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Research Article
Samantha Howerton1,2, Yanping Liang1, Jennifer Hammel1,3, Benjamin Purow4, Jennifer Munson1,3
1Fralin Biomedical Research Institute at Virginia Tech Carilion, 2Translational Biology, Medicine, and Health Graduate Program,Virginia Tech, 3Department of Biomedical Engineering & Mechanics,Virginia Tech, 4Department of Neurology,University of Virginia School of Medicine
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Apresentamos um método para replicar o microambiente tumoral de glioma na frente invasiva que incorpora fluxo de fluido intersticial. Este modelo é um hidrogel de hialuronano-colágeno I em um inserto de cultura de tecidos onde uma cabeça de pressão de fluido pode ser aplicada. A invasão pode ser quantificada e as células podem ser isoladas ou lisadas.
A recorrência do glioblastoma é um grande obstáculo ao sucesso do tratamento e é impulsionada pela invasão de células-tronco de glioma (GSCs) em tecidos saudáveis que são inacessíveis à ressecção cirúrgica e resistentes às quimioterapias existentes. O movimento de fluido no nível do tecido, ou fluxo de fluido intersticial (IFF), regula a invasão de GSC de maneira dependente do microambiente tumoral (TME), destacando a necessidade de sistemas modelo que incorporem IFF e TME. Apresentamos um método acessível para replicar o TME invasivo no glioblastoma: um hidrogel de hialuronano-colágeno I composto por GSCs humanos, astrócitos e microglia semeados em um inserto de cultura de tecidos. O IFF elevado pode ser representado pela aplicação de uma carga de pressão de fluido ao hidrogel. Além disso, este modelo pode ser ajustado para replicar diferenças inter ou intra-paciente em proporções celulares, taxas de fluxo ou rigidez da matriz. A invasão pode ser quantificada, enquanto os géis podem ser colhidos para uma variedade de resultados, incluindo invasão de GSC, citometria de fluxo, extração de proteína ou RNA ou imagem.
O glioblastoma é uma doença devastadora, marcada por curta sobrevida1 que é estendida apenas moderadamente por tratamentos clinicamente disponíveis 2,3. Esse impedimento para uma terapia eficaz é amplamente impulsionado pela natureza altamente infiltrativa das células-tronco de glioma quimiorresistentes (GSCs) que são inacessíveis à ressecção e à semeadura de tumores recorrentes4. Concomitantemente, as GSCs são altamente plásticas, respondendo a diversos estímulos no microambiente tumoral (TME) para sobreviver e invadir 5,6. Especificamente, o tumor densamente povoado e a vasculatura permeável produzem um diferencial de pressão acentuado na borda do tumor, aumentando o fluxo de fluido intersticial (IFF) em regiões distintas que se correlacionam com a invasão de GSC7. Este aumento do IFF influencia 8,9,10 e muitas vezes aumenta a invasãode 8,9 GSC por meio de vias moleculares que são passíveis de inibição farmacológica. No entanto, esse processo é confundido pela influência da glia no TME na invasão do glioma; de fato, a glia foi descrita para modular a invasão do glioma em vários contextos11, e evidências preliminares em nosso laboratório indicam uma influência semelhante da glia na invasão do glioma aprimorada por IFF12. Assim, nosso laboratório desenvolveu um modelo 3D TME ajustável que replica essas regiões invasivas da borda do tumor, incorporando interações IFF e glia-GSC para quantificar a invasão de GSC e outros resultados (ou seja, expressão de proteína de superfície ou intracelular, expressão de RNA, etc.) conforme influenciado por IFF, glia e / ou terapêutica candidata12 (Figura 1).
O modelo TME é semelhante a outros ensaios de fluxo de fluido intersticial baseados em insertos de cultura de tecidos (ou seja, ensaios estáticos / de fluxo) que foram amplamente publicados 8,9,10,13,14,15,16,17,18. As principais distinções deste modelo são a incorporação de uma matriz de ácido hialurônico colágeno não proprietária e ajustável, a inclusão de astrócitos e micróglia na matriz em proporções representativas de TMEsde pacientes 12, e o sistema é totalmente fechado em uma placa de poço, sem tubulação externa, reservatórios ou bombas. O ácido hialurônico está entre os principais componentes da matriz extracelular cerebral19, mas não é suficiente para permitir o fluxo de fluidos; assim, o colágeno I é incluído na mistura. A reticulação ocorre em duas etapas: uma polimerização de crescimento em cadeia iniciada por radicais livres em que, após a exposição à luz ultravioleta (UV), os radicais livres são produzidos a partir do fotoiniciador e geram ligações cruzadas químicas entre moléculas de ácido hialurônicometacrilato 20 e neutralização do colágeno preservado em ácido e exposição ao calor para formar fibras de colágeno21 , 22 , 23 .
