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Research Article
Katarzyna Okurowska1,2, Sanhita Roy3, Praveen Thokala4, Lynda Partridge1,5, Prashant Garg3, Sheila MacNeil1,6, Peter N. Monk1,7, Esther Karunakaran1,2
1Sheffield Collaboratorium for Antimicrobial Resistance and Biofilms (SCARAB),University of Sheffield, 2Department of Chemical and Biological Engineering,University of Sheffield, 3Hyderabad Eye Research Foundation,L V Prasad Eye Institute, 4Health Economics and Decision Science, School of Health and Related Research,University of Sheffield, 5Department of Molecular Biology and Biotechnology,University of Sheffield, 6Department of Materials Science and Engineering,University of Sheffield, 7Department of Infection, Immunity and Cardiovascular Disease,University of Sheffield
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Questo articolo descrive un protocollo passo-passo per impostare un modello suino ex vivo di cheratite batterica. Pseudomonas aeruginosa è usato come organismo prototipico. Questo modello innovativo imita l'infezione in vivo in quanto la proliferazione batterica dipende dalla capacità del batterio di danneggiare il tessuto corneale.
Quando si sviluppano nuovi antimicrobici, il successo delle sperimentazioni sugli animali dipende da un'accurata estrapolazione dell'efficacia antimicrobica dai test in vitro alle infezioni animali in vivo. I test in vitro esistenti in genere sopravvalutano l'efficacia antimicrobica in quanto la presenza del tessuto ospite come barriera di diffusione non è contabilizzata. Per superare questo collo di bottiglia, abbiamo sviluppato un modello corneale suino ex vivo di cheratite batterica usando Pseudomonas aeruginosa come organismo prototipico. Questo articolo descrive la preparazione della cornea suina e il protocollo per l'istituzione dell'infezione. Gli stampi in vetro su misura consentono una configurazione semplice della cornea per gli studi sulle infezioni. Il modello imita l'infezione in vivo poiché la proliferazione batterica dipende dalla capacità del batterio di danneggiare il tessuto corneale. L'accertamento dell'infezione è verificato come un aumento del numero di unità di formazione della colonia valutate tramite conteggio delle piastre vitali. I risultati dimostrano che l'infezione può essere stabilita in modo altamente riproducibile nelle cornee ex vivo utilizzando il metodo qui descritto. Il modello può essere esteso in futuro per imitare la cheratite causata da microrganismi diversi da P. aeruginosa. Lo scopo finale del modello è quello di indagare l'effetto della chemioterapia antimicrobica sui progressi dell'infezione batterica in uno scenario più rappresentativo delle infezioni in vivo. In tal modo, il modello qui descritto ridurrà l'uso di animali per i test, migliorerà i tassi di successo negli studi clinici e, in ultima analisi, consentirà una rapida traduzione di nuovi antimicrobici in clinica.
Le infezioni corneali sono importanti cause di cecità e si verificano in proporzioni epidemiche nei paesi a basso e medio reddito. L'eziologia della malattia varia da regione a regione, ma i batteri rappresentano la grande maggioranza di questi casi. Pseudomonas aeruginosa è un importante agente patogeno che causa una malattia rapidamente progressiva. In molti casi, i pazienti sono lasciati con cicatrici stromali, astigmatismo irregolare, richiedono trapianto o, nel peggiore dei casi, perdono unocchio 1,2.
La cheratite batterica causata da P. aeruginosa è un'infezione oculare difficile da trattare, in particolare a causa della crescente comparsa di ceppi antimicrobici resistenti di P. aeruginosa. Nell'ultimo decennio, è diventato evidente che i test e lo sviluppo di nuovi trattamenti per le infezioni corneali, in generale, e quelli causati da Pseudomonas sp., in particolare, sono essenziali per combattere l'attuale tendenza nella resistenza agli antibiotici3.
