Thomas Dandekar Department of Bioinformatics University Wuerzburg Biography Publications Institution JoVE Articles Thomas Dandekar has not added a biography. If you are Thomas Dandekar and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications Hacia Una Comprensión Sistémica De Listeria Monocytogenes Metabolismo Durante La Infección Frontiers in Microbiology. 2012 | Pubmed ID: 22347216 PlateletWeb: Un Análisis Biológico De Sistemas De Señalización De Redes En Plaquetas Humanas Blood. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22123846 Resuelta En El Tiempo En El Modelado De Silico De Afinarse Campamento Señalización En Plaquetas: Bucles De Retroalimentación, Valoradas Fosforilaciones Y Modulación Farmacológica BMC Systems Biology. 2011 | Pubmed ID: 22034949 Integración De Modelos Booleanos, Ejemplificado En La Transducción De La Señal Del Hepatocito Briefings in Bioinformatics. Oct, 2011 | Pubmed ID: 22016404 Limitaciones De Crecimiento Fisiológico De Staphylococcus Aureus: Perspectivas De Los Cálculos De Flujo Basados En Proteómica Y Datos Externos Metabolito Proteomics. May, 2011 | Pubmed ID: 21472852 Respuesta Inmune De La Hormiga Camponotus Floridanus Contra Patógenos Y Su Obligan Endosymbiont Mutualista Insect Biochemistry and Molecular Biology. Aug, 2011 | Pubmed ID: 21440063 Modelado Efectos Antibióticos Y Citotóxicos De La Isoquinolina Dimérico IQ-143 Sobre El Metabolismo Y Su Regulación En Staphylococcus Aureus, Staphylococcus Epidermidis Y Células Humanas Genome Biology. 2011 | Pubmed ID: 21418624 Un Metabolómica Y Proteómica Estudio De La Adaptación De Staphylococcus Aureus a La Inanición De Glucosa Molecular BioSystems. Apr, 2011 | Pubmed ID: 21327190 Quinasas De CDK-como Núcleo Localizadas Dos Con Papeles Cruciales Para Replicación Eritrocítica Del Parásito De La Malaria Están Involucradas En La Fosforilación Del Factor De Empalme Journal of Cellular Biochemistry. May, 2011 | Pubmed ID: 21312235 Unicelulares Genómica Revela El Estilo De Vida De Poribacteria, Filo Candidato Asociado Simbióticamente Con Esponjas Marinas The ISME Journal. Jan, 2011 | Pubmed ID: 20613790 Llevar La Expansión Y Proyección Virtual De Indinavir Inhibidores Derivados De Proteasa HIV-1 Con Pharmacophoric - Semejanza De Forma, Función De Puntuación Bioinformation. 2010 | Pubmed ID: 20978602 Tecnología De Microarrays De Alto Rendimiento En El Diagnóstico De Enterobacterias Basadas En Análisis De Selección Y Regresión De Sonda De Genoma BMC Genomics. 2010 | Pubmed ID: 20964857 Descifrando El Metabolismo Intracelular De Listeria Monocytogenes Por Mutante Detección Y Modelado BMC Genomics. 2010 | Pubmed ID: 20955543 Farmacogenómica Estrategias Contra Resistencias Microbianas: De Brillante a Albures a Innovadores Pharmacogenomics. Sep, 2010 | Pubmed ID: 20860457 Protege, Una Completo Y Potente De Almacenamiento Y Sistema De Análisis De Datos OMICS, Aplicado Para Perfilar La Respuesta De Anaerobiosis Del Estafilococo áureo COL Proteomics. Aug, 2010 | Pubmed ID: 20662099 Perfiles Del Desarrollo Mediante Espectrometría De Fosfocolina Que Contiene Fosfolípidos En El Sistema Nervioso De Rata Revela Gradientes Temporo-espaciales Journal of Neurochemistry. Aug, 2010 | Pubmed ID: 20524967 Metabolismo De Carbono De Patógenos Bacterianos Intracelulares Y Posibles Vínculos a La Virulencia Nature Reviews. Microbiology. Jun, 2010 | Pubmed ID: 20453875 Encuesta De Transcriptoma De La Tardigradum Anhydrobiotic De Milnesium Tardigrade En Comparación Con Hypsibius Dujardini Y Richtersius Coronifer BMC Genomics. 