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Research Article
Katarzyna Okurowska1,2, Sanhita Roy3, Praveen Thokala4, Lynda Partridge1,5, Prashant Garg3, Sheila MacNeil1,6, Peter N. Monk1,7, Esther Karunakaran1,2
1Sheffield Collaboratorium for Antimicrobial Resistance and Biofilms (SCARAB),University of Sheffield, 2Department of Chemical and Biological Engineering,University of Sheffield, 3Hyderabad Eye Research Foundation,L V Prasad Eye Institute, 4Health Economics and Decision Science, School of Health and Related Research,University of Sheffield, 5Department of Molecular Biology and Biotechnology,University of Sheffield, 6Department of Materials Science and Engineering,University of Sheffield, 7Department of Infection, Immunity and Cardiovascular Disease,University of Sheffield
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이 문서에서는 세균 성 각질염의 전 생체 돼지 모델을 설정하는 단계별 프로토콜을 설명합니다. 슈도모나스 아에루기노사는 대생 유기체로 사용된다. 이 혁신적인 모델은 세균성 증식이 각막 조직을 손상시키는 박테리아의 능력에 달려 있기 때문에 생체 내 감염을 모방합니다.
새로운 항균제가 개발될 때, 동물 실험의 성공은 생체 외 실험에서 생체 내 동물 감염에 항균 효능의 정확한 외삽에 달려 있습니다. 기존 시험관내 시험은 전형적으로 확산 장벽으로서 숙주 조직의 존재가 고려되지 않기 때문에 항균 효능을 과대 평가한다. 이 병목 현상을 극복하기 위하여는, 우리는 초원 유기체로 슈도모나스 aeruginosa를 사용하여 세균 각질염의 전 생체 돼지 각막 모형을 개발했습니다. 이 문서에서는 감염의 확립을 위한 돼지 각막 및 프로토콜의 준비를 설명합니다. 맞춤형 유리 금형은 감염 연구를 위해 각막의 간단한 설정을 가능하게 합니다. 이 모델은 세균성 증식이 각막 조직을 손상시키는 박테리아의 능력에 따라 생체 내 감염을 모방합니다. 감염의 확립은 실행 가능한 플레이트 수를 통해 평가된 식민지 형성 단위의 수의 증가로 확인됩니다. 결과는 여기에 설명된 방법을 사용하여 전 생체 내 각막에서 매우 재현 가능한 방식으로 감염이 확립될 수 있음을 보여준다. 이 모델은 P. aeruginosa이외의 미생물에 의한 각질염을 모방하기 위해 미래에 확장 될 수있다. 모델의 궁극적인 목표는 생체 내 감염을 더 대표하는 시나리오에서 세균 감염의 진행에 항균 화학 요법의 효과를 조사하는 것입니다. 이렇게함으로써, 여기에서 기술된 모형은 시험을 위한 동물의 사용을 감소시키고, 임상 시험에서 성공률을 향상하고 궁극적으로 병원에 새로운 항균제의 급속한 번역을 가능하게 할 것입니다.
각막 감염은 실명의 중요한 원인이며 저소득 및 중간 소득 국가에서 전염병 비율에서 발생합니다. 질병의 병인학은 지역마다 다르지만 박테리아는 이러한 경우의 대부분을 차지합니다. 슈도모나스 아에루기노사는 급속하게 진보적인 질병을 일으키는 원인이 되는 중요한 병원체입니다. 많은 경우에, 환자는 기질 흉터, 불규칙한 난시로 남아, 이식을 요구하거나 최악의 시나리오에서, 눈1을잃고1,2.
P. aeruginosa에 기인한 세균성 각질염은 P. aeruginosa의항균 저항긴장의 증가 출현 때문에 특히 취급하기 어려운 눈 감염입니다. 지난 10 년 이내에, 각막 감염에 대한 새로운 치료법을 테스트하고 개발하는 것이 명백해졌으며, 일반적으로 슈도모나스 스프에 의해 유발된 치료법은 특히 항생 저항3의현재 추세에 대처하는 데 필수적입니다.
