Fundacao Oswaldo Cruz (FIOCRUZ) 6 articles published in JoVE Biochemistry Improvement of Bacillus subtilis Spore Enumeration and Label Analysis in Flow Cytometry Késsia Caroline Alves1,2, Yury Oliveira Chaves1,3,4, Maria Edilene Almeida1,4, Maria Gabriella Vasconcelos1,4, Paulo Afonso Nogueira1,3,6, Joyce Melo1,9, Jéssica Marques8, Juliana Pavan Zuliani7, Charles Nunes Boeno7, Mauro Valentino Paloschi7, Rachele Isticato5, Ezio Ricca5, Luís André Mariúba1,2,3,6 1Laboratório de diagnóstico e controle de doenças infecciosas na Amazônia, Instituto Leônidas e Maria Deane - Fiocruz Amazônia, 2Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Amazonas (UFAM), 3Programa de Pós-Graduação em Biologia da Interação Patógeno-Hospedeiro - Fiocruz Amazônia, 4Programa de Pós-graduação em Ciências Aplicadas à Hematologia PPGH-UEA/HEMOAM, 5Department of Biology, Federico II University, 6Programa de Pós-Graduação em Imunologia Básica e Aplicada, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Amazonas (UFAM), 7Laboratório de Imunologia Celular Aplicada à saúde, Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ Rondônia, 8Centro Multiusuário para Análises de Fenômenos Biomédicos (CMABio-UEA), Universidade Estadual do Amazonas, 9Universidade Federal do Amazonas (UFAM) This protocol focuses on the use of flow cytometry and counting beads to quantify bacterial spores labeled with ethidium bromide. The method is also efficient for analyzing the covalent coupling of proteins on the surface of intact spores. Biochemistry Standardization of a Cytometric Bead Assay Based on Egg-Yolk Antibodies Juliane Corrêa Glória1,2,3, Yury Oliveira Chaves2,3,4, Adélia Marques de Figueiredo1, Caio Coutinho de Souza2, Eliza Raquel Duarte da Silva2, Jeniffer Clorives Lopes Batista2,5, Paulo Afonso Nogueira2,3,5, Luis André Morais Mariúba1,2,3,5 1Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia da Universidade Federal do Amazonas - UFAM, 2Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), 3Programa de Pós-Graduação em Biologia da Interação Patógeno-Hospedeiro do Instituto Leônidas e Maria Deane (ILMD), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), 4Programa de Pós-graduação em Ciências Aplicadas à Hematologia – Universidade Estadual do Amazonas/Fundação Hospitalar de Hematologia e Hemoterapia do Amazonas, 5Programa de Pós-Graduação em Imunologia Básica e Aplicada, Instituto de Ciências Biológicas, Universidade Federal do Amazonas (UFAM) This protocol describes a methodology for the preparation of latex beads for assays using IgY antibodies for antigen detection. Immunology and Infection In Vitro Assay of Plasmodium-Infected Red Blood Cell Killing by Cytotoxic Lymphocytes Luna de Lacerda*1, Guilherme Castro*1,2, Cristopher Gomes1, Caroline Junqueira1 1Instituto René Rachou, Fundação Oswaldo Cruz, 2Departamento de Bioquímica e Imunologia, Universidade Federal de Minas Gerais Here we describe a new method to help elucidate the mechanisms of cellular immunity to Plasmodium during the blood stage of infection. This is an in vitro assay that measures infected red blood cell killing by cytotoxic lymphocytes. Immunology and Infection Mouse Model of Oleic Acid-Induced Acute Respiratory Distress Syndrome Sarah de Oliveira Rodrigues*1,2,5, Matheus Augusto Patricio de Almeida*1,2,6, Hugo Caire Castro-Faria-Neto1,3,4, Adriana Ribeiro Silva1,3, Cassiano Felippe Gonçalves-de-Albuquerque1,2,4,5,6 1Laboratório de Imunofarmacologia, Fundação Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, 2Laboratório de Imunofarmacologia, Departamento de Bioquímica, Instituto Biomédico, Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro, 3Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e Molecular, Instituto Oswaldo Cruz, FIOCRUZ, 4Programa de Pós-Graduação em Biologia Molecular e Celular, Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro, 5Programa de Pós-Graduação em Ciências e Biotecnologia, Universidade Federal Fluminense, 6Programa de Pós-Graduação em Neurociências, Universidade Federal Fluminense The present protocol describes a lung injury model in mice using oleic acid to mimic acute respiratory distress syndrome (ARDS). This model increases the inflammatory mediators on edema and decreases lung compliance. Oleic acid is used in the salt form (oleate) since this physiological form avoids the risk of embolism. Biochemistry Ready-To-Use qPCR for Detection of DNA from Trypanosoma cruzi or Other Pathogenic Organisms Alexandre Dias Tavares Costa1,2,3, Steffanie Skau Amadei1,3, Amanda Bertão-Santos1,2, Tuany Rodrigues1,3 1Laboratório de Ciências e Tecnologias Aplicadas em Saúde (LaCTAS), Instituto Carlos Chagas (ICC), Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz), 2Pós-graduação em Engenharia de Bioprocessos e Biotecnologia, Universidade Federal do Paraná (UFPR), 3Pós-graduação em Biociências e Biotecnologia, Instituto Carlos Chagas (ICC), Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz) The present work describes the steps for producing ready-to-use qPCR for T. cruzi DNA detection that can be pre-loaded on the reaction vessel and stored in the refrigerator for several months. Biology Comparison of Methods for Isolating Entomopathogenic Fungi from Soil Samples Thais A. Correa1, Fernanda S. Santos2, Mariana G. Camargo3, Simone Quinelato2, Vânia R. E. P. Bittencourt1,3, Patricia S. Golo1,3 1Programa de Pós-Graduação em Ciências Veterinárias, Instituto de Veterinária, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, 2Laboratório de Taxonomia Bioquímica e Bioprospecção de Fungos/Coleção de Cultura de Fungos Filamentosos, Instituto Oswaldo Cruz, Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), 3Departamento de Parasitologia Animal, Instituto de Veterinária, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro Entomopathogenic fungal colonies are isolated from tropical soil samples using Tenebrio bait, Galleria bait, as well as selective artificial medium, i.e., potato dextrose agar enriched with yeast extract supplemented with chloramphenicol, thiabendazole, and cycloheximide (CTC medium).
