Summary
作为3d 培养体生长的神经球是研究胶质瘤生物学的有力工具。在这里, 我们提出了一个执行免疫组织化学的协议, 同时保持三维结构的胶质瘤神经球通过石蜡嵌入。这种方法可以描述胶质瘤神经球的性质, 如干细胞和神经分化。
Abstract
胶质瘤蛋白表达分析与胶质瘤病理学研究有关。许多蛋白质被描述为生物标志物, 在诊断、预后、分类、肿瘤进展状态和细胞分化状态等方面都有应用。这些生物标志物的分析也有助于表征胶质瘤患者和胶质瘤模型产生的肿瘤神经球 (ns)。肿瘤 ns 提供了一个有价值的体外模型来评估不同的特征, 从中获得, 并能更准确地反映胶质瘤生物学。在这里, 我们描述了一个详细的方法来分析生物标志物在肿瘤 ns 使用免疫组织化学 (ihc) 石蜡嵌入肿瘤 ns。
Introduction
胶质瘤是根据世界卫生组织1的表型和基因型特征分类的中枢神经系统的主要实体瘤。这种分类包括司机突变的存在或不存在, 这些突变代表了一个有吸引力的生物标志物来源 2。生物标志物是生物特性, 可以测量和评估, 以表明正常和病理过程, 以及药理反应的治疗干预3。生物标志物可以在胶质瘤的肿瘤组织和细胞中检测到, 使其能够在不同的方面进行生物表征。胶质瘤生物标志物的一些例子包括突变的异氰酸酯脱氢酶 1 (idh1), 这是一种与预后较好相关的低度胶质瘤的突变酶特征4。突变 idh1 常与 tp53 和α-地中海贫血综合征 x-连锁 (atrx) 失活突变结合表达, 定义了特定的胶质瘤亚型 4,5。atrx 失活突变也发生在44% 的儿童高级胶质瘤 2,6, 并已与攻击性肿瘤和基因组不稳定6,7。此外, 在组织内 h3 基因 h3f3a 或 hist1hb 基因 1, 6 中, 根据 k27m 突变的存在或不存在, 在亚组中对小儿弥漫性内脑桥胶质瘤 (dipg) 进行分化。因此, 分子特征的引入允许将胶质瘤作为单独的实体进行细分、研究和治疗, 这将更允许为每个亚型开发更有针对性的疗法。此外, 生物标志物的分析可用于评估不同的生物过程, 如凋亡8、自体吞噬9、细胞周期进展 10、细胞增殖11和细胞分化12.
基因工程动物模型, 窝藏人类癌症中存在的遗传病变是至关重要的信号路径的研究, 调解疾病的进展。我们的实验室已经实施了使用睡眠美容 (sb) 转相酶系统, 以开发基因工程小鼠模型的胶质瘤窝藏特定的突变, 重述人类胶质瘤亚型13,14。这些基因工程小鼠模型用于生成肿瘤衍生 ns, 使其能够在三维系统中进行体外研究, 反映了原位15肿瘤中存在的显著特征。此外, 将 ns 移植到小鼠体内可以产生继发性肿瘤, 这些肿瘤保留原发肿瘤的特征, 并模仿相应原发肿瘤15的组织病理学、基因组和表型特性。
在无血清培养中, 具有干细胞特性的脑肿瘤细胞可以得到丰富, 在表皮生长因子 (egf) 和成纤维细胞生长因子 (fgf) 的存在下, 它们可以作为单一细胞衍生的菌落 (如 ns 培养) 生长。在这种选择性培养系统中, 大多数分化或分化的细胞会迅速死亡, 而干细胞则分裂并形成细胞簇。这使得 ns 培养保持胶质瘤肿瘤的特点16,17,18。胶质瘤 ns 可用于评估肿瘤生物学的几个方面, 包括分析生物标志物, 在诊断, 预后, 分类, 肿瘤进展状态, 细胞分化状态, 细胞分化状态。在这里, 我们详细介绍了生成胶质瘤 ns 的协议, 并将3d 培养物嵌入石蜡中, 用于 ihc 染色。固定和嵌入胶质瘤 ns 的一个优点是, 与传统的细胞旋旋法相比, ns 的形态保持得更好,其中胶质瘤 ns 受到细胞离解的压力操纵, 并变得扁平。此外, 嵌入抑制任何内源性荧光体表达从基因工程肿瘤 ns, 使染色整个荧光光谱。该方法的总体目标是通过石蜡包埋过程保存胶质瘤细胞的三维结构, 并利用免疫组织化学对胶质瘤神经球进行表征。
