Michael Q. Zhang Computational Biology and Bioinformatics Cold Spring Harbor Laboratory Biography Publications Institution JoVE Articles Michael Q. Zhang has not added a biography. If you are Michael Q. Zhang and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications 소설 Foxo1 종속 Transcriptional 프로그램 T(reg) 셀 기능을 제어 합니다 Nature. Nov, 2012 | Pubmed ID: 23135404 Caenorhabditis Elegans Ribosomal 단백질 유전자의 요소를 규정 합니다 BMC Genomics. Aug, 2012 | Pubmed ID: 22928635 바인딩 단백질-DNA와 히스톤 수정 칩-seq 데이터로 베이지안 지점 변경 방법으로 게놈 전체 지역화 PLoS Computational Biology. Jul, 2012 | Pubmed ID: 22844240 Chromatin 상태와 MicroRNA 다른 유전자 식 역학 TNF 자극 반응 결정 Genomics. Jul, 2012 | Pubmed ID: 22824656 Bivalent 같은 Chromatin 마커는 인간의 전사 시작 사이트 배포에 대 한 예측 PloS One. 2012 | Pubmed ID: 22768038 Jarid1a 및 Jarid1b H3K4 Demethylation Retinoblastoma 중재 유전자 세포 노화는 동안 침묵에 기여 한다 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jun, 2012 | Pubmed ID: 22615382 쥐의 뇌에서 프로필 Microrna의 셀 형식 기반 분석 Neuron. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22243745 칩 칩 칩 Seq 데이터 위치 정보를 사용 하 여 매우 효율적이 고 효과적인 주제 검색 방법 Nucleic Acids Research. Apr, 2012 | Pubmed ID: 22228832 유도 Pluripotency의 소설 마르코프 모델 프로그래밍의 진 식 변화를 전망 했다 BMC Systems Biology. Dec, 2011 | Pubmed ID: 22784579 불확실성과 높은 처리량 데이터에서 복사본 번호 유사의 Haplotypes 유추 G3 (Bethesda, Md.). Jun, 2011 | Pubmed ID: 22384316 소설 안 드로 겐을 레 귤 레이트 된 경로 및 MRNA Isoforms 게놈 넓은 Exon 특정 LNCaP Transcriptome의 프로 파일링을 통해 식별 합니다 PloS One. 2011 | Pubmed ID: 22194994 종양 진압 및 난소 암에서 게놈 및 Epigenetic 기능에서 Oncogenes 식별 합니다 PloS One. 2011 | Pubmed ID: 22174824 EpiRegNet: 인 간에 대 한 높은 처리량 유전자 표현 데이터에서 Epigenetic 규제 네트워크 구축 Epigenetics : Official Journal of the DNA Methylation Society. Dec, 2011 | Pubmed ID: 22139581 자동 유전자에서 FoxA 개척자 요소의 연구 결과 밝혀 Cdx2에서 Rfx 억압 증강 및 식도 선 암 발전의 잠재적인 표시기 PLoS Genetics. Sep, 2011 | Pubmed ID: 21935353 SpliceTrap: 단일 세포 조건 하에서 대체 접합 계량 메서드 Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2011 | Pubmed ID: 21896509 전사 인자 바인딩 사이트의 상호 관련 된 진화 Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2011 | Pubmed ID: 21896508 더블-좌초 RNAs RNase 보호 분석에서의 직접 복제 C/D 상자 Snornas의 처리 패턴을 보여 하 고 광범위 하 게 센스 대 본 식에 대 한 증거를 제공 합니다 Nucleic Acids Research. Dec, 2011 | Pubmed ID: 21880592 SMAC/디아블로, 인코딩 미토 콘 드리 아 Proapoptotic 단백질의 기능 돌연변이 인간 진보적인 청력 손실 DFNA64 발생 합니다 American Journal of Human Genetics. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21722859 칩 어레이: 녹음 방송 요인의 직접/간접 대상을 발견 Seq/칩 및 Microarray 유전자 표현 데이터의 조합 분석 Nucleic Acids Research. Jul, 2011 | Pubmed ID: 21586587 히스톤 수정 프로필은 조직/세포 형 단백질 코딩 및 MicroRNA 유전자의 특정 표현에 대 한 예측 BMC Bioinformatics. 2011 | Pubmed ID: 21569556 프로필 DNA 메 틸 화 및 Monoallelic Epigenetic 수정 식별에 시퀀싱 기반 방법의 비교 Nature Biotechnology. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20852635 긴 핵 유지 비 코딩 RNA 유전자 발현을 변조 하 여 Synaptogenesis를 규제 한다 The EMBO Journal. Sep, 2010 | Pubmed ID: 20729808 인간의 암 MicroRNA 네트워크의 개발입니다 Silence. 2010 | Pubmed ID: 20226080 Transcriptome 초기 조-성취, 도전 및 새로운 기회에 대 한 연구 Journal of Cellular Physiology. Jun, 2010 | Pubmed ID: 20143329 SFSSClass: Mirna에 대 한 통합된 된 접근 방식을 종양 분류를 기반 으로합니다 BMC Bioinformatics. 2010 | Pubmed ID: 20122194 RMAP 짧은 읽기 매핑 소프트웨어를 업데이트 합니다 Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2009 | Pubmed ID: 19736251 고화질 포유류 DNA 메 틸 화 배열 캡처 및 단일 분자 황산 시퀀싱 하 여 프로 파일링 합니다 Genome Research. Sep, 2009 | Pubmed ID: 19581485 통합 유전체학 접근 식별 Hypoxia 유도할 수 있는 요인 1 (HIF 1)-코어 응답 Hypoxia 형성 하는 유전자를 대상 Nucleic Acids Research. Aug, 2009 | Pubmed ID: 19491311 인간의 CD34 + 조 혈 줄기 뿌리 세포의 Transcriptome Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. May, 2009 | Pubmed ID: 19416867 인간 게놈의 비 Genic 부분에서 농축된 히스톤 수정 결정 BMC Genomics. 2009 | Pubmed ID: 19335899 유 방 암 Transcriptome 유전자 집합 기반 모듈 발견 BMC Bioinformatics. 2009 | Pubmed ID: 19243633 일곱 번째 아시아 태평양 생물 정보학 회의 (APBC2009) BMC Bioinformatics. 2009 | Pubmed ID: 19208108 C57/b 6 마우스 간 개발에서 유전자 표현과 전사 조절의 다단계 분석 Genomics. Mar, 2009 | Pubmed ID: 19015022 Coreboost_hm와 고해상도 인간의 핵심 발기인 예측입니다 Genome Research. Feb, 2009 | Pubmed ID: 18997002 유방암 세포의 Transcriptional 규제 프로그램의 통합 생물 정보학 분석 BMC Bioinformatics. 2008 | Pubmed ID: 18823535 폭스 1과 폭스-2 조직 특정 접합 요인의 규제 네트워크를 정의합니다 Genes & Development. Sep, 2008 | Pubmed ID: 18794351 확대/축소! 인터랙티브한 Oligos 매핑됩니다 Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2008 | Pubmed ID: 18684737 Rb E2F1 복잡 하 여 PDK4 Isozyme의 규제 The Journal of Biological Chemistry. Oct, 2008 | Pubmed ID: 18667418 폴 리-성적표 헬러 세포 단위로입니다 PloS One. 2008 | Pubmed ID: 18665230 히스톤 메 틸 화 마크 CpG 섬의 메 틸 화 상태를 예측에 중요 한 역할을 합니다 Biochemical and Biophysical Research Communications. Sep, 2008 | Pubmed ID: 18656446 히스톤 Acetylations 및 인간 게놈에는 Methylations의 조합 패턴 Nature Genetics. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18552846 Drosophila Pumilio의 시 냅 스 대상의 Id입니다 PLoS Computational Biology. Feb, 2008 | Pubmed ID: 18463699 네트워크 기반 인간 질병 유전자의 글로벌 유추 Molecular Systems Biology. 