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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
이 문서는 공초점 살아있는 현미경 검사를 사용하여 1 차해 및 피질 뉴런에 있는 급성 동요에 기초 redox 상태 및 redox 반응에 있는 다름을 결정하는 프로토콜을 기술합니다. 프로토콜은 최소한의 수정으로 다른 세포 유형 및 현미경에 적용 될 수 있습니다.
미토콘드리아 레독스 항상성은 신경 생존력과 기능에 중요합니다. 미토콘드리아는 여러 레독스 시스템을 포함하고 있지만, 매우 풍부한 티올-디설파이드 레독스 버퍼 글루타티온은 항산화 방어의 핵심 선수로 간주됩니다. 따라서 미토콘드리아 글루타티온 레독스 전위를 측정하면 미토콘드리아 레독스 상태 및 산화 스트레스에 대한 유용한 정보를 제공한다. 글루타레독신1-roGFP2(Grx1-roGFP2)는 510m에서 단일 방출 피크를 가진 400nm및 490nm에서 2개의 레독스 상태 민감성 난초 피크를 가진 글루타티온 레독스 전위(GFP)-기반 의 유전자 인코딩된 녹색 형광 단백질(GFP)기반 의 비율 지표이다. 이 문서는 1 차해 및 피질 뉴런에서 미토콘드리아 표적 Grx1-roGFP2의 공초점 살아있는 현미경 검사를 수행하는 방법을 설명합니다. 그것은 정상 상태 미토콘드리아 글루타티온 redox 잠재력을 평가하는 방법을 설명 (예를 들어, 질병 상태 또는 장기 치료를 비교) 급성 치료에 레독스 변화를 측정하는 방법 (엑시토 독성 약물 N-메틸-D-아스파르타트 (NMDA를 사용하여) 예를 들어). 또한, 이 기사는 Grx1-roGFP2 및 미토콘드리아 막 전위 지표인 테트라메틸lr호다민, 에틸 에스테르(TMRE)의 공동 이미징을 제시하여 Grx1-roGPF2가 다중 파라메트릭 분석을 위한 추가 지표로 어떻게 멀티플렉스화될 수 있는지를 보여줍니다. 이 프로토콜은 (i) 공초점 레이저 스캐닝 현미경 설정을 최적화하는 방법에 대한 자세한 설명을 제공하고, (ii) 디아미드및 디티오스레이톨로 센서 교정을 거쳐 자극을 위한 약물을 적용하고, (iii) ImageJ/FIJI로 데이터를 분석한다.
몇몇 중요한 미토콘드리아 효소 및 신호 분자는 티올 레독스 규정1의 적용을 받습니다. 더욱이, 미토콘드리아는 반응성 산소 종의 주요 세포 공급원이며 산화 손상에 선택적으로 취약하다2. 따라서, 미토콘드리아 레독스 전위는 생체 에너지, 세포 신호, 미토콘드리아 기능 및 궁극적으로 세포 생존가능성에 직접적인 영향을 미친다3,4. 미토콘드리아 매트릭스는 레독스 항상성을 유지하고 항산화 방어를 탑재하기 위해 티올-디설파이드 레독스 완충글루타티온(GSH)의 고량(1-15 mMM)을 함유하고 있다. GSH는 표적 단백질(S-글루타티온분해)에 공유하여 레독스 상태와 활성을 조절할 수 있으며 산화 단백질을 감소시키는 다양한 해독 효소에 의해 사용됩니다. 따라서 미토콘드리아 글루타티온 레독스 전위는 미토콘드리아 기능 및 병리생리학을 연구할 때 매우 유익한 매개 변수입니다.
roGFP2는 인공 디티올-이설화 쌍을 형성하는 두 개의 표면 노출 시스테인을 첨가하여 레독스에 민감하게 만들어진 GFP의 변종이다7,8. ~510nm에서 단일 방출 피크와 ~400 nm 및 490 nm에서 두 개의 여기 봉우리가 있습니다. 중요한 것은, 두 개의 여기 피크의 상대진폭은 roGFP2(도 1)의 레독스 상태에 따라 달라지며, 이 단백질을 비율 센서로 만듭니다. Grx1-roGFP2 센서에서 인간 글루타레독신-1(Grx1)이 roGFP29,10의 N-종자에 융합되었습니다. roGFP2에 대한 Grx1 효소의 공유 부착은 센서의 두 가지 주요 개선을 제공합니다: GSH/GSSG 글루타티온 레독스 쌍(그림 1)에 대한 센서 반응을 특정하게 만들고, GSSG와 roGFP2 간의 평형을 최소 100,0009배 이상의 비율로 가속화합니다. 따라서 Grx1-roGFP2는 세포 글루타티온 레독스 전위의 특이적이고 역동적인 이미징을 가능하게 합니다.