각막 감염에 대한 새로운 치료법의 효능을 시험하기 위해, 기존의 체외 미생물 방법은 실험실 배양 중 및 생체 내 감염 시 세균성 생리학의 차이로 인해 대리가 좋지 않은 반면, 호스트 인터페이스4,5의부족으로 인한 것이다. 그러나 생체 내 동물 모델은 비용이 많이 들고 시간이 많이 소요되며 소수의 복제본만 전달하고 동물 복지에 대한 우려를 제기할 수 있습니다.
이 기사에서는 급성 및 만성 감염에 대한 다양한 치료를 테스트하는 데 사용할 수있는 각질염의 간단하고 재현 가능한 organotypic ex vivo 돼지 모델을 시연합니다. 우리는 이 실험을 위해 P. aeruginosa를 사용했습니다 그러나 모형은 또한 다른 박테리아및 각질염을 일으키는 원인이 되는 균류 및 효모와 같은 유기체와 잘 작동합니다.
Albino 실험실 토끼는 홈 오피스 승인 프로토콜에서 다른 계획된 실험 작업을 위해 실험실에서 희생되었습니다. 눈은 이 프로토콜에 사용되었기 때문에 그 연구 결과에 있는 실험적인 사용을 위해 필요하지 않았습니다.
1. 살균
2. 샘플 컬렉션
3. 코네클레럴 버튼 준비
4. 코네클레럴 버튼 의 유지 보수
5. 접종 준비
6. 코네클레럴 버튼 감염
7. 박테리아를 수확하기 위해 각막의 균질화
유리 금형의 디자인은 혁신적이고 독창적 인 아이디어이며, 이를 통해 오염에 대한 최소한의 문제 / 전혀 문제가없는 일관된 방식으로 모델을 설정할 수 있었습니다. 금형은설계(그림 1A)에기초하여 셰필드 대학의 유리 송풍기로 제조하였다. 실험용 설정은 각막의 볼록 모양을 유지하고 감염이 발생하는 상피의 상단에 박테리아를 보유합니다(도1B).
돼지 각막은 일반적으로 매체에서 며칠 후 팽창. 이것은 정상이며 우리는 일반적으로 각막(도 1H)의붓기를 방지하기 위해 추가되는 dextran의 추가와 함께 및 추가없이 각막 사이에 유의한 차이가 없다는 것을 발견했습니다. 각막은 일반적으로 박테리아가 상피를 관통하는 것을 돕기 위하여 상처를 입습니다. 상처 (절단)와 상처 (절단되지 않은) 각막 사이의 감염의 진행에 유의한 차이가 없었지만, 우리는 절단되지 않은 각막(그림 1C)에서복제 사이의 더 많은 변형을 발견했다. PBS로 각막을 두 번 세척하면 상피에 부착되지 않은 과도한 박테리아를 제거합니다. 24시간 동안 P. aeruginosa PAO1에 감염된 세척및 세척되지 않은 돼지 각막 사이에 CFU에 상당한 차이가 있었다(도1D). PA14와 PAO1에 감염된 돼지와 토끼 각막 사이에 CFU 수에 유의한 차이가없었다(도 1E,1F). 두 모델의 결과는 재현할 수 있었습니다. 24시간 후, 슈도모나스 균주에 감염된 각막은 항상 불투명도를 개발하고 절단 부위는 감염되지 않은 각막(도1G)에비해 더 눈에 띄고 개방된다.