2010 | Pubmed ID: 20226016 Análisis Proteómico De Tardígrados: Hacia Una Mejor Comprensión De Los Mecanismos Moleculares Por Los Organismos Anhydrobiotic PloS One. 2010 | Pubmed ID: 20224743 El Paquete De Evaluación De IronChip: Un Conjunto De Módulos De Perl Para Análisis De Microarrays Personalizado BMC Bioinformatics. 2010 | Pubmed ID: 20193060 BioNet: Un R-paquete Para El Análisis Funcional De Redes Biológicas Bioinformatics (Oxford, England). Apr, 2010 | Pubmed ID: 20189939 Caracterización De Una Nueva Interacción Entre Fosfoproteína Estimulada Vasodilatador Y Abelson Interactor 1 En Plaquetas Humanas: Un Enfonque Computacional Y Experimental Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20110575 Incluidas Las Estructuras Secundarias Del ARN Mejora La Precisión Y Solidez En La Reconstrucción De árboles Filogenéticos Biology Direct. 2010 | Pubmed ID: 20078867 Subrayar La Respuesta En Tardígrados: Expresión Génica Diferencial De Chaperonas Moleculares Cell Stress & Chaperones. Jul, 2010 | Pubmed ID: 19943197 Modelización De La Cruz-la Hibridación En Microarrays De ADN Filogenéticos Aumenta El Poder De Detección De Especies Estrechamente Relacionadas Molecular Ecology Resources. Jan, 2009 | Pubmed ID: 21564570 JANE: Asignación Eficiente De ESTs Procariotas Y Secuencia De Longitud Variable Lee En Genomas Relacionados Con Plantilla BMC Bioinformatics. 2009 | Pubmed ID: 19943962 Banco De Trabajo Tardigrade: Comparando Las Proteínas Relacionadas Con El Estrés, Clústeres De Secuencia-similar Y Funcional De La Proteína Así Como Elementos De RNA En Tardígrados BMC Genomics. 2009 | Pubmed ID: 19821996 Modelado De Estados Del Sistema En Las Células Hepáticas: Supervivencia, Apoptosis Y Sus Modificaciones En Respuesta a La Infección Viral BMC Systems Biology. 2009 | Pubmed ID: 19772631 Virus Vaccinia Recombinantes Altamente Atenuada Oncolíticos GLV - 1 H 68: Características Genómicas Comparativas Y La Contribución De Inactivación F14.5L Molecular Genetics and Genomics : MGG. Oct, 2009 | Pubmed ID: 19701652 CA/C1 Peptidasas De Los Parásitos De La Malaria Plasmodium Falciparum Y P. Berghei Y Sus Huéspedes Mamíferos--un Análisis De Bioinformatical Biological Chemistry. Nov, 2009 | Pubmed ID: 19663681 Detección De Dependencias De Especies-sitio En Grandes Alineaciones Múltiples De La Secuencia Nucleic Acids Research. Oct, 2009 | Pubmed ID: 19661281 Bioinformatical Métodos Para Detectar Y Analizar Las Interacciones Proteína Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2009 | Pubmed ID: 19544036 Mecanismos Moleculares De La Tolerancia En Los Tardígrados: Nuevas Perspectivas Para La Conservación Y Estabilización De Material Biológico Biotechnology Advances. Jul-Aug, 2009 | Pubmed ID: 19472511 5.8S-28S RRNA Y La Interacción Basada En HMM-ITS2 Anotación Gene. Feb, 2009 | Pubmed ID: 19026726 Metanálisis No Supervisado En Conjuntos De Datos De Expresión Diversos Genes Permite Penetración En Función Del Gen Y La Regulación Bioinformatics and Biology Insights. 2008 | Pubmed ID: 19812781 Modelación De Redes De Lípidos Phagosomal Que Regulan La Asamblea De La Actina BMC Systems Biology. 2008 | Pubmed ID: 19061496 Nuevas Tendencias En Estrategias De Farmacogenómica Contra El Desarrollo De La Resistencia En Las Infecciones Microbianas Pharmacogenomics. Nov, 2008 | Pubmed ID: 19018725 Análisis Sincrónico Visual Y Edición De Secuencias De ARN Y Las Alineaciones Secundarias Estructura Mediante 4SALE BMC Research Notes. 2008 | Pubmed ID: 18854023 ProfDistS: (Perfil) Filogenia Distancia Basados en La Secuencia - Alineaciones Estructura Bioinformatics (Oxford, England). Oct, 2008 | Pubmed ID: 18723521 ITS2 Datos Corroboran Una Clorofícea Monofilético DO-grupo (Sphaeropleales) BMC Evolutionary Biology. 