Frederick P. Roth Donnelly Centre & Department of Molecular Genetics University of Toronto Biography Publications Institution JoVE Articles Frederick P. Roth has not added a biography. If you are Frederick P. Roth and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications ChromoZoom: 柔軟な, 流体, Web ベースのゲノムのブラウザー。 Bioinformatics (Oxford, England). Dec, 2012 | Pubmed ID: 23220575 イントロン UTRs で: なぜ我々 はそれらを無視して停止する必要があります。 BioEssays : News and Reviews in Molecular, Cellular and Developmental Biology. Dec, 2012 | Pubmed ID: 23108796 体系的なホスト ネットワーク摂動による腫瘍ウイルス蛋白質を用いた癌のゲノムを解釈します。 Nature. Jul, 2012 | Pubmed ID: 22810586 ホスト ネットワークのウイルスの摂動は疾患の病因を反映しています。 PLoS Computational Biology. 2012 | Pubmed ID: 22761553 出芽酵母における不可欠な DNA 複製タンパク質の枯渇によるゲノム再編成。 Genetics. Sep, 2012 | Pubmed ID: 22673806 応答を"MHC 依存型配偶者選択人間に: ゲノムのパターン ハップマップ ヨーロッパ アメリカ データ セットから仮説を支持する理由"。ハップマップ遺伝子型自信を持って人間仲間選択で MHC 軌跡の役割をサポートしていません。 BioEssays : News and Reviews in Molecular, Cellular and Developmental Biology. Jul, 2012 | Pubmed ID: 22467222 リソースの定量的機能アノテーションのホモ ・ サピエンス遺伝子。 G3 (Bethesda, Md.). Feb, 2012 | Pubmed ID: 22384401 パーソナライズされた医学: 遺伝子型および計算療法に向けての分子の表現型から。 Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing. 2012 | Pubmed ID: 22174287 相乗薬物ペアの系統的探査 Molecular Systems Biology. 2011 | Pubmed ID: 22068327 独立して病原性植物免疫ネットワークのハブにエフェクタを収束進化していません。 Science (New York, N.Y.). Jul, 2011 | Pubmed ID: 21798943 計算システム生物学による医薬品のターゲットを発見します。 The Journal of Biological Chemistry. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21566122 ゲノム解析では、分泌およびミトコンドリア遺伝子の5'UTRのイントロンと核内mRNAの輸出の間の相互作用を明らかに PLoS Genetics. Apr, 2011 | Pubmed ID: 21533221 次世代シーケンシング インタラクトーム データセットを生成します。 Nature Methods. Jun, 2011 | Pubmed ID: 21516116 出芽酵母のヒト RNA 干渉の再構成 Nucleic Acids Research. Apr, 2011 | Pubmed ID: 21252293 性的な品揃えと蛍光の選択のサイクル経由で多重遺伝子の冗長性をノックアウト Nature Methods. Feb, 2011 | Pubmed ID: 21217751 TDP 43 を含むリボ核蛋白質複合体の神経細胞 RNA 標的の同定 The Journal of Biological Chemistry. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21051541 キイロショウジョウバエのゲノム遺伝子機能予測リソースです。 PloS One. 2010 | Pubmed ID: 20711346 ひと血漿中の運動の代謝の署名。 Science Translational Medicine. May, 2010 | Pubmed ID: 20505214 FuncBase: 量的遺伝子機能アノテーションのためのリソース。 Bioinformatics (Oxford, England). Jul, 2010 | Pubmed ID: 20495000 MHC 依存型仲間選択プレゼンテーションにおけるハップマップ母集団内の証拠の不在。 PLoS Genetics. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20442868 人間 5 変換されない ' 地域イントロンのゲノム機能解析。 Genome Biology. 2010 | Pubmed ID: 20222956 サルモネラのタンデム インバージョン重複: 選択ドライブ不安定前駆体への最終的な変異型。 Genetics. May, 2010 | Pubmed ID: 20215473 公平な経路モデルを用いた代謝プロファイルを解釈します。 PLoS Computational Biology. Feb, 2010 | Pubmed ID: 20195502 多数の保存と発散のマイクロ Rna 単純ヘルペス ウイルスによって 1 と 2 を表明しました。 Journal of Virology. May, 2010 | Pubmed ID: 20181707 細胞の遺伝的景観 Science (New York, N.Y.). Jan, 2010 | Pubmed ID: 20093466 心の経路。 Circulation. Cardiovascular Genetics. Aug, 2009 | Pubmed ID: 20031600 プロアクティブな実験的定義線虫 ORFeome のための大規模レース アプローチ。 Genome Research. Dec, 2009 | Pubmed ID: 19801531 次世代のソフトウェア機能の動向を分析。 Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2009 | Pubmed ID: 19717575 ディープバーコードシーケンス経由で定量的な表現型 Genome Research. Oct, 2009 | Pubmed ID: 19622793 Q&A: エピスタシス。 Journal of Biology. 2009 | Pubmed ID: 19486505 経験的線虫線虫タンパク質インタラクトーム ネットワークのマッピングを制御します。 Nature Methods. Jan, 2009 | Pubmed ID: 19123269 文学のキュレーション タンパク質相互作用のデータセット。 Nature Methods. Jan, 2009 | Pubmed ID: 19116613 バイナリ インタラクトーム マッピングの経験的なフレームワーク。 Nature Methods. Jan, 2009 | Pubmed ID: 19060904 バイナリ蛋白質蛋白質の相互作用のための実験的派生信頼スコア。 Nature Methods. Jan, 2009 | Pubmed ID: 19060903 線虫ゲノム スケール マイクロ Rna ネットワークには複合フィードバック モチーフには高フラックス容量持つにはが含まれます。 Genes & Development. Sep, 2008 | Pubmed ID: 18794350 化学の生物学的活動を豊かにサブ構造体。 Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2008 | Pubmed ID: 18784118 計画的心筋梗塞を受ける個人からの血液の代謝物プロファイリング初期心筋傷害マーカーを明らかにします。 The Journal of Clinical Investigation. Oct, 2008 | Pubmed ID: 18769631 酵母インタラクトーム ネットワークの高品質のバイナリ蛋白質相互作用の地図。 Science (New York, N.Y.). Oct, 2008 | Pubmed ID: 18719252 遺伝子、タンパク質、生物の他の識別子を翻訳する Synergizer サービス。 Bioinformatics (Oxford, England). Oct, 2008 | Pubmed ID: 18697767 線虫の初期胚発生のタンパク質インタラクトーム ドメイン ベース ネットワーク。 Cell. Aug, 2008 | Pubmed ID: 18692475 ハツカネズミのためアン一斉表現型と機能予測システム。 Genome Biology. 2008 | Pubmed ID: 18613952 協会が罪悪感と罪悪感-によって-プロファイリング サッカロ ミセス酵母遺伝子機能予測するために組み合わせること。 Genome Biology. 2008 | Pubmed ID: 18613951 ハツカネズミ大腿遺伝子機能予測の統合ゲノム証拠を使用しての重要な評価。 Genome Biology. 2008 | Pubmed ID: 18613946 ゲノム証拠の迷路を介してのレース。 Genome Biology. 2008 | Pubmed ID: 18613945 ターゲットを絞ったクローニング、' 深井 ' をプーリングおよび並列シーケンスによるアイソ フォーム発見。 Nature Methods. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18552854 血漿プロテオミクス ベンチからベッドサイドへの翻訳の課題: 更新 NHLBI 臨床プロテオミクス プログラムから。 American Journal of Physiology. Lung Cellular and Molecular Physiology. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18456800 遺伝的相互作用を定義します。 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18305163 リボソームタンパク質の間で機能的特異性遺伝子発現を調節します。 Cell. Nov, 2007 | Pubmed ID: 17981122 組織モジュールで酵母インタラクトームの確認。 PLoS Biology. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17564493 In Vivo 時空間プロモーター活性線虫のゲノム スケール解析。 Nature Biotechnology. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17486083 遺伝的相互作用の画面を逆の順序で事前します。 Genes & Development. Jan, 2007 | Pubmed ID: 17234880 コンビナトリアル遺伝子欠失の高解像度フィットネスプロファイリングを用いた体系的なパスウェイ解析 Nature Genetics. Feb, 2007 | Pubmed ID: 17206143 哺乳類の Ultraconserved 要素は強く分節重複の間で枯渇しているし、番号の変形をコピーします。 Nature Genetics. Oct, 2006 | Pubmed ID: 16998490 体系的な遺伝学前方優雅に泳ぐ。 Molecular Systems Biology. 2006 | Pubmed ID: 16969340 高スループット スクリーニング データを使用して、化合物 1 つのターゲットの効果と副作用とのそれらから差別します。 Journal of Chemical Information and Modeling. Jul-Aug, 2006 | Pubmed ID: 16859287 クエリ ケム: テキストと化学構造を組み合わせて Google の Web 検索。 Bioinformatics (Oxford, England). Jul, 2006 | Pubmed ID: 16672261 心筋虚血の新規バイオ マーカーの同定メタボローム。 Circulation. Dec, 2005 | Pubmed ID: 16344383 チッパー: 分散安定化を用いたクロマチン免疫沈降マイクロ アレイからの転写因子のターゲットを発見します。 Genome Biology. 2005 | Pubmed ID: 16277751 人間蛋白質蛋白質の相互作用ネットワークのプロテオーム スケール マップに向かって。 Nature. Oct, 2005 | Pubmed ID: 16189514 予測モデル線虫線虫の初期胚発生に関与する分子機械の。 Nature. Aug, 2005 | Pubmed ID: 16094371 Sko1 標的プロモータのゲノムワイド同定出芽酵母における浸透圧ストレスに応答して動作する規制ネットワークを明らかにします。 