Andreas Gnirke Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology Biography Publications Institution JoVE Articles Andreas Gnirke has not added a biography. If you are Andreas Gnirke and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications ヒト細胞の種類にわたって非CpGメチル化のゲノム分布とサンプル点間における変動 PLoS Genetics. Dec, 2011 | Pubmed ID: 22174693 臨床試料から病原体ゲノムを配列するためのハイブリッド選択。 Genome Biology. 2011 | Pubmed ID: 21835008 フルレングスのトランスクリプトーム アセンブリなし参照ゲノム RNA Seq データから。 Nature Biotechnology. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21572440 分類の RNA の代謝原則哺乳類細胞における RNA の生産と分解ダイナミクスの覆いを取る。 Nature Biotechnology. May, 2011 | Pubmed ID: 21516085 ゲノム スケール DNA メチル化プロファイル用の縮小表示が重亜硫酸塩の配列ライブラリの準備。 Nature Protocols. Apr, 2011 | Pubmed ID: 21412275 分析、イルミナ シーケンス ライブラリにおける PCR 増幅バイアスを最小限に抑えます。 Genome Biology. 2011 | Pubmed ID: 21338519 ヒトESやiPS細胞の変化のリファレンス·マップは、多能性細胞株の高スループット特性を有効にする Cell. Feb, 2011 | Pubmed ID: 21295703 因子の発現のリプログラミング広範なターゲットを絞ったクロマチンを開始します。 Cell Stem Cell. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21211784 並列配列データから哺乳類ゲノムの高品質のドラフトアセンブリ Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21187386 シーケンスに基づいてメソッド プロファイル DNA メチル化とエピジェネティック エピジェネティック修飾の同定の比較。 Nature Biotechnology. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20852635 Quantitative Comparison of Genome-wide DNA Methylation Mapping Technologies Nature Biotechnology. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20852634 アンチセンス RNA シーケンス酵母種を越えて保存されている広範囲の規制長いアンチセンス転写を明らかにします。 Genome Biology. 2010 | Pubmed ID: 20796282 アンチセンス RNA 配列方法の包括的な比較分析。 Nature Methods. Sep, 2010 | Pubmed ID: 20711195 エクソン シーケンスによるソリューションでハイブリッド選択ターゲット。 Current Protocols in Human Genetics / Editorial Board, Jonathan L. Haines ... [et Al.]. Jul, 2010 | Pubmed ID: 20582916 マウスの細胞タイプ特異的トランスクリプトームの第一原理からの復興はLincRNAsの保存マルチエクソン構造を明らかに Nature Biotechnology. May, 2010 | Pubmed ID: 20436462 メラノーマトランスクリプトームの統合解析 Genome Research. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20179022 シングルヌクレオチド分解能での臨床サンプルのゲノム規模のDNAメチル化マッピング Nature Methods. Feb, 2010 | Pubmed ID: 20062050 ZBED6、家畜のDNAトランスポゾン由来の新規転写因子はIGF2の発現と筋肉の成長を調節する PLoS Biology. Dec, 2009 | Pubmed ID: 20016685 対象となる次世代シーケンシングがんトランスクリプトームのシーケンスの亜種と新規融合転写産物の検出が向上します。 Genome Biology. 2009 | Pubmed ID: 19835606 長距離相互作用の包括的なマッピングは、ヒトゲノムの折りたたみの原理を明らかに Science (New York, N.Y.). Oct, 2009 | Pubmed ID: 19815776 ALLPATHS 2: 小さなゲノム正確かつ高い継続性ショートのペアになっている読み取りから組み立てください。 Genome Biology. 2009 | Pubmed ID: 19796385 哺乳動物ゲノムにおける高スループットの重亜硫酸塩のシーケンス。 Methods (San Diego, Calif.). Jul, 2009 | Pubmed ID: 19442738 Ab Initio 建設の真核生物トランスクリプトームによる超並列 MRNA シーケンス。 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19208812 超並列ターゲットシーケンスのための超長いオリゴヌクレオチドを有する溶液ハイブリッド選択 Nature Biotechnology. Feb, 2009 | Pubmed ID: 19182786 母性効果、利己的な遺伝的要素メデア複合 Tc1 トランスポゾンと関連付けられています。 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18621706 多能性と分化した細胞のゲノム規模のDNAメチル化の地図 Nature. Aug, 2008 | Pubmed ID: 18600261 モデル カブトムシと害虫コクヌストモドキのゲノム。 Nature. Apr, 2008 | Pubmed ID: 18362917 CTCF絶縁体何千ものサイトを含むヒトゲノムの保存領域における規制モチーフの系統的な発見 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2007 | Pubmed ID: 17442748 真菌の Biotrophic のゲノムからの洞察力は、病原体 Ustilago アルテリシジンを植物します。 Nature. Nov, 2006 | Pubmed ID: 17080091 比較高解像度のDNAメチル化解析のためのシーケンシングを低減表現亜硫酸 Nucleic Acids Research. 2005 | Pubmed ID: 16224102 ヒト18番染色体のDNA配列と解析 Nature. Sep, 2005 | Pubmed ID: 16177791 ショウジョウバエのゲノムの機能アノテーションに関する比較ゲノム シーケンス データの影響の評価。 Genome Biology. 2002 | Pubmed ID: 12537575 ハイC:ゲノムの三次元構造を研究する方法。 Nynke L. van Berkum*1, Erez Lieberman-Aiden*2,3,4,5, Louise Williams*2, Maxim Imakaev6, Andreas Gnirke2, Leonid A. Mirny3,6, Job Dekker1, Eric S. Lander2,7,8 1Program in Gene Function and Expression, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, 2Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology, 3Division of Health Sciences and Technology, Massachusetts Institute of Technology, 4Program for Evolutionary Dynamics, Department of Organismic and Evolutionary Biology, Department of Mathematics, Harvard University, 5Department of Applied Mathematics, Harvard University, 6Department of Physics, Massachusetts Institute of Technology, 7Department of Systems Biology, Harvard Medical School, 8Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology JoVE 1869 Biology
ハイC:ゲノムの三次元構造を研究する方法。 Nynke L. van Berkum*1, Erez Lieberman-Aiden*2,3,4,5, Louise Williams*2, Maxim Imakaev6, Andreas Gnirke2, Leonid A. Mirny3,6, Job Dekker1, Eric S. Lander2,7,8 1Program in Gene Function and Expression, Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, University of Massachusetts Medical School, 2Broad Institute of Harvard and Massachusetts Institute of Technology, 3Division of Health Sciences and Technology, Massachusetts Institute of Technology, 4Program for Evolutionary Dynamics, Department of Organismic and Evolutionary Biology, Department of Mathematics, Harvard University, 5Department of Applied Mathematics, Harvard University, 6Department of Physics, Massachusetts Institute of Technology, 7Department of Systems Biology, Harvard Medical School, 8Department of Biology, Massachusetts Institute of Technology JoVE 1869 Biology