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
这里描述的所有方法都已得到密歇根大学动物护理和使用机构委员会 (iacuc) 的批准。
1. 从小鼠模型衍生出的脑肿瘤神经球的产生
- 在解剖过程之前, 准备神经干细胞培养基 (nsc 培养基: dmem/f12 与 1x b27 补充剂, 1x n2 补充, 1x 诺康和12倍药/抗真菌的 yic-yacce 补充人类重组 egf 和基本 fgf 在浓度为 20 ngml 每个)。在 1.5 ml 管中填充300μl 的 nsc 介质, 并为以后的工作做好准备。
- 选择有大肿瘤的老鼠。
注: 如果质粒或病毒注射编码荧光素, 则可通过生物发光监测肿瘤的大小。通常, 大肿瘤具有 > 106 光子的生物发光. - 对小鼠进行过量的异氟醚安乐死: 注入用异氟醚的纸巾, 并在安乐死室中引入组织, 避免与小鼠直接接触, 以防止刺激。等待, 直到老鼠不显示踏板反射 (通常 5-10)。斩首鼠标和解剖大脑, 如卡利内斯库等人所述.13岁
- 如果肿瘤是荧光的, 使用配备荧光灯的解剖显微镜来识别大脑中的肿瘤质量。用精细的钳子, 从正常的脑组织解剖肿瘤 (通常直径5-7 毫米)。
- 将解剖的肿瘤与 nsc 介质 (步骤 1.1) 放在 1.5 ml 管中。通过施加温和的压力, 用适合微离心管壁的一次性塑料钉将肿瘤均质。
- 要分离细胞团块, 在37°c 下加入1毫升的无酶解离培养基, 孵育5分钟。
- 通过70μm 的电池过滤器过滤细胞悬浮液, 并用20毫升的 nsc 介质清洗过滤器。
- 以 300 x 克离心 5分钟, 将上清液切好, 并根据颗粒的大小将颗粒重新悬浮到 nsc 介质中6毫升或15毫升。
- 将肿瘤细胞悬浮液放入 t-25 或 t-75 培养瓶, 并在37°c 时在空气和 5%co2的气氛的组织培养孵化器中培养。
- 3天后, 将健康悬浮的 ns 转移, 并将其重新装入 t-25 或 t-75 组织培养瓶。如有必要, 向区域性中添加更多的 nsc 媒体。
注: 通常会有混合的细胞群, 有的会死, 有的会坚持, 有的会形成将漂浮在媒体中的 ns "
2. 维护和传递 ns
注: 防止过度生长, 并将细胞保持在相对较高的密度。融合是由球体大小决定的 (大球体的黑色中心意味着过度生长)。ns 的生长速度将取决于用于产生肿瘤的癌基因。
- 一旦 ns 培养物达到融合, 将培养物收集在无菌离心管中, 并以 300 x g 的速度将 ns 颗粒收集5分钟。
- 丢弃上清液, 加入细胞分离溶液的1毫升, 并将移液器重新悬浮颗粒。
- 在37°c 下孵化 5分钟, 每2分钟闪烁一次管, 以帮助细胞离解。
注: 当 ns 达到融合时, 它们通常在宏观上被视为白色的小球体。为了确保细胞离解, 至少所有可见的 ns 都必须消失。 - 加入5毫升 hbss 1x 和移液器几次。颗粒细胞在 300 x g 5分钟内丢弃上清液。在5毫升的 nsc 介质中重新悬浮颗粒, 辅以重组 egf 和基本 fgf。
- 在空气为95%、co2 为5% 的组织培养孵化器中, 在 t-75 烧瓶中加入1毫升细胞, 并在 t-75 烧瓶中培养。
- 每3天添加生长因子 (egf 和基本 fgf)。如果介质变浅橙色, 而细胞尚未融合, 请更换介质。要做到这一点, 离心 ns 在 300 x g 4分钟, 并在 nsc 介质中重新暂停与生长因子补充。
注: 根据颗粒形成的大小, 细胞可能需要分裂成更多的烧瓶。
3. 长期储存的冷冻 ns