2008 | Pubmed ID: 18655698 Identificación De Módulos Funcionales En Redes De Interacción De Proteínas: Un Enfoque Integrado De La Exacto Bioinformatics (Oxford, England). Jul, 2008 | Pubmed ID: 18586718 El Cromosoma Linear Del Mycoplasma Fitopatógenas 'Candidatus Phytoplasma Mali' BMC Genomics. 2008 | Pubmed ID: 18582369 Interacciones Proteicas De Plaquetas: Mapa, Señalización Componentes Y Fosforilación Groundstate Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. Jul, 2008 | Pubmed ID: 18451328 Análisis Exploratorio De Datos De MCL Revelan Redes De Expresión De Genes Implicadas En La Supervivencia Y Pronóstico Apoyada Por Análisis Exploratorio De CGH BMC Cancer. 2008 | Pubmed ID: 18416826 Interacciones Del Azul De Metileno Con Reductasas Disulfuro Humana Y Sus Orthologues De Plasmodium Falciparum Antimicrobial Agents and Chemotherapy. Jan, 2008 | Pubmed ID: 17967916 La Base De Datos ITS2 II: Modelado Homología De La Estructura Del ARN De Sistemática Molecular Nucleic Acids Research. Jan, 2008 | Pubmed ID: 17933769 Uso De Plaquetas Humanas Altamente Purificadas Funcionales Para La Identificación De Nuevas Proteínas De La Vía De Señalización De IPP Thrombosis Research. 2008 | Pubmed ID: 17931695 ¿Exonization De Ratón Activo L1s: Un Conductor De La Evolución Del Transcriptoma? BMC Genomics. 2007 | Pubmed ID: 17963496 Reconstrucción De Red Integrada, Visualización Y Análisis Con YANAsquare BMC Bioinformatics. 2007 | Pubmed ID: 17725829 Profundo Filogenia Metazoos In Silico Biology. 2007 | Pubmed ID: 17688440 Distinguir Las Especies RNA (New York, N.Y.). Sep, 2007 | Pubmed ID: 17652131 Uso De Métodos De Vía Análisis Y Genoma De Contexto Para La Genómica Funcional Del Metabolismo De Nucleótidos De Mycoplasma Pneumoniae Gene. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17467928 An Integrated View of Gene Expression and Solute Profiles of Arabidopsis Tumors: a Genome-wide Approach The Plant Cell. Dec, 2006 | Pubmed ID: 17172353 4SALE - Una Herramienta Para La Secuencia De ARN Sincrónica Y Estructura Secundaria De Alineación Y Edición BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 17101042 Esquemas XML Para Tipos De Datos Comunes De Bioinformática Y Su Aplicación En Sistemas De Flujo De Trabajo BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 17087823 InGeno--un Genoma Integrado Y Ortólogo Visor Para Comparaciones De Genoma a Genoma Mejoradas BMC Bioinformatics. 2006 | Pubmed ID: 17054788 Modelado Sitios De Interacción En Los Dominios De La Proteína Con Interacción Perfil Modelos Ocultos De Markov Bioinformatics (Oxford, England). Dec, 2006 | Pubmed ID: 17000753 Un Applet De Java Para Explorar La Nueva Clasificación De Nivel Superior De Los Eucariotas, Con énfasis En La Taxonomía De Los Protistas The Journal of Eukaryotic Microbiology. Sep-Oct, 2006 | Pubmed ID: 16968448 Secuencia Del Genoma Completo De Listeria Welshimeri Revela Pasos Comunes En Reducción Del Genoma Con Listeria Innocua En Comparación Con Listeria Monocytogenes Journal of Bacteriology. Nov, 2006 | Pubmed ID: 16936040 La Interna Espaciador Transcrito 2 Base De Datos - Un Servidor Web Para (no Sólo) De Bajo Nivel De Análisis Filogenéticos Nucleic Acids Research. Jul, 2006 | Pubmed ID: 16845103 Reglamento Y El Ciclo Celular De Hierro: Identificación De Un Elemento Sensible Al Hierro En La Región Sin Traducir 3' De La División De Célula Humana Ciclo 14A MRNA Por Una Estrategia Refinada Proyección Basada