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通过气相色谱/质谱法对大麦进行代谢组学分析
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Metabolomic Analysis of Barley by Gas Chromatography/Mass Spectrometry

通过气相色谱/质谱法对大麦进行代谢组学分析

Full Text
909 Views
08:15 min
November 8, 2024

DOI: 10.3791/67175-v

Peter J. Wieber1,2, Gabrielle Feber3, Patrick J. Hrdlicka1, Zachary Kayler3

1Department of Chemistry,University of Idaho, 2Department of Chemical and Biological Engineering,University of Idaho, 3Department of Soil and Water Systems,University of Idaho

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

提出了一种大麦代谢组学分析方法。该方法需要代谢物的分馏和衍生化,并通过气相色谱/质谱 (GC/MS) 对其进行分析。代谢组学分析可用于确定间作和干旱胁迫对谷物的影响。

本研究的目标是解决干旱对农业的影响。随着气候的不断变化,干旱加剧,干旱影响粮食安全。代谢组学对于识别和量化干旱对我们食物的影响非常重要。

代谢组学的一大挑战是获得已鉴定化合物的高质量。通过在氧基模拟步骤中使用甲氧基胺代替羟胺,我们提高了后续硅烷基化步骤的效率,因为甲氧基不会与 MSTFA 反应。目前观察植物对环境胁迫反应的方法集中在特定的过程或组织上。

虽然这种方法通过检测最终谷物产品中的化学信号来更加综合。将来,我们希望使用这种方法来了解干旱和间作如何影响大麦。大麦是影响粮食安全的重要谷物,我们希望了解不断变化的气候将如何影响它。

首先,将 200 毫克大麦粉加载到固相萃取或 SPE 溶剂储液槽中。将面粉用 200 微升甲醇浸泡 20 分钟以浸渍。通过在真空下蒸发 30 分钟去除甲醇。

干燥后,将色谱柱连接到真空歧管上。将含二氯甲烷的非极性组分 A 提取到 10 毫升小瓶中,然后运行真空歧管直至面粉干燥。接下来,加入甲醇和去离子水的混合物,将极性组分 B 提取到 10 mL 样品瓶中。

运行真空歧管,直到面粉干燥。将标准 1 和标准 2 添加到组分 A 中,并通过重复移液混合。使用旋转蒸发器在减压下完全蒸发溶剂。

然后将样品重新溶解在甲基叔丁基醚 (MTBE) 中,然后将甲醇和甲醇钠加入样品瓶中。在磁力搅拌下,在室温下进行酯交换反应 90 分钟。向溶液中加入盐酸水溶液。

将酸化溶液与二氯甲烷混合。用长巴斯德移液管收集小瓶中的内容物,并让相在移液管中分离。加入盐酸水溶液洗涤有机相。

同样,用长巴斯德移液管收集小瓶中的内容物,并让相在移液管中分离。将下层有机相转移到新样品瓶中,并使用旋转蒸发器蒸发至干燥。接下来,向 SPE 柱中加入无水硫酸钠。

将蒸发的样品溶解在二氯甲烷中,然后将其加载到 SPE 柱上。用三份正己烷和 MTBE 将馏分 1 洗脱到 10 mL 样品瓶中。在旋转蒸发器上蒸发含有馏分 1 的溶液至干燥。

将样品重新溶解在正己烷中,并将其转移到用于 GC/MS 的自动进样器样品瓶中。接下来,将 SPE 柱中的前馏分 2 与随后的三份正己烷和 MTBE 洗脱到 10 mL 样品瓶中。将前馏分 2 蒸发至干后,将其重新溶于无水吡啶中并加入 MSTFA。

使用扎带将硝基手套固定在注射器末端,并取下柱塞。用无水氩气填充球囊,并将一次性针头连接到注射器上。将球囊注射器推入装有无水试剂的瓶子的隔膜,然后插入第二个带有长针头的注射器以吸取溶剂。

用温和的无水氩气流冲洗样品瓶。用封口膜密封小瓶后,将其置于 70 摄氏度的油浴中 15 分钟。硅烷化后,在室温下冷却馏分 2 5 分钟,然后将其上样到自动进样器样品瓶中。

将标准品 3 和 4 添加到组分 B 中,并通过重复移液混合。将 2 毫升和 4 毫升馏分 B 混合物转移到新样品瓶中,分别加工成馏分 3 和馏分 4。在旋转蒸发器上蒸发馏分前 3 至干,然后用无水吡啶共蒸发。

将预馏分 3 重新溶于无水吡啶中,并加入三甲基硅基咪唑。用温和的无水氩气流冲洗样品瓶。用封口膜密封样品瓶后,在 70 摄氏度的油浴中加热 20 分钟。

将溶液冷却至室温后,加入正己烷和去离子水。搅拌混合物,并使用长巴斯德移液管将上层有机相转移到自动进样器样品瓶中。在旋转蒸发器上将前馏分 4 蒸发至干,然后用无水吡啶共蒸发。

将样品重新溶于无水吡啶中,并加入盐酸甲氧基拉敏。用无水氩气冲洗样品瓶后,将封口膜密封样品瓶在 70 摄氏度的油浴中草胺化 30 分钟。样品瓶冷却至室温后,加入 MSTFA 并在油浴中进行甲硅解 20 分钟。

接下来,将正己烷和去离子水加入小瓶中,并使用长巴斯德移液管收集下层水相。最后一次洗涤后,使用旋转蒸发器将水相蒸发至干,然后用无水乙腈共蒸发剩余材料。将样品重新溶解在无水乙腈和 MSTFA 中。

用无水氩气冲洗样品瓶后,在 70 摄氏度的油浴中加热密封的样品瓶 60 分钟。使用指定的进样体积将样品上样到 GC/MS 上。在 250 摄氏度的进样温度下,以每分钟 14 mL 的分流氦气流运行样品。

对于馏分 1 和 2,以每分钟 4 摄氏度的速率将柱温从 100 摄氏度升至 300 摄氏度。达到 300 摄氏度后,保持温度 10 分钟。对于馏分 3,在整个运行过程中将色谱柱加热并保持在 300 摄氏度。

对于馏分 4,以每分钟 2.5 摄氏度的速度将柱温从 70 °C 升至 142 °C。将温度保持在 142 摄氏度 10 分钟。然后以每分钟 142 摄氏度的速度将温度从 235 摄氏度提高到 4 摄氏度,保持 10 分钟。

最后,将柱子在 320 摄氏度下烘烤 8 分钟。

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代谢组学分析 大麦 气相色谱 质谱 干旱风险 农业 食品安全 代谢物 生化反应 衍生化 脂肪酸甲酯 甲硅烷基醚 NIST串联质谱库 胁迫植物

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