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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Este protocolo mostra como para excisar consistentemente olhos planarian (copos óptica), sem perturbar os tecidos circundantes. Utilizando uma agulha de seringa de insulina e, de um ou ambos os olhos pode ser cauterizado para facilitar investigações sobre os mecanismos que regulam a regeneração do olho, a evolução de regeneração visual, e a base neural de comportamento induzida pela luz.
No estudo de células estaminais adultas e os mecanismos regenerativos, vermes planarian são um grampo no sistema modelo in vivo. Isto é devido em grande parte à sua população de células-tronco pluripotentes abundante e capacidade de regenerar todos os tipos de células e tecidos após lesões que seria catastrófico para a maioria dos animais. Recentemente, planárias ganharam popularidade como um modelo para a regeneração olho. A sua capacidade de regenerar todo o olho (composto de dois tipos de tecidos: células pigmentares e fotorreceptores) permite a dissecção dos mecanismos que regulam a regeneração sistema visual. ablação do olho tem diversas vantagens sobre outras técnicas (tais como a decapitação ou furador) para examinar as vias e os mecanismos específicos do olho, o mais importante dos quais é que a regeneração é largamente restringida a tecidos oculares sozinho. A finalidade deste artigo vídeo é para demonstrar como para remover de forma fiável a taça óptica planarian sem perturbar o cérebro ou tecidos circundantes.O tratamento de vermes e manutenção de uma colónia criada também é descrito. Esta técnica utiliza uma 31 L, agulha de insulina 16/05 polegadas para colher cirurgicamente para fora a cúpula óptica de planarians imobilizados numa placa fria. Este método engloba tanto simples e dupla ablação olho, com olhos de regeneração no prazo de 1-2 semanas, para permitir que uma ampla gama de aplicações. Em particular, esta técnica de ablação pode ser facilmente combinado com (interferência de ARN) telas farmacológicas e genéticas para uma melhor compreensão dos mecanismos de regeneração e da sua evolução, células estaminais do olho e a sua manutenção, e respostas comportamentais phototaxic e sua base neurológica.
Planárias são um poderoso organismo modelo para o estudo da regeneração mediada por células-tronco adultas. Estes vermes de água doce não-parasitárias possuem a capacidade de regenerar a quaisquer e todos os tecidos em falta, incluindo o sistema nervoso central e do cérebro 1. Estudado, tanto para trás como os 1700s 2, avanços tecnológicos no domínio planarian durante os últimos 10-15 anos (tais como um genoma sequenciado, hibridao in situ, imuno-histoquímica, de ARN de interferência (ARNi), e transcriptómica) ter actualizado este organismo modelo histórico . Especificamente, planárias recentemente ganhou popularidade como um modelo emergente de pesquisa olho 3.
Planárias têm olhos prototípicas com apenas dois tipos de tecido, os neurónios fotorreceptores e células de pigmento; esta permitiu a caracterização da sua população de células-tronco olho e demonstrado que muitos dos mesmos genes regulando vertebrado de olhosenvolvimento são conservados em planarians 4, 5. Os copos óptica estão localizados dorsalmente e composta dos dendritos branco, não pigmentadas dos neurónios fotorreceptores e as células de pigmento preto semi-lunar, e os olhos inervam o cérebro através de um quiasma. Além de ser um modelo para elucidar os processos regenerativos 6, o olho planarian é bem adequado para o estudo da evolução de mecanismos visuais 7, as respostas comportamentais a luz (planarians exibir fototaxia negativo) 8, e a base neurológica de comportamento 9.
Regeneração olho em planarians tem sido largamente estudada em dois contextos principais: como parte de regeneração da cabeça seguinte decapitação 4, 10, e após a excisão de apenas os tecidos do olho 11, 12 13, 14, embora alguns estudos também realizada amputações apenas por trás dos olhos (decapitação parcial) 15. No entanto, todos estes métodos envolvem a perda de muitas outras do que apenas o olho tecidos (tais como tumores do cérebro, intestinos, e nefrídios), potencialmente complicar a interpretação dos resultados. O protocolo de ablação olho aqui apresentada restringe a excisão para os tecidos do olho (excluindo especificamente cerebral), resultando em dados que são mais específicos para o olho. Além disso, ao contrário de vermes decapitados que levam 7-14 dias para iniciar a alimentação, olho ablated vermes irá alimentar dentro de 24 h de ablação 12, permitindo que as experiências de ARNi (onde ARNi é entregue através dos alimentos) para ser performed concorrentemente.
