La prostate humaine contient l'épithélium luminal avec la fonction sécrétrice et les cellules basales la sous-jacente s'il y a un composant neuroendocrine peu commun de cellules. Les cellules épithéliales, dans ce cas, sont générées à partir d'une population rare de cellules souches de la prostate qui sont relativement calmes in vivo et agissent comme un système de réparation pour maintenir l'homéostasie glandulaire tout au long de la vie1. Malgré de nombreux progrès, l'identification et l'isolement fonctionnel des cellules souches de la prostate demeurent un défi majeur dans le domaine. Les biomarqueurs de cellules souches, y compris les méthodologies basées sur les marqueurs de surface cellulaire combinés à la cytométrie du débit sont couramment utilisés pour la recherche sur les cellules souches2,3,4. Cependant, les résultats pour l'enrichissement et l'isolement varient considérablement en fonction des combinaisons de marqueurs et de la spécificité d'anticorps5,6, soulevant des questions au sujet de l'identité des cellules isolées. Une autre approche largement utilisée pour l'enrichissement cellulaire de type souche est la culture sphéroïde tridimensionnelle (3D)2,3,4. Bien que les cellules souches résidentes soient relativement calmes in vivo avec des contraintes de niche, elles subissent une division cellulaire dans la culture de la matrice 3D (à la fois symétrique et asymétrique), générant à la fois des cellules souches et progénitrices qui se reproduisent rapidement vers l'engagement de lignée7,8. Les sphéroïdes formés sont un mélange hétérogène contenant à la fois des cellules souches et des cellules progénitrices à divers stades de l'engagement de la lignée, y compris les cellules progénitrices à un stade précoce et avancé. Ainsi, les essais utilisant l'ensemble des sphéroïdes ne sont pas exclusifs aux cellules souches, ce qui rend l'identification des propriétés uniques des cellules souches non concluante. Par conséquent, il est essentiel de créer des essais pour identifier et séparer les cellules souches de la prostate de leurs ancêtres filles. À cette fin, l'objectif du protocole actuel est d'établir un système d'analyse qui permet l'identification efficace et l'isolement des cellules souches des tissus de la prostate humaine suivies d'une analyse robuste en aval de leurs fonctions biologiques.
La rétention à long terme de l'étiquette 5-bromo-2'-deoxyuridine (BrdU) est largement utilisée pour le traçage in vivo et in vitro des cellules souches en fonction de leur temps de doublement prolongé9,10. L'approche actuelle pour l'identification et l'isolement de cellules souches de prostate décrites ci-dessus est basée sur leurs caractéristiques quiescentes relatives et leurs propriétés d'étiquette-rétention dans une population épithéliale mélangée. En outre, sur la base de l'hypothèse de l'ADN brin immortel, seules les cellules souches peuvent subir une division asymétrique des cellules. La cellule souche représente la cellule fille qui contient l'ADN parental plus ancien tandis que la cellule progénitrice, qui est une cellule fille engagée, reçoit l'ADN nouvellement synthétisé. La propriété unique de cellules souches décrite ci-dessus est exploitée pour effectuer l'étiquetage BrdU dans les cellules souches parentales dans les cultures primaires, puis suivre leur étiquette après BrdU-washout lors du transfert à la culture sphéroïde 3D sans ancrage. Tandis que la majorité des cellules épithéliales primaires de prostate maintiennent un phénotype basal et de transit amplifiant dans la culture 2D, il y a également une population rare de cellules souches multipotentes réapprovisionnant et maintenant l'homéostasie épithéliale comme démontré par la formation des sphéroïdes ou des organoïdes entièrement différenciés avec les médias de culture correspondants sur le transfert aux systèmes 3D3,12. Dans notre protocole actuel, en utilisant des sphéroïdes de la prostate HPrEC ou des tests de rétention BrdU, CFSE ou Far Red à base de prostasphere, suivis du tri des cellules activées par la fluorescence (FACS), nous identifions les cellules souches qui conservent l'étiquette dans les sphéroïdes à un seul niveau cellulaire13.
Fait important, nous avons confirmé en outre les caractéristiques des cellules souches des cellules de rétention d'étiquette dans les sphéroïdes à un stade précoce par rapport aux cellules progénitrices avec engagement de lignée. Ceux-ci incluent la division asymétrique de cellules souches, la capacité de formation sphéroïde in vitro et la capacité de régénération in vivo de tissu, l'activité élevée d'autophagie, la biogenèse augmentée de ribosome et l'activité métabolique diminuée. Par la suite, l'analyse de RNAseq a été exécutée. Des gènes exprimés différemment dans les cellules sphéroïdes qui conservent l'étiquette ont été observés qui peuvent servir de nouveaux biomarqueurs pour les cellules souches de la prostate humaine. Cette approche de conservation de l'étiquette à base de sphéroïdes peut s'appliquer aux échantillons de cancer afin d'identifier de la même façon un petit nombre de cellules souches cancéreuses, offrant ainsi des possibilités translationnelles de gérer les populations résistantes à la thérapeutique13. Présenté ci-dessous est le test de rétention d'étiquette à base de prostasphère à l'aide de cellules épithéliales primaires humaines de la prostate (HPrEC) à titre d'exemple.