Grx1-roGFP2 이미징은 넓은 범위의 현미경으로 수행될 수 있으며, 여기에는 넓은 필드 형광 현미경, 회전 디스크 공초점 현미경 및 레이저 스캐닝 공초점 현미경이 포함됩니다. 1차 뉴런에서 센서의 발현은 lipofection11, DNA/칼슘-인산염 인산염 인계 연수량, 바이러스 매개 유전자 전달, 또는 형질전환 동물의 세포를 세포 공급원으로 사용하는 등 다양한 방법에 의해 달성될 수 있다(그림 2). AAV1 및 AAV2 캡시드 단백질 13,14의 1:1 비율을 포함하는 의사형 재조합 아데노 관련 바이러스(rAAV)가 이 문서에서 실험을 위해 사용되었다. 이 벡터를 사용하면 최대 센서 발현은 일반적으로 감염 후 4-5 일에 도달하고 적어도 2 주 동안 안정적으로 유지됩니다. 우리는 성공적으로 마우스와 쥐에서 1 차해 및 피질 뉴런에서 Grx1-roGFP2를 사용했습니다.
이 문서에서는, 1차 쥐 해마 및 피질 뉴런에서 미토콘드리아 표적 Grx1-roGFP2의 rAAV 매개 발현은 기저 미토콘드리아 글루타티온 레독스 상태와 급성 변투를 평가하는 데 사용된다. (i) 레이저 스캐닝 공초점 현미경 설정을 최적화하는 방법에 대한 자세한 지침과 함께 공초점 라이브 이미징을 위한 프로토콜이 제공되며, (ii) 라이브 이미징 실험을 실행하고 (iii) FIJI와 데이터를 분석한다.
모든 동물 실험은 유럽 의회의 이사회 지침 2010/63/EU를 포함하여 국가 및 제도적 지침에 부합하고, 전체 홈 오피스 윤리 승인을했다 (하이델베르크 동물 복지 사무소와 레지에룽스프라에시듐 카를스루에 대학, 라이센스 T14/21 및 T13/21). 1차 해마 및 피질 뉴런은 표준 절차에 따라 신생아 마우스 또는 쥐 새끼로부터 제조되었으며, 이전에 설명된 바와 같이 12-14일 동안 유지되었다.
1. 솔루션 준비
| 구성 요소 | MW | 농도 (M) | 양(g) | 볼륨(mL) |
| 나Cl | 58.44 | 5 | 14.61 | 50 |
| KCl | 74.55 | 3 | 1.12 | 5 |
| MgCl2, 6H2O | 203.3 | 1.9 | 2 | 5 |
| 카Cl2·2H2O | 147.01 | 1 | 1.47 | 10 |
| 글리신 | 75.07 | 0.1 | 0.375 | 50 |
| 자당 | 342.3 | 1.5 | 25.67 | 50 |
| 피루바테 나트륨 | 110.04 | 0.1 | 0.55 | 50 |
| 헤페스 | 238.3 | 1 | 11.9 | 50 |
| 포도당 | 180.15 | 2.5 | 45 | 100 |
표 1: 이미징 버퍼용 스톡 솔루션입니다.
| 구성 요소 | 스톡 솔루션(M) | 최종 농도(mM) | 볼륨(mL) |
| 나Cl | 5 | 114 | 2.3 |
| KCl | 3 | 5.29 | 0.176 |
| MgCl2 | 1.9 | 1 | 0.053 |
| 카Cl2 | 1 | 2 | 0.2 |
| 글리신 | 0.1 | 0.005 | 0.005 |
| 자당 | 1.5 | 52 | 3.5 |
| 피루바테 나트륨 | 0.1 | 0.5 | 0.5 |
| 헤페스 | 1 | 10 | 1 |
| 포도당 | 2.5 | 5 | 0.2 |
표 2: 이미징 버퍼의 구성. 표시된 볼륨은 이미징 버퍼의 100mL의 제조를 위해 사용됩니다.