Embora a ablação do olho é tecnicamente mais difícil de executar com êxito do que a decapitação, estudos atuais que envolvem a excisão olho não incluíram instruções detalhadas sobre os seus procedimentos. O objetivo deste artigo vídeo é para permitir aos investigadores para remover consistentemente o copo óptica planarian sem perturbar os tecidos cerebrais subjacentes e removendo como alguns outros tecidos quanto possível. Este método pode ser utilizado para ambos simples e dupla ablação olho e é aplicável a uma vasta gama de investigações. Como a maioria dos ensaios de regeneração, ablação olho é bem adequado para combinação com ambas as telas farmacológicas e genéticas (ARNi), bem como estudos comportamentais. Aqui nós descrevemos métodos para o tratamento de vermes, mantendo uma colônia planarian, ea técnica de ablação de olho em si.
1. Cultura Animal e Manuseamento
NOTA: Este protocolo utiliza mediterranea Schmidtea, uma espécie planarian diplóides com um genoma seqüenciado 16, 17 que é comumente usado para a pesquisa de regeneração. No entanto, o ensaio é igualmente bem sucedido com outras espécies, tais como Girardia Tigrina e Girardia dorotocephala (que se encontram comercialmente disponível).
2. Preparação
3. ablação cirúrgica
Para o primeiro 1-2 h após a cirurgia, os animais podem apresentar movimento diminuiu em comparação com vermes intactos (no entanto, eles ainda se move). Se desejado, vermes vai comer dentro de 24 horas após a cirurgia (por exemplo, para a alimentação de RNAi). Ao seguir a regeneração olho nos mesmos indivíduos ao longo do tempo, certifique-se para tirar uma fotografia de cada verme tanto antes da cirurgia (intacto) e em 1 h após ablação (HPA). Ao fim de 4 dias após a ablação (DPA) regeneração de células de pigmento deveria ser visível, e por 14 DPA todo o olho terão totalmente regenerada (Figura 3A-B). Isto inclui os neurónios fotorreceptores e sua inervação para o cérebro (Figura 3C), bem como a recuperação funcional do sistema visual (Figura 4A-C). Ablações bem sucedidos não vai perturbar os tecidos subjacentes do cérebro (Figura 4D-E), nem introduzir outros ferimentos para o animal (Figura 5A). ablações mal sucedidasincluem animais com: um excessivamente grande excisão que liga os dois olhos (Figura 5B), rasgos para a margem lateral do animal (Figura 5C), locais e / ou de feridas que picam através da epiderme ventral (Figura 5D). Além disso, as ablações mal sucedidas incluem a remoção incompleta de todo o copo óptica, composto de ambos os tecidos não pigmentadas brancas e as células de pigmento preto (Figura 5E-F).

