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Research Article
Katarzyna Okurowska1,2, Sanhita Roy3, Praveen Thokala4, Lynda Partridge1,5, Prashant Garg3, Sheila MacNeil1,6, Peter N. Monk1,7, Esther Karunakaran1,2
1Sheffield Collaboratorium for Antimicrobial Resistance and Biofilms (SCARAB),University of Sheffield, 2Department of Chemical and Biological Engineering,University of Sheffield, 3Hyderabad Eye Research Foundation,L V Prasad Eye Institute, 4Health Economics and Decision Science, School of Health and Related Research,University of Sheffield, 5Department of Molecular Biology and Biotechnology,University of Sheffield, 6Department of Materials Science and Engineering,University of Sheffield, 7Department of Infection, Immunity and Cardiovascular Disease,University of Sheffield
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Cet article décrit un protocole étape par étape pour mettre en place un modèle ex vivo porcin de kératite bactérienne. Pseudomonas aeruginosa est utilisé comme un organisme prototypique. Ce modèle novateur imite l’infection in vivo car la prolifération bactérienne dépend de la capacité de la bactérie à endommager le tissu cornéen.
Lors du développement de nouveaux antimicrobiens, le succès des essais sur les animaux dépend de l’extrapolation précise de l’efficacité antimicrobienne des tests in vitro aux infections animales in vivo. Les tests in vitro existants surestiment généralement l’efficacité antimicrobienne, car la présence de tissu hôte comme barrière de diffusion n’est pas prise en compte. Pour surmonter ce goulot d’étranglement, nous avons développé un modèle cornéen ex vivo porcin de kératite bactérienne utilisant Pseudomonas aeruginosa comme organisme prototypique. Cet article décrit la préparation de la cornée porcine et le protocole pour l’établissement de l’infection. Les moules en verre sur mesure permettent la configuration simple de la cornée pour des études d’infection. Le modèle imite l’infection in vivo car la prolifération bactérienne dépend de la capacité de la bactérie à endommager le tissu cornéen. L’établissement de l’infection est vérifié comme une augmentation du nombre d’unités formant des colonies évaluées au moyen de dénombrements viables des plaques. Les résultats démontrent que l’infection peut être établie d’une manière hautement reproductible dans les cornées ex vivo en utilisant la méthode décrite ici. Le modèle peut être étendu à l’avenir pour imiter la kératite causée par des micro-organismes autres que P. aeruginosa. Le but ultime du modèle est d’étudier l’effet de la chimiothérapie antimicrobienne sur la progression de l’infection bactérienne dans un scénario plus représentatif des infections in vivo. Ce faisant, le modèle décrit ici réduira l’utilisation d’animaux pour les tests, améliorera les taux de réussite dans les essais cliniques et, en fin de compte, permettra la traduction rapide de nouveaux antimicrobiens à la clinique.
Les infections cornéeennes sont d’importantes causes de cécité et se produisent dans des proportions épidémiques dans les pays à revenu faible ou intermédiaire. L’étiologie de la maladie varie d’une région à l’autre, mais les bactéries représentent une grande majorité de ces cas. Pseudomonas aeruginosa est un agent pathogène important qui provoque une maladie rapidement progressive. Dans de nombreux cas, les patients sont laissés avec des cicatrices stromales, astigmatisme irrégulier, nécessitent une greffe ou dans le pire des cas, perdreun œil 1,2.
La kératite bactérienne causée par P. aeruginosa est une infection oculaire difficile à traiter en particulier en raison de l’émergence croissante de souches résistantes aux antimicrobiens de P. aeruginosa. Au cours de la dernière décennie, il est devenu évident que l’essai et le développement de nouveaux traitements pour les infections cornéeennes, en général, et ceux causés par Pseudomonas sp., en particulier, sont essentiels pour lutter contre la tendance actuelle de la résistanceaux antibiotiques 3.
