David Fenyo Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry Rockefeller University Biography Publications Institution JoVE Articles David Fenyo has not added a biography. If you are David Fenyo and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications The GPMDB REST Interface Bioinformatics (Oxford, England). Feb, 2015 | Pubmed ID: 25697819 Use of ENCODE Resources to Characterize Novel Proteoforms and Missing Proteins in the Human Proteome Journal of Proteome Research. Feb, 2015 | Pubmed ID: 25369122 Pathway Analysis and Transcriptomics Improve Protein Identification by Shotgun Proteomics from Samples Comprising Small Number of Cells--a Benchmarking Study BMC Genomics. 2014 | Pubmed ID: 25521637 A Robust Pipeline for Rapid Production of Versatile Nanobody Repertoires Nature Methods. Dec, 2014 | Pubmed ID: 25362362 Super-resolution Imaging Reveals That Loss of the C-terminus of Connexin43 Limits Microtubule Plus-end Capture and NaV1.5 Localization at the Intercalated Disc Cardiovascular Research. Nov, 2014 | Pubmed ID: 25139742 Ischemia in Tumors Induces Early and Sustained Phosphorylation Changes in Stress Kinase Pathways but Does Not Affect Global Protein Levels Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jul, 2014 | Pubmed ID: 24719451 Integrated Chromosome 19 Transcriptomic and Proteomic Data Sets Derived from Glioma Cancer Stem-cell Lines Journal of Proteome Research. Jan, 2014 | Pubmed ID: 24266786 Super-resolution Fluorescence Microscopy of the Cardiac Connexome Reveals Plakophilin-2 Inside the Connexin43 Plaque Cardiovascular Research. Nov, 2013 | Pubmed ID: 23929525 Developments in Biobanking Workflow Standardization Providing Sample Integrity and Stability Journal of Proteomics. Dec, 2013 | Pubmed ID: 23856607 Atypical and Classical Memory B Cells Produce Plasmodium Falciparum Neutralizing Antibodies The Journal of Experimental Medicine. Feb, 2013 | Pubmed ID: 23319701 A Chromosome-centric Human Proteome Project (C-HPP) to Characterize the Sets of Proteins Encoded in Chromosome 17 Journal of Proteome Research. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23259914 Chromosome 19 Annotations with Disease Speciation: a First Report from the Global Research Consortium Journal of Proteome Research. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23249167 Comparative Proteomic Analysis of the ATP-sensitive K+ Channel Complex in Different Tissue Types Proteomics. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23197389 Strategy for Identifying Dendritic Cell-processed CD4+ T Cell Epitopes from the HIV Gag P24 Protein PloS One. 2012 | Pubmed ID: 22860026 Séquence Et La Convergence Structurelle Des Anticorps Anti-VIH Grandes Et Puissantes Qui Imitent CD4 Reliure Science (New York, N.Y.). Sep, 2011 | Pubmed ID: 21764753 Ion Trap Haute Capacité Couplé à Un Spectromètre De Masse à Temps De Vol Pour Complets Scans Liés à Pas De Pertes De Numérisation International Journal of Mass Spectrometry. Mar, 2011 | Pubmed ID: 21516228 Modélisation Analyse Des Protéines Basé Sur La Spectrométrie De Masse Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2011 | Pubmed ID: 21082431 Modélisation Expérimental Pour La Protéomique Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835802 La Quantification Des Protéines Par Spectrométrie De Masse Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835801 Identification Des Protéines Par Spectrométrie De Masse à L'aide De La Machine Global Proteome Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835799 L'Asie Océanie Human Proteome Organisation Membrane Proteomics Initiative. Préparation Et Caractérisation De La Membrane De Carbonate De Chaux Standard Proteomics. Nov, 2010 | Pubmed ID: 20486120 GINS Mouvement Révèle La Progression Des Fourches De Réplication Est Remarquablement Uniforme Dans Tout Le Génome De La Levure Molecular Systems Biology. 2010 | Pubmed ID: 20212525 Étude Interlaboratoires Caractérisation D'une Norme De Performance Pour La Performance De Levure Plate-forme D'analyse Comparative LC-MS Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Feb, 2010 | Pubmed ID: 19858499 Analyse Rapide De Sensible Riche En Cystéine Composants Venom Peptidiques Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2009 | Pubmed ID: 19380747 Quatre Variants D'histones Marquent Les Limites Des Unités De Transcription Polycistronique à Trypanosoma Brucei Genes & Development. May, 2009 | Pubmed ID: 19369410 Evaluation De La Variation Dans La Préparation De L'échantillon Pour La Protéomique Comparative Utilisant L'isotope Stable étiquetant Par Des Acides Aminés En Culture Cellulaire Journal of Proteome Research. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19140678 Dépistage De L'EphB Signaling Effecteurs Utilisant SILAC Avec Un Spectromètre De Masse Linéaire Ion Trap-Orbitrap Valant Journal of Proteome Research. Nov, 2008 | Pubmed ID: 18816084 Validation Des Identifications De Peptide Endogène à L'aide D'une Base De Données De Spectres De Masse En Tandem Journal of Proteome Research. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18549260 Identification Efficace Des Phosphorylation Par Empreintes Digitales Phosphopeptide Spectrométrie De Masse Analytical Chemistry. Apr, 2008 | Pubmed ID: 18321079 Isolement Et Identification Rapides D'bactériophage T4-codées Modifications De Escherichia Coli ARN Polymérase: Une Méthode Générique Pour L'étude De Bactériophages / Interactions Entre L'hôte Journal of Proteome Research. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18271525 Utilisation Des échelles D'ADN Pour Le Fractionnement Des Protéines Reproductible De Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel D'électrophorèse (SDS-PAGE) Pour La Protéomique Quantitative Journal of Proteome Research. Feb, 2008 | Pubmed ID: 18189343 Développement Informatique : Défis Et Solutions Pour MALDI Spectrométrie De Masse Mass Spectrometry Reviews. Jan-Feb, 2008 | Pubmed ID: 17979143 Une Méthode Automatisée Pour La Numérisation De Données LC-MS Définit Pour Significatives Peptides Et Protéines, Y Compris Le Profilage Quantitatif Et Confirmation Interactive Journal of Proteome Research. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17559249 Améliorer Le Taux De Réussite De L'analyse Du Protéome De Modélisation Des Distributions De Protéine-abondance Et Expérimentaux Nature Biotechnology. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17557102 Neuropeptidomics Les Stratégies D'identification Spécifique Et Sensible De Peptides Endogènes Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17401030 Déterminer Le Mérite Global Des Protéines Des Ensembles De Données D'identification : Rho-diagrammes Et Rho-scores Journal of Proteome Research. May, 2007 | Pubmed ID: 17397212 Détection Des Artefacts Et Des Modifications De Peptide Dans Les Données De Spectrométrie De Liquid Chromatography/mass à L'aide De La Visualisation De Données Carte Signal Bidimensionnel Intensité Rapid Communications in Mass Spectrometry : RCM. 2006 | Pubmed ID: 16628601 Reproductibilité De L'identification Des Protéines à Base De LC-MS Journal of Experimental Botany. 2006 | Pubmed ID: 16551682 SwePep, Une Base De Données Conçu Pour Les Peptides Endogènes Et Spectrométrie De Masse Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jun, 2006 | Pubmed ID: 16501280 Optimisation Des Conditions De Recherche Pour L'identification Des Empreintes Digitales Masse De Protéines Proteomics. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16485258 Une évaluation, De Comparaison Et étalonnage Précis Des Plusieurs Accessibles MS/MS Des Algorithmes De Recherche : Analyse De Sensibilité Et De Spécificité Proteomics. Aug, 2005 | Pubmed ID: 16047398 Identification Des Protéines Dans Des Mélanges Complexes Journal of Proteome Research. Mar-Apr, 2005 | Pubmed ID: 15822914 Phosphotyrosine Réseaux Au Récepteur De Facteur De Croissance épidermique Surexprimant Les Cellules De Carcinome épidermoïde De La Signalisation Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Apr, 2005 | Pubmed ID: 15657067 Trouver Des Séquences De Protéines à L'aide De Vagabondage Current Protocols in Bioinformatics / Editoral Board, Andreas D. Baxevanis ... [et Al.]. Oct, 2004 | Pubmed ID: 18428719 A Approche Protéomique Pour L'étude De L'absorption, Distribution, Métabolisme, Excrétion Et Toxicité Journal of Biomolecular Techniques : JBT. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15585823 La Recherche De La Signification Statistique Des Résultats D'identification De Protéines En Fonction Du Nombre De Séquences De Protéines Journal of Proteome Research. Sep-Oct, 2004 | Pubmed ID: 15473685 Probité : Un Protéine D'identification Algorithme Avec Affectation Précise De La Signification Statistique Des Résultats Journal of Proteome Research. Jan-Feb, 2004 | Pubmed ID: 14998160 Une Méthode Pour évaluer La Signification Statistique Des Identifications De Protéines Par Spectrométrie De Masse En Utilisant Des Systèmes De Notation Générales Analytical Chemistry. Feb, 2003 | Pubmed ID: 12622365 Une Approche Modulaire De La Croix-lier Pour La Prospection De Interactions Protéiques Journal of the American Chemical Society. Mar, 2003 | Pubmed ID: 12603129 Informatique Et Gestion De Données En Protéomique Trends in Biotechnology. Dec, 2002 | Pubmed ID: 12570158 Un Modèle D'appariement Aléatoire De Masse Et De Son Utilisation Automatisée Importance Dans L'analyse Par Spectrométrie De Masse Protéomique Proteomics. Mar, 2002 | Pubmed ID: 11921442 RADARS, Une Solution De Bio-informatique Qui Automatise Les Spectres De Masse Analyse Protéomique, Optimise L'identification Des Protéines Et Archivage De Données Dans Une Base De Données Relationnelle Proteomics. Jan, 2002 | Pubmed ID: 11788990 Préparation des échantillons MALDI: la méthode de la couche ultra mince David Fenyo1, Qingjun Wang1, Jeffrey A. DeGrasse1, Julio C. Padovan1, Martine Cadene1, Brian T. Chait1 1Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry, Rockefeller University JoVE 192 Biology
Préparation des échantillons MALDI: la méthode de la couche ultra mince David Fenyo1, Qingjun Wang1, Jeffrey A. DeGrasse1, Julio C. Padovan1, Martine Cadene1, Brian T. Chait1 1Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry, Rockefeller University JoVE 192 Biology