En Microarreglos The Journal of Biological Chemistry. Aug, 2006 | Pubmed ID: 16760464 Alteraciones Lisosomales, Citoesqueleto Y Metabólicas En Cardiomiopatía De Ratones Knockout De Catepsina L FASEB Journal : Official Publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology. Jun, 2006 | Pubmed ID: 16636100 Mapeo Del Genoma De Integraciones De Vector De Virus Espumoso En Una Línea De Células Humanas The Journal of General Virology. May, 2006 | Pubmed ID: 16603537 Análisis De Datos SAGE En Plaquetas Humanas: Características De La Transcriptoma En Una Celda Anucleados Thrombosis and Haemostasis. Apr, 2006 | Pubmed ID: 16601835 RIP Interacciones Estructurales De Muerte Dominio Implicadas En La Supervivencia Y Proliferación De TNF-mediada Proteins. May, 2006 | Pubmed ID: 16470584 13 C Isotopólogo Estudios De Perturbación Del Metabolismo De Carbono De Listeria Monocytogenes Y Su Modulación Por El Regulador De Virulencia Superior Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Feb, 2006 | Pubmed ID: 16461909 Análisis De Y Predicciones De La Función De Proteínas Hipotéticas O Supuestas Previamente Conservadas En Blochmannia Floridanus BMC Microbiology. 2006 | Pubmed ID: 16401340 Plaquetas De Comprensión. Lecciones De Genómica, Proteómica Y Promesas De Análisis De Redes Thrombosis and Haemostasis. Nov, 2005 | Pubmed ID: 16363231 B-Raf Y Señalización Investigados En Un Modelo Simplificado De La Cascada De Mitógenos Quinasa C-Raf Biological Chemistry. Nov, 2005 | Pubmed ID: 16307482 Modelado De Homología Reveló Que Más De 20.000 Interno De ARNr Espaciador Transcrito 2 (ITS2) Estructuras Secundarias RNA (New York, N.Y.). Nov, 2005 | Pubmed ID: 16244129 CBCAnalyzer: Inferir Filogenias Basadas En Los Cambios De Base Compensatorias En Estructuras Secundarias Del ARN In Silico Biology. 2005 | Pubmed ID: 15996120 Metabolitos Y Flexibilidad De La Vía In Silico Biology. 2005 | Pubmed ID: 15972010 YANA - Una Herramienta De Software Para El Análisis De Modos De Flujo, Expresión Génica Y Las Actividades Enzimáticas BMC Bioinformatics. 2005 | Pubmed ID: 15929789 SU-2 Y Filogenia 18S RRNA Gen De Aplysinidae (Verongida, Demospongiae) Journal of Molecular Evolution. Mar, 2005 | Pubmed ID: 15871043 Los Esfuerzos Actuales En El Análisis De RNAi Y ARNi Objetivo Genes Briefings in Bioinformatics. Mar, 2005 | Pubmed ID: 15826358 ProfDist: Una Herramienta Para La Construcción De árboles Filogenéticos Basados en Distancias Grandes Perfil Bioinformatics (Oxford, England). May, 2005 | Pubmed ID: 15677706 L1Base: De Anotación Funcional a La Predicción De Los Elementos Activos De La Línea-1 Nucleic Acids Research. Jan, 2005 | Pubmed ID: 15608246 Interdependencia Metabólica De Bacterias Intracelulares Obligadas Y Sus Anfitriones Insectos Microbiology and Molecular Biology Reviews : MMBR. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15590782 ¿Los Componentes Compartidos De Complejos De La Proteína--versátiles Construcción De Bloques O Artefactos Bioquímicos? BioEssays : News and Reviews in Molecular, Cellular and Developmental Biology. Dec, 2004 | Pubmed ID: 15551274 Filogenia Precisa Y Robusta De Estimación Basada En Las Distancias Perfil: Un Estudio De La Chlorophyceae (Chlorophyta) BMC Evolutionary Biology. Jun, 2004 | Pubmed ID: 15222898 Riboswitch Buscador--una Herramienta Para La Identificación De Riboswitch RNAs Nucleic Acids Research. Jul, 2004 | Pubmed ID: 15215370 Farmacogenómica Estrategias Contra El Desarrollo De La Resistencia En Las Infecciones Microbianas Pharmacogenomics. Jun, 2004 | Pubmed ID: 15165173 Filogenia De Los