Pour tester l’efficacité de nouveaux traitements pour les infections cornéeennes, les méthodes microbiologiques in vitro conventionnelles sont un substitut pauvre en raison de la différence de physiologie bactérienne pendant la culture de laboratoire et pendant les infections in vivo ainsi que dues au manque de l’interfacehôte 4,5. Les modèles animaux in vivo, cependant, sont coûteux, prennent beaucoup de temps, ne peuvent fournir qu’un petit nombre de répliques et soulever des préoccupations au sujet du bien-être des animaux.
Dans cet article, nous démontrons un modèle organotypique simple et reproductible ex vivo porcine de kératite qui peut être employé pour tester divers traitements pour des infections aiguës et chroniques. Nous avons utilisé P. aeruginosa pour cette expérience, mais le modèle fonctionne également bien avec d’autres bactéries, et des organismes tels que les champignons et la levure qui causent la kératite.
Les lapins de laboratoire albinos ont été sacrifiés en laboratoire pour d’autres travaux expérimentaux prévus dans le cadre de protocoles approuvés par le siège social. Les yeux n’étaient pas nécessaires pour une utilisation expérimentale dans ces études de sorte qu’ils ont été utilisés pour ce protocole.
1. Stérilisation
2. Collecte d’échantillons
3. Préparation du bouton cornéosclérical
4. Entretien des boutons cornéoscléraux
5. Préparation d’un inoculum
6. Infecter le bouton cornéosclérical
7. Homogénéisation de la cornée pour récolter les bactéries
La conception des moules en verre sont une idée innovante et originale, dont l’utilisation nous a permis de mettre en place le modèle d’une manière cohérente avec un minimum / pas de problèmes avec la contamination. Les moules ont été préparés par un souffleur de verre à l’Université de Sheffield sur la base d’une conception (Figure 1A). La configuration expérimentale maintient la forme convexe de la cornée et maintient les bactéries sur le dessus de l’épithélium où l’infection a lieu (Figure 1B).
Les cornées porcines gonflent habituellement après quelques jours à moyen. C’est normal et nous avons constaté qu’il n’y avait pas de différence significative entre les cornées avec et sans ajout de dextran, qui est habituellement ajouté pour prévenir l’enflure de la cornée (Figure 1H). Les cornées sont généralement blessées pour aider les bactéries à pénétrer l’épithélium. Bien qu’il n’y ait pas eu de différence significative dans le progrès de l’infection entre les cornées blessées (coupées) et non blessées (non coupées), nous avons remarqué plus de variations entre les répliques dans les cornées non coupées (figure 1C). Laver les cornées deux fois avec PBS élimine l’excès de bactéries qui ne se sont pas attachés à l’épithélium. Il y avait une différence significative dans cfu entre les cornées porcines lavées et non lavées infectées par P. aeruginosa PAO1 pendant 24 heures (Figure 1D). Il n’y avait aucune différence significative dans les dénombrements de cfu entre les cornées de porcine et de lapin infectées par PA14 et PAO1(figure 1E,1F). Les résultats pour les deux modèles étaient reproductibles. Après 24 heures, la cornée infectée par l’une ou l’autre souche Pseudomonas développe toujours l’opacité et la zone coupée devient plus visible et ouverte par rapport à la cornée non infectée (Figure 1G).

Figure 1: Ex vivo cornée infectée par Pseudomonas aeruginosa. (A) Image schématique d’un moule en verre utilisé pour maintenir la forme de la cornée et faciliter l’introduction de bactéries et de traitements. L’épaisseur des moules en verre est de 1,5 mm et est la même que l’épaisseur des tubes à essai en verre borosilicate. (B) Image schématique de la mise en place expérimentale. (C) Tester l’effet de la blessure sur le décompte final de l’UNIVERSITÉ après homogénéisation. Les cornées non coupées (n = 16) et coupées (n = 28) ont été infectées par P. aeruginosa PAO1 et P. aeruginosa PA14 pendant 24 heures. Les cornées ont été lavées avec 1 mL de PBS avant homogénéisation. Les barres d’erreur indiquent l’écart type. (D) Tester l’effet du lavage des cornées avec 2 x 1 mL de PBS (n = 6) et ne pas laver (n = 6) sur le décompte final de la CFU après l’infection par P. aeruginosa PAO1 pendant 24 heures. Les barres d’erreur indiquent l’écart type. (E) Compte final de CFU dans les cornées porcines infectées par P. aeruginosa PAO1 et P. aeruginosa PA14 pendant 24 heures (n = 10). Les cornées ont été lavées et coupées. Les barres d’erreur indiquent l’écart type. (F) Compte final de CFU dans les cornées de lapin infectées par P. aeruginosa PAO1 et P. aeruginosa PA14 pendant 24 heures (n = 6). Les cornées ont été lavées et coupées. Les barres d’erreur indiquent l’écart type. (G) Photos de cornées porcines ex vivo infectées par P. aeruginosa PAO1 pendant 24 heures. Le contrôle a été blessé, mais aucune bactérie n’a été ajoutée. Les cornées infectées ont été blessées et 107 CFU ont été ajoutés au côté coupé. Aucun CFU n’a été récupéré de la cornée de contrôle. (H) Le CFU final s’est rétabli après 24 heures d’infection par P. aeruginosa PAO1 des cornées traitées par dextran (n = 2) et celles sans dextran (n = 9). Les cornées ont été lavées et coupées. Les barres d’erreur indiquent l’écart type. S’il vous plaît cliquez ici pour voir une version plus grande de ce chiffre.
Les auteurs n’ont rien à divulguer.
Cet article décrit un protocole étape par étape pour mettre en place un modèle ex vivo porcin de kératite bactérienne. Pseudomonas aeruginosa est utilisé comme un organisme prototypique. Ce modèle novateur imite l’infection in vivo car la prolifération bactérienne dépend de la capacité de la bactérie à endommager le tissu cornéen.
Les auteurs aimeraient remercier Elliot Abattoir à Chesterfield d’avoir fourni des yeux de porcine. Les anneaux de verre ont été fabriqués sur la base de notre conception par le souffleur de verre Dan Jackson du département de chimie de l’Université de Sheffield. Les auteurs remercient le Conseil de recherches médicales (MR/S004688/1) pour son financement. Les auteurs remercient également Mme Shanali Dikwella pour son aide technique à la préparation de la cornée. Les auteurs remercient M. Jonathan Emery pour leur aide dans la mise en forme des images.
| 50 mL Falcon tube | SLS | 352070 | |
| Amphotéricine B | Sigma | A2942 | |
| Cellstar 12 well plate | Greiner Bio-One | 665180 | |
| Dextran | Sigma | 31425-100mg-F | |
| Distel | Fisher Scientific | 12899357 | |
| DMEM + glutamax | SLS | D0819 | |
| Incubateur à deux | fours SLS | OVe1020 | Four de stérilisation |
| Facteur de croissance épidermique | SLS | E5036-200UG | |
| F12 HAM | Sigma | N4888 | |
| Sérum de veau fœtal | Labtech International | CA-115/500 | |
| Forceps | Fisher Scientific | 15307805 | |
| Homogénéisateur à main 220 | Fisher Scientific | 15575809 Homogénéisateur | |
| Heracell VIOS 160i | Thermo Scientific | 15373212 | Incubateur de culture tissulaire |
| Heraeus Megafuge 16R | VWR | 521-2242 | |
| Centrifugeuse Insuline humaine recombinante | SLS | 91077C-1G | |
| LB gélose | Sigma | L2897 | |
| Multitron | Infors | Non applicable | Bactérien incubateur |
| PBS | SLS | P4417 | |
| Pénicilline-Streptomycine | SLS | P0781 | |
| Boîte de Pétri | Fisher Scientific | 12664785 Boîte de | |
| Pétri 35x10mm CytoOne | Starlab | CC7672-3340 | |
| Povidone iodée | Pharmacie Weldricks | 2122828 | |
| Safe 2020 | Fisher Scientific | 1284804 | Armoire de sécurité microbiologique de classe II |
| Lame de scalpel numéro 15 | Fisher Scientific | O305 | |
| Scalpel Swann Morton | Fisher Scientific | 11849002 |