2008 | Pubmed ID: 18463613 최적의 Exon과 Intron 차별에 대 한 진화의 RNA 풍경 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2008 | Pubmed ID: 18391195 CD36 종속 레 귤 레이 션의 근육 FoxO1 및 PDK4 PPAR 델타/베타 중재 적응 대사 스트레스를 The Journal of Biological Chemistry. May, 2008 | Pubmed ID: 18308721 품질 평가 점수를 사용 하 여 더 이상 읽기 Solexa 매핑 읽기의 정확성을 향상 시킵니다 BMC Bioinformatics. 2008 | Pubmed ID: 18307793 Genome Research. May, 2008 | Pubmed ID: 18292219 열 충격 단백질 90beta1 불포화 지방산 유도 미토 콘 드리 아 Ca2 + 경과 대 한 필수적입니다 The Journal of Biological Chemistry. Mar, 2008 | Pubmed ID: 18178560 Adipogenesis의 Transcriptional 레 귤 레이 터는 인터페론 규제 요소입니다 Cell Metabolism. Jan, 2008 | Pubmed ID: 18177728 게놈 전체 매핑 및 마우스 배아 줄기 세포와 성인 장기의 활성 발기인의 분석 Genome Research. Jan, 2008 | Pubmed ID: 18042645 12 Drosophila 종에 걸쳐 Phylogenetically 보존된 MicroRNA Cis 규정 요소 식별 Bioinformatics (Oxford, England). Jan, 2008 | Pubmed ID: 18037683 Putative Zinc Finger Protein Binding Sites Are Over-represented in the Boundaries of Methylation-resistant CpG Islands in the Human Genome PloS One. 2007 | Pubmed ID: 18030324 전사의 예측 사이트 AMOSA을 사용 하 여 기능 선택에 따라 시작 합니다 Computational Systems Bioinformatics / Life Sciences Society. Computational Systems Bioinformatics Conference. 2007 | Pubmed ID: 17951823 오스카: 1 클래스 SVM Cis-요소의 정확한 인식에 대 한 Bioinformatics (Oxford, England). Nov, 2007 | Pubmed ID: 17921174 진 핵 발기인의 전산 분석입니다 BMC Bioinformatics. 2007 | Pubmed ID: 17903284 머리 여 포에서 줄기 세포 인구의 신경 잠재력 Cell Cycle (Georgetown, Tex.). Sep, 2007 | Pubmed ID: 17873521 이중 특이성 또는 5'과 3' 스플라이스 사이트 사이트 함수를 결합 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Sep, 2007 | Pubmed ID: 17848517 제한 된 접합 충실도 포유류 유전자의 진화에 미치는 영향 Trends in Genetics : TIG. Oct, 2007 | Pubmed ID: 17719121 고도로 보존된 규제 요소 Zebrafish GATA 2 조 혈 표현의 제어합니다 BMC Developmental Biology. 2007 | Pubmed ID: 17708765 유전자 조절의 예측 모델: Microarray 데이터를 회귀 방법의 응용 프로그램 Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2007 | Pubmed ID: 17634611 인간 게놈의 척추 절연체 단백질 CTCF 바인딩 사이트의 분석 Cell. Mar, 2007 | Pubmed ID: 17382889 여성 번째 Dicer에 대 한 중요 한 역할입니다 Genes & Development. Mar, 2007 | Pubmed ID: 17369401 증폭 녹음 시작 사이트를 예측 하기 위해 젊고 아름 다운 여자와 Genome Biology. 2007 | Pubmed ID: 17274821 Cis 규정 모듈의 통계적 의미입니다 BMC Bioinformatics. 2007 | Pubmed ID: 17241466 DNA 모티프에 대 한 정확한 P 값을 계산 합니다 Bioinformatics (Oxford, England). Mar, 2007 | Pubmed ID: 17237046 포유류 발기인 조직 관련 규제 요소입니다 Molecular Systems Biology. 