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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Le divisioni cellulari possono essere visualizzate in tempo reale utilizzando proteine fluorescenti e microscopia time-lapse. Utilizzando il protocollo qui presentato, gli utenti possono analizzare le dinamiche di temporizzazione della divisione cellulare, l'assemblaggio del mandrino mitotico e il congresso cromosomico e la segregazione. I difetti in questi eventi a seguito del knockdown genico mediato dall'RNA (RNAi) possono essere valutati e quantificati.
Drosophila Le cellule S2 sono uno strumento importante nello studio della mitosi nella coltura tissutale, fornendo informazioni molecolari su questo processo cellulare fondamentale in modo rapido e ad alta produttività. Le cellule S2 si sono dimostrate suscettibili sia alle applicazioni di imaging a cellule fisse che a quella con cellule vive. In particolare, l'imaging a cellule vive può fornire informazioni preziose su come la perdita o l'abbattimento di un gene può influenzare la cinetica e la dinamica degli eventi chiave durante la divisione cellulare, tra cui l'assemblaggio del mandrino mitotico, il congresso cromosomico e la segregazione, nonché temporizzazione complessiva del ciclo cellulare. Qui utilizziamo le cellule S2 trattate stabilmente con mCherry: z-tubulina fluorescente per contrassegnare il mandrino mitotico e GFP:CENP-A (chiamato gene 'CID' in Drosophila) per contrassegnare il centromero per analizzare gli effetti dei geni mitotici chiave sulla tempistica di divisioni cellulari, dalla profase (in particolare a Nuclear Envelope Breakdown; NEBD) all'inizio dell'anafase. Questo protocollo di imaging consente anche la visualizzazione del microtubulo del mandrino e delle dinamiche cromosomiche in tutta la mitosi. Qui, ci proponiamo di fornire un protocollo semplice ma completo che permetterà ai lettori di adattare facilmente le celle S2 per esperimenti di imaging dal vivo. I risultati ottenuti da tali esperimenti dovrebbero ampliare la nostra comprensione dei geni coinvolti nella divisione cellulare definendo il loro ruolo in diversi eventi simultanei e dinamici. Le osservazioni fatte in questo sistema di coltura cellulare possono essere convalidate e ulteriormente studiate in vivo utilizzando l'impressionante toolkit di approcci genetici nei moscerini.
La Divisione Cellulare è un processo critico per tutti gli organismi multicellulari, sia nel loro sviluppo che nell'omeostasi1. La Drosophila è stata a lungo utilizzata come modello per lo studio della divisione cellulare, con esperimenti in vari tipi di tessuto e condizioni genetiche che forniscono informazioni chiave sul processo. Mentre molte di queste intuizioni provengono da condizioni cellulari fisse, la divisione cellulare è una procedura dinamica con molte parti in movimento, rendendo la visualizzazione delle cellule vive integrale alla valutazione degli effetti di RNAi o di knockout genetico su numerose parti della divisione cellulare, tra cui formazione di mandrini, congresso cromosomico e segregazione, e citocinesi.
Molti protocolli sono stati sviluppati e utilizzati nel corso degli anni per visualizzare le divisioni cellulari della Drosophila in vivo. Vari gruppi hanno coltivato tecniche per l'immagine divisioni in entrambi i dischi larvali e cervelli larvali2,3,4,5,6,7,8 . Queste tecniche, sebbene utili per l'imaging in tessuti specifici, sono limitate nella produttività e spesso richiedono la generazione e il mantenimento di scorte genetiche per generare componenti fluorescenti e alterare l'espressione di geni di interesse. Le cellule S2 coltivate della Drosophila forniscono un'alternativa più elevata alla produttività per testare rapidamente gli effetti di vari geni nella divisione cellulare. Inoltre, con la capacità di trasfecare varie proteine fluorescenti, le cellule S2 possono essere rapidamente modificate per determinare gli effetti del knockdown RNAi su numerosi componenti della divisione cellulare. I geni fluorescenti di interesse possono essere osservati anche nella divisione cellulare, consentendo una caratterizzazione dinamica della loro funzione9.
Qui forniamo un protocollo dettagliato per l'imaging dal vivo delle cellule Mitotiche S2 utilizzando metodi che abbiamo recentemente descritto10. Il nostro metodo utilizza cellule trascate stabilmente con marcatori fluorescenti per microtubuli e centrimeri la cui espressione è sotto il controllo di un promotore inducibile di rame (metallothionein; pMT). Questa metodologia può essere utilizzata per immagini dinamiche del mandrino e del cromosoma in tutte le fasi della mitosi utilizzando un microscopio fluorescente relativamente semplice con un software di imaging di base. Può essere ulteriormente personalizzato per soddisfare le esigenze di ricerca individuali, con la trasfezione transitoria e l'RNAi che offre possibilità ampliate per determinare il ruolo dei geni candidati nella mitosi. A causa della relativa semplicità del protocollo, può essere utilizzato per schermi di perdita di funzione su piccola scala per identificare i geni per i quali sarebbe utile un ulteriore studio in vivo, consentendo sforzi e efficienza più mirati con i successivi manipolazione nelle mosche.
1. Preparazione delle cellule S2 per il trattamento con RNAi
2. Trattamento delle cellule di semi con dsRNA contro i geni di interesse
NOT: L'esempio seguente e la sezione Results useranno Shortstop (Shot), un agente che collega l'atto-microtubulo come gene di interesse. Utilizzare un trattamento fittizio senza dsRNA o con dsRNA diretto contro un gene irrilevante (ad esempio, beta-galactosidase, lacà) come controllo negativo.
3. Induzione dell'espressione proteica fluorescente e preparazione delle cellule per l'imaging
4. Impostare un programma Live Cell Imaging
NOT: Live Cell Imaging in questo esperimento è stato eseguito utilizzando un sistema di imaging invertito e il relativo software (ad esempio, Olympus IX83 con il pacchetto software cellSens Dimensions). I dettagli saranno diversi dal produttore del microscopio e dal pacchetto software; pertanto, le linee guida e le operazioni generali sono elencate di seguito.
5. Immagine dividendo le celle utilizzando il programma di imaging delle celle dal vivo
NOT: Le cellule S2 non richiedono CO2 e crescono in modo ottimale a 23-27 gradi centigradi. Tutte le immagini sono state eseguite a temperatura ambiente in una stanza ben controllata.
I metodi che descriviamo sopra porteranno all'identificazione e all'imaging delle cellule della Drosophila S2 sottoposte a divisione cellulare. Le cellule che stanno per dividersi (cioè, poco prima di entrare nella fase M) possono essere prese di mira dalla presenza di due centrisomi e da un nucleo intatto indicato dalla luce rifratta e da un punto più scuro all'interno della cella quando vengono visualizzati nel canale z-tubulina (Figura 1, pannelli più a sinistra, canale rosso; freccia nella figura 1A). Stimiamo che circa il 2-5% delle cellule rientri in questa categoria, e tra esperimenti di imaging, di solito passiamo un massimo di 2-3 minuti a scansionare per un'altra cella qualificata. NEBD può essere visualizzato attraverso la scomparsa di questa macchia scura, con conseguente colorazione uniforme del citoplasma (Figura 1, pannelli contrassegnati "00:00", rosso). Dopo la NEBD, il tempo che ogni cellula impiega per formare il mandrino, i cromosomi congressuali e separare i cromosomi può essere misurato semplicemente notando i punti temporali di questi eventi rispetto al NEBD.
Utilizziamo queste divisioni per valutare la tempistica mitotica, in particolare di NEBD per l'insorgenza dell'anaphase, notando il punto in cui i cromosomi iniziano a separarsi. La maggioranza (90%) di cellule indotte dal rame, espresse sia mCherry:z-tubulina che GFP:CID. Una piccola percentuale di celle (10%) espresso solo un marcatore o nessuno dei due. Queste cellule sono state evitate durante la selezione delle cellule. In genere, le celle S2 visualizzano NEBD per anaphase insorgenza di tempi compresi tra 20-30 minuti (Figura1A, Controllo). Successivamente abbiamo trattato le cellule con dsRNA mirate contro Shortstop (Shot), una proteina che collega l'atto-microtubulo che sospettavamo possa influenzare la dinamica del ciclo cellulare. Infatti, a seguito di cellule a seguito di Shot knockdown cellule hanno mostrato un significativo ritardo mitotico (Figura 1B, ShotRNAi ritardo), con molte cellule arresto in metafase e mai la transizione ad anaphase durante l'intero esperimento di imaging 2-3 ore (Figura 1D, Arresto di ShotRNAi). Abbiamo motivato questo fenotipo di ritardo/arresto potrebbe essere probabilmente dovuto all'attivazione del checkpoint di assemblaggio del mandrino (cioè il checkpoint della fase M). Per testare direttamente questa ipotesi, abbiamo co-trattato le cellule con dsRNA contro Colpo e Rough deal (Rod), una componente importante di questo checkpoint13. Ciò ha portato a una soppressione del fenotipo di arresto, con conseguente NEBD a tempi di anaphase simili al controllo (Figura 1C, ShotRNAi-RodRNAi). Così, questo protocollo di imaging dal vivo ci ha permesso di concludere che Shot è necessario per la progressione tempestiva della fase M e che la sua perdita porta all'attivazione del checkpoint che ritarda o arresta le cellule mitotiche.

Figura 1: l'imaging dinamico dinamico rivela i difetti del ciclo cellulare dovuti all'attivazione del checkpoint mitotico nelle celle S2.
In tutte le condizioni, l'imaging a cellule vive è stato condotto su cellule S2 co-trascate stabilmente con GFP:CID inducibile e mCherry: (A) I cartoni animati illustrano importanti punti di riferimento durante la mitosi, e le immagini corrispondenti sono mostrate da filmati rappresentativi di genotipi indicati con punti temporali relativi a NEBD (t-00:00) indicati. Le celle di controllo in genere avanzano verso l'anafase entro 20-30 min. Le cellule trattate con ShotRNAi mostrano un ritardo NEBD-anaphase (B) e spesso subiscono l'arresto della metafase, senza mai entrare in anaphase all'interno dell'esperimento di imaging (D). Il co-trattamento delle cellule con ShotRNAi e RodRNAi, un componente del checkpoint di assemblaggio del mandrino, sopprime il fenotipo Shot che porta alla cinetica ad esordio anaphase simile alle cellule di controllo (C). Le frecce in (A) indicano le strutture centrosomere 'stella-like' e la grande punta della freccia indica il nucleo. Ogni barra della scala rappresenta 5 micron. Questa cifra viene adattata e ripubblicata con il permesso di10 (https://www.molbiolcell.org/info-for-authors). Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Video 1: Filmato time-lapse della divisione cellulare S2 di controllo. Il video mostra un filmrappresentativo della divisione cellulare S2 nel genotipo 'Controllo'. Questo filmato corrisponde alla figura 1A. Questo video è adattato e ripubblicato con il permesso da10 (https://www.molbiolcell.org/info-for-authors). Clicca qui per scaricare questo video.
Video 2: Filmato time-lapse della divisione cellulare S2 ritardata 'ShotRNAi'. Il video mostra un film rappresentativo della divisione cellulare S2 nel genotipo 'ShotRNAi' che porta a un ritardo mitotico fenotipica. Questo filmato corrisponde alla figura 1B. Clicca qui per scaricare questo video.
Video 3: Film time-lapse della divisione cellulare S2 'ShotRNAi'RodRNAi'. Il video mostra un film rappresentativo della divisione cellulare S2 nel genotipo 'ShotRNAi'RodRNAi'. Questo filmato corrisponde alla figura 1C. Questo video è adattato e ripubblicato con il permesso da10 (https://www.molbiolcell.org/info-for-authors). Clicca qui per scaricare questo video.
Video 4: Film time-lapse della divisione cellulare S2 arrestata 'ShotRNAi'. Il video mostra un film rappresentativo della divisione cellulare S2 nel genotipo 'ShotRNAi' che porta ad un arresto mitotico fenotipica. Questo filmato corrisponde alla figura 1D. Clicca qui per scaricare questo video.
Gli autori non hanno nulla da dichiarare.
Le divisioni cellulari possono essere visualizzate in tempo reale utilizzando proteine fluorescenti e microscopia time-lapse. Utilizzando il protocollo qui presentato, gli utenti possono analizzare le dinamiche di temporizzazione della divisione cellulare, l'assemblaggio del mandrino mitotico e il congresso cromosomico e la segregazione. I difetti in questi eventi a seguito del knockdown genico mediato dall'RNA (RNAi) possono essere valutati e quantificati.
Questo lavoro è stato finanziato dai National Institutes of Health (R01 GM108756). Siamo grati a Gary Karpen (Università della California, Berkeley) per averci generosamente fornito un stock di linee cellulari GFP:CID S2 da cui è statageneratala nostra linea GFP:CID/mCherry:
| Ematocitometro Bright-Line | Sigma-Aldrich | Z359629-1EA | per conteggio cellulare |
| software di imaging cellSens | Olympus | ||
| CELLSTAR Pallone per colture cellulari, 50 mL, 25 CM2, PS, filtro rosso Tappo a vite, trasparente, sterile, 10 pz/sacchetto | Greiner Bio-One | 690175 | |
| CELLSTAR Piastra multipozzetto per colture cellulari, 6 pozzetti, PS, trasparente, TC, coperchio con anelli di condensazione, sterile, confezione singola | Greiner Bio-One | 657160 | |
| Centrifuge 5804 R | eppendorf | Cat. 022623508 | |
| Solfato di rame(II) pentaidrato, minimo 98% | Sigma-Aldrich | C3036-250G | |
| Corning Siero fetale bovino | FisherScientific | MT35015CV | |
| Reagente per trasfezione Effectene 1 mL | Qiagen | 301425 | per trasfezione transitoria |
| IX-83 Microscopio a epifluorescenza invertita | Olympus | ||
| LabTek Inserto per vetrini camerati | Applied Scientific Instruments | I-3016 | |
| Kit di trascrizione MEGAscript T7 | Thermo Fisher Scientific | AM1334 | Per la produzione di dsRNA |
| MOXI Z Mini kit contatore di cellule automatizzato | ORFLO | MXZ001 | per il conteggio |
| delle celluleMS-2000 XY Flat-Top Automated Stage e controller | Strumenti scientifici | applicati | |
| Nunc Lab-Tek II Coverglass a camera (senza vetro borosilicato da 1,5) | Thermo Fisher Scientific | 155409 | a 8 pozzetti |
| Fotocamera Orca-Flash 4.0 LT | Hammamatsu Photonics K.K. | C11440-42U | |
| pMT/V5-His Vettore di espressione A Drosophila | Thermo Fisher Scientific | V412020 | |
| Poly-L-Lysine | Cultrex | 3438-100-01 | |
| Purificatore Logic+ Classe II, Tipo A2 Armadi di biosicurezza | Labconco | 302310000 | |
| Medium per insetti di Schneider | Sigma-Aldrich | S0146-100ML | |
| Spectra Tub Provette per centrifuga | VWR | 470224-998 | |
| Uner Counter BOD Incubator | Sheldon manufacturing (VWR) | 89409-346 | |
| X-CITE 120 LED | ExcelitasTechnologies | Sorgente luminosa a led | |
| Z -Drift Compensator (ZDC) | Controllodella messa a fuoco a infrarossi | Olympus |