- 当 ns 培养变得融合时, 如步骤 2.1-2.4 中所述, 分离细胞。一旦颗粒被重新悬浮在 hbss 中, 取出一个并对细胞进行计数。
- 以 300 x g 离心细胞 4分钟, 并尽可能去除上清液。
- 在冷冻介质中重新悬浮颗粒 (热失活 fbs, 10% dmso)。建议每瓶每瓶每瓶冷冻 1 x10 6 和 3 x 106 个细胞。
- 根据需要将重新悬浮的细胞分成尽可能多的冷冻细胞, 然后先将小瓶转移到冰中, 然后转移到-20°c, 然后转移到-80°c, 最后第二天再冷却到液氮储存容器。
4. 肿瘤的固定
- 在 t-25 瓶中培养肿瘤 ns 2-3天, 直到细胞融合 (~ 3 x10 6 细胞)。从至少一个 t-25 融合的烧瓶中收集肿瘤 ns 在一个15毫升的锥形管中。在 300 x g 的颗粒5分钟。
- 重新悬浮颗粒在1毫升的10% 福尔拉林, 并保持在室温下 10分钟 (rt) 1 毫升, 加入5毫升的 1x hbss 和颗粒细胞如步骤3.2 所做的那样。重复此步骤一次。
- 将含有颗粒的15毫升锥形管放在冰上。
5. 肿瘤 ns 的石蜡嵌入
- 在2% 温热液体琼脂糖的500μl 中重新悬浮清洗后的 ns 颗粒, 通过移液轻轻混合。
- 立即将琼脂嵌体 ns 放在冰上, 直到琼脂糖聚合。取下窝藏 ns 的琼脂糖件。将与 ns 一起聚合的琼脂糖片放入盒式磁带进行组织处理 (图 2)。
- 继续进行组织处理 (使用自动石蜡处理器) 和石蜡嵌入 (使用嵌入站)。
6. 石蜡嵌入 ns 的切片
- 将水浴设置为 42°c, 并使用两个油漆刷小心地将刀片插入微胶卷上, 以确保其平整。仅使用此刀片进行修剪。
- 将石蜡块放在微孔上。使用非优势手, 按下位于左侧的杠杆, 控制每个部分的厚度。按下到指示厚度为30微米的第二个停止点。
- 开始修剪块 (即, 删除多余的石蜡), 用右手转动粗糙的手轮, 直到到达样品的表面。此时, 松开控制修剪厚度的杠杆, 使其达到10μm 或5μm。当到达样品表面时, 停止修剪。
- 在冰盒里装满冰, 加装足够的水, 这样当石蜡块放在冰上时, 水就会像石蜡块周围的膜一样, 保护它不直接接触冰面。在冰上培养石蜡块20分钟。
- 丢弃旧刀片, 并插入一个新的进行切片。用纱布干块, 然后把它放在微管上。
- 用非优势手, 获得一对弯曲的钳子, 将用于拉石蜡丝带。在右手附近放一把潮湿的油漆刷, 用来将石蜡丝带转移到水浴中。开始分, 用右手快速转动粗糙的手轮。使用左手的钳子按住石蜡丝带。
- 使用潮湿的油漆刷将石蜡丝带转移到水浴中。
- 使用钳子的曲线, 通过表面上将钳子放在两个石蜡截面之间, 然后轻轻地将两个部分推开, 将横截面分开。
注: 此运动应完全位于石蜡部分的表面。不要按下该部分。 - 使用潮湿的油漆刷将分离的石蜡部分推到带正电荷的粘附显微镜幻灯片上。
- 在将幻灯片存放在幻灯片箱中之前, 请让幻灯片在化学引擎盖内过夜。幻灯片的存储取决于所执行的污渍类型。
7. 石蜡包埋 ns 的免疫组织化学 (ihc)
- 将幻灯片放入金属机架中, 在60°c 下孵育 20分钟, 将石蜡熔化。
- 在 rtrt 补液列车中孵育幻灯片: 3x 二甲苯 5分钟, 100% 2倍乙醇 2分钟, 95% 2倍乙醇 2分钟, 70% 1x 乙醇 2分钟, 1x 去离子水 2分钟, 然后将滑梯保存在自来水中, 直到回收抗原, 因为干燥会导致非特异性抗体结合。
- 在125°c 和90°c 下, 在柠檬酸缓冲液 (10 mm 柠檬酸, 0.05% 非离子洗涤剂, ph 6) 中对滑块进行37秒和90°c 的培养。让它们冷却, 然后用蒸馏水冲洗幻灯片5次。
- 在 rt 中培养幻灯片, 在 0.3% h2o2 中, 30分钟.
