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寄生性锥虫锥虫锥虫的 f1-atpase 的分离
寄生性锥虫锥虫锥虫的 f1-atpase 的分离
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JoVE Journal Biochemistry
Isolation of F1-ATPase from the Parasitic Protist Trypanosoma brucei

寄生性锥虫锥虫锥虫的 f1-atpase 的分离

Full Text
7,618 Views
08:44 min
January 22, 2019

DOI: 10.3791/58334-v

Ondřej Gahura1, Alena Zíková1,2

1Biology Centre,Czech Academy of Science, Institute of Parasitology, 2Faculty of Science,University of South Bohemia

AI Banner

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

该方案描述了从锥虫培养阶段的 f1-atpase 的纯化.该程序产生了高度纯、均匀和活性的复合物, 适用于结构和酶学研究。

F1-ATPase 的纯化基于一种经典的生化方法,这证明对于我们了解其他 ATP 合成器的 ATP 生产机制至关重要。该技术的主要优点是,它产生一种高度纯净的酶,适合通过X射线晶体学或低温电子显微镜进行结构测定。虽然此协议针对 F1-ATPase 与锥形体进行分离进行了优化,但它可以适应其他来源,如组织或培养细胞,以及各种致病性蛋白酶。

这项技术可能导致新药的识别,以治疗严重的人类疾病。例如,结核分枝杆菌F-ATPase是结核病治疗的经过认证的药物靶点。为了开始协议,解冻并轻轻地重新暂停线粒体,也被称为米托皮斯特,以前通过低吨位解解从1倍10到11到2倍10到11个细胞的青霉蛋白锥虫布鲁西在5毫升的冰冷的缓冲剂 A.保持样品冷却。

接下来,根据制造商的说明,确定悬浮液中的蛋白质浓度,即BCA蛋白测定。在超纯水中执行 BSA 稀释系列,以构建标准曲线。用超纯水稀释少量样品 20 至 100 次,以符合 BSA 标准的范围。

计算样本中的总蛋白质量后,通过额外的缓冲器 A 稀释蛋白质浓度,将蛋白质浓度控制在每毫升 16 毫克,然后用声波将米托普斯特片切成倒置囊泡和膜片,每次声波 15 秒,总能量为 70 至 100 焦耳/脉冲,微尖直径为 3.9 毫米。在破碎时,在脉冲之间孵育样品在冰上30秒。声波化后,悬浮液可能会显得稍微暗一些。

在摄氏4度下,以5.4万克的超离心沉淀膜碎片,在4摄氏度下以9.8万克沉积5小时。去干上一样物,然后进行氯仿萃取。根据使用的缓冲区 A 的总量计算缓冲区 B 的体积。

将冷冻沉积物从离心管转移到均质器中。借助小型 Dounce 均质器,在缓冲器 B 中重新吸收线粒体膜的颗粒。将悬浮液转移到 50 毫升锥形管中。

从冰中去除样品,将样品和所有溶液保持室温,以执行其余步骤。然后加入饱和的氯仿,用HCl调整为pH 8.5,一对一。紧闭盖子,用力摇动样品整整20秒。

立即将混合物在8,400克下离心,在室温下5分钟。接下来,将上部、多云水相转移到1.6毫升微管。在样品中加入蛋白酶抑制剂,以取代氯仿处理去除的抑制剂。

在室温下以13,000克离心样品30分钟。旋转后,将上经剂转移到新鲜的微管中,然后重复离心以去除任何剩余的不溶性材料。平衡连接到快速蛋白液相色谱系统的五毫升阴离子交换Q柱,其Q柱缓冲液流量为每分钟5毫升,直到吸收率在280纳米且电导率稳定。

以每分钟一毫升的流速将上流器加载到平衡柱上。等待,直到 280 纳米的吸收度稳定在背景。以每分钟 0.5 毫升的流速,将 Q 柱洗脱缓冲液的 25 毫升线性梯度从 0%到 100%应用,并收集 1 毫升分数。

在pH 8.0的pH8.0下,铂尔曼ATP酶测定,每分微升与ATP水解活性的主要洗脱峰值对应10微升。汇集显示 ATPase 活动的分数。使用具有 100,000 分子量截止 PES 过滤器的旋转柱,通过膜超滤将池样本浓缩到 200 到 500 微升。

然后进行大小排除色谱。以每分钟 0.5 毫升的流速平衡连接到液相色谱系统的 Superose 6 增加柱,其至少 48 毫升的 SEC 缓冲液。将示例应用于列。

以每分钟 0.25 毫升的流速运行色谱,同时收集 0.25 毫升分数。接下来,运行与 SDS-PAGE 上 UV 280 纳米吸收度轨迹峰值对应的 10 微升分数。然后用库马西蓝弄脏样品。

通过铂尔曼 ATPase 测定,检测与包含 ATP 水解活性的 F1 峰值的第一个主要峰值对应的分数和 azide 灵敏度。然后进行 BCA 测定以确定蛋白质浓度。最后,将纯化的 F1-ATPase 保持室温,并在净化后三天内用于下游应用。

这种黄离子交换色谱的洗脱轮廓显示洗脱缓冲液中 280 纳米的紫外线吸收度和氯化钠浓度。选定的分数在SDS-PAGE凝胶上分离,并沾染了库马西蓝色染料。对应于 Anion 交换色谱中主要洗脱峰值并包含 F1-ATPase 的分数被汇集、浓缩,并用作大小排除色谱的输入。

主要污染物是二氢二苯二基脱氢酶,从大小排除色谱柱中脱氢作为离散峰。F1-ATPase 在第一个占主导地位的,主要是对称的峰中。通过 SDS-PAGE 分离纯化的 F1-ATPase 后,典型波段模式的 Coomassie 蓝色染色显示贝塔子单位上方可见的零星弱带,这些弱带表示 alpha 三个 beta 三头饰、200 度和 β 亚单位的寡聚体,并且没有质谱仪可检测到的任何污染物。

在执行氯仿萃取(协议的关键步骤)时,必须大力摇动样品,并立即进行有机和水相的离心分离。按照此过程,通过质谱法可以详细描述隔离的 F1-ATPase。此外,它可用于活性测定或结构研究,无论是自己或存在各种抑制剂或基板类比。

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生物化学 第143期 f1atpase 锥虫瘤布鲁过 线粒体 atp 合成酶 f 型 atpase 氯仿提取 液相色谱

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