Vitali Sintchenko Centre for Infectious Diseases and Microbiology-Public Health Westmead Hospital Biography Publications Institution JoVE Articles Vitali Sintchenko has not added a biography. If you are Vitali Sintchenko and would like to personalize this page please email our Author Liaison for assistance. Publications Genome Sequencing Links Persistent Outbreak of Legionellosis in Sydney to an Emerging Clone of Legionella Pneumophila ST211 Applied and Environmental Microbiology. Dec, 2017 | Pubmed ID: 29247056 Comparative Genomics of Australian and International Isolates of Salmonella Typhimurium: Correlation of Core Genome Evolution with CRISPR and Prophage Profiles Scientific Reports. Aug, 2017 | Pubmed ID: 28851865 Drug Resistance and Mycobacterium Tuberculosis Strain Diversity in TB/HIV Co-infected Patients in Ho Chi Minh City, Vietnam Journal of Global Antimicrobial Resistance. Sep, 2017 | Pubmed ID: 28743648 Francisella Tularensis Ssp. Holarctica in Ringtail Possums, Australia Emerging Infectious Diseases. 07, 2017 | Pubmed ID: 28628459 Genomic Heterogeneity of Salmonella Enterica Serovar Typhimurium Bacteriuria from Chronic Infection Infection, Genetics and Evolution : Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases. Jul, 2017 | Pubmed ID: 28279807 Characterisation of the Bordetella Pertussis Secretome Under Different Media Journal of Proteomics. Mar, 2017 | Pubmed ID: 28242451 Evolution of Variable Number Tandem Repeats and Its Relationship with Genomic Diversity in Salmonella Typhimurium Frontiers in Microbiology. 2016 | Pubmed ID: 28082952 Transmission of Multi-drug Resistant Tuberculosis in Mongolia is Driven by Beijing Strains of Mycobacterium Tuberculosis Resistant to All First-line Drugs Tuberculosis (Edinburgh, Scotland). Dec, 2016 | Pubmed ID: 27865397 16S-23S Internal Transcribed Spacer Region PCR and Sequencer-Based Capillary Gel Electrophoresis Has Potential As an Alternative to High Performance Liquid Chromatography for Identification of Slowly Growing Nontuberculous Mycobacteria PloS One. 2016 | Pubmed ID: 27749897 Whole Genome Sequencing Demonstrates Limited Transmission Within Identified Mycobacterium Tuberculosis Clusters in New South Wales, Australia PloS One. 2016 | Pubmed ID: 27737005 SnpFilt: A Pipeline for Reference-free Assembly-based Identification of SNPs in Bacterial Genomes Computational Biology and Chemistry. 12, 2016 | Pubmed ID: 27647159 Whole Genome Sequencing of Salmonella Typhimurium Illuminates Distinct Outbreaks Caused by an Endemic Multi-locus Variable Number Tandem Repeat Analysis Type in Australia, 2014 BMC Microbiology. Sep, 2016 | Pubmed ID: 27629541 Better Colonisation of Newly Emerged Bordetella Pertussis in the Co-infection Mouse Model Study Vaccine. 