2. TMRE를 가진 셀로드
참고: 이 프로토콜에서 TMRE는 20nM의 최종 농도에서 비담금전 모드15 에 사용됩니다. 일반적으로, 선택의 현미경에 충분한 신호 강도를 제공하는 TMRE의 가장 낮은 가능한 농도가 사용되어야한다. 고르지 않은 증발로 인해, 다른 우물에서 매체의 양은 장기 기본 문화권에서 다를 수 있습니다. 모든 우물에서 일관된 TMRE 농도를 보장하기 위해 우물에 TMRE를 직접 추가하지 마십시오. 대신 각 우물의 배지를 동일한 양의 TMRE 함유 매체로 교체합니다. 아래 프로토콜은 잘 당 중간의 ~ 1 mL를 포함하는 24 웰 플레이트에서 기본 뉴런을 위해 설계되었습니다.
3. 공초점 현미경 설정 스캐닝 최적화
참고: 이 단계는 라이브 이미징 중에 이미지 품질과 세포 생존 가능성 사이의 최상의 절충안을 찾는 것을 목표로 합니다. 이 섹션에서는 roGFP 이미징에 대한 설정 최적화에 대해 설명합니다. 다단계 이미징이 수행되는 경우 표백 또는 광독성의 징후가없는 안정적인 기준선 검사를 포함하여 유사한 최적화가 추가 지표에 대해 수행되어야합니다.
4. 기초 레독스 상태 평가
5. 급성 치료의 라이브 이미징
참고: 아래 프로토콜은 NMDA 치료에 미토콘드리아 레독스 반응의 이미징을 설명합니다. 다른 치료법에 맞게 이미지 간격과 실험 기간을 조정해야 할 수도 있습니다.
6. 데이터 분석

성장 인자 철수 후 정상 상태 미토콘드리아 레독스 상태의 차이의 정량화
미토콘드리아 레독스 상태에서 정상 상태 차이의 정량화를 입증하기 위해, 표준 배지에서 자란 1차 뉴런은 이미징 전에 48h의 성장 인자 없이 배양된 뉴런과 비교하였다. 성장 인자 철수 결과 후 세포 세포 죽음 72 h16. 세포는 이것이 미토콘드리아 레독스 상태의 변화에 선행되는 경우에 시험하기 위하여 48 시간 후에 심상되었습니다. 폴리 L-ornithine 코팅 커버립에서 자란 1차 쥐 피질 뉴런은 체외 6(DIV6)에서 며칠 동안 rAAV-mito-Grx1-roGFP2에 감염되어 DIV12에서 이미지화되었다. 라이브 이미징은 40x/1.10 물 침수 목표를 갖춘 반전된 레이저 스캐닝 공초점 현미경에 대한 이 프로토콜의 섹션 4에 따라 실온에서 수행되었다. 공초점 설정은 핀홀 7 통풍 유닛, 픽셀 크기 568.7 nm (512 x 512 픽셀), 스캔 속도 600 Hz, 레이저 파워 405 nm 3%, 레이저 파워 488 nm 1%, 배출 대역폭 505-550 nm, 프레임 평균 4. 두 조건의 원시 405:488 nm 비율 사이에는 큰 차이가 없었다(그림 3B). 데이터 정규화 후, 405:488 nm 비율이 증가한 세포의 하위 집합은 성장 인자 철수 그룹에서 검출가능하였다(도 3C). 이것은 미토콘드리아 redox 변경이 신경 세포 죽음 앞에 있을 수 있다는 것을 표시하고, 그룹 사이 기초 redox 상태의 비교를 위한 최대/min 데이터 정규화의 관련성을 강조합니다.