Figura 1: preparação da cirurgia. (A) Diagrama de construção da placa a frio, usando a parte inferior de uma placa de Petri de 100 mm (cheio com gelo) e a tampa de uma placa de Petri de 60 mm (colocado de cabeça para baixo sobre a superfície de gelo). (B) Diagrama da superfície da cirurgia, feita a partir de uma pilha de (de cima para baixo) de papel de filtro branco, um tecido dobrado húmido limpar, e uma peça de película de parafina.(C) A cirurgia configurar (para a mão direita). A: escopo de dissecação, B: iluminação de pescoço de ganso, C: superfície cirurgia, D: Placa de Peltier, E: prato de vermes 5-7 mm pronto para ablação, F: frasco de lavagem de água sem-fim, L: resto pauzinho segurando pipeta de transferência limpa, H: resto pauzinho reteno da agulha / seringa, I: resto pauzinho que prende o fórceps, J: recipiente de pipetas de transferência adicionais. Configuração placa (D) personalizado Peltier. Configuração placa fria prato (E) Petri. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Posição das mãos e da agulha / seringa durante a ablação. (A) A colocação de mãos (para a mão direita). Note-se que o polegar esquerdo é usado para suportar a seringa (realizadana mão direita) para minimizar o movimento. (B) colocação da agulha em relação ao olho do sem-fim. Note-se que a superfície biselada da agulha virada para cima. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: ablated olhos planarian regenerar. Morfologia do Schmidtea mediterranea planarians renováveis olhos seguinte (A) ablação dupla olho e (B) único ablação olho. (C) A imuno-histoquímica mostra a regeneração dos neurónios fotorreceptores (anti-arrestina) após a ablação do olho único. vermes intactas são mostradas antes da cirurgia, e regenera são mostrados nos dias 4 e 14 após a ablação. Para ablações único olho, o olho esquerdo era umblated e o olho direito serve como um controlo interno (não lesionado). setas vermelhas: olhos ablação. Barras de escala = 100 pm. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4: A recuperação funcional do sistema visual após a ablação. (A - C) Ensaio funcional para testar fotofobia planarian. (A) vermes intactas evitar viajar através de áreas de luz, tal como uma mancha a partir de um ponteiro laser verde. (B) 24 horas após a ablação, "cegos" vermes ablacionadas dupla olho viajar através de pontos de luz. (C) aos 7 dias após a ablação, duplos olho ablated vermes regenerados seu sistema visual suficientemente para recuperar evitar luz. seta amarela: comportamento aberranteresposta al. (D - E) ablação do olho é restrita aos tecidos do cálice óptico, e não perturba os tecidos cerebrais subjacentes. (D) A imuno-histoquímica mostra arquitectura cérebro (anti-sinapsina) está inalterada em relação a uma ablação antes h após ablação. (E) hematoxilina e eosina (H & E) coloração em 1 h após a ablação de uma secção transversal que mostra o dano é grandemente restringida ao local do cálice óptico sujeito a ablação. olho direito (com células de pigmento preto) serve como controlo interno. setas vermelhas: olhos ablação. Barras de escala = 1 mm em (AC) 1 mM, 100 ^ M no (DE). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 5: Marcas do ablações bem e mal sucedidas. (A) bem sucedidos ablações olho simples e duplas (a 5 min após a ablação) têm feridas que são mais ou menos semelhante em tamanho ao copo óptica inicial. (B - E) ablações mal sucedidas: (B) demasiado tecido é removido ou a ferida liga os dois olhos, (C) as lágrimas local da ferida e estende-se para a margem, (D) a ferida é demasiado profunda e pica através do dorsal (D) para o lado ventral (D'), e (e - F) nem todos os tecidos do copo óptica são removidos, visualizado tanto morfologicamente (e) e por coloração com anti-arrestina dos neurónios fotorreceptores (F). setas amarelas: ablações aberrante. círculos amarelos: site ablação. Barras de escala = 100 pm. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores não têm nada a revelar.
Este protocolo mostra como para excisar consistentemente olhos planarian (copos óptica), sem perturbar os tecidos circundantes. Utilizando uma agulha de seringa de insulina e, de um ou ambos os olhos pode ser cauterizado para facilitar investigações sobre os mecanismos que regulam a regeneração do olho, a evolução de regeneração visual, e a base neural de comportamento induzida pela luz.
