11.3: RNA 编辑

RNA Editing
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RNA Editing
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02:23 min
November 23, 2020

RNA 编辑是一种转录后修饰,其中前体 mRNA (pre-mRNA) 核苷酸序列通过碱基插入、缺失或修饰而改变。RNA 编辑的范围从锥虫线粒体 DNA 中的几百个碱基到哺乳动物核基因中的单个碱基不等。即使是前 mRNA 中的单个碱基变化也可以将一个氨基酸的密码子转化为另一个氨基酸的密码子或终止密码子。这种类型的重编码会显着影响蛋白质的结构和功能,并可能导致从单个基因产生蛋白质的多个变体。

插入和删除 RNA 编辑

插入和删除 RNA 编辑涉及从 pre-mRNA 中添加和删除特定核苷酸或核苷酸序列。在一些致病性锥虫线粒体的 RNA 编辑中,添加了数百个非编码尿苷,并从前 mRNA 中删除了特异性尿苷残基。这些添加和缺失由称为 editosome 的酶复合物执行。editosome 由一种称为向导 RNA (gRNA) 的特殊 RNA 转录本引导。gRNA 在互补锚定序列的帮助下连接到目标前 mRNA 区域,该锚定序列长 10-15 个核苷酸。gRNA 也有一个模板序列,该序列指示编辑体在前 mRNA 中添加或删除尿苷残基的位置和数量。一些锥虫超过 50% 的线粒体 RNA 是通过添加尿苷残基形成的。

替代 RNA 编辑

在高等真核生物中观察到碱基修饰的取代 RNA 编辑,其中碱基被修饰而不改变前 mRNA 的长度。在脊椎动物中,涉及腺苷和胞苷的脱氨反应是最常见的 RNA 编辑类型。腺苷通过一种称为作用于 RNA 的腺苷脱氨酶 (ADAR) 的酶脱氨为肌苷。为了识别编辑位点,ADAR 需要在靶区和前 mRNA 的下游互补内含子区之间形成双链 RNA 结构。在脊椎动物中发现了三种类型的 ADAR 酶。ADAR1 和 ADAR2 酶存在于各种组织中,而 ADAR3 对某些物种的大脑具有特异性。在哺乳动物的 ApoB 基因中观察到另一种不太常见的 RNA 编辑类型,其中胞苷被修饰为尿苷。这是通过酶复合物实现的,包括载脂蛋白 B mRNA 编辑酶催化多肽 1 (APOBEC1)。尽管 RNA 编辑在脊椎动物中是一种相对罕见的现象,但该过程中的缺陷会导致与中枢神经系统相关的多种疾病,例如肌萎缩侧索硬化症、癫痫、抑郁症和精神分裂症。

Transcript

RNA 编辑是前体或前体 mRNA 中的核苷酸序列在转录后发生变化的过程。它允许生物体在不改变 DNA 序列的情况下产生不同形式的蛋白质。

脊椎动物中的 mRNA 编辑是位点特异性碱基脱氨的结果,这是一种从含氮碱基、腺嘌呤或胞嘧啶中去除氨基的反应。

当腺苷脱氨时,它会转化为肌苷。肌苷与鸟苷非常相似,可以欺骗翻译机制将肌苷读作鸟苷。

该反应是动物中最常见的 RNA 编辑类型,由作用于 RNA 的腺苷脱氨酶或 ADAR 催化。

ADAR 识别在外显子-内含子连接处形成的前 mRNA 发夹环,并编辑外显子上存在的特异性腺嘌呤。

在脊椎动物中,ADAR 编辑谷氨酸受体的前 mRNA。特定的 C-A-G 密码子被修饰为 C-I-G,然后被核糖体读取为 C-G-G。这种取代在最终蛋白质中用精氨酸取代谷氨酰胺。

第二种类型的 mRNA 编辑发生在胞苷脱氨为尿苷时。载脂蛋白 B pre-mRNA 的编辑是一个经过充分研究的例子。

载脂蛋白 B 有两种类型——较大的肝脏特异性 ApoB-100 和较小的肠道特异性 ApoB-48。

相同的前体 mRNA 编码两种蛋白质;然而,肠道特异性酶复合物作用于前 mRNA 中间附近的特定胞嘧啶,将 CAA 密码子转化为 UAA,即终止密码子。

这导致在肠道中产生截短的 ApoB-48 蛋白,而未改变的载脂蛋白 B 前体 mRNA 在肝脏中产生全长 ApoB-100 蛋白。