David Fenyo Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry Rockefeller University Biography Publications Institution JoVE Articles David Fenyo has not added a biography. If you are David Fenyo and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications The GPMDB REST Interface Bioinformatics (Oxford, England). Feb, 2015 | Pubmed ID: 25697819 Use of ENCODE Resources to Characterize Novel Proteoforms and Missing Proteins in the Human Proteome Journal of Proteome Research. Feb, 2015 | Pubmed ID: 25369122 Pathway Analysis and Transcriptomics Improve Protein Identification by Shotgun Proteomics from Samples Comprising Small Number of Cells--a Benchmarking Study BMC Genomics. 2014 | Pubmed ID: 25521637 A Robust Pipeline for Rapid Production of Versatile Nanobody Repertoires Nature Methods. Dec, 2014 | Pubmed ID: 25362362 Super-resolution Imaging Reveals That Loss of the C-terminus of Connexin43 Limits Microtubule Plus-end Capture and NaV1.5 Localization at the Intercalated Disc Cardiovascular Research. Nov, 2014 | Pubmed ID: 25139742 Ischemia in Tumors Induces Early and Sustained Phosphorylation Changes in Stress Kinase Pathways but Does Not Affect Global Protein Levels Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jul, 2014 | Pubmed ID: 24719451 Integrated Chromosome 19 Transcriptomic and Proteomic Data Sets Derived from Glioma Cancer Stem-cell Lines Journal of Proteome Research. Jan, 2014 | Pubmed ID: 24266786 Super-resolution Fluorescence Microscopy of the Cardiac Connexome Reveals Plakophilin-2 Inside the Connexin43 Plaque Cardiovascular Research. Nov, 2013 | Pubmed ID: 23929525 Developments in Biobanking Workflow Standardization Providing Sample Integrity and Stability Journal of Proteomics. Dec, 2013 | Pubmed ID: 23856607 Atypical and Classical Memory B Cells Produce Plasmodium Falciparum Neutralizing Antibodies The Journal of Experimental Medicine. Feb, 2013 | Pubmed ID: 23319701 A Chromosome-centric Human Proteome Project (C-HPP) to Characterize the Sets of Proteins Encoded in Chromosome 17 Journal of Proteome Research. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23259914 Chromosome 19 Annotations with Disease Speciation: a First Report from the Global Research Consortium Journal of Proteome Research. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23249167 Comparative Proteomic Analysis of the ATP-sensitive K+ Channel Complex in Different Tissue Types Proteomics. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23197389 Strategy for Identifying Dendritic Cell-processed CD4+ T Cell Epitopes from the HIV Gag P24 Protein PloS One. 2012 | Pubmed ID: 22860026 Sequenza E Strutturali Convergenza Degli Anticorpi HIV Ampi E Potenti Che Imitano CD4 Associazione Science (New York, N.Y.). Sep, 2011 | Pubmed ID: 21764753 Ad Alta Capacità Trappola Ionica Accoppiato Ad Uno Spettrometro Di Massa a Tempo Di Volo Per Scansioni Complete Collegati Senza Perdite Di Scansione International Journal of Mass Spectrometry. Mar, 2011 | Pubmed ID: 21516228 Modelli Di Analisi Della Proteina Di Base Di Spettrometria Di Massa Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2011 | Pubmed ID: 21082431 Disegno Sperimentale Di Modellazione Per La Proteomica Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835802 Quantificazione Della Proteina Mediante Spettrometria Di Massa Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835801 Identificazione Di Spettrometria Di Massa Della Proteina Usando La Macchina Globale Proteome Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835799 Asia Oceania Human Proteome Organizzazione Membrana Proteomics Iniziativa. Preparazione E Caratterizzazione Della Membrana Carbonato-lavato Standard Proteomics. Nov, 2010 | Pubmed ID: 20486120 Gin Movimento Rivela Progressione Forcella Replica è Notevolmente Uniforme in Tutto Il Genoma Del Lievito Molecular Systems Biology. 2010 | Pubmed ID: 20212525 Studio Interlaboratorio Che Caratterizza Uno Standard Di Prestazioni Lievito Per L'analisi Comparativa Delle Prestazioni Di Piattaforma Di LC-MS Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Feb, 2010 | Pubmed ID: 19858499 Rapida Analisi Sensibile Delle Cisteina Peptide Ricco Veleno Componenti Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2009 | Pubmed ID: 19380747 Quattro Varianti Dell'istone Segnano I Confini Delle Unità Di Trascrizione Policistronico in Trypanosoma Brucei Genes & Development. May, 2009 | Pubmed ID: 19369410 Valutazione Della Variazione Nella Preparazione Del Campione Per La Proteomica Comparativa Utilizzando Isotopo Stabile Di Etichettatura Da Amminoacidi Nella Coltura Delle Cellule Journal of Proteome Research. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19140678 Lo Screening Per La EphB Segnalazione Effettori Usando SILAC Con Uno Spettrometro Di Massa a Trappola Ionica-orbitrap Lineare Journal of Proteome Research. Nov, 2008 | Pubmed ID: 18816084 Convalida Di Identificazioni Di Peptidi Endogeni Utilizzando Un Database Di Spettri Di Massa Tandem Journal of Proteome Research. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18549260 Efficiente Identificazione Della Fosforilazione Di Fingerprinting Fosfopeptide Spettrometria Di Massa Analytical Chemistry. Apr, 2008 | Pubmed ID: 18321079 Rapido Isolamento Ed Identificazione Del Batteriofago T4-codificato Modifiche Escherichia Coli RNA Polimerasi: Un Metodo Generico Per Studiare Le Interazioni Del Batteriofago/host Journal of Proteome Research. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18271525 Uso Di Scalette Del DNA Per Frazionamento Proteine Riproducibile Di Sodio Dodecil Solfato-poliacrilammide Gel Elettroforesi (SDS-PAGE) Per Proteomica Quantitativa Journal of Proteome Research. Feb, 2008 | Pubmed ID: 18189343 Sviluppo Informatico: Sfide E Soluzioni Per MALDI Spettrometria Di Massa Mass Spectrometry Reviews. Jan-Feb, 2008 | Pubmed ID: 17979143 Un Metodo Automatico Per La Scansione Dei Dati Di LC-MS Imposta Per Significativi Peptidi E Proteine, Tra Cui Analisi Quantitativa E Interattivo Conferma Journal of Proteome Research. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17559249 Migliorare Il Tasso Di Successo Del Proteome Analysis Di Modellazione Distribuzioni Abbondanza Della Proteina E Disegni Sperimentali Nature Biotechnology. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17557102 Neuropeptidomics Strategie Di Identificazione Specifica E Sensibile Di Peptidi Endogeni Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17401030 Determinare Il Merito Complessivo Del Set Di Dati Di Identificazione Della Proteina: Rho-diagrammi E Gol Di Rho Journal of Proteome Research. May, 2007 | Pubmed ID: 17397212 Rilevamento Di Artefatti E Peptide Modifiche Nei Dati Di Spettrometria Di Massa Cromatografia Liquida Utilizzando La Visualizzazione Di Dati Mappa Di Intensità Del Segnale Bidimensionale Rapid Communications in Mass Spectrometry : RCM. 2006 | Pubmed ID: 16628601 Riproducibilità Di Identificazione Della Proteina Basate Su LC-MS Journal of Experimental Botany. 2006 | Pubmed ID: 16551682 SwePep, Un Database Progettato Per Peptidi Endogeni E Spettrometria Di Massa Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jun, 2006 | Pubmed ID: 16501280 Ottimizzazione Delle Condizioni Di Ricerca Per L'identificazione Di Proteine Massa Basate Su Impronte Digitali Proteomics. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16485258 Una Valutazione, Confronto E Accurata Analisi Comparativa Di MS/MS Pubblicamente Disponibili Diversi Algoritmi Di Ricerca: Analisi Di Sensibilità E Specificità Proteomics. Aug, 2005 | Pubmed ID: 16047398 Identificazione Di Proteine in Miscele Complesse Journal of Proteome Research. Mar-Apr, 2005 | Pubmed ID: 15822914 Phosphotyrosine Segnalazione Reti Epidermal Growth Factor Receptor Con Sovraesprimono Relativa Delle Cellule Di Carcinoma Squamoso Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Apr, 2005 | Pubmed ID: 15657067 Ricerca Di Sequenze Proteiche Con PROWL Current Protocols in Bioinformatics / Editoral Board, Andreas D. Baxevanis ... [et Al.]. Oct, 2004 | Pubmed ID: 18428719 Un Approccio Di Proteomica Per Lo Studio Dell'assorbimento, Distribuzione, Metabolismo, Escrezione E Tossicità Journal of Biomolecular Techniques : JBT. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15585823 La Significatività Statistica Dei Risultati Di Identificazione Della Proteina in Funzione Del Numero Di Sequenze Proteiche Cercato Journal of Proteome Research. Sep-Oct, 2004 | Pubmed ID: 15473685 Probità: Un Proteina Algoritmo Per L'identificazione Con Accurata Assegnazione Della Significatività Statistica Dei Risultati Journal of Proteome Research. Jan-Feb, 2004 | Pubmed ID: 14998160 Un Metodo Per Valutare La Significatività Statistica Di Identificazioni Di Massa Basati Sulla Spettrometria Di Proteine Utilizzando Schemi Di Punteggi Generale Analytical Chemistry. Feb, 2003 | Pubmed ID: 12622365 Un Modulare, Cross-linking Approccio Per Esplorare Le Interazioni Della Proteina Journal of the American Chemical Society. Mar, 2003 | Pubmed ID: 12603129 Gestione Informatica E Dati in Proteomics Trends in Biotechnology. Dec, 2002 | Pubmed ID: 12570158 Un Modello Di Massa-corrispondenza Casuale E Il Suo Uso Per Significato Automatizzato Test in Spettrometria Di Massa Proteome Analysis Proteomics. Mar, 2002 | Pubmed ID: 11921442 RADAR, Una Soluzione Di Bioinformatica Che Automatizza Proteome Analysis Massa Spettrale, Ottimizza L'identificazione Della Proteina E Archivi Dati in Un Database Relazionale Proteomics. Jan, 2002 | Pubmed ID: 11788990 MALDI Preparazione del campione: il metodo ultra sottile strato David Fenyo1, Qingjun Wang1, Jeffrey A. DeGrasse1, Julio C. Padovan1, Martine Cadene1, Brian T. Chait1 1Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry, Rockefeller University JoVE 192 Biology
MALDI Preparazione del campione: il metodo ultra sottile strato David Fenyo1, Qingjun Wang1, Jeffrey A. DeGrasse1, Julio C. Padovan1, Martine Cadene1, Brian T. Chait1 1Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry, Rockefeller University JoVE 192 Biology