Vários parâmetros que foram otimizados para este ensaio foram descritos em trabalhos publicados anteriormente em hidrogéis de hialuronano-colágeno modificados com tiol 8,12. Especificamente, as células (GSCs humanas primárias24, astrócitos corticais humanos primários e micróglia humana imortalizada) usadas para este ensaio são pelo menos 60% viáveis por 3 dias em géis compostos de meio astrobasal suplementado com fatores de crescimento GSC, 0,5% v/v N-2 e 1% v/v B-27 sem vitamina A12. Nos casos em que os géis devem ser degradados (por exemplo, para extração de proteínas ou citometria de fluxo), colagenase e dispase são usadas e mantêm viabilidade suficiente (Figura 2).
Para quantificar a invasão, os GSCs devem ser marcados com fluorescência antes de serem combinados com a glia na matriz. Isso pode ser obtido marcando com Hoechst 33342 (conforme descrito abaixo), rastreadores celulares12, modificação genética ou transdução. Independentemente disso, a viabilidade das células marcadas com novos marcadores deve ser medida antes de incorporá-las ao modelo TME. Alternativamente, se a invasão não for quantificada, mas os géis forem colhidos para extrações de proteínas, extrações de RNA ou outros resultados, as células geralmente não precisam ser marcadas com fluorescência durante o processo de preparação do gel. Nesse caso, os géis podem ser fixados em formalina para imagem, degradados e lisados por células para extração de RNA ou degradados usando proteases para citometria de fluxo e subsequentemente lisados com tampões de lise de proteínas para Western blots ou outro trabalho de proteína.
Aqui, apresentamos um protocolo para incorporar astrócitos humanos, microglia e GSCs derivados de pacientes em uma proporção definida pelo paciente, 4:1:112, em uma matriz hialurônica de colágeno I de 1,2 mg/mL e 4 mg/mL sob condições estáticas de fluxo. Os parâmetros específicos usados para um ensaio (ou seja, proporções celulares, rigidez, tipos de células, etc.) podem ser alterados para representar diferentes contextos se a viabilidade for adequada.

Figura 1: Diagrama do modelo TME composto por GSCs, astrócitos e microglia em um hidrogel sob uma cabeça de pressão de fluido. As células são incorporadas em um hidrogel de ácido hialurônico de colágeno dentro de uma inserção de cultura de tecidos. A força gravitacional impulsiona o fluxo líquido para baixo. Os poros na membrana da inserção da cultura de tecidos permitem que as células que invadem para baixo se fixem na superfície inferior da inserção da cultura de tecidos, e essas células podem ser fixadas, visualizadas e quantificadas. Criado com BioRender.com. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Viabilidade celular após degradação do hidrogel. G34s (GSCs), astrócitos e microglia foram semeados no modelo TME a 4:1:1 e incubados por 21 h a 37 °C. Os géis foram removidos e degradados usando 0,3 mg / mL de colagenase + 0,02 mg / mL de dispase por um total de 30, 45 ou 60 min, pipetando para misturar a cada 15 min (condição de 30 min) ou a 30 min e depois a cada 15 min (condições de 45 min e 60 min). Depois que os géis foram degradados, as células foram coradas com laranja de acridina (todas as células) e iodeto de propídio (células mortas) e contadas usando um contador de células automatizado. A viabilidade é relatada para todas as células dentro do modelo TME. As células mantiveram pelo menos 70% de viabilidade em 30-60 min. Os dados são apresentados como média ± EPM; n = 3 réplicas biológicas. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Este protocolo foi desenvolvido em conformidade com as diretrizes estabelecidas pelo Comitê Institucional de Biossegurança da Virginia Tech.
NOTA: Execute todos os procedimentos em um gabinete de cultura de células BSL-2, a menos que especificado de outra forma. Consulte o comitê de biossegurança da instituição para obter orientação sobre o uso de células humanas.
1. Cálculos para preparação de gel
2. Preparação de materiais
3. Células de passagem e marcação de GSCs
4. Preparação de hidrogéis
NOTA: Execute as etapas após abrir o ácido hialurônico metacrilato e o fotoiniciador no escuro até que os géis tenham sido fotoreticulados.