Per testare l'efficacia di nuovi trattamenti per le infezioni corneali, i metodi microbiologici convenzionali in vitro sono un surrogato scadente a causa della differenza nella fisiologia batterica durante la coltura di laboratorio e durante le infezioni in vivo, nonché a causa della mancanza dell'interfaccia ospite4,5. I modelli animali in vivo, tuttavia, sono costosi e dispendiosi in termini di tempo, possono fornire solo un piccolo numero di repliche e sollevare preoccupazioni sul benessere degli animali.
In questo articolo, dimostriamo un modello di cheratite organotipica ex vivo semplice e riproducibile che può essere utilizzato per testare vari trattamenti per infezioni acute e croniche. Abbiamo usato P. aeruginosa per questo esperimento, ma il modello funziona bene anche con altri batteri e organismi come funghi e lieviti che causano cheratite.
I conigli da laboratorio albini sono stati sacrificati in laboratorio per altri lavori sperimentali pianificati secondo protocolli approvati dall'ufficio domestico. Gli occhi non erano necessari per l'uso sperimentale in quegli studi, quindi sono stati utilizzati per questo protocollo.
1. Sterilizzazione
2. Raccolta dei campioni
3. Preparazione del pulsante corneosclerale
4. Mantenimento dei bottoni corneosclerali
5. Preparazione di un inoculo
6. Infettare il pulsante corneosclerale
7. Omogeneizzazione della cornea per raccogliere i batteri
Il design degli stampi in vetro è un'idea innovativa e originale, il cui utilizzo ci ha permesso di allevare il modello in modo coerente con problemi minimi/nessun problema di contaminazione. Gli stampi sono stati preparati da un soffiatore di vetro dell'Università di Sheffield sulla base di un progetto(Figura 1A). La configurazione sperimentale mantiene la forma convessa della cornea e trattiene i batteri sulla parte superiore dell'epitelio in cui avviene l'infezione (Figura 1B).
Le cornee suina di solito si gonfiano dopo pochi giorni a medio. Questo è normale e abbiamo scoperto che non c'era alcuna differenza significativa tra cornee con e senza aggiunta di dextran, che di solito viene aggiunto per prevenire il gonfiore della cornea(Figura 1H). Le cornee sono tipicamente ferite per aiutare i batteri a penetrare nell'epitelio. Sebbene non vi sia stata alcuna differenza significativa nel progresso dell'infezione tra cornee ferite (tagliate) e non losse (non tagliate), abbiamo notato più variazioni tra le repliche nelle cornee non tagliate(figura 1C). Lavare le cornee due volte con PBS rimuove i batteri in eccesso che non si attaccavano all'epitelio. C'è stata una differenza significativa nella CFU tra cornee suine lavate e non lavate infettate da P. aeruginosa PAO1 per 24 ore(figura 1D). Non vi è stata alcuna differenza significativa nel numero di CFU tra cornee suine e coniglio infettate da PA14 e PAO1(figura 1E,1F). I risultati per entrambi i modelli erano riproducibili. Dopo 24 ore, la cornea infetta da entrambi i ceppi pseudomonas sviluppa sempre opacità e l'area di taglio diventa più visibile e aperta rispetto alla cornea non infetta (Figura 1G) .