- 在洗涤缓冲液中清洗幻灯片 3次 (tbs 中的洗涤剂 0.025), 搅拌温和5分钟。
- 用阻滞剂 (10% 马血清, tbs 中 0.1% bsa) 在 rt 上对幻灯片进行2013年代。
- 在4°c 的加湿室内用稀释溶液中制备的原生抗体 (tbs 中为 0.1% bsa) 将滑块在加湿室中过夜。在洗涤缓冲液中清洗幻灯片 3次, 用温和搅拌5分钟。
- 用稀释溶液中制备的生物素化二级抗体在 rt 上对幻灯片进行1小时的培养。在洗涤缓冲液中清洗幻灯片 3次, 用温和搅拌5分钟。
- 用阿维丁-生物素酰化辣根过氧化物酶复合物在黑暗中将幻灯片在 rt 中培养30分钟。在洗涤缓冲液中清洗幻灯片 3次, 用温和搅拌5分钟。
- 在 rt使用db-h 2o2 基板品牌在这里加氢2-5。
- 用自来水冲洗3次。将滑块 (1-2. s) 浸入血红素溶液中进行反染色, 并在自来水中彻底冲洗, 直至清除。
- 将幻灯片脱水如下: 在蒸馏水中孵育 2分钟, 在80% 乙醇中浸渍 3次, 在95% 乙醇中孵育 2次, 每次 2分钟, 在100% 乙醇中孵育 2次, 每次 2分钟, 最后在二甲苯中孵育 3次, 每次3分钟。
- 用基于二甲苯的安装介质覆盖幻灯片, 让滑块在 rt 的平面上干燥, 直到它们准备好进行成像。 注: 如果进行 3, 3 '-二胺酶 (dab) 染色, 幻灯片可以存储在 rt。然而, 如果进行免疫荧光染色, 幻灯片应存储在黑暗中-20°c, 以减少光漂白。
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
为了监测肿瘤的发展和评估肿瘤是否达到生成 ns 所需的大小, 我们使用生物发光分析了肿瘤发出的发光。这使得通过荧光素酶的发光信号研究幼崽的转导效率和肿瘤进展 (图 1a和1b)。当肿瘤大小达到 1 x 10 7 光子/ponss\ cm/sr (图 1b) 时, 大脑可以被处理为 ns 生成.该系统的另一个优点是, 不同荧光蛋白的编码序列可以添加到用于基因传递和肿瘤产生的质粒中。然后, 我们可以使用配备荧光灯的解剖显微镜来确认插入的基因改变的表达 (图 1c)。wt-idh1 (图 1d) 和 midh1 (图 1e) 肿瘤产生的 ns 是通过特征球状形态来识别的, 与特定遗传病变相关的荧光表达 (即与 shatrx 和 shp53 有关的 gfp, 以及与 midh1 相关的 katushka;图 1d和1e)。要在 ns 上继续进行 ihc, 细胞是固定的, 然后嵌入琼脂糖和石蜡中 (图 2)。将 ns 嵌入石蜡块具有几个优点, 包括保存 ns 的3d 结构和允许长期存储。嵌入的 ns 可以染色特定的胶质瘤生物标志物。利用该技术, 我们分析了 atrx、ki67 和 olig2 (少突胶质细胞分化标记) 的表达 (图 3a-3c)。我们证实了 atrx 蛋白在 ns 培养中的低表达水平 (图 3a), 这是目前正在研究的 lgg 胶质瘤亚型的一个特点4。另外, ki-67 是细胞增殖的良好生物标志物, 在 midh1 ns (图 3b) 中呈阳性, 显示出活跃增殖, 这是肿瘤细胞的一个关键特征。有趣的是, 定位在较大胶质瘤 ns 簇中心的细胞对 ki-67 呈阴性 (图 3b), 这表明它们没有增殖, 这与定位在外围的 ki-67 阳性细胞不同。这种现象可能是由于外周细胞无法从生长介质中获得营养物质。当他们达到这个更大的大小, 胶质瘤 ns 应该被离解和传代。最后, wt-idh1 ns 对 olig2 呈阳性, 这是一种参与少突胶质细胞分化的转录因子 (图 3c)。
图 1: 由 gfp 和 katushka 阳性睡眠美容 (sb) 脑瘤产生的胶质瘤神经球.(a) 新生儿小鼠注射 sb-转座酶质粒, 结合具遗传病变的质粒, 发出发光信号, 诱导胶质瘤 (nras/shshasrxxxxh1-r132h)。(b) 发光, 表明注射后132天肿瘤发育。(c) 从到达终点的老鼠身上采集的大脑的明亮场和荧光图像。肿瘤区域用虚线划定, 对荧光记者、gfp 和 k作 ushka 呈阳性。(d 和 e)从表达 gfp 的 sb 脑肿瘤产生的肿瘤神经球与 shp53 和 shP53 有关;和与 idh1-r132h 有关的 ketushka。刻度栏 = 100μm. 请点击这里查看此图的较大版本.
