David Fenyo Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry Rockefeller University Biography Publications Institution JoVE Articles David Fenyo has not added a biography. If you are David Fenyo and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications The GPMDB REST Interface Bioinformatics (Oxford, England). Feb, 2015 | Pubmed ID: 25697819 Use of ENCODE Resources to Characterize Novel Proteoforms and Missing Proteins in the Human Proteome Journal of Proteome Research. Feb, 2015 | Pubmed ID: 25369122 Pathway Analysis and Transcriptomics Improve Protein Identification by Shotgun Proteomics from Samples Comprising Small Number of Cells--a Benchmarking Study BMC Genomics. 2014 | Pubmed ID: 25521637 A Robust Pipeline for Rapid Production of Versatile Nanobody Repertoires Nature Methods. Dec, 2014 | Pubmed ID: 25362362 Super-resolution Imaging Reveals That Loss of the C-terminus of Connexin43 Limits Microtubule Plus-end Capture and NaV1.5 Localization at the Intercalated Disc Cardiovascular Research. Nov, 2014 | Pubmed ID: 25139742 Ischemia in Tumors Induces Early and Sustained Phosphorylation Changes in Stress Kinase Pathways but Does Not Affect Global Protein Levels Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jul, 2014 | Pubmed ID: 24719451 Integrated Chromosome 19 Transcriptomic and Proteomic Data Sets Derived from Glioma Cancer Stem-cell Lines Journal of Proteome Research. Jan, 2014 | Pubmed ID: 24266786 Super-resolution Fluorescence Microscopy of the Cardiac Connexome Reveals Plakophilin-2 Inside the Connexin43 Plaque Cardiovascular Research. Nov, 2013 | Pubmed ID: 23929525 Developments in Biobanking Workflow Standardization Providing Sample Integrity and Stability Journal of Proteomics. Dec, 2013 | Pubmed ID: 23856607 Atypical and Classical Memory B Cells Produce Plasmodium Falciparum Neutralizing Antibodies The Journal of Experimental Medicine. Feb, 2013 | Pubmed ID: 23319701 A Chromosome-centric Human Proteome Project (C-HPP) to Characterize the Sets of Proteins Encoded in Chromosome 17 Journal of Proteome Research. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23259914 Chromosome 19 Annotations with Disease Speciation: a First Report from the Global Research Consortium Journal of Proteome Research. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23249167 Comparative Proteomic Analysis of the ATP-sensitive K+ Channel Complex in Different Tissue Types Proteomics. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23197389 Strategy for Identifying Dendritic Cell-processed CD4+ T Cell Epitopes from the HIV Gag P24 Protein PloS One. 2012 | Pubmed ID: 22860026 Secuencia Y Convergencia Estructural De Anticuerpos Contra El VIH Amplias Y Potentes Que Imitan CD4 Vinculante Science (New York, N.Y.). Sep, 2011 | Pubmed ID: 21764753 Alta Capacidad De Trampa De Iones Junto a Un Espectrómetro De Masas De Tiempo De Vuelo De Las Exploraciones Integrales Vinculados Sin Pérdidas De Escaneo International Journal of Mass Spectrometry. Mar, 2011 | Pubmed ID: 21516228 Análisis De La Proteína Basadas En Espectrometría De Masa De Modelado Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2011 | Pubmed ID: 21082431 Modelado Diseño Experimental De Proteómica Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835802 La Cuantificación De Proteínas Mediante Espectrometría De Masas Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835801 Identificación De Espectrometría De Masa De La Proteína Mediante La Máquina Global Proteoma Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2010 | Pubmed ID: 20835799 El Asia Oceanía Proteoma Humano Organización Membrana Proteómica Iniciativa. Preparación Y Caracterización De La Membrana De Lavado Con Carbonato Estándar Proteomics. Nov, 2010 | Pubmed ID: 20486120 GINS Movimiento Revela La Progresión De Replicación Tenedor Es Notablemente Uniforme En Todo El Genoma De Levadura Molecular Systems Biology. 2010 | Pubmed ID: 20212525 Estudio Interlaboratorios Caracterización De La Norma De Desempeño Levadura De Rendimiento De La Plataforma De Evaluación Comparativa De LC-MS Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Feb, 2010 | Pubmed ID: 19858499 Análisis Rápido Sensible De Cisteína Ricos Componentes Péptidos Del Veneno Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2009 | Pubmed ID: 19380747 Cuatro Variantes De La Histona Marcan Los Límites De Las Unidades De Transcripción Policistrónico En Trypanosoma Brucei Genes & Development. May, 2009 | Pubmed ID: 19369410 Evaluación De La Variación En La Preparación De Muestras Para Proteómica Comparativa Utilizando Isótopos Estables Etiquetado Por Aminoácidos En Cultivo Celular Journal of Proteome Research. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19140678 Detección EphB Señalización Efectores Con Estándar De Un Espectrómetro De Masas De Trampa De Iones Lineal-orbitrap Journal of Proteome Research. Nov, 2008 | Pubmed ID: 18816084 Validación De Identificaciones De Péptidos Endógenos Utilizando Una Base De Datos De Espectros De Masas Tándem Journal of Proteome Research. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18549260 La Identificación Eficiente De La Fosforilación Por Espectrometría De Masa De Huellas Dactilares Fosfopeptida Analytical Chemistry. Apr, 2008 | Pubmed ID: 18321079 Aislamiento E Identificación Rápida De Bacteriófago T4 Codificados Modificaciones De E. Coli De La Polimerasa De ARN: Un Método Genérico Para El Estudio De Bacteriófagos / Host Interacciones Journal of Proteome Research. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18271525 Uso De Escaleras De ADN Para El Fraccionamiento De Proteínas Reproducibles Por Sodio Dodecil Sulfato-poliacrilamida Gel De Electroforesis (SDS-PAGE) Para Proteómica Cuantitativa Journal of Proteome Research. Feb, 2008 | Pubmed ID: 18189343 Desarrollo De La Informática: Desafíos Y Soluciones Para MALDI Espectrometría De Masas Mass Spectrometry Reviews. Jan-Feb, 2008 | Pubmed ID: 17979143 Un Método Automatizado Para Análisis De Datos De LC-MS Establece Para Importantes Péptidos Y Proteínas, Incluyendo Perfiles Cuantitativa Y Confirmación Interactivo Journal of Proteome Research. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17559249 Mejorar La Tasa De éxito Del Análisis Del Proteoma Modelando Proteína-abundancia Distribuciones Y Diseños Experimentales Nature Biotechnology. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17557102 Neuropeptidomics Estrategias Para La Identificación Específica Y Sensible De Péptidos Endógenos Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17401030 Determinar El Mérito General De Conjuntos De Datos De Identificación De Proteínas: Rho-diagramas Y Rho-partituras Journal of Proteome Research. May, 2007 | Pubmed ID: 17397212 Detección De Artefactos Y Modificaciones Del Péptido En Datos De Espectrometría De Masa/cromatografía Líquida Mediante Visualización De Datos De Mapa De Intensidad De Señal De Dos Dimensiones Rapid Communications in Mass Spectrometry : RCM. 2006 | Pubmed ID: 16628601 Reproducibilidad De Identificación Basadas En LC-MS De La Proteína Journal of Experimental Botany. 2006 | Pubmed ID: 16551682 SwePep, Una Base De Datos Diseñada Para Péptidos Endógenos Y Espectrometría De Masas Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Jun, 2006 | Pubmed ID: 16501280 Optimización De Las Condiciones De Búsqueda Para La Identificación De Masa Basada En Huellas Dactilares De Proteínas Proteomics. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16485258 Algoritmos De Búsqueda De Una Evaluación, Comparación Y Benchmarking Precisa De Varios Públicamente Disponibles MS/MS: Análisis De Sensibilidad Y Especificidad Proteomics. Aug, 2005 | Pubmed ID: 16047398 Identificación De Proteínas En Mezclas Complejas Journal of Proteome Research. Mar-Apr, 2005 | Pubmed ID: 15822914 Phosphotyrosine Señalización De Redes En El Receptor Del Factor De Crecimiento Epidérmico Overexpressing Células De Carcinoma Epidermoide Molecular & Cellular Proteomics : MCP. Apr, 2005 | Pubmed ID: 15657067 Encontrar Las Secuencias De Proteínas Usando Acechar Current Protocols in Bioinformatics / Editoral Board, Andreas D. Baxevanis ... [et Al.]. Oct, 2004 | Pubmed ID: 18428719 A Proteómica Aproximación Al Estudio De La Absorción, Distribución, Metabolismo, Excreción Y Toxicidad Journal of Biomolecular Techniques : JBT. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15585823 Búsquedas En La Significación Estadística De Los Resultados De Identificación De Proteínas En Función Del Número De Secuencias De Proteínas Journal of Proteome Research. Sep-Oct, 2004 | Pubmed ID: 15473685 Probidad: Un Proteína Identificación Algoritmo Con Asignación Precisa De La Significación Estadística De Los Resultados Journal of Proteome Research. Jan-Feb, 2004 | Pubmed ID: 14998160 Un Método Para Determinar La Significancia Estadística De Identificaciones De La Proteína Basadas En Espectrometría De Masa Con Esquemas De Puntuación Generales Analytical Chemistry. Feb, 2003 | Pubmed ID: 12622365 Un Enfoque Modular De Reticulación Para La Exploración De Interacciones Entre Proteínas Journal of the American Chemical Society. Mar, 2003 | Pubmed ID: 12603129 Informática Y Administración De Datos En Proteómica Trends in Biotechnology. Dec, 2002 | Pubmed ID: 12570158 Un Modelo De Coincidencia Al Azar De Masa Y Su Uso Para La Significación Automatizado En El Análisis Del Proteoma De Espectrometría De Masa Proteomics. Mar, 2002 | Pubmed ID: 11921442 RADARES, Una Solución De Bioinformática Que Automatiza El Análisis Del Proteoma Masa Espectral, Optimiza La Identificación De Proteínas Y Archiva Los Datos En Una Base De Datos Relacional Proteomics. Jan, 2002 | Pubmed ID: 11788990 MALDI preparación de la muestra: el método de ultra capa fina David Fenyo1, Qingjun Wang1, Jeffrey A. DeGrasse1, Julio C. Padovan1, Martine Cadene1, Brian T. Chait1 1Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry, Rockefeller University JoVE 192 Biology
MALDI preparación de la muestra: el método de ultra capa fina David Fenyo1, Qingjun Wang1, Jeffrey A. DeGrasse1, Julio C. Padovan1, Martine Cadene1, Brian T. Chait1 1Laboratory of Mass Spectrometry and Gaseous Ion Chemistry, Rockefeller University JoVE 192 Biology