5. Fixação de células para análise de invasão
NOTA: Não permita que a membrana da inserção da cultura de tecidos seque e não aplique as soluções diretamente na membrana para evitar o desprendimento das células da membrana.
6. Imagem e quantificação

7. Parâmetro alternativo: citometria de fluxo
NOTA: Além ou em vez de analisar a invasão, os géis não fixados podem ser degradados e as células colhidas para citometria de fluxo ou outras análises de endpoint. Um exemplo de protocolo que analisa a viabilidade celular (coloração viva/morta corrigível), proliferação (anticorpo Ki67) e estaminalidade (anticorpo CD71) é fornecido. Outros marcadores de interesse podem ser substituídos neste protocolo após a validação da eficácia da coloração. Em particular, existe uma grande variedade de marcadores que visam os GSCs (revisados em25). Este protocolo começa após a etapa 4.14.
Dados representativos para invasão (Figura 3), viabilidade e expressão de Ki67 e CD71 via citometria de fluxo (Figura 4) são fornecidos para linhas de GSC, conforme publicado anteriormente para um hidrogel de hialuronano-colágeno modificado com tio-modificado12. A presença de astrócitos e micróglias no modelo TME tem um efeito diferencial na invasão de GSC dependente da linhagem celular (Figura 4). Especificamente, os GSCs G44 e G6224 foram semeados no modelo TME com e sem astrócitos e micróglia e expostos a uma carga de pressão de fluido (fluxo) ou fluxo líquido zero (estático).
A presença versus ausência de astrócitos e micróglia dentro do modelo TME foi associada a uma redução na invasão de G44 dentro da condição estática (Figura 3; p < 0,05). Em contraste, nem o fluxo nem a presença de astrócitos e micróglia afetaram significativamente a invasão do G62. Esses diferentes efeitos do microambiente tumoral e do fluxo na invasão foram descritos para linhagens celulares adicionais12 e devem ser investigados para novas linhagens celulares incorporadas ao sistema modelo.
Para analisar a viabilidade, proliferação de Ki67+ e stemness CD71+ de GSCs no modelo TME, a linhagem G3424 de GSC foi semeada com astrócitos e micróglias marcados com corante fluorescente, e foi aplicado estático ou fluxo. Em seguida, os géis foram degradados para isolar as células para citometria de fluxo. As células foram coradas com vivos/mortos fixáveis, depois fixadas e marcadas com anticorpos Ki67 ou CD7112. A Figura 4A mostra o protocolo geral de gating para CD71 + vivo, Ki67 + G34s diferenciados de astrócitos e micróglia. A proliferação de G34 (Ki67) foi significativamente aumentada no fluxo em relação à estática quando isolada nos géis (p < 0,001) e na presença versus ausência de glia dentro da condição estática (p < 0,05) (Figura 4B). Embora estatisticamente não significativo, o G34 tendeu a aumentar a expressão de CD71 durante o fluxo quando sozinho nos géis; essa tendência não foi observada na presença de glia (Figura 4C). Este método pode ser usado para quantificar outros marcadores de interesse para cada tipo de célula dentro do modelo TME.
Notavelmente, devido à variabilidade introduzida por múltiplos fatores que podem potencialmente influenciar a invasão do glioma (rigidez do gel, gliose reativa, alterações fenotípicas devido à seleção e passagem, etc.), muitas vezes é útil relatar o tamanho do efeito, e é necessário gerar réplicas técnicas e realizar uma análise de poder para réplicas biológicas antes de testar novas linhagens celulares. Geralmente, n = 3-6 réplicas biológicas são aceitáveis. Para minimizar a variabilidade e maximizar a potência, as condições devem ser executadas dentro do mesmo experimento, incluindo comparações entre diferentes linhas GSC, quando possível.