07, 2016 | Pubmed ID: 27346304 Nontoxic Metal-Cyclam Complexes, a New Class of Compounds with Potency Against Drug-Resistant Mycobacterium Tuberculosis Journal of Medicinal Chemistry. Jun, 2016 | Pubmed ID: 27214150 DfrA ThyA Double Deletion in Para-Aminosalicylic Acid-Resistant Mycobacterium Tuberculosis Beijing Strains Antimicrobial Agents and Chemotherapy. Jun, 2016 | Pubmed ID: 27021327 Concordance of Four Commercial Enzyme Immunoassay and Three Immunoblot Formats for the Detection of Lyme Borreliosis Antibodies in Human Serum: the Two-tier Approach Remains Pathology. Apr, 2016 | Pubmed ID: 27020501 Identifying Likely Transmission Pathways Within a 10-Year Community Outbreak of Tuberculosis by High-Depth Whole Genome Sequencing PloS One. 2016 | Pubmed ID: 26938641 Genomic Dissection of Australian Bordetella Pertussis Isolates from the 2008-2012 Epidemic The Journal of Infection. Apr, 2016 | Pubmed ID: 26826518 Genotype Heterogeneity of Mycobacterium Tuberculosis Within Geospatial Hotspots Suggests Foci of Imported Infection in Sydney, Australia Infection, Genetics and Evolution : Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases. 06, 2016 | Pubmed ID: 26187743 Antibiotic Susceptibility of Diverse Mycobacterium Abscessus Complex Strains in New South Wales, Australia Pathology. Dec, 2015 | Pubmed ID: 26517625 Pertactin Negative Bordetella Pertussis Demonstrates Higher Fitness Under Vaccine Selection Pressure in a Mixed Infection Model Vaccine. Nov, 2015 | Pubmed ID: 26432908 It Is Not All About Single Nucleotide Polymorphisms: Comparison of Mobile Genetic Elements and Deletions in Listeria Monocytogenes Genomes Links Cases of Hospital-Acquired Listeriosis to the Environmental Source Journal of Clinical Microbiology. Nov, 2015 | Pubmed ID: 26311854 Genomic Variability of Serial Human Isolates of Salmonella Enterica Serovar Typhimurium Associated with Prolonged Carriage Journal of Clinical Microbiology. Nov, 2015 | Pubmed ID: 26311853 Epidemiology of Peripheral Lymph Node Tuberculosis and Genotyping of M. Tuberculosis Strains: A Case-Control Study PloS One. 2015 | Pubmed ID: 26177546 Editorial: Laboratory Preparedness for Ebolavirus Disease Pathology. Aug, 2015 | Pubmed ID: 26126052 Genomic Epidemiology of Clostridium Botulinum Isolates from Temporally Related Cases of Infant Botulism in New South Wales, Australia Journal of Clinical Microbiology. Sep, 2015 | Pubmed ID: 26109442 Defining the Core Genome of Salmonella Enterica Serovar Typhimurium for Genomic Surveillance and Epidemiological Typing Journal of Clinical Microbiology. Aug, 2015 | Pubmed ID: 26019201 Genome Sequencing Reveals Novel Deletions Associated with Secondary Resistance to Pyrazinamide in MDR Mycobacterium Tuberculosis The Journal of Antimicrobial Chemotherapy. Sep, 2015 | Pubmed ID: 25977398 The Role of Pathogen Genomics in Assessing Disease Transmission BMJ (Clinical Research Ed.). May, 2015 | Pubmed ID: 25964672 Intercontinental Dissemination of Azithromycin-resistant Shigellosis Through Sexual Transmission: a Cross-sectional Study The Lancet. Infectious Diseases. Aug, 2015 | Pubmed ID: 25936611 Proficiency Testing for Bacterial Whole Genome Sequencing: an End-user Survey of Current Capabilities, Requirements and Priorities BMC Infectious Diseases. Apr, 2015 | Pubmed ID: 25887164 Delineating Community Outbreaks of Salmonella Enterica Serovar Typhimurium by Use of Whole-genome Sequencing: Insights into Genomic Variability Within