그림 1: 슈도모나스 아에루기노사에감염된 Ex vivo 각막 . (A)각막의 모양을 유지하고 박테리아및 치료의 도입을 용이하게하는 데 사용되는 유리 금형의 회로도 그림. 유리 금형의 두께는 1.5 mm이며 보로실리케이트 유리로 만든 테스트 튜브의 두께와 동일합니다. (B)실험 설정의 회로도 그림. (C)균질화 후 최종 CFU 수에 상처의 효과를 테스트합니다. 절단 해제(n = 16) 및 절단(n = 28) 각막은 24시간 동안 P. aeruginosa PAO1 및 P. aeruginosa PA14에 감염되었다. 각막은 균질화하기 전에 PBS의 1 mL로 세척되었다. 오류 막대는 표준 편차를 나타냅니다. (D)24시간 동안 P. aeruginosa PAO1감염 후 최종 CFU 카운트에 2 x 1 mL의 PBS(n=6)를 세척하지 않고 세척하지 않는 각막 세척 효과를 테스트한다. 오류 막대는 표준 편차를 나타냅니다. (E) P. aeruginosa PAO1 및 P. aeruginosa PA14에 감염된 돼지 각막에서 최종 CFU 카운트24 시간 (n = 10). 각막은 씻고 잘라냈다. 오류 막대는 표준 편차를 나타냅니다. (F) P. aeruginosa PAO1 및 P. aeruginosa PA14에 감염된 토끼 각막에서 최종 CFU 카운트 24 시간 (n = 6). 각막은 씻고 잘라냈다. 오류 막대는 표준 편차를 나타냅니다. (G) P. aeruginosa PAO1에 감염된 전 생체 돼지 돼지 각막의 사진 24 시간. 통제는 부상을 입었지만 박테리아는 추가되지 않았습니다. 감염된 각막이 부상을 입었고 107 개의 CFU가 절단 측에 추가되었습니다. 제어 각막에서 CFU가 복구되지 않았습니다. (H) 최종 CFU는 Dextran (n = 2)로 처리 된 각막에서 P. aeruginosa PAO1및 dextran (n = 9)이없는 것과 24 시간 동안 감염 된 후에 회복되었습니다. 각막은 씻고 잘라냈다. 오류 막대는 표준 편차를 나타냅니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
저자는 공개 할 것이 없습니다.
이 문서에서는 세균 성 각질염의 전 생체 돼지 모델을 설정하는 단계별 프로토콜을 설명합니다. 슈도모나스 아에루기노사는 대생 유기체로 사용된다. 이 혁신적인 모델은 세균성 증식이 각막 조직을 손상시키는 박테리아의 능력에 달려 있기 때문에 생체 내 감염을 모방합니다.
저자는 체스터 필드의 엘리엇 아바토이르에게 돼지 눈을 제공해 준 것에 대해 감사드립니다. 유리 링은 셰필드 대학의 화학학과의 유리 송풍기 댄 잭슨 (Dan Jackson)의 설계를 기반으로 만들어졌습니다. 저자는 자금 조달을 위한 의학 연구 위원회 (MR/S004688/1)를 감사하고 싶습니다. 저자는 또한 각막 준비에 대한 기술적 인 도움을 샤날리 딕웰라 부인에게 감사드립니다. 저자는 사진 서식에 도움을 준 조나단 에머리 씨에게 감사드립니다.
| 50mL 팔콘 튜브 | SLS | 352070 | |
| 암포테리신 B | 시그마 | A2942 | |
| Cellstar 12 웰 플레이트 | Greiner Bio-One | 665180 | |
| 덱스트란 | 시그마 | 31425-100mg-F | |
| Distel | Fisher Scientific | 12899357 | |
| DMEM + glutamax | SLS | D0819 | |
| 듀얼 오븐 인큐베이터 | SLS | OVe1020 | 살균 오븐 |
| 표피 성장 인자 | SLS | E5036-200UG | |
| F12 HAM | Sigma | N4888 | |
| 태아 송아지 혈청 | Labtech International | CA-115/500 | |
| 집게 | Fisher Scientific | 15307805 | |
| 휴대용 균질기 220 | Fisher Scientific | 15575809 | Homogeniser |
| Heracell VIOS 160i | Thermo Scientific | 15373212 | 조직 배양 인큐베이터 |
| Heraeus Megafuge 16R | VWR | 521-2242 | 원심분리기 |
| 인슐린, 재조합 Human | SLS | 91077C-1G | |
| LB Sigma | L2897 | ||
| Multitron | Infors | 적용 불가 | 세균성 인큐베이터 |
| PBS | SLS | P4417 | |
| 페니실린-스트렙토마이신 | SLS | P0781 | |
| 페트리 접시 | Fisher Scientific | 12664785 | |
| 페트리 접시 35x10mm CytoOne | Starlab | CC7672-3340 | |
| 포비돈 요오드 | Weldricks 약국 | 2122828 | |
| Safe 2020 | Fisher Scientific | 1284804 | 클래스 II 미생물학 안전 캐비닛 |
| 메스 블레이드 번호 15 | Fisher Scientific | O305 | |
| 메스 Swann Morton | Fisher Scientific | 11849002 |