Figura 3: Influência diferencial do microambiente tumoral na invasão estimulada por fluxo em duas linhas de GSC. As GSCs marcadas com fluorescência (G44 e G62) foram semeadas apenas em hidrogéis (-A/M) ou com astrócitos e micróglia (+A/M). Uma cabeça de pressão de fluido foi aplicada às condições de "fluxo"; O fluxo líquido de fluido zero foi aplicado a condições "estáticas". As GSCs invadidas foram fixadas na membrana da inserção da cultura de tecidos, contadas e calculadas as médias entre as repetições técnicas. A invasão média foi plotada para cada réplica biológica. A invasão do G44 foi significativamente reduzida pela presença de A/M dentro da condição estática (p < 0,05). Em contraste, nem o fluxo nem a presença de A/M influenciaram a invasão em G62. A proporção de GSCs semeados que invadiram é representada graficamente como média ± SEM; n = 3 repetições biológicas; *p < 0,05 para uma ANOVA de 2 vias pareada seguida de comparações múltiplas de Tukey. Os dados são reformatados e reimpressos com permissão de Cornelison et al. 202212. A análise estatística foi revisada para incluir apenas as linhagens celulares de interesse. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4: Medindo a viabilidade, proliferação (Ki67) e stemness (CD71) em GSCs dentro do modelo TME. As GSCs foram semeadas com ou sem astrócitos marcados com corante fluorescente (verde) e micróglia (vermelho escuro) no modelo TME e expostas a fluxo líquido zero de fluido (estático) ou fluxo líquido (fluxo). Os géis foram degradados e corados com corante de infravermelho próximo vivo/morto e com anticorpos Ki67 ou CD71 para citometria de fluxo. Os controles de isotipo são mostrados em cinza. (A) Os tipos de células foram fechados e as células viáveis quantificadas por meio de coloração de infravermelho próximo vivo / morto. (B) A proliferação de Ki67 em G34s é significativamente aumentada no fluxo em relação à estática quando isolada no hidrogel (p < 0,001) e na presença de astrócitos e micróglias (A/M) dentro da condição estática (p < 0,05). (C) Em contraste, embora estatisticamente não significativa, a stemness G34, representada pela expressão de CD71, é mantida nas condições estáticas pela inclusão de astrócitos e micróglias no modelo TME. Os dados são apresentados como média ± EPM; n = 3 réplicas biológicas. *p < 0,05 e ***p < 0,0001 para uma ANOVA de duas vias seguida pelas comparações múltiplas de Tukey. A figura é reformatada e reimpressa com permissão de Cornelison et al. 202212; dados adicionais estão incluídos demonstrando as condições estáticas nos painéis B e C. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores não têm conflitos de interesse relevantes a divulgar.
Apresentamos um método para replicar o microambiente tumoral de glioma na frente invasiva que incorpora fluxo de fluido intersticial. Este modelo é um hidrogel de hialuronano-colágeno I em um inserto de cultura de tecidos onde uma cabeça de pressão de fluido pode ser aplicada. A invasão pode ser quantificada e as células podem ser isoladas ou lisadas.
Gostaríamos de agradecer às fontes de financiamento para este trabalho: o National Institutes of Health, o National Cancer Institute (R37 CA222563 to J.M.), a Coulter Foundation (J.M.) e a Virginia Tech ICTAS-CEH (J.M. & J.H.). Os GSCs usados neste ensaio foram derivados por Jakub Godlewski, Ph.D. (Harvard Medical School).
| Placa de Cultura de Tecidos de 12 Poços, Produtos | Científicos Esterilizados Celltreat | 229112 | |
| Filtro de 250 mL Sistema, Material do Filtro PES, 0.22 µ m, 50 mm, Estéril | DOT Scientific | 667706 | |
| 385 nm, 1650 mW (Min) LED Montado, 1700 mA | Thorlabs | M385LP1-C1 | |
| 75cm2 Frasco de Cultura de Tecidos - Tampa de Ventilação, Produtos Científicos Celltreat Estéril | 229341 | ||
| 8.0 μ m Inserção de Placa de Cultura de Células 12 mm de Diâmetro | Milicell | PI8P01250 | |
| Etanol Absoluto, 200 provas, Grau de Biologia Molecular | Thermo Fisher Scientific | T038181000CS | Etanol para controle de células mortas por citometria de fluxo. |