图 2: 石蜡嵌入胶质瘤 ns 的工作流程的表示.ns 从 t-25 烧瓶中收集到15毫升的锥形管中, 并固定在10% 的福尔马林中。然后, ns 用 hbss 清洗, 并嵌入2% 琼脂糖中。含有胶质瘤 ns 的聚合琼脂酯被放置在盒式磁带中进行组织处理和石蜡包埋。请点击这里查看此图的较大版本.
图 3: 免疫组织化学的代表性结果与 hrp-dab 检测的生物标志物.(A-C)ihc 在石蜡嵌入的大马士革胶质瘤 ns 上进行了对 atrx (a) 和 ki67 (b) 染色, wt-idh1 胶质瘤 ns 染色为 olig2 (c)。红色箭头表示生物标志物染色的阳性细胞。刻度栏 = 50μm. 请点击这里查看此图的较大版本.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
本文详细介绍了一种对石蜡嵌入胶质瘤 ns 进行免疫组织化学的通用和可重复的方法, 该方法保持了原位生长在大脑中的肿瘤细胞的特征三维结构。与使用镀金或塑料表面的细胞相比, 该技术具有以下优点: i) 保存 ns 的三维结构;ii) 在分析蛋白质表达之前, 避免细胞离解的应激;(iii) 从基因工程肿瘤 ns 中淬火任何内源性荧光体表达, 从而在荧光光谱中进行染色;和 iv) 长期储存。
这项技术的一个关键步骤是确保细胞在琼脂糖中重新悬浮, 以确保它们均匀分布, 而不是聚集在一起。这种技术的一个局限性是 ihc 染色程序之前与细胞培养和 ns 处理相关的耗时步骤。第二个限制是执行此方法所需的大量单元格。如果单元格数小于 1 x10 6个单元格, 则每个部分中每个视场 ns 群集的单元格太少。因此, 如果胶质瘤细胞培养缓慢, 可能很难达到理想的细胞数量。我们使用了一个融合 t-25 烧瓶, 至少含有 3.0 x 106 细胞。使用的单元格数可以根据需要进行修改;但是, 有必要为嵌入过程获得一个适当大小的 ns 颗粒。之后, 嵌入的 ns 可以作为一个规则的石蜡嵌入块进行操作, 然后它可以进行切片和 ihc 染色, 使用免疫荧光或 ihc 染色使用 dab 染色分析蛋白质表达。
块切片后, 并按照 ihc 的协议, 部分应与血红素 (蓝色) 进行反击。如果组织表达目标蛋白, 棕色信号应该是可见的 (图 3)。如果 ihc 后的部分是太棕色 (高背景), 这可能是由于 1) 非特异性的二级抗体的投标, 2) 内源性过氧化物酶的不完全淬火, 或 3) 不充分的阻塞。这些问题可以通过以下方式解决: 1) 使用负控制滑块 (仅与二级抗体孵育) 检查二级抗体的非特异性结合, 2) 增加过氧化物酶淬火时间, 或 3) 增加阻断潜伏期。另一方面, 如果没有检测到信号, 表位可能仍然被屏蔽, 这可能与用于抗原检索的缓冲液类型有关。根据我们的经验, 我们已经有了令人满意的染色使用柠檬酸缓冲液, 但这可以是组织和抗体相关的, 不同的配方抗原检索缓冲液可以使用, 如 0.1 m Tris-HCl (ph 8.0) 缓冲液 21。这些都是与 ihc 染色有关的一些最常见的问题, 但如果出现其他困难, 应像任何其他 ihc 一样进行故障排除 (即尝试初级和二级抗体的不同稀释, 不同的阻滞试剂、不同的阻隔时间等)。
哈塞尔巴赫等人先前描述了使用石蜡包埋细胞评估蛋白质表达的另一种方法.20. 这种方法不包括琼脂糖步骤, 在本议定书中, 这些步骤能够充分地特别分配三维细胞集群。我们还描述了一种用于长期存储的 ns 培养、传递和冻结的精确方法。此方法还说明了如何在不改变3d 结构的情况下收集、修复和嵌入 ns (图 2)。
由于 ns 可以从从患者和胶质瘤动物模型中获得的胶质瘤组织中生成, 因此该技术构成了一个强大的工具, 可用于分析不同胶质瘤支持类型中的生物标志物表达并验证原始模型。在这里, 我们描述了 ns 的技术来自基因工程小鼠使用 sb 转相酶系统 (图 1)。然而, 这种技术也可用于分析石蜡嵌入的人胶质瘤细胞中的蛋白质, 这些细胞在没有修改协议的情况下作为三维培养细胞生长, 而不是细胞培养条件。因此, 该方法也可应用于从可移植动物模型、人类 pdx 模型和其他基因工程模型中获得的三维培养。最后, 这种方法除了胶质瘤外, 还可用于其他类型的癌症, 包括小鼠模型和人类癌症。