Os autores gostariam de obrigado Michelle Deochand para aperfeiçoar esta técnica de ablação olho, Taylor Birkholz para assistência com o ensaio funcional, Michael Levin para o anticorpo anti-arrestina, e Junji Morokuma para obter informações sobre as placas de Peltier. Este trabalho foi apoiado por uma bolsa SFSA da Western Michigan University para WSB.
| Sais marinhos instantâneos do oceano | Spectrum Brands | SS15-10 | "10 Galões" caixa (peso líquido 3 libras) |
| Kimwipes EX-L limpeza de lenços de papel sem fiapos | Kimberly-Clark | 34155 | 4.5 x 8.5 in |
| Whatman #2 papel de filtro | Sigma | WHA1002125 | Círculos, 125 mm de diâmetro, branco |
| Seringa de insulina Easy Touch (com agulha) | Pet Health Market | 17175-04 | Seringa U-100 de 1 cc, 31 G 5/16 in agulha |
| 100 mm Placa de Petri | VWR | 25384-342 | 100 mm x 15 mm |
| 60 mm Placa de Petri | VWR | 25384-092 | 60 mm x 15 mm |
| Dumont #5 pinça | Fine Science Tools | 11254-20 | Inox, ponta reta, pipetas de transferência de 11 cm |
| Samco Scientific | 225 | Graduado, lâmpada grande, 7.5 mL, não estéril | |
| Parafilm M filme de parafina | Marca | 701606 | Rolo de 4 in x 125 ft |
| Placa de cultura de tecidos não tratada de 12 poços | VWR | 15705-059 | Não tratada, fundo plano, estéril, marca Falcon |
| Recipientes de plástico para alimentos (para colônia) | Ziploc | Grande retângulo | 2.25 qt (2.12 L), 10" x 6 -3/4 " x 3 -3/16" |
| Planaria (Girardia tigrina) | Carolina Biological | 132954 | Vendida como Planaria "Marrom"; na maioria das vezes são G. tigrina (também conhecido como Dugesia tigrina), mas às vezes são G. dorotocephala (também conhecido como Dugesia dorotocephala); qualquer um funcionará. |
| Planaria (Schmidtea mediterranea) | n/a | n/a | S. mediterranea não estão disponíveis comercialmente. No momento, os animais só podem ser obtidos em laboratórios que os utilizam e têm animais extras. |
| Toalhas de papel marrom | Toalha de papel multidobra de 1 camadaGrainger | 2U229 | 9-3/16 x 9-3/8", garrafa de lavagem NÃO BRÍQUEADA |
| (para água de verme), | frascos de lavagemVWR | 16650-275 | opcionais, polietileno de baixa densidade, boca larga, 500 mL |
| de anticorpo anti-sinapsina, opcional | Estudos de desenvolvimento Banco de hibridoma | 3C11 | Sobrenadante |
| anticorpo anti-arrestina, opcional | n/a | n/a | Não disponível comercialmente. Presente gentil de Michael Levin, Tufts University |
| Nalgene Lowboy garrafão com torneira (para armazenar água de minhoca), opcional | Nalge Nunc International Corporation | 2324-0015 | 15 L, polipropileno, perfil baixo facilita o enchimento de recipientes plásticos de colônias |
| Placa Peltier personalizada, máquina Williams opcional | , Foxboro, MA | n/a | Especificações do design cortesia de Junji Morokuma, Tufts University: A placa Peltier é construída com uma bomba de calor termoelétrica padrão (por exemplo, All Electronics Corp Catalog # PJT-1, 30 mm2). A bomba de calor quadrada é coberta com uma fina superfície espelhada e, em seguida, colocada dentro de um orifício quadrado de 30 mm2 em forma circular de plexiglass (~50 mm de diâmetro). Esta forma é de espessura semelhante à bomba de calor e se encaixa em um poço trabalhado no centro de um dissipador de calor redondo (~ 115 mm de diâmetro). A forma/bomba de calor é "ancorado" ao dissipador com composto do dissipador de calor da base do silicone. Os cabos são enfiados através de orifícios perfurados na forma e no dissipador de calor. A metade inferior do dissipador de calor é trabalhada em um "pé" que se encaixa na abertura da placa de base do seu microscópio. |
| Fonte de alimentação DC (para placa Peltier), opcional | B & K Precision | 1665 | Fonte de alimentação CC de baixa tensão regulada, 1-18 V (DC), 1-10 amperes. |
| Outros suprimentos | comuns | ||
| Luvas | |||
| Lâmina de barbear | |||
| Tesoura | |||
| Dissecando o escopo com iluminação | pescoço de ganso | ||
| O pauzinho descansa, opcional |