| Meio de Astrócito (Astrofull) | ScienCell Research Laboratories | 1801 | Contém astrobasal, FBS, e penicilina/estreptomicina. |
| Suplemento B-27 (50x), menos vitamina A (Gibco) | Thermo Fisher Scientific | 12587010 | |
| BSA (MACS) | Miltenyi Biotec | 130-091-376 | |
| Anticorpo CD71 (eBioscience, Invitrogen) | Fisher Scientific | 25-0719-41 | |
| Lâminas de Contagem de Células | Nexcelom Bioscience | CHT4-PD100-002 | |
| Raspadores de Células | Biologix USA | Contador de Células Fluorescentes70-1250 | |
| Cellometer K2 (Nexelcom Bioscience) | VWR | Centrífuga NEXCCMK2-SK150-FCS | |
| Eppendorf | deBaixa Velocidade | 5702 | R Centrífuga para cultura de células. |
| Microplacas de Poliestireno Transparente de 96 Poços, Corning | Fisher Scientific | 07-200-108 | Placas de fundo em V para coloração por citometria de fluxo. |
| CO2 Incubadora, 150L, Heracell 150i (Thermo Scientific) | Thermo Fisher Scientific | 50116047 | |
| Collagen I, Alta Concentração, Cauda de Rato | Corning | 354249 | |
| Collagen I, Rat Tail | Corning | 354236 | Concentração "Baixa" para revestimento de frascos aderentes. |
| Collagenase (CAS# 9001-12-1) | Adaptador biológico da colimaçãoC7511-30 | dos Estados Unidos | |
| para Olympus BX & IX, Revestimento AR: 350 - 700 nm | Cotonetes Thorlabs | COP1-A | |
| , Pontas de Precisão Q-tips | Distribuição | do Amazon B01KCJB3R2 | |
| (CAS# 9001-92-7) | Estados Unidos Biological | D3760 | |
| DMEM, glicose alta (Gibco) | Thermo Fisher Scientific | 11330032 | |
| EVOS FL | Invitrogen | AMF4300 | |
| Fetal Bovine Serum (Gibco) | Thermo Fisher Scientific | 26140079 | Para cultura de microglia. |
| Solução de formalina, tamponada neutra, 10% (Sigma-Aldrich) | Millipore Sigma | HT501128 | |
| Foxp3 / Conjunto de Tampão de Coloração de Fator de Transcrição (eBioscience, Invitrogen) | Thermo Fisher Scientific | 00-5523-00 | |
| Células-tronco de glioma | n/a | n/a | Podem ser derivadas de pacientes ou linhagens de células-tronco de glioma comerciais. |
| Millipore Sigma | 0500-4008 | doGH do easyCyte da goiaba | . |
| HBSS (Sigma-Aldrich) | Millipore Sigma | H6648 | |
| HEPES (1 M) (Gibco) | Thermo Fisher Scientific | 15630080 | |
| Driver LED de 1 Canal de Alta Potência com Modulação de Pulso, 10.0 A Max, 50.0 V Max | InterfaceThorlabs | DC2200 | para lâmpada UV. |
| Hoechst 33342 Solução (20 mM) (Thermo Scientific) | Thermo Fisher Scientific | 62249 | |
| Astrócitos Humanos | ScienCell Research Laboratories | 1800 | Astrócitos primários derivados do córtex cerebral. |
| Proteína Recombinante EGF Humana (Gibco) | Thermo Fisher Scientific | PHG0311 | |
| Proteína Recombinante Humana FGF-básica (FGF-2/bFGF) (aa 10-155) (Gibco) | Thermo Fisher Scientific | PHG0021 | |
| Microglia Humana Imortalizada - hTERT | Applied Biological Materials | T0251 | |
| Incu-mixer MP Microplate Aquecido Vortexer, 2 posições | Benchmark Scientific | H6002 | |
| Ki67 REAfinity, anticorpo PerCP-Vio 700 | Miltenyi Biotec | 130-120-420 | |
| LED Medidor de cura UV | Gigahertz-Optik | X1-RCH-116 | Optômetro para medir a intensidade da luz UV. |
| Fenil-2,4,6-trimetilbenzoilfosfinato de lítio (LAP) | Advanced Biomatrix | 5269-100MG | Fotoiniciador. |
| LIVE/DEAD Corrigível Near-IR (Invitrogen) | Thermo Fisher Scientific | L24975 | |
| Ácido hialurônico metacrilado (photoHA) | Advanced Biomatrix | 5212-100MG | |
| Microcentrífuga, Sorvall ST8R (Thermo Scientific) | Centrífuga Fisher Scientific | 75-997-203 | para coloração por citometria de fluxo. |
| Suplemento N-2 (100X) (Gibco) | Thermo Fisher Scientific | 17502048 | |
| Neurobasal-A Medium (Gibco) | Thermo Fisher Scientific | 10888022 | |
| PBS (10X), pH 7,4 sem Ca & | Mg Quality Biological | 119-069-101 | |
| Hidróxido de sódio, pellets ACS (CAS# 1310-73-2) | VWR | 97064-476 | |
| Tripsina-EDTA (0,25%), vermelho de fenol (Gibco) | Thermo Fisher Scientific | 25200056 | |
| ViaStain AOPI Staining Solution | Nexcelom Bioscience | CS2-0106 |