NMDA를 가진 신경의 처리시 미토콘드리아 레독상태에 있는 동적 변경
NMDA 형 글루타민산 체 (NMDAR) 신경 가소성에 있는 중심 적인 역할을 하지만 또한 신경 손상 및 세포 죽음을 중재할 수 있습니다. NMDAR의 병리학적 활성화는 매트릭스 칼슘 과부하, 미토콘드리아 산화 및 단편화, 미토콘드리아 투과성 전이를 포함하는 미토콘드리아에 대한 몇 가지 부작용으로 이어집니다. 이전 연구에서는, 전술한 프로토콜은 NMDA 유도된 미토콘드리아 칼슘 과부하와 미토콘드리아 산화 13 사이의 인과 관계를 조사하기 위해 사용되었다. 폴리-D-리신/라미닌 코팅 커버립에서 자란 1차 쥐 해마 뉴런은 DIV4에서 rAAV-mito-Grx1-roGFP2에 감염되어 DIV12에서 이미지화되었다. 라이브 이미징은 20x/0.75 다중 침수 목표(수분 침수가 사용되었습니다)와 무대 내 인큐베이션 시스템을 갖춘 반전 된 회전 디스크 공초점 현미경에 37 °C에서 수행되었다. Mito-Grx1-roGFP2는 405 nm 및 488 nm 레이저 라인을 사용하여 20s마다 순차적으로 흥분했으며, 배출은 두 내분 파장에 대해 527/55 nm 방출 필터로 수집되었습니다. 30 μM NMDA를 가진 뉴런의 처리는 몇 분 안에 미토콘드리아의 산화를 일으켰습니다 (그림 4A, B). 특히, NMDA 유도 미토콘드리아 산성소증은 잘 알려진 pH 감도8에 따라 roGFP2 형광의 상당한 담금질을 일으켰습니다. 이러한 pH 의존적 담금질이 405:488 비율9에 영향을 미치지 않았음을 확인하기 위해, 미토콘드리아는 대조군 실험에서 NMDA를 첨가하기 전에 DA에 의해 완전히 산화되었다. DA를 가진 전처리는 NMDA에 의하여 미토콘드리아의 추가 산화를 배제하고, 따라서, 405:488 비율은 roGFP2 형광 강도의 상당한 담금질에도 불구하고 이 실험에서 변경되지 않았습니다 (도 4C).
수지상 미토콘드리아의 NMDA 유도 된 변화의 다단계 분석
미토콘드리아 형태, 막 전위 및 레독스 상태의 NMDA 유도된 변화의 시간적 서열을 평가하기 위해 TMRE-및 미토-Grx1-roGFP2 형광의 병렬 이미징은 높은 공간 및 측두성 해상도로 수행되었다. 폴리 L-ornithine 코팅 커버립에서 자란 1차 쥐 피질 뉴런은 DIV6에서 rAAV-mito-Grx1-roGFP2에 감염되어 DIV12에서 이미지화되었다. 라이브 이미징은 63x/1.40 오일 침지 목표, 600Hz의 스캔 속도, 90.2nm(2배 스캔 줌시 1024 x 1024픽셀), 3개의 공기 단위의 핀홀 크기, 평균 2개의 프레임을 사용하여 반전된 공초점 레이저 스캐닝 현미경의 실온에서 수행되었다. 매 30 s, 세 이미지는 순차 모드로 기록되었다 : 405 nm 여기 / 505-550 nm 방출; 488 nm 흥분/505-550 nm 방출; 552 nm 여기/560-600 nm 방출. 60 μM NMDA를 가진 뉴런의 처리는 TMRE 신호의 손실 및 405:488 nm roGFP 비율에 있는 증가 귀착되고, 미토콘드리아의 몇몇 연기한 반올림에 선행된 그(그림 5).

그림 1: Grx1-roGFP2 기능 및 roGFP2 흥분 스펙트럼의 회로도 표현. (A) 산화 스트레스및 항산화 방어 시스템의 작용은 세포 글루타티온 풀을 산화한다. Grx1-roGPF2 융합 단백질내의 Grx1은 글루타티온 풀의 레독스 상태로 roGFP2 레독스 상태의 신속한 평형을 촉진합니다. roGFP2 풀의 레독스 상태는 405 nm 및 488 nm에서 흥분 후 510 nm에서 GFP-형광 방출의 비율을 모니터링하여 평가할 수 있다. 감소 된 종은 파란색으로 표시됩니다; 산화된 종은 빨간색으로 표시됩니다. (B) 완전히 감소된(파란색) 및 산화(빨간색) roGFP2의 흥분 스펙트럼. roGFP2의 산화시, 400 nm 흥분에서 형광 방출이 증가하는 반면, 490 nm 흥분에서 방출은 감소합니다. 이 그림은 이전 간행물13에서 수정되었습니다. B의 흥분 스펙트럼은 8에서 그림 1B를 기반으로 그려졌습니다. B의 점선은 일반적으로 사용되는 405 nm 및 488 nm 레이저 라인의 파장을 나타냅니다. 약어: GSH = 글루타티온; GSSG = 산화 글루타티온; Grx = 글루타레독신; roGFP = 레독스에 민감한 녹색 형광 단백질 변이체. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 2: 메서드의 워크플로우입니다. 뉴런에서 의외의 배분-배후-백산화-민감한 형광 단백질 roGFP2의 발현은 트랜스페션, 리포페션, 바이러스 유전자 전달 및 형질 동물을 포함하는 여러 가지 방법을 통해 달성될 수 있다. 센서는 배양 된 1 차 신경, 전 생체 조직 이식 및 그대로 동물에서 신경 레독스 상태를 연구하는 데 사용할 수 있습니다. roGFP2 이미징은 넓은 필드 형광 현미경, 공초점 현미경 및 2-광자 현미경을 포함하는 다양한 현미경에서 수행 될 수 있습니다. roGFP2 이미징 데이터의 분석은 자유롭게 사용할 수 있는 소프트웨어 ImageJ/FIJI로 수행할 수 있습니다. 약어: roGFP = 레독스에 민감한 녹색 형광 단백질 변이체. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