an Outbreak Journal of Clinical Microbiology. Apr, 2015 | Pubmed ID: 25609719 Added Value of Whole-genome Sequencing for Management of Highly Drug-resistant TB The Journal of Antimicrobial Chemotherapy. Apr, 2015 | Pubmed ID: 25492392 Investigating Genome Reduction of Bordetella Pertussis Using a Multiplex PCR-based Reverse Line Blot Assay (mPCR/RLB) BMC Research Notes. Oct, 2014 | Pubmed ID: 25319278 Clinical Microbiology Informatics Clinical Microbiology Reviews. Oct, 2014 | Pubmed ID: 25278581 Temporal Dynamics of Mycobacterium Tuberculosis Genotypes in New South Wales, Australia BMC Infectious Diseases. Aug, 2014 | Pubmed ID: 25149181 Fluoroquinolone Resistance in Non-multidrug-resistant Tuberculosis-a Surveillance Study in New South Wales, Australia, and a Review of Global Resistance Rates International Journal of Infectious Diseases : IJID : Official Publication of the International Society for Infectious Diseases. Sep, 2014 | Pubmed ID: 25086437 Use of the 5' Untranslated Region and VP1 Region to Examine the Molecular Diversity in Enterovirus B Species Journal of Medical Microbiology. Oct, 2014 | Pubmed ID: 25038138 Improved Identification of Rapidly Growing Mycobacteria by a 16S-23S Internal Transcribed Spacer Region PCR and Capillary Gel Electrophoresis PloS One. 2014 | Pubmed ID: 25013955 Pathogen Genome Bioinformatics Methods in Molecular Biology (Clifton, N.J.). 2014 | Pubmed ID: 24870136 Rapid Increase in Pertactin-deficient Bordetella Pertussis Isolates, Australia Emerging Infectious Diseases. Apr, 2014 | Pubmed ID: 24655754 Potent Antimycobacterial Activity of the Pyridoxal Isonicotinoyl Hydrazone Analog 2-pyridylcarboxaldehyde Isonicotinoyl Hydrazone: a Lipophilic Transport Vehicle for Isonicotinic Acid Hydrazide Molecular Pharmacology. Feb, 2014 | Pubmed ID: 24243647 Effectiveness of Hospital-wide Methicillin-resistant Staphylococcus Aureus (MRSA) Infection Control Policies Differs by Ward Specialty PloS One. 2013 | Pubmed ID: 24340085 The Use of Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit Typing and Whole Genome Sequencing to Inform Tuberculosis Prevention and Control Activities New South Wales Public Health Bulletin. Jul, 2013 | Pubmed ID: 23849021 Software for Selecting the Most Informative Sets of Genomic Loci for Multi-target Microbial Typing BMC Bioinformatics. May, 2013 | Pubmed ID: 23635100 Quantitative Estimation of the Stability of Methicillin-resistant Staphylococcus Aureus Strain-typing Systems by Use of Kaplan-Meier Survival Analysis Journal of Clinical Microbiology. Jan, 2013 | Pubmed ID: 23100339 Assignment of RecA Reference Sequence Types for Enhanced Identification of the Burkholderia Cepacia Complex Pathology. Jun, 2012 | Pubmed ID: 28193343 Francisella Tularensis Subspecies Holarctica, Tasmania, Australia, 2011 Emerging Infectious Diseases. Sep, 2012 | Pubmed ID: 22931809 Prospective Genotyping of Hospital-acquired Methicillin-resistant Staphylococcus Aureus Isolates by Use of a Novel, Highly Discriminatory Binary Typing System Journal of Clinical Microbiology. Nov, 2012 | Pubmed ID: 22895043 Linear Normalised Hash Function for Clustering Gene Sequences and Identifying Reference Sequences from Multiple Sequence Alignments Microbial Informatics and Experimentation. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22587938 Impact of a Web-based Personally Controlled Health Management System on Influenza Vaccination and Health Services Utilization Rates: a Randomized Controlled Trial Journal of the American Medical Informatics Association : JAMIA. Sep-Oct, 2012 | Pubmed ID: 22582203 Protocol for a Randomised Controlled Trial Examining the Impact of a Web-based Personally Controlled Health Management System on the Uptake of Influenza Vaccination Rates BMC Health Services Research. Apr, 2012 | Pubmed ID: 22462549 Improving Resolution of Public Health Surveillance for Human Salmonella Enterica Serovar Typhimurium Infection: 3 Years of Prospective Multiple-locus Variable-number Tandem-repeat Analysis (MLVA) BMC Infectious Diseases. Mar, 2012 | Pubmed ID: 22462487 선택 및 백 일 해 독 소 발기인 PtxP3 Bordetella 백 일 해의 진화에서 대립 유전자의 출현 Infection, Genetics and Evolution : Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22293463 살 균 소 유형 및 살 모 넬 라 Enterica Serovar 티의 단일 염기 다형성 입력의 유전 관계 Journal of Clinical Microbiology. Jan, 2012 | Pubmed ID: 22205813 Translational Web Robots for Pathogen Genome Analysis Microbial Informatics and Experimentation. Oct, 2011 | Pubmed ID: 22587672 유사성 및 16S RRNA 유전자 시퀀스 데이터의 클러스터링 분석에 의해 Nocardia 종족에 대 한 참조 시퀀스를 정의합니다 PloS One. 2011 | Pubmed ID: 21687706 전산 세균성 게놈 넓은 분석 Phylogenetic 프로필의 연쇄 상 구 균 Agalactiae의 잠재적인 독성 유전자를 보여준다 PloS One. 2011 | Pubmed ID: 21483735 5' 엔드 16S RRNA 유전자 시퀀싱, Gordonia, Rhodococcus 및 Tsukamurella의 향상 된 식별 합니다 Pathology. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21240067 편집기의 선택: Mycobacterium Bovis 균 Calmette Guérin Immunotherapy 방광 암에 대 한 사용 Isoniazid 저항의 의미 Clinical Infectious Diseases : an Official Publication of the Infectious Diseases Society of America. Jan, 2011 | Pubmed ID: 21148524 비교 게놈 분석에서 Bordetella 백 일 해의 진화에 대 한 통찰력: 백신 구동 선택의 증거 Molecular Biology and Evolution. Jan, 2011 | Pubmed ID: 20833694 버그 게시판에 아침 식사: 농수산 및 전염병 New South Wales Public Health Bulletin. May-Jun, 2010 | Pubmed ID: 21604605 SecA1 유전자 시퀀스 Polymorphisms Nocardia 종의 종 식별 및 공략 유전적 다양성의 인정에 대 한 Journal of Clinical Microbiology. Nov, 2010 | Pubmed ID: 20810768 메 티 실린 내성 황색 포도 상 구 균 종자에 포도 카세트 염색체 Mec 유형 IV의 예기치 않은 다양성 Journal of Clinical Microbiology. Oct, 2010 | Pubmed ID: 20686095 입력 멀티플렉스 PCR 및 역 선 오 점 분석 결과 의해 향상 된 살 균 소 파생 열려있는 독서 프레임의 사용에 의해 병원에서 메 티 실린 내성 황색 포도 상 구 균 전송의 신속 하 게 식별 합니다 Journal of Clinical Microbiology. Aug, 2010 | Pubmed ID: 20519463 3 년의 낮은 발병 률 인구에서 결핵균의 Genotypes 경도 연구 Pathology. Apr, 2010 | Pubmed ID: 20350221 전염병의 PubMed 전체 권합니다 연구 PloS One. 2010 | Pubmed ID: 20224767 Bordetella 백 일 해 클론 Multilocus 변수 번호 탠덤 반복 분석으로 식별 합니다 Emerging Infectious Diseases. Feb, 2010 | Pubmed ID: 20113564 역 선 오 점 교 잡 및 병원 성 Nocardia 종 신흥 5 16S-23S RRNA 유전자 Intergenic 공백 영역의 DNA 시퀀싱 연구 Journal of Medical Microbiology. May, 2010 | Pubmed ID: 20110385 역 선 오 점 교 잡 16S RRNA 16S-23S Rrna을 타겟팅 하 여 병원 성 Nocardia 종의 식별 유전자 공백 영역 Journal of Clinical Microbiology. Feb, 2010 | Pubmed ID: 19955277 일반적으로 분자 역학 독성 예측 연쇄 상 구 균 Agalactiae의 표식 표시 되지 않습니다 사용 됩니다 Pathology. 