Firmicutes, Con Especial Referencia a Micoplasma (Mollicutes) Según Se Desprende De Fosfoglicerato Quinasa De Datos De Secuencias De Aminoácidos International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. May, 2004 | Pubmed ID: 15143038 ¿Una Novela Conserva La Familia De La óxido Nítrico Sintasa? Trends in Biochemical Sciences. May, 2004 | Pubmed ID: 15130557 Mioglobina NO Enlazado: Diversidad Estructural Y Dinámica Del Ligando NO Journal of the American Chemical Society. Feb, 2004 | Pubmed ID: 14971914 Un Código Abierto Proteína Gel Sistema De Documentación Para El Análisis Del Proteoma Journal of Chemical Information and Computer Sciences. Jan-Feb, 2004 | Pubmed ID: 14741024 En Busca Del Prototipo De La óxido Nítrico Sintasa FEBS Letters. Nov, 2003 | Pubmed ID: 14596904 Un Método De Clasificación De Los Metabolitos En Análisis Vía Topológica Basados En La Minimización Del Número De La Vía Bio Systems. Aug, 2003 | Pubmed ID: 12941488 Hacia La Predicción De Sitio Informático Escote De Endopeptidasas De Cisteína Biological Chemistry. Jun, 2003 | Pubmed ID: 12887057 ¿Metabolitos: Una Mano Amiga Para La Evolución De La Vía? Trends in Biochemical Sciences. Jun, 2003 | Pubmed ID: 12826406 Una Software-caja De Herramientas Para El Análisis De Elementos Reguladores De RNA Nucleic Acids Research. Jul, 2003 | Pubmed ID: 12824342 Sospecha De Utilidad De Enzimas Con Múltiples Actividades En El Genoma Pequeña Especies De Micoplasma: La Sustitución Del Gen De Falta "hogar" Nucleósido Difosfato Y Actividad Por Cinasas Glicolíticas Omics : a Journal of Integrative Biology. 2002 | Pubmed ID: 12427276 Reconstrucción De Vía Como Análisis De Genómica Comparativa Pharmacogenomics. Mar, 2002 | Pubmed ID: 11972445 Un Servidor De Análisis Versátil Dominio Estructural Utilizando Matrices De Peso Del Perfil Journal of Chemical Information and Computer Sciences. Mar-Apr, 2002 | Pubmed ID: 11911710 Un Tejido Combinada 3D Diseñado Claudia Göttlich*1, Lena C. Müller*1, Meik Kunz*3, Franziska Schmitt1, Heike Walles1,4, Thorsten Walles2, Thomas Dandekar3, Gudrun Dandekar1,4, Sarah L. Nietzer1 1Department of Tissue Engineering and Regenerative Medicine (TERM), University Hospital Wuerzburg, 2Department of Cardiothoracic Surgery, University Hospital Wuerzburg, 3Department of Bioinformatics, University Wuerzburg, 4Translational Center Wuerzburg, Fraunhofer Institute Interfacial Engineering and Biotechnology IGB Bioengineering La base de datos ITS2 Benjamin Merget1,2, Christian Koetschan1, Thomas Hackl1, Frank Förster1, Thomas Dandekar1, Tobias Müller1, Jörg Schultz1, Matthias Wolf1 1Department of Bioinformatics, Biocenter, University of Würzburg, 2Institute of Pharmacy and Food Chemistry, University of Würzburg JoVE 3806 Biology
Un Tejido Combinada 3D Diseñado Claudia Göttlich*1, Lena C. Müller*1, Meik Kunz*3, Franziska Schmitt1, Heike Walles1,4, Thorsten Walles2, Thomas Dandekar3, Gudrun Dandekar1,4, Sarah L. Nietzer1 1Department of Tissue Engineering and Regenerative Medicine (TERM), University Hospital Wuerzburg, 2Department of Cardiothoracic Surgery, University Hospital Wuerzburg, 3Department of Bioinformatics, University Wuerzburg, 4Translational Center Wuerzburg, Fraunhofer Institute Interfacial Engineering and Biotechnology IGB Bioengineering
La base de datos ITS2 Benjamin Merget1,2, Christian Koetschan1, Thomas Hackl1, Frank Förster1, Thomas Dandekar1, Tobias Müller1, Jörg Schultz1, Matthias Wolf1 1Department of Bioinformatics, Biocenter, University of Würzburg, 2Institute of Pharmacy and Food Chemistry, University of Würzburg JoVE 3806 Biology