Generating the Transcriptional Regulation View of Transcriptomic Features for Prediction Task and Dark Biomarker Detection on Small Datasets

Kewei Li; Yusi Fan; Yaqing Liu; Hongmei Liu; Gongyou Zhang; Meiyu Duan; Lan Huang; Fengfeng Zhou

doi:10.3791/66030

GAT Framework for Identifying Dark Biomarkers in Transcriptomes

March 01, 2024

יצירת תצוגת ויסות התמלול של תכונות תמלול למשימת חיזוי וזיהוי סמנים ביולוגיים כהים במערכי נתונים קטנים

00:58 min

•

יצירת תצוגת תקנת התמלול של ערכת נתונים של תמלול

02:41 min

•

Kewei Li, Yusi Fan, Yaqing Liu, Hongmei Liu, Gongyou Zhang, Meiyu Duan, Lan Huang, Fengfeng Zhou

¹College of Computer Science and Technology, and Key Laboratory of Symbolic Computation and Knowledge Engineering of Ministry of Education,Jilin University, ²School of Biology and Engineering,Guizhou Medical University

Summary

כאן, אנו מציגים פרוטוקול להמרת נתוני שעתוק לתצוגת mqTrans, המאפשר זיהוי של סמנים ביולוגיים כהים. בעוד שסמנים ביולוגיים אלה אינם באים לידי ביטוי באופן דיפרנציאלי בניתוחי שעתוק קונבנציונליים, הם מציגים ביטוי דיפרנציאלי בתצוגת mqTrans. הגישה משמשת כטכניקה משלימה לשיטות מסורתיות, וחושפת סמנים ביולוגיים שבעבר התעלמו מהם.

GAT Framework for Identifying Dark Biomarkers in Transcriptomes

יצירת תצוגת ויסות התמלול של תכונות תמלול למשימת חיזוי וזיהוי סמנים ביולוגיים כהים במערכי נתונים קטנים

יצירת תצוגת תקנת התמלול של ערכת נתונים של תמלול

Summary

Article