرام/مل صندوق الأجيال القادمة-2, 25 ميكروغرام/مل الهيبارين وتكملة مجموعة ال 21 والبنسلين/ستربتوميسين 1% في DMEM/F12) للخلايا.
- الطرد المركزي مرة أخرى في ز x 500 لمدة 5 دقائق وإزالة المادة طافية. وأخيراً، ريسوسبيند بيليه الخلية في 1 مل الوسط كاملة وتمرير الخلايا مع وقف التنفيذ من خلال مصفاة خلية 70 ميكرومتر. المياه والصرف الصحي (مستحسن) المصفاة مع مل 4 إضافية من المتوسط كاملة إلى أقصى حد عدد الخلايا استردادها.
- تقدير تركيز الخلايا في تعليق استخدام هيموسيتوميتير. تقسيم الخلية تعليق 2 أنابيب الطرد المركزي، حيث يحتوي كل أنبوب خلايا ~ 80,000. الطرد المركزي في ز x 500 لمدة 5 دقائق؛ عموما، سوف تشكل الخلايا 80,000 2 80 ميليلتر الهلاميات المائية.
- إزالة المادة طافية وريسوسبيند بيليه واحد في 80 ميليلتر من حل شماعة-القانون النموذجي للتحكيم-إدارات وبيليه ثاني في ميليلتر 80 الحل CYS-شماعة-القانون النموذجي للتحكيم (إعدادها في الخطوة 3، 1).
- استخدام 200 ميليلتر، نصيحة ميكروبيبيتي واسعة الفوهة، الاستغناء عن 40 ميليلتر لحل ها (من الخطوة 3، 3 أعلاه) إلى كل العفن سيليكون المطاط (كما أعدت في الخطوة 3، 4).
- استخدام 200 ميليلتر، نصيحة الفوهة على نطاق ميكروبيبيتي، خلط ميليلتر 40 شماعة-القانون النموذجي للتحكيم-CYS أو شماعة-القانون النموذجي للتحكيم-إدارات الخلية الحل مع الحل هكتار في القالب. "الماصة؛" صعودا وهبوطاً بسرعة لا تزيد عن 10 مرات. كرر لكل ثقافة جل يجري إعدادها.
ملاحظة: هذه الخطوة تأخذ الممارسة، منذ جيليشن الأولى يحدث بسرعة (خلال 30 ثانية). "الماصة؛" صعودا وهبوطاً بينما تتحرك في التلميح إلى مواقع مختلفة في قوالب لضمان حتى خلط. دائماً نصيحة أدناه مستوى السائل لتجنب تكوين فقاعات الهواء. عدم ميكس تلميح مرات كثيرة كما قد الحصول على شكل هلام داخل ميكروبيبيتي الحل. ويمكن الجمع بين الوتد-القانون النموذجي للتحكيم-CYS وشماعة-القانون النموذجي للتحكيم-إدارات في نسب متفاوتة لتحقيق تركيز الببتيد إدارات المرجوة.
- ضع لوحة البئر الذي يحتوي على خلايا مغلفة جل إلى حاضنة ثقافة خلية 37 درجة مئوية لمدة 5-10 دقائق لضمان الانتهاء من رد فعل.
- إضافة 2-2.5 مل من الثقافة المتوسطة لكل بئر بتشكيل المواد الهلامية. استخدام عقيمة، 2 ميليلتر ماصة تلميح أو الجزئي-البسط، لفصل بلطف العفن وجل. استخدام الملقط المعقم قبل إزالة القالب من لوحة جيدا. ضع لوحة جيدا مرة أخرى إلى الخلية الحاضنة (37 درجة مئوية و 5 في المائة من أول أكسيد الكربون2) للثقافة والتجارب المستقبلية.
