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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
L'obiettivo di questo protocollo è misurare la contrazione delle colture e quantificare la distribuzione degli alimenti nell'intestino della Drosophila.
La maggior parte degli animali usa il tratto gastrointestinale (GI) per digerire il cibo. Il movimento del cibo ingerito nel tratto GI è essenziale per l'assorbimento dei nutrienti. La motilità e lo svuotamento gastrico disordinato causano molteplici malattie e sintomi. Come potente organismo modello genetico, la Drosophila può essere utilizzata nella ricerca sulla motilità delle GI. Lacoltura di rosophila Dè un organo che contrae e sposta il cibo nel midgut per un'ulteriore digestione, funzionalmente simile allo stomaco di un mammifero. Presentato è un protocollo per studiare la motilità delle colture della Drosophila utilizzando semplici strumenti di misurazione. Viene descritto un metodo per contare le contrazioni delle colture per valutare la motilità delle colture e un metodo per rilevare la distribuzione degli alimenti tinto di blu tra il raccolto e l'intestino utilizzando uno spettrofotometro per studiare l'effetto della coltura sul passaggio degli alimenti. Il metodo è stato utilizzato per rilevare la differenza di motilità delle colture tra il controllo e le mosche mutanti nprl2. Questo protocollo è sia conveniente che altamente sensibile alla motilità delle colture.
La maggior parte degli animali hanno un tubo digestivo chiamato tratto gastrointestinale (GI) per assorbire energia e sostanze nutritive dall'ambiente. Il tratto di GI umano è composto da quattro parti: l'esofago, lo stomaco, l'intestino tenue e l'intestino crasso (colon). Il passaggio alimentare dallo stomaco all'intestino è essenziale per l'assorbimento dei nutrienti. Alcuni effetti, come l'invecchiamento, farmaci tossici, e l'infezione, causano la motilità del tratto GI disordinato e lo svuotamento gastrico, che è legato ad alcune malattie e ai loro sintomi come la dispepsia, la malattia del reflusso gastroesofageo, e costipazione1.
La mosca della frutta (Drosophila melanogaster) è un animale modello ampiamente usato nella ricerca biomedica grazie alla sua facile manipolazione genetica. È importante sottolineare che circa il 77% dei geni associati alla malattia umana ha un omologa nella Drosophila2. La ricerca con la Drosophila ha fatto enormi progressi nella nostra comprensione di molti meccanismi di malattia. Come potente organismo modello genetico, la Drosophila è ampiamente utilizzata nella ricerca sul tratto GI3. La Drosophila ha un tratto digestivo più semplice, che è diviso in tre domini discreti: budello, midgut e hindgut4. Il raccolto, una parte del foregut, è una struttura simile a un sacchetto che funge da sito per lo stoccaggio di cibo ingerito. Il midgut è un tubo lungo e funziona come il sito per la digestione alimentare e l'assorbimento dei nutrienti attraverso lo strato epiteliale, che consiste di enterociti addominali (EC) e cellule di enteroendocrina secretory (EE)5. È interessante notare che la funzione dello stomaco in Drosophila è divisa in due parti: le funzioni delle colture come conservazione degli alimenti e la regione delle cellule di rame (CCR) è una regione altamente acida con un pH < 36. In Drosophila, il cibo ingerito viene inizialmente spostato al raccolto e successivamente pompato nel mezzo budello7. Così, la coltura svolge un ruolo fondamentale nel passaggio del cibo. Avvolto da muscoli viscerali e costituito da una complessa gamma di valvole e sfinteri, il raccolto continua a contrarre e spostare il cibo nel midgut per un'ulteriore digestione.
Questo protocollo consente di rilevare il movimento alimentare dalla coltura al midgut in Drosophila. La contrazione delle colture viene valutata contando la frequenza di contrazione del raccolto. Inoltre, l'effetto della coltura sul passaggio degli alimenti viene studiato rilevando la distribuzione degli alimenti tra colture e intestini. Inoltre, la distribuzione degli alimenti può essere utilizzata per riflettere il movimento alimentare immediato o lo stato degli alimenti di base utilizzando diversi periodi di alimentazione. Nel loro insieme, questo protocollo fornisce metodi per valutare rapidamente la motilità delle colture e il passaggio di cibo nella Drosophila.