도 3: 성장 인자 철수는 신경 미토콘드리아의 산화를 일으킨다. (A) 대표 405:488 nm 비 이미지는 이미징 전에 48 h에 대한 성장 인자의 존재(+ GF) 또는 부재(-GF)에서 배양된 뉴런의 비(- GF)이다. 색상 코드 척도는 비정규화된 405:488 nm 비율을 나타냅니다(낮은 비율은 감소된 상태에 해당하며, 비율이 더 높은 것은 산화 상태에 해당합니다). 스케일 바 = 개별 뉴런에서 405:488 nm 비의 50 μm.(B) 정량화. (C) 개별 뉴런의 최대/최소 보정 405:488 nm 비율. 둥근 기호는 단일 셀을 나타냅니다. 바는 평균을 나타냅니다. N = 3 개의 커버리에서 40-44 셀은 하나의 준비에서 입술을 덮는다. 약어: GF = 성장 인자. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

도 4: NMDA 유도산화 뉴런 미토콘드리아. (A) 대표 405:488 nm 비 이미지 치료 전후 30 μM NMDA 및 DA 및 DTT로 최대/분 보정 후. 이 배율에서, roGFP 신호는 주로 소마 및 근위 원점에서 검출됩니다. 색상 코드 척도는 비정규화된 405:488 nm 비율을 나타냅니다(낮은 비율은 감소된 상태에 해당하며, 비율이 더 높은 것은 산화 상태에 해당합니다). 스케일 바 = 50 μm. (B) A에 도시된 이미징 실행의 정량화. NMDA는 DA와 DTT를 사용하여 교정할 수 있는 신속하고 지속적인 미토콘드리아 산화를 유도합니다. (C) NMDA 유도 미토콘드리아 산성증은 405 nm과 488 nm 난초 (상부 패널)에 GFP 형광의 방울을 일으킨다. pH 구동 효과를 분리하고 405:488 nm 비율이 pH-무감각임을 확인하기 위해, 뉴런은 DA를 사용하여 먼저 최대 산화되었고, 이후 DA(하부 패널)가 있는 NMDA로 도전하였다. 이러한 조건하에서, NMDA는 아직도 미토콘드리아 산성증을 일으키는 원인이 되지만 더 이상 미토콘드리아 산화는 아닙니다. 이에 따라 405nm와 488nm 미량은 모두 형광 강도의 pH 구동 하락을 나타내지만, 405:488 nm 비율은 안정적으로 유지된다. 이 그림은 13에서 수정됩니다. 약어: GFP = 녹색 형광 단백질; roGFP = 레독스에 민감한 녹색 형광 단백질 변이체; NMDA = N-메틸-D-아스파르타트; DA = 디아미드; DTT = 디티오스리톨. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.

그림 5: NMDA유도막 전위, 레독스 상태 및 수지상 미토콘드리아의 형태에 대한 NMDA 유도된 변화. (A) 시간 경과 실험에서 3개의 고배율 이미지, t = 1, 4, 및 9분에서 획득하여 수지상 및 축산 미토콘드리아를 나타낸다. 색화는 TMRE 강도를 나타냅니다(교정 막대 참조). (B) 405:488 nm roGFP 비 이미지는 t = 1, 4 및 9분에서 (A)와 동일한 시간 경과 실험에서 동일한 시간 경과 실험에서. 제한된 AAV 감염 효율로 인해 뉴런의 하위 집합만이 미토 Grx1-roGFP2를 나타내므로 모든 TMRE 양성 미토콘드리아는 roGFP 양성입니다. 색상 코드 교정 바는 비정규화된 405:488 nm 비율을 나타냅니다(낮은 비율은 감소된 상태에 해당하며, 비율이 더 높은 것은 산화 상태에 해당합니다). (C) TMRE 강도, roGFP 405:488 nm 비율 및 단일 미토콘드리온의 원도( A, B의 화살표로 표시)의 정량화. 기준선 기록 1분 후, 60 μM NMDA가 목욕 용액에 추가되었습니다. 스케일 바 = 5 μm. C 의 y축은 기준선 T0 (녹색 파선), 베이스라인 T0(빨간색 점선)에 비해 TMRE 형광 강도, FIJI/ImageJ 형상 설명자 "둥글림"(검정 선)에 비해 405 :488 nm roGFP 비율을 묘사합니다. 약어: GFP = roGFP = 레독스에 민감한 녹색 형광 단백질 변이체; 미토-Grx1-roGFP2 = 글루타레독신-1이 roGFP의 N-종부에 융합; AAV = 아데노 관련 바이러스; TMRE = 테트라메틸lrhodamine, 에틸 에스테르; NMDA = N-메틸-D-아스파르타트. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
저자는 이해 상충이 없다고 선언합니다.