ملاحظة: سحب القالب رأسياً إلى أعلى لتجنب إلحاق الضرر بثقافات هلام. وبصفة عامة، ينبغي استبدال المتوسطة في جل الثقافات كل 3-4 أيام. الحرص على عدم نضح الهلاميات المائية عند إزالة المتوسطة. إذا كان هذا مشكلة، نوصي باستخدام ماصة نقل بلاستيك. إذا كان من المعتزم الإضاءة الحيوية التصوير لتعقب عدد الخلايا، يجب أن ترانسدوسيد الخلايا GBM مع lentivirus ترميز مؤثرا التعبير لوسيفراس قبل التغليف، كما هو موضح سابقا3. للتصوير بالإضاءة الحيوية، إضافة 1 ملم د-لوسيفرين للثقافة المتوسطة ح 1 قبل تصوير التﻷلؤ.
4-إعداد النشاف الغربية
- تشيل أنابيب ميكروسينتريفوجي 1.5 مل على الجليد (1 كل العينات هلام). بارد للطرد المركزي إلى 4 درجات مئوية.
- إزالة المتوسطة من لوحات جيدا. نقل المواد الهلامية في أنابيب ميكروسينتريفوجي بريشيليد.
- إضافة 100 ميليلتر من المخزن المؤقت ريبا مع مثبطات البروتياز/الفوسفاتيز x 1.
- استخدام المحاقن 1 مل بإبرة ز 20، تفريق الجل عن طريق دفع الخليط كله من خلال إبرة على الأقل 20 مرة.
- فلاش تدور العينة باستخدام ميكروسينتريفوجي أعلى مقاعد البدلاء ومكان العينة مرة أخرى على الجليد.
- دوامة عينات بإيجاز كل 5 دقائق لمجموعة من 20 دقيقة.
- عينات من أجهزة الطرد المركزي في 14000 ز س لمدة 15 دقيقة في 4 درجات مئوية.
- نقل المادة طافية إلى أنابيب ميكروسينتريفوجي الجديدة، مبردة مسبقاً وتخزينها في-20 درجة مئوية (قصيرة الأجل) أو و-80 درجة مئوية (طويلة الأجل). إجراء التفريد جل استخدام إجراءات معيارية، كما هو موضح سابقا3.
5-استخراج الخلايا المفردة من الثقافات المائية للتدفق الخلوي
- إزالة ثقافة جل المتوسطة ونقل (من الخطوة 3.11) في أنبوب ميكروسينتريفوجي 1.5 مل.
- احتضان جل مع 500 ميليلتر إنزيم تفكك الخلية (مثل تريبل إكسبرس) في 37 درجة مئوية لمدة 5 دقائق، أحياناً يسددها أنبوب تحرض.
- نقل الخليط في أنبوب 50 مل الطرد مركزي مع 5 مل متوسطة كاملة. ضع الأنبوب على الجليد.
- إرفاق إبرة 20 غرام على حقنه 10 مل. بلطف بتعليق خلية صعودا وهبوطاً من خلال سحب الإبرة 8 مرات.
- تدفق الخليط من خلال مصفاة خلية ميكرومتر 70 في أنبوب 50 مل أجهزة الطرد مركزي جديدة. تطبيق 5 مل إضافية من المتوسطة كاملة من خلال مصفاة لجمع أي الخلايا المتبقية.
- الطرد المركزي العينة في ز 400 x 5 الحد الأدنى إزالة المادة طافية وريسوسبيند بيليه في المخزن المؤقت المطلوب للتدفق الخلوي (باستخدام البروتوكولات القياسية3).
6-تجميد الهلاميات المائية لتقطيع
- إزالة المتوسطة من الثقافات هلام (من الخطوة 3.11).
- احتضان جل الثقافات مع 2 مل من 4% بارافورمالدهيد (PFA) في 4 درجات مئوية بين عشية وضحاها.
تنبيه: منهاج عمل بيجين سامة ويجب أن تعالج بعناية.
- في اليوم التالي، إزالة منهاج عمل بيجين. إضافة 2 مل من محلول السكروز 5% في برنامج تلفزيوني للهلام واحتضانها ح 1 في درجة حرارة الغرفة.
