RESEARCH
Peer reviewed scientific video journal
Video encyclopedia of advanced research methods
Visualizing science through experiment videos
EDUCATION
Video textbooks for undergraduate courses
Visual demonstrations of key scientific experiments
BUSINESS
Video textbooks for business education
OTHERS
Interactive video based quizzes for formative assessments
Products
RESEARCH
JoVE Journal
Peer reviewed scientific video journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Video encyclopedia of advanced research methods
EDUCATION
JoVE Core
Video textbooks for undergraduates
JoVE Science Education
Visual demonstrations of key scientific experiments
JoVE Lab Manual
Videos of experiments for undergraduate lab courses
BUSINESS
JoVE Business
Video textbooks for business education
Solutions
Language
ru_RU
Menu
Menu
Menu
Menu
A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Research Article
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Здесь описан метод определения межцарственной ассоциации и конкуренции (бактериальной и грибковой) за адгезию к инфицированным вирусом монослоям клеток HeLa. Этот протокол может быть расширен на несколько комбинаций прокариот, эукариот и вирусов.
Изучение Полимикробные взаимодействий через таксономических царств, которые включают грибы, бактерии и вирусы не были ранее рассмотрены в отношении того, как вирусные члены микробиомом влияют на последующие микробные взаимодействия с этими инфицированных вирусом клеток-хозяев. Сожительства вируса с бактериями и грибами, главным образом присутствует на поверхности слизистой оболочки полости рта и половых путей. Слизистые клетки, особенно с постоянными хроническими или стойкими латентных вирусных инфекций, может оказать существенное влияние на членов микробиомом посредством вируса изменения в количестве и типе рецепторов, выраженных. Внесение изменений в архитектуре клетки - хозяина мембраны приведет к измененному способности последующих членов нормальной флоры и условно - патогенных микроорганизмов , чтобы инициировать первый шаг в формировании биопленки, т.е. присоединения. Это исследование описывает способ количественного и визуального изучения эффекта HSV на инициирование biofilформирование м (присоединение) из S. стафилококк и C. Albicans.
Человек микробиомом включает в себя разнообразные организмы из различных таксономических царств, которые разделяют географические регионы в организме. Приверженность к поверхности клеток является важным первым шагом в формировании биопленки, которая является частью процесса микробиомом колонизации. Включенный в микробиомом могут быть вирусы, которые вызывают хронические и хронические инфекции. Хроническая инфекция клеток этими вирусами , может привести к изменению в мнимым доступности рецепторов. 1,2 Кроме того, проникновение в клетку путем внутриклеточных патогенов также может влиять на хост текучесть мембран / гидрофобность , которая в свою очередь может изменить прикрепление других членов микробиомом, в том числе бактерии и грибы , Для того, чтобы понять взаимодействия, которые могут возникнуть между этими несколькими патогенными микроорганизмами, которые совместно локализуются в одних и тех же географических регионах человеческого организма, мы должны иметь возможность изучать взаимодействие патогенных микроорганизмов, которые представляют спектр таксономических царств, присутствующих на поверхности слизистых оболочек.