2007 | Pubmed ID: 17224917 폐 Transcriptional 네트워크의 소설 구성 요소 계산 예측 Bioinformatics (Oxford, England). Jan, 2007 | Pubmed ID: 17050569 세이 지 태그를 사용 하 여 낮은 풍부한 녹취 록의 팬 게놈 격리 FEBS Letters. Dec, 2006 | Pubmed ID: 17113583 인간의 재조합 핫스팟와 햅 맵 인코딩 데이터에 응용 프로그램을 탐지 하기 위한 새로운 방법 American Journal of Human Genetics. Oct, 2006 | Pubmed ID: 16960799 인간의 두뇌에 CpG 섬의 메 틸 화 상태를 예측 합니다 Bioinformatics (Oxford, England). Sep, 2006 | Pubmed ID: 16837523 SF2/ASF 관련 Exonic 접합 증강의 예측에 대 한 증가 한 특이성 점수 행렬 Human Molecular Genetics. Aug, 2006 | Pubmed ID: 16825284 인간의 게놈 시퀀스에서 메 틸 화 상태 계산 예측 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jul, 2006 | Pubmed ID: 16818882 모양이 순응적으로 인간의 Transcriptional 서브 유추 Molecular Systems Biology. 2006 | Pubmed ID: 16760900 소스의 RNase R 소화 세포질 RNA 고리 및 사전 MRNA 접합에서 원형 RNAs 구성 된 특성화 Nucleic Acids Research. 2006 | Pubmed ID: 16682442 포유류 게놈에 매우 타락 한 전사 인자 바인딩 사이트의 클러스터링 속성 Nucleic Acids Research. 2006 | Pubmed ID: 16670430 양자 택일로 접합된 MRNA Isoforms 전립선 암 분류에 대 한 프로 파일링 BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 16608523 인간의 DNA 모티프와 마우스 인접 발기인 조직 관련 식 예측 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16606849 게놈 메 틸 화 패턴의 대규모 구조입니다 Genome Research. Feb, 2006 | Pubmed ID: 16365381 Corepromoter를 사용 하 여 인간의 핵심 발기인을 찾을 수 있습니다 Current Protocols in Bioinformatics / Editoral Board, Andreas D. Baxevanis ... [et Al.]. Jul, 2005 | Pubmed ID: 18428749 RNA 핵 보유를 통해 유전자 발현 조절 Cell. Oct, 2005 | Pubmed ID: 16239143 SR 단백질 Exonic 접합 증강 모티프의 인간 단백질 코딩 유전자에 대 한 배포 Nucleic Acids Research. 2005 | Pubmed ID: 16147989 게놈 넓은 발기인 추출 및 인간 분석, 마우스 및 쥐 Genome Biology. 2005 | Pubmed ID: 16086854 녹음 방송 요인 및 공동 인자 바인딩 사이트에 대 한 칩 데이터 마이닝 Bioinformatics (Oxford, England). Jun, 2005 | Pubmed ID: 15961485 척추 발기인에 조직을 선택적 전사 인자 바인딩 사이트를 식별 합니다 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2005 | Pubmed ID: 15668401 인 간에 게 웜으로부터: 생물 정보학 FOXO 대상 유전자 식별 방법 Mechanisms of Ageing and Development. Jan, 2005 | Pubmed ID: 15610780 했으나: Transcriptional 규제 요소 데이터베이스와 Silico 유전자 규제 연구에 대 한 플랫폼 Nucleic Acids Research. Jan, 2005 | Pubmed ID: 15608156 DWE: 단어 열거자 차별 Bioinformatics (Oxford, England). Jan, 2005 | Pubmed ID: 15333453 전사 인자 바인딩 사이트 위치 주파수 매트릭스의 유사성 Bioinformatics (Oxford, England). Feb, 2005 | Pubmed ID: 15319260 마우스 게놈: 실험적인 시험 그리고 Transcriptional 유전자 예측의 사이트를 시작 합니다 Genome Research. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15574821 협동 유전자 조절의 상호 작용 모델입니다 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Nov, 2004 | Pubmed ID: 15534222 게놈 전체 예측 및 분석 기능 특정 전사 인자 바인딩 사이트의 In Silico Biology. 2004 | Pubmed ID: 15506990 증거와 상 인간의 알파 재조합 핫스팟의 특성 Human Molecular Genetics. Nov, 2004 | Pubmed ID: 15385449 녹음 방송 요인의 조합 규칙을 식별 하 고 바인딩 모티브 Genome Biology. 2004 | Pubmed ID: 15287978 전사 인자 바인딩 요소 탐지 돌연변이 식 데이터의 클러스터링 기능을 사용 하 여 Nucleic Acids Research. 2004 | Pubmed ID: 15115798 효 모의 세포 주기를 조절 하는 전사 인자 중 Cooperativity를 식별 Nucleic Acids Research. Dec, 2003 | Pubmed ID: 14627835 식물 게놈 DNA에 유전자를 찾을 컴퓨터 소프트웨어 Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2003 | Pubmed ID: 14501060 ESEfinder: Exonic 접합 강화를 식별 하는 웹 리소스 Nucleic Acids Research. Jul, 2003 | Pubmed ID: 12824367 C-Myc Burkitt의 림프 종 세포에 대 한 글로벌 Transcriptional 규제 역할 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Jul, 2003 | Pubmed ID: 12808131 두 개의 마우스 초안 유전자와 인간의 황금 경로 계산 비교 Genome Biology. 2003 | Pubmed ID: 12537546 Argonaute 가족: RNAi, 발달 제어, 줄기 세포 관리 및 Tumorigenesis에 도달 촉수 Genes & Development. Nov, 2002 | Pubmed ID: 12414724 E2f에 의해 세포 주기와 세포 죽음 기계 커플링을 직접 Nature Cell Biology. Nov, 2002 | Pubmed ID: 12389032 유전자 발현은 인간의 해 마 개발에서 프로 파일링입니다 Journal of Neuroscience Research. Oct, 2002 | Pubmed ID: 12271469 Microarrays에서 기능 정보를 추출: 기능 유전체학에 대 한 도전 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Oct, 2002 | Pubmed ID: 12271149 진 핵 단백질 코딩 유전자의 전산 예측입니다 Nature Reviews. Genetics. Sep, 2002 | Pubmed ID: 12209144 GFScan: 유전자 가족 검색 도구 Genomic DNA 수준에서 Genome Research. Jul, 2002 | Pubmed ID: 12097353 기능 유전체학으로 전사 규제 네트워크 매핑 적용 Current Opinion in Microbiology. Jun, 2002 | Pubmed ID: 12057687 다양한 ChIPseq 데이터 유형의 게놈 차원의 분석을위한 소설 베이지안 변경 - 포인트 알고리즘 Haipeng Xing1, Willey Liao1,2, Yifan Mo1,2, Michael Q. Zhang2,3 1Department of Applied Mathematics & Statistics, Stony Brook University, 2Computational Biology and Bioinformatics, Cold Spring Harbor Laboratory, 3Department of Molecular and Cell Biology, University of Texas at Dallas JoVE 4273 Biology
다양한 ChIPseq 데이터 유형의 게놈 차원의 분석을위한 소설 베이지안 변경 - 포인트 알고리즘 Haipeng Xing1, Willey Liao1,2, Yifan Mo1,2, Michael Q. Zhang2,3 1Department of Applied Mathematics & Statistics, Stony Brook University, 2Computational Biology and Bioinformatics, Cold Spring Harbor Laboratory, 3Department of Molecular and Cell Biology, University of Texas at Dallas JoVE 4273 Biology