Eukaryotic Cell. Aug, 2005 | Pubmed ID: 16087739 遺伝子転写補償出芽酵母遺伝子の堅牢性を維持するためのマイナーな役割を果たしています。 Genetics. Oct, 2005 | Pubmed ID: 15998714 機能的な関係を発見: 生化学遺伝学対。 Trends in Genetics : TIG. Aug, 2005 | Pubmed ID: 15982781 主題マップ統合サッカロ ミセス酵母相互作用ネットワークのモチーフやテーマ。 Journal of Biology. 2005 | Pubmed ID: 15982408 遺伝子相互作用を予測する生物学的ネットワークを組み合わせること。 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Nov, 2004 | Pubmed ID: 15496468 動的に組織化されたモジュール性酵母のタンパク質相互作用ネットワークのための証拠。 Nature. Jul, 2004 | Pubmed ID: 15190252 キイロショウジョウバエと D.pseudoobscura のサブシーケンス プロファイリング ・比較ゲノミクスによってシス調節モジュールを同様に演技の予測。 Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2004 | Pubmed ID: 15145800 銀役立ちます割り当てるペプチド タンデム質量スペクトル強度に基づいて採点を使うには。 Journal of the American Society for Mass Spectrometry. Jun, 2004 | Pubmed ID: 15144981 確率的ネットワークの信頼性を使用して蛋白質複雑なメンバーシップを予測します。 Genome Research. Jun, 2004 | Pubmed ID: 15140827 ゲノムを用いた Co 複合体タンパク質のペアとプロテオミクス データ統合を予測します。 BMC Bioinformatics. Apr, 2004 | Pubmed ID: 15090078 酵母の遺伝的相互作用ネットワークのグローバル マッピング。 Science (New York, N.Y.). Feb, 2004 | Pubmed ID: 14764870 タンデム質量スペクトルの強度に基づくタンパク質同定ライブラリから機械学習を用いた。 Nature Biotechnology. Feb, 2004 | Pubmed ID: 14730315 後生動物の線虫のインタラクトーム ネットワークの地図。 Science (New York, N.Y.). Jan, 2004 | Pubmed ID: 14704431 遺伝子を特徴づける FuncAssociate を設定します。 Bioinformatics (Oxford, England). Dec, 2003 | Pubmed ID: 14668247 転写因子結合部位の非パラメトリック モデル。 Nucleic Acids Research. Oct, 2003 | Pubmed ID: 14500844 潜在単純ヘルペス ウイルス感染感覚ニューロンの神経細胞の遺伝子発現を変更します。 Journal of Virology. Sep, 2003 | Pubmed ID: 12915567 表現型の注釈のパターンから予測します。 Bioinformatics (Oxford, England). 2003 | Pubmed ID: 12855456 一般的な突然変異率を規制する: Hypermutable 状態モデル Cairnsian 適応的突然変異のための検討。 Genetics. Apr, 2003 | Pubmed ID: 12702691 遺伝子機能アノテーションのパターンから予測します。 Genome Research. May, 2003 | Pubmed ID: 12695322 GoFish 遺伝子の遺伝子の Ontology の組み合わせと属性を検索します。 Bioinformatics (Oxford, England). Apr, 2003 | Pubmed ID: 12691998 実験的に評価する小さな世界の相互作用を派生します。 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2003 | Pubmed ID: 12676999 質遺伝子の遺伝子アノテーションを使用して式に基づくクラスタ リング手法を判断します。 Genome Research. Oct, 2002 | Pubmed ID: 12368250 Rsc9 のゲノム広い局在、コンポーネント、RSC クロマチン再構築複合体のストレス反応の変化。 Molecular Cell. Mar, 2002 | Pubmed ID: 11931764 複数の遺伝子欠失を持つ酵母菌株の世代のためのグリーンモンスタープロセス Yo Suzuki1, Jason Stam1, Mark Novotny2, Nozomu Yachie3, Roger S. Lasken2, Frederick P. Roth3,4 1Department of Synthetic Biology and Bioenergy, J. Craig Venter Institute, 2Department of Microbial and Environmental Genomics, J. Craig Venter Institute, 3Donnelly Centre & Department of Molecular Genetics, University of Toronto, 4Lunenfeld Research Institute, Mt Sinai Hospital JoVE 4072 Biology
複数の遺伝子欠失を持つ酵母菌株の世代のためのグリーンモンスタープロセス Yo Suzuki1, Jason Stam1, Mark Novotny2, Nozomu Yachie3, Roger S. Lasken2, Frederick P. Roth3,4 1Department of Synthetic Biology and Bioenergy, J. Craig Venter Institute, 2Department of Microbial and Environmental Genomics, J. Craig Venter Institute, 3Donnelly Centre & Department of Molecular Genetics, University of Toronto, 4Lunenfeld Research Institute, Mt Sinai Hospital JoVE 4072 Biology