2009 | Pubmed ID: 19900108 시드니 세계 청년 주 2008 년 동안 독감 발발: 실험실 테스트 및 대량 발발 제약 수집에 케이스 정의의 유틸리티 PloS One. 2009 | Pubmed ID: 19727401 참조 5' 엔드 16S RDNA 시퀀스 및 Species-Specific 시퀀스 Polymorphisms 향상 종 식별의 Nocardia 할당 The Open Microbiology Journal. 2009 | Pubmed ID: 19639036 결핵균에 서클 증폭 및 KatG 및 인하의 신속한 검출을 위한 멀티플렉스 대립 유전자 특정 PCR 유전자 변이 롤링 International Journal of Medical Microbiology : IJMM. Dec, 2009 | Pubmed ID: 19604720 분석 새로운 멀티플렉스 PCR에 기초를 둔 역방향 선-오 교 잡 (mPCR/RLB) 결과 신속 하 게 포도 카세트 염색체 멕 (SCCmec) 입력을 위한 Journal of Medical Microbiology. Aug, 2009 | Pubmed ID: 19528184 결핵 Mycobacteria의 식별: HPLC 및 16S RRNA 유전자 시퀀싱에 비해 유전자 형 진 CM/AS 분석 결과의 유틸리티 Journal of Medical Microbiology. Jul, 2009 | Pubmed ID: 19502366 질병 발생의 실험실 기반 감지: 감시 시스템의 3 세대 Archives of Pathology & Laboratory Medicine. Jun, 2009 | Pubmed ID: 19492884 신속 하 고 정확한 인코딩을 사용 하 여 실시간 PCR 및 높은 해상도 녹여 분석 Acellular 백신 항 원 유전자를 대상으로 Bordetella 백 일 해의 입력 Journal of Microbiological Methods. Jun, 2009 | Pubmed ID: 19341769 Prokaryotic 유전자 기능 검색에 대 한 후보 유전자의 Silico 차별화에: Phylogenetic 프로필 응용 프로그램 BMC Bioinformatics. 2009 | Pubmed ID: 19292914 생물 정보학 쪽으로 전염병 관리를 지원 합니다 BMC Bioinformatics. 2009 | Pubmed ID: 19208185 확장 가능한 유전자 형 클러스터링을 사용 하 여 신흥 Biothreats의 Biosurveillance입니다 Journal of Biomedical Informatics. Feb, 2009 | Pubmed ID: 18723122 백 일 해의 재 출현: 진단 및 감시에 대 한 의미 New South Wales Public Health Bulletin. Jul-Aug, 2008 | Pubmed ID: 19007547 항생제 처방에 대 한 의사 결정 지원 시스템입니다 Current Opinion in Infectious Diseases. Dec, 2008 | Pubmed ID: 18988320 단일 뉴클레오티드 Polymorphisms Bordetella 백 일 해 비교 게놈 시퀀싱을 사용 하 여에서 게놈 넓은 분석 Research in Microbiology. Nov-Dec, 2008 | Pubmed ID: 18790049 임상 생물 정보학에서 의사 결정 지원 시스템을 개발 Methods in Molecular Medicine. 2008 | Pubmed ID: 18453098 임상의 정보 요구와 치료의 다른 모델에 의해 영향을 하는 의사 결정 지원? 실험적 연구입니다 Studies in Health Technology and Informatics. 2007 | Pubmed ID: 17911845 리스로 Bordetella 백 자화 율 변화? 호주 가운데 마이크 동향 격리 1971-2006 The Journal of Antimicrobial Chemotherapy. Nov, 2007 | Pubmed ID: 17827145 단일 및 Multilocus 시퀀스 입력 및 독 소 유전자 메 티 실린 내성 황색 포도 상 구 균의 특성에 대 한 프로 파일링의 비교 Journal of Clinical Microbiology. Oct, 2007 | Pubmed ID: 17715374 우리가 바로 종점 측정 하는? 환자 결과에 전산화 결정의 영향에 영향을 주는 변수 지원: 체계적인 검토 Medical Informatics and the Internet in Medicine. Sep, 2007 | Pubmed ID: 17701828 포인트의 관리 지역 사회 획득 폐 렴에 대 한 테스트: 우리가 모든 해답을가지고? The Medical Journal of Australia. Jul, 2007 | Pubmed ID: 17605702 병원 체는 질병 관리 및 감시에 대 한 프로 파일링 Nature Reviews. Microbiology. Jun, 2007 | Pubmed ID: 17487146 젊은 호주에서 폐 결핵의 확산입니다 The Medical Journal of Australia. Mar, 2007 | Pubmed ID: 17391086 연락처 조사에서 결핵균의 유전형의 유틸리티: 의사 결정 분석 Tuberculosis (Edinburgh, Scotland). May, 2007 | Pubmed ID: 17161653 결정 복잡성 결정 지원 사용의 유형과 정도 영향을 줍니다 AMIA ... Annual Symposium Proceedings / AMIA Symposium. AMIA Symposium. 