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
作者没有什么可透露的。
Acknowledgments
这项工作得到了国家健康研究所/国家神经疾病研究所的支持 & 中风 (nih/nnds) 赠款 r37-ns094804, r01 ns074387, r21-ns091555 至 m. g. c.;nhhninsd 赠款 r01-ns07691、r01-ns082311 和 r01 ns096756 至中华人民共和国;nhhxninsr01-eb022563;1uo1ca224160;神经外科;莉娅的快乐之心 m. g. c. 和 p. l.;和 rna 生物医学赠款 f046166 m. g. c. f. m. 由 f31 nhhxinds-f31 ns103500 支持。j. p. 得到了阿根廷富力体育和教育部研究金的支持。
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Coated microtome blade HP35 | Thermo Scientific | 3150734 | |
| Microtome RM 2135 | Leica | MR2135 | |
| Formalin solution, neutral buffered, 10% | Sigma-aldrich | HT501128-4L | |
| Rabbit polyclonal anti-ATRX, | Santa Cruz Biotechnology | sc-15408 | IHC, 1:250 dilution |
| Rabbit polyclonal anti-Ki-67 | Abcam | Ab15580 | IHC, 1:1000 dilution |
| Rabbit polyclonal anti-OLIG2 | Millipore | AB9610 | IHC, 1:500 dilution |
| Goat polyclonal anti-rabbit biotin-conjugated | Dako | E0432 | IHC, 1:1000 dilution |
| Vectastain Elite ABC HRP kit | Vector Laboratories Inc | PK-6100 | |
| BETAZOID DAB CHROMOGEN KIT | Biocare medical | BDB2004 L/price till 12/18 | |
| N-2 Supplement | ThermoFisher | 17502048 | |
| N-27 Supplement | ThermoFisher | A3582801 | |
| Accutase® Cell Detachment Solution | Biolegend | 423201 | |
| AGAROSE LE | GoldBio | A-201-1000 | |
| Genesee Sc. Corporation | Olympus 15 ml | 21-103 | |
| Genesee Sc. Corporation | TC-75 treated Flask | 25-209 | |
| Genesee Sc. Corporation | TC-25 treated Flask | 25-207 | |
| DMEM/F12 | Gibco | 11330-057 | NS media |
| HBSS | GibcoTM | 14175-103 | balanced salt solution |
| C57BL/6 | Taconic | B6-f | C57BL/6 mouse |
References
- Louis, D. N., et al. The 2016 World Health Organization Classification of Tumors of the Central Nervous System: a summary. Acta Neuropatholica. 131 (6), 803-820 (2016).