- استبدال 5% من محلول السكروز مع 2 مل من محلول السكروز 20% في برنامج تلفزيوني واحتضان لمدة 30 دقيقة.
- استبدال محلول السكروز مع 2 مل الطازجة السكروز 20% في برنامج تلفزيوني واحتضانها 30 دقيقة إضافية.
- لمرة ثالثة، يحل محل محلول السكروز مع 2 مل الطازجة السكروز 20% في برنامج تلفزيوني. احتضان عند 4 درجة مئوية بين عشية وضحاها.
- إعداد السكروز 20% في مجمع "خفض درجة الحرارة المثلى" (OCT).
ملاحظة: نظراً للزوجة OCT، تفكك السكروز يمكن أن يستغرق بعض الوقت (حتى بين عشية وضحاها). من المستحسن وضع الخليط على شاكر خلال حل للحفاظ على الانفعالات.
- إزالة محلول السكروز 20% في اليوم التالي، وصب بلطف السكروز 20% في أكتوبر حل أكثر من الهلام. تأكد من تغطية جيل كامل. تبني في 4 درجات مئوية عن ح 3.
- نقل الهلام داخل المركز من العفن التضمين استخدام ملعقة كبيرة، شقة؛ وهذا يجب أن يتم بعناية لتجنب إتلاف الهلام.
- بارد 2-ميثيلبوتاني داخل كريوتشامبير مع وجود فائض ثلج الجاف.
- ملء القالب التضمين مع أكتوبر خالصة (لا السكروز). تعبئة لأسفل الحافة العلوية للقالب.
- تجميد العينة المائية بالانغماس في تبريد 2-ميثيلبوتاني وثم الانتقال إلى تمزيقها.
- قسم العينة باستخدام كريوستات؛ ينصح سمك الباب 10-18 ميكرومتر وتقطيع درجة الحرارة حوالي-26 درجة مئوية.
- تنفيذ الإجراءات القياسية إيمونوستينينج على ثقافة جل مقطعة، كما هو موضح سابقا3.
ملاحظة: يعرف PFA مهيجة ومسرطنة. الرجاء معالجة والتخلص منها منهاج العمل وفقا للمعايير المعمول بها محلياً والأنظمة.
7-مجموع الجيش الملكي النيبالي الاستخراج من العينات في المائية
ملاحظة: هنا، يمكننا وصف بروتوكول باستخدام تجاري كيت (انظر الجدول للمواد) لاستخراج الحمض النووي الريبي مجموع من الخلايا المائية المستزرعة. المخازن المؤقتة وجميع المواد متوفرة داخل مجموعة المواد المستخدمة.
- إزالة الثقافة المتوسطة. استخدام ماصة نقل P1000 مع نصيحة تحمل على نطاق نقل الثقافة المائية إلى 1.5 مل ميكروسينتريفوجي الأنبوبة.
- إضافة 350 ميليلتر من المخزن المؤقت RLT للثقافة المائية.
- باستخدام إبرة ز 20 المرفقة بحقنه 1 مل، اجاد الجل عن طريق دفع الخليط كله من خلال إبرة على الأقل 20 مرة.
- تحويل المزيج كله إلى عمود الخالطون توضع في أنبوب جمع 2 مل. الطرد المركزي في 13,000 س ز 2 دقيقة.
- نقل المادة طافية في أنبوب ميكروسينتريفوجي مل 1.5 نظيفة. احرص على عدم تعكير متسرعا جل في الجزء السفلي.
- خلط العينة ليستي مع 350 ميليلتر من الإيثانول 100%. نقل جميع العينة إلى مكان عمود (من kit) تدور في أنبوب جمع 2 مل. أجهزة الطرد المركزي لمدة 1 دقيقة في 13,000 س ز.
- للحصول على الخطوات اللاحقة لتنقية الحمض النووي الريبي لبكر، اتبع البروتوكول العام التي توفرها الشركة المصنعة لمجموعة.
ملاحظة: حالما يتم استخراج الحمض النووي الريبي، يمكن استخدام البروتوكولات القياسية لبكر.