2006 | Pubmed ID: 17238436 뉴 사우스 웨일즈에서 결핵균의 유전형: 주 재판의 18 개월에서 유래한 다 New South Wales Public Health Bulletin. May-Jun, 2006 | Pubmed ID: 17036086 Mycobacterium Bovis 종에서 Caprae 인해 요도 결핵의 경우 Pathology. Aug, 2006 | Pubmed ID: 16916737 항생제 내성 그람 음성 세균에 대 한 심사입니다 The Lancet Infectious Diseases. Jun, 2006 | Pubmed ID: 16728313 핸드헬드 컴퓨터 기반 의사 결정 지원 환자 투숙 기간, 환자 치료에 항생제 처방을 줄일 수 있습니다 Journal of the American Medical Informatics Association : JAMIA. Jul-Aug, 2005 | Pubmed ID: 15802478 Comparative Impact of Guidelines, Clinical Data, and Decision Support on Prescribing Decisions: an Interactive Web Experiment with Simulated Cases Journal of the American Medical Informatics Association : JAMIA. Jan-Feb, 2004 | Pubmed ID: 14527970 임상 의사 결정 자동화에서 혜택? 작업 복잡성 접근입니다 International Journal of Medical Informatics. Jul, 2003 | Pubmed ID: 12909183 임상 의사 결정 자동화에서 혜택? 작업 복잡성 접근입니다 Studies in Health Technology and Informatics. 2002 | Pubmed ID: 15460772 전체 게놈 시퀀싱 Candida glabrata 검출의 마커 항진균 약물 저항에 대 한의 Chayanika Biswas*1, Sharon C-A. Chen*1,2,3, Catriona Halliday1,2, Elena Martinez1, Rebecca J. Rockett1, Qinning Wang1, Verlaine J. Timms1, Rajat Dhakal1, Rosemarie Sadsad1, Karina J. Kennedy4, Geoffrey Playford4,5, Deborah J. Marriott6, Monica A. Slavin7, Tania C. Sorrell1,3, Vitali Sintchenko1,2,3 1Centre for Infectious Diseases and Microbiology-Public Health, Westmead Hospital, 2Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services, ICPMR, 3Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, The University of Sydney, 4Department of Microbiology and Infectious Diseases, Canberra Hospital and Health Services, Australian National University Medical School, 5Infection Management Services, Australian National University Medical School, 6Department of Microbiology and Infectious Diseases, St. Vincent's Hospital, 7Department of Infectious Diseases, Peter MacCallum Cancer Centre JoVE 56714 Medicine 멀티 플렉스 PCR 및 역방향 라인 얼룩 하이브리드화 분석 (mPCR / RLB) Matthew V. N. O'Sullivan1, Fei Zhou1, Vitali Sintchenko1, Fanrong Kong1, Gwendolyn L. Gilbert1 1Centre for Infectious Diseases and Microbiology, University of Sydney JoVE 2781 Biology
전체 게놈 시퀀싱 Candida glabrata 검출의 마커 항진균 약물 저항에 대 한의 Chayanika Biswas*1, Sharon C-A. Chen*1,2,3, Catriona Halliday1,2, Elena Martinez1, Rebecca J. Rockett1, Qinning Wang1, Verlaine J. Timms1, Rajat Dhakal1, Rosemarie Sadsad1, Karina J. Kennedy4, Geoffrey Playford4,5, Deborah J. Marriott6, Monica A. Slavin7, Tania C. Sorrell1,3, Vitali Sintchenko1,2,3 1Centre for Infectious Diseases and Microbiology-Public Health, Westmead Hospital, 2Centre for Infectious Diseases and Microbiology Laboratory Services, ICPMR, 3Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity, The University of Sydney, 4Department of Microbiology and Infectious Diseases, Canberra Hospital and Health Services, Australian National University Medical School, 5Infection Management Services, Australian National University Medical School, 6Department of Microbiology and Infectious Diseases, St. Vincent's Hospital, 7Department of Infectious Diseases, Peter MacCallum Cancer Centre JoVE 56714 Medicine
멀티 플렉스 PCR 및 역방향 라인 얼룩 하이브리드화 분석 (mPCR / RLB) Matthew V. N. O'Sullivan1, Fei Zhou1, Vitali Sintchenko1, Fanrong Kong1, Gwendolyn L. Gilbert1 1Centre for Infectious Diseases and Microbiology, University of Sydney JoVE 2781 Biology
