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JoVE Journal
Genetics

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JoVE Journal Genetics
Un pipeline de bioinformatique pour analyser avec précision et efficacité les transcriptomes microARN dans les plantes
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Un pipeline de bioinformatique pour analyser avec précision et efficacité les transcriptomes microARN dans les plantes

Article DOI: 10.3791/59864-v • 06:34 min • January 21st, 2020
January 21st, 2020 •
*1,2, *1,2, 2, 1
1Beijing Key Laboratory of Agricultural Genetic Resources and Biotechnology, Beijing Agro-Biotechnology Research Center, Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences, 2State Key Laboratory of Protein and Plant Gene Research, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, School of Advanced Agricultural Sciences and School of Life Sciences, Peking University
* These authors contributed equally

Kapitel

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Un pipeline bioinformatique, à savoir miRDeep-P2 (miRDP2 pour faire court), avec des critères de miARN végétal mis à jour et un algorithme révisé, pourrait analyser avec précision et efficacité les transcriptomes de microARN chez les plantes, en particulier pour les espèces ayant des génomes complexes et volumineux.

Tags

Génétique microARN (miRNA) plante sRNA-seq miRDeep-P2 (miRDP2) Séquençage de nouvelle génération critères miRNA des plantes miRDeep-P (miRDP)
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