- Hochberg, F. H., et al. Glioma diagnostics and biomarkers: an ongoing challenge in the field of medicine and science. Expert Review of Molecular Diagnosis. 14 (4), 439-452 (2014).
- Ziegler, A., Koch, A., Krockenberger, K., Grosshennig, A. Personalized medicine using DNA biomarkers: a review. Human Genetics. 131 (10), 1627-1638 (2012).
- Ceccarelli, M., et al. Molecular Profiling Reveals Biologically Discrete Subsets and Pathways of Progression in Diffuse Glioma. Cell. 164 (3), 550-563 (2016).
- Cancer Genome Atlas Research, N., et al. Comprehensive, Integrative Genomic Analysis of Diffuse Lower-Grade Gliomas. The New England Journal of Medicine. 372 (26), 2481-2498 (2015).
- Mackay, A., et al. Integrated Molecular Meta-Analysis of 1,000 Pediatric High-Grade and Diffuse Intrinsic Pontine Glioma. Cancer Cell. 32 (4), 520-537 (2017).
- Koschmann, C., et al. ATRX loss promotes tumor growth and impairs nonhomologous end joining DNA repair in glioma. Science Translational Medicine. 8 (328), (2016).
- Ward, T. H., et al. Biomarkers of apoptosis. British Journal of Cancer. 99 (6), 841-846 (2008).
- Gil, J., Pesz, K. A., Sasiadek, M. M. May autophagy be a novel biomarker and antitumor target in colorectal cancer. Biomarkers in Medicine. 10 (10), 1081-1094 (2016).
- Williams, G. H., Stoeber, K. The cell cycle and cancer. Journal of Pathology. 226 (2), 352-364 (2012).
- Preusser, M., et al. Ki67 index in intracranial ependymoma: a promising histopathological candidate biomarker. Histopathology. 53 (1), 39-47 (2008).
- Trepant, A. L., et al. Identification of OLIG2 as the most specific glioblastoma stem cell marker starting from comparative analysis of data from similar DNA chip microarray platforms. Tumour Biology. 36 (3), 1943-1953 (2015).
- Calinescu, A. A., et al. Transposon mediated integration of plasmid DNA into the subventricular zone of neonatal mice to generate novel models of glioblastoma. Journal of Visualized Experiments. (96), (2015).
- Wiesner, S. M., et al. De novo induction of genetically engineered brain tumors in mice using plasmid DNA. Cancer Research. 69 (2), 431-439 (2009).
- Xie, Y., et al. The Human Glioblastoma Cell Culture Resource: Validated Cell Models Representing All Molecular Subtypes. EBioMedicine. 2 (10), 1351-1363 (2015).
- Vescovi, A. L., Galli, R., Reynolds, B. A. Brain tumour stem cells. Nature Reviews Cancer. 6, 425 (2006).
- Dirks, P. B. Brain tumor stem cells: bringing order to the chaos of brain cancer. Journal of Clinical Oncology. 26 (17), 2916-2924 (2008).
- Lenting, K., Verhaak, R., Ter Laan, M., Wesseling, P., Leenders, W. Glioma: experimental models and reality. Acta Neuropathologica. 133 (2), 263-282 (2017).
- Koh, C. M. Preparation of cells for microscopy using cytospin. Methods in Enzymology. 533, 235-240 (2013).
- Hasselbach, L. A., et al. Optimization of high grade glioma cell culture from surgical specimens for use in clinically relevant animal models and 3D immunochemistry. Journal of Visualized Experiments. (83), e51088 (2014).
- Pileri, S. A., et al. Antigen retrieval techniques in immunohistochemistry: comparison of different methods. The Journal of Pathology. 183 (1), 116-123 (1997).