이 문서는 공초점 살아있는 현미경 검사를 사용하여 1 차해 및 피질 뉴런에 있는 급성 동요에 기초 redox 상태 및 redox 반응에 있는 다름을 결정하는 프로토콜을 기술합니다. 프로토콜은 최소한의 수정으로 다른 세포 유형 및 현미경에 적용 될 수 있습니다.
이 작품은 도이치 포르충스게마인샤프트(BA 3679/5-1)에 의해 지원되었다. 2289: BA 3679/4-2). A.K.는 ERASMUS+ 펠로우십의 지원을 받고 있습니다. 아이리스 뷔즈리-에레트, 리타 로스너, 안드레아 슐릭섭에게 1차 뉴런을 준비해 주셔서 감사합니다. 우리는 pLPCX- 미토 - Grx1-roGFP2를 제공 토비아스 딕 박사에게 감사드립니다. 그림 4 에 나타난 실험은 하이델베르크 대학의 니콘 이미징 센터에서 수행되었다. 도 2 는 BioRender.com 준비하였다.
| 시약 | |||
| 염화칼슘 (CaCl2· 2H2O) | Sigma-Aldrich | C3306 | |
| Diamide (DA) | Sigma-Aldrich | D3648 | |
| Dithiothreitol (DTT) | Carl Roth GmbH | 6908.1 | |
| 포도당 (2.5 M 원액) | Sigma-Aldrich | G8769 | |
| 포도당 | Sigma-Aldrich | G7528 | |
| Glycine | neoFroxx GmbH | LC-4522.2 | |
| HEPES (1 M 원액) | 시그마 - 알드리치 | 15630-080 | |
| HEPES | 시그마 - 알드리치 | H4034 | |
| 염화 마그네슘 (MgCl2< / sub>· 6H2O) | Sigma-Aldrich | 442611-M | |
| N-methyl-D-aspartate (NMDA) | Sigma-Aldrich | M3262 | |
| 염화칼륨 (KCl) | Sigma-Aldrich | P3911 | |
| 염화나트륨 (NaCl) | neoFroxx GmbH | LC-5932.1 | |
| 피루브산 나트륨 (0.1 M 원액) | Sigma-Aldrich | S8636 | |
| 나트륨 피루브산 | Sigma-Aldrich | P8574 | |
| 설탕 | Carl Roth GmbH | 4621.1 | |
| 테트라메틸로다민 에틸 에스테르 퍼클로레이트 (TMRE) | Sigma-Aldrich | 87917 | |
| equipment | |||
| imaging chamber | Life Imaging Services (Basel, Switzerland) | 10920 | Ludin Chamber Type 3 for & 오슬래시; 12mm 커버 슬립 |
| 레이저 스캐닝 컨포칼 현미경, 현미경 | Leica | DMI6000 | |
| 레이저 스캐닝 컨포칼 현미경, 스캐닝 장치 | Leica | SP8 | |
| 연동 펌프 | VWR PP1080 181-4001 | ||
| 회전 디스크 공 초점 현미경, 카메라 | Hamamatsu | C9100-02 EMCCD | |
| 회전 디스크 공 초점 현미경, incubationsystem | TokaiHit | INU-ZILCF-F1 | |
| 회전 디스크 컨 포칼 현미경, 현미경 | Nikon | Ti 현미경 | |
| 회전 디스크 컨 포칼 현미경, 스캐닝 장치 | Yokagawa | CSU-X1 | |
| software | |||
| FIJI | https://fiji.sc | ||
| StackReg 플러그인 | https://github.com/fiji-BIG/StackReg/blob/master/src/main/java/StackReg_.java | ||
| TurboReg 플러그인 | https://github.com/fiji-BIG/TurboReg/blob/master/src/main/java/TurboReg_.java |