1. Mantenere e preparare mosche sperimentali
2. Conteggio delle contrazioni delle colture
3. Preparazione del cibo tato
4. Alimentazione vola con cibo tinto
5. Dissezione mosche e raccolta di campioni di tintura in coltura e budello
6. Calcolo delle quantità di tintura in coltura e budello
Questi metodi per contare la velocità di contrazione delle colture e rilevare la distribuzione degli alimenti tinto possono essere utilizzati per valutare la funzione delle colture sulla motilità degli alimenti. La contrazione del raccolto riflette la frequenza di spingere il cibo nell'intestino. La distribuzione del colorante nella mosca dopo un breve periodo di alimentazione indica il passaggio immediato del cibo dal raccolto al midgut.
Obiettivo di rapamicicina complesso 1 (TORC1) è un regolatore principale che media nutrienti e metabolismo cellulare. L'inibizione TORC1 estende la durata della vita in molti organismi, tra cui la Drosophila. Come inibitore di TORC1, la mosca mutante nprl2 mostra l'iperattivazione dei difetti di digestione TORC1 e GI8,9. La dimensione del raccolto in un mutante nprl2 è normale a 3 giorni e ingrandita a 15 giorni di età, rispetto al suo controllo genetico dello sfondo (yw)8. Per valutare il test sulla motilità delle colture, sono state utilizzate mosche mutanti e controlli di yw di 3 giorni. yw Ogni coltura è stata conteggiata cinque volte ed è stato utilizzato il valore medio(tabella supplementare 1). Il numero della contrazione delle colture durante le cinque ripetizioni era simile, il che suggerisce che la PBS potrebbe non influenzare la fisiologia delle colture in brevi poppate ed è adatta per il conteggio della contrazione delle colture. La mutazione nprl2 ha ridotto significativamente il tasso di contrazione delle colture (Figura 1).
Simile allo stomaco dei mammiferi, il raccolto della Drosophila continua a contrarsi per spostare il cibo nell'intestino. Per confermare ulteriormente la funzione di Nprl2 sulla coltura, è stato rilevato il movimento alimentare. Le mosche sono state alimentate con cibo tinto per 30 min e sezionato immediatamente per rilevare la quantità di colorante nel raccolto e l'intestino utilizzando la spettrofotometria. Come mostrato nella Figura 2A, le quantità di colorante blu nelle colture di controllo e i mutanti nprl2 erano simili, in linea con la dimensione comparabile delle colture8. I mutanti nprl2 avevano meno tintura nell'intestino, che può essere associata alla diminuzione del tasso di contrazione (Figura 2B).

Figura 1: Differenza di contrazione delle colture tra il controllo e i maschi mutanti nprl2. Le mosche maschili di 3 giorni sono state sezionate e il tasso di contrazione del grano è stato contato. La frequenza di contrazione del ritaglio di ogni mosca viene visualizzata come punto dati. Le barre di errore rappresentano SD dal punto dati indicato. , P < 0.001. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.

Figura 2: Differenza di distribuzione alimentare tra il controllo e i maschi mutanti nprl2 dopo un breve tempo di alimentazione. Le mosche maschili di 3 giorni sono state alimentate con cibo contenente 0,5% di colorante blu per 30 min e poi sezionato immediatamente per rilevare la quantità di colorante. (A) La quantità di colore nel raccolto. (B) La quantità di tinri nell'intestino senza raccolto. P < 0,01; NS, non significativo. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Tabella supplementare 1: I dati originali di contrazione del raccolto utilizzati nella Figura 1. Fare clic qui per scaricare questa tabella.
Gli autori non hanno nulla da rivelare.
L'obiettivo di questo protocollo è misurare la contrazione delle colture e quantificare la distribuzione degli alimenti nell'intestino della Drosophila.
Questo lavoro è stato sostenuto dalla National Natural Science Foundation of China (n. 31872287), Natural Science Foundation of Jiangsu Province (NO. BK20181456) e sei picchi di talenti progetto nella provincia di Jiangsu (n. SWYY-146).
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