т "> The Герпесвиридае семейство микробов , присутствующих в 100% людей в качестве постоянных членов микробиомом 3,4. Кроме того , они могут также быть постоянно пролил как в присутствии и в отсутствие симптомов. В частности, вируса простого герпеса-1 и вируса простого герпеса-2 (ВПГ-1 и ВПГ-2, соответственно) являются постоянными членами микробиомом в oronasopharynx и половых путей. в иммунокомпетентных лиц, как ВПГ-1 и ВПГ-2 вызывают гингивостоматит, а также генитальный герпес 5-8. на этих участках, ВПГ вызывает латентную инфекцию характеризуется хроническим персистирующим бессимптомным вирусовыделение 9. Вступление HSV в клетках приводит к изменениям в поверхностной экспрессии nectins, гепарансульфата, липидных плотах и герпесвирусов ввода посредника / некроза опухоли рецептор фактора (HVEM / TNFR) 10-25. Эти потенциально представляют собой общие рецепторы для некоторых бактерий и грибков, например , золотистого стафилококка и C. Albicans, которые в то время как условно - патогенными микроорганизмами,могут также находиться в качестве членов слизистого микробиомом из oronasopharynx 26,27. В oronasopharynx С. стафилококк и C. Albicans занимают две различные участки колонизации. В хостов с естественными зубами, слизистой оболочки полости рта разделяют HSV-1 и С. Albicans, в то время как передние носовые ноздри заняты S. стафилококк 28. Однако, несмотря на в пробирке выводы , что С. стафилококк прилипает ко рту эпителиальных клеток, 29,30 S. стафилококк нечасто изолирована от полости рта образцов при нормальной ткани присутствует 29,30. Мало что известно о половых путях со-колонизацию нишах , помимо клинических данных , что С. стафилококк связано с аэробного вагинита, характеризующийся воспалением половых органов, выделения и диспареунии, в то время как C. Albicans производит повреждения слизистой оболочки , аналогичные тому , что наблюдается в ротовой полости 31-35. Таким образом, хотя эти члены устного и генитального microbiекоторые крест таксономические царства мало известно об их взаимодействии , как это влияет на их способности инициировать образование биопленки за счет присоединения к поверхности клетки - хозяина 5. Этот протокол был эффективно применен для определения функциональных последствий совместного колонизации / инфекции.1. HSV Штаммы и регулировать
Примечание: Рекомбинантный нерасплывающихся ВПГ-1 (KOS) gL86 и HSV-2 (нокаутов) 333gJ - с репортером активности бета-галактозидазы , используемой были предоставлены В. Twiari 36,37.
2. HeLa 299 Cell Погрузочно-разгрузочные работы
3. С. Albicans Погрузочно - разгрузочные работы
Примечание: C. Albicans , полученные из клинической лаборатории источника хранят при -80 ° С в Remmel обезжиренного молока 2x среды.
4. С. стафилококк Погрузочно - разгрузочные работы
5. Кандида и S. стафилококк Суспензии
6. Полимикробные биопленки Пробирной
7. Исследования визуализации </ Р>
Уровень надежности данных , полученных из системы , описанной в настоящем докладе показано на рисунке 2 аф 38. С помощью этой системы модуляции стафилококковой и грибковой взаимодействия с инфицированных вирусом клеток и их влияние на соблюдение друг друга может быть разграничены. Такого рода исследования требуют микроскопическое исследование взаимодействия , как показано на рисунках 3 и 4 на 38, чтобы определить , является ли полимикробными взаимодействие происходит на одних и тех же клетках. В этом исследовании взаимодействия различных клеток наблюдается в результате HSV-модуляции стафилококковой и грибковой присоединение что вирусный специфичны по видам.
С. стафилококк и С. Albicans (GT и YF) присоединились к тем же контрольными клетками HeLa HSV-неинфицированных. Эта совместная локализация на клетках указывает на отсутствие Phys скую умозаключение друг друга соблюдения HeLa клеток и того, что измеренные уровни дифференциального соблюдения измеренными, вероятно ВПГ-опосредованный (Фигура 3А, А1) 38. Тем не менее, при HSV-1 или HSV-2 не инфицированных клеток HeLa не совместной локализации стафилококков и C. Albicans наблюдалось. (Фиг.3В, В1, В2, В3, C1, C2). С помощью флуоресцентной микроскопии (FITC-конъюгированные анти-ВПГ-Б - жьей моноклональное антитело) также подтвердил , что С. стафилококк - видимому , не ко-локализуются с C. Albicans ни ВПГ-1 или ВПГ-2 (фиг.4А, А1, А2, А3, А4, В1, В2, В3). Это сотрудничество между HSV и кандида распространяется на обоих дрожжей и зародышевых форм трубки (рис 2A-F) С. Albicans. Эта специфика ассоциации между триады микробов отражает специфику колонизации видели в гораздо более широком масштабе в принимающей oronasopharynx слизистую оболочку.
1 ">
Файлы / ftp_upload / 54162 / 54162fig2.jpg "/>
Рисунок 2. Влияние ВПГ-1 (панели A, C, E) и ВПГ-2 (панели B, D, F) при кратностей инфекции (MOI) 50 и 10 на прилипание S. стафилококк и / или C. Albicans к