Figura 1: Ex vivo cornea infettato da Pseudomonas aeruginosa. (A) Immagine schematica di uno stampo di vetro utilizzato per mantenere la forma della cornea e facilitare l'introduzione di batteri e trattamenti. Lo spessore degli stampi in vetro è di 1,5 mm ed è lo stesso dello spessore delle provette realizzate in vetro borosilicato. (B)Quadro schematico dell'insieme sperimentale. (C) Verifica dell'effetto del mento sul conteggio finale della CFU dopo l'omogeneizzazione. Le cornee non tagliate (n = 16) e tagliate (n = 28) sono state infettate da P. aeruginosa PAO1 e P. aeruginosa PA14 per 24 ore. Le cornee sono state lavate con 1 mL di PBS prima dell'omogeneizzazione. Le barre di errore indicano la deviazione standard. (D) Testare l'effetto del lavaggio delle cornee con 2 x 1 mL di PBS (n = 6) e non del lavaggio (n = 6) sul conteggio finale della CFU dopo l'infezione da P. aeruginosa PAO1 per 24 ore. Le barre di errore indicano la deviazione standard. (E) Numero finale di CFU nelle cornee suine infettate da P. aeruginosa PAO1 e P. aeruginosa PA14 per 24 ore (n = 10). Le cornee sono state lavate e tagliate. Le barre di errore indicano la deviazione standard. (F) Conteggio finale della CFU nelle cornee di coniglio infettate da P. aeruginosa PAO1 e P. aeruginosa PA14 per 24 ore (n = 6). Le cornee sono state lavate e tagliate. Le barre di errore indicano la deviazione standard. (G) Immagini di cornee suine ex vivo infettate da P. aeruginosa PAO1 per 24 ore. Il controllo è stato ferito ma non sono stati aggiunti batteri. Le cornee infette furono ferite e10 7 CFU furono aggiunti al lato tagliato. Nessun CFU è stato recuperato dalla cornea di controllo. (H) CFU finale recuperato dopo 24 ore di infezione da P. aeruginosa PAO1 da cornee trattate con destro (n = 2) e quelle senza dextran (n = 9). Le cornee sono state lavate e tagliate. Le barre di errore indicano la deviazione standard. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Gli autori non hanno nulla da rivelare.
Questo articolo descrive un protocollo passo-passo per impostare un modello suino ex vivo di cheratite batterica. Pseudomonas aeruginosa è usato come organismo prototipico. Questo modello innovativo imita l'infezione in vivo in quanto la proliferazione batterica dipende dalla capacità del batterio di danneggiare il tessuto corneale.
Gli autori ringraziano Elliot Abattoir a Chesterfield per aver fornito occhi suini. Gli anelli di vetro sono stati realizzati sulla base del nostro design dal soffiatore di vetro Dan Jackson del Dipartimento di Chimica dell'Università di Sheffield. Gli autori ringraziano il Medical Research Council (MR/S004688/1) per il finanziamento. Gli autori ringraziano anche la signora Shanali Dikwella per l'aiuto tecnico nella preparazione della cornea. Gli autori ringraziano l'onorevole Jonathan Emery per l'aiuto nella formattazione delle immagini.
| Provetta Falcon da 50 mL | SLS | 352070 | |
| Amfotericina B | Sigma | A2942 | |
| Piastra Cellstar a 12 pozzetti | Greiner Bio-One | 665180 | |
| Destrano | Sigma | 31425-100mg-F | |
| Distel | Fisher Scientific | 12899357 | |
| DMEM + glutamax | SLS | D0819 | |
| Incubatrice a doppio forno | SLS | OVe1020 | Forno di sterilizzazione |
| Fattore di crescita epidermico | SLS | E5036-200UG | |
| F12 HAM | Sigma | N4888 | |
| Siero fetale di vitello | Labtech International | CA-115/500 | |
| Pinze | Fisher Scientific | 15307805 | |
| Omogeneizzatore portatile 220 | Fisher Scientific | 15575809 | Omogeneizzatore |
| Heracell VIOS 160i | Thermo Scientific | 15373212 | Incubatore per colture tissutali |
| Heraeus Megafuge 16R | VWR | 521-2242 | Centrifuga |
| Insulina, ricombinante Umano | SLS | 91077C-1G | |
| LB agar | Sigma | L2897 | |
| Multitron | Infors | Non applicabile | Batterico incubatrice |
| PBS | SLS | P4417 | |
| Penicillina-Streptomicina | SLS | P0781 | |
| Piastra di Petri | Fisher Scientific | 12664785 | |
| Piastra di Petri 35x10mm CytoOne | Starlab | CC7672-3340 | |
| Iodio povidone | Farmacia Weldricks | 2122828 | |
| Safe 2020 | Fisher Scientific | Cabina | di sicurezza per microbiologia 1284804 Classe II |
| Lama per bisturi numero 15 | Fisher Scientific | O305 | |
| Bisturi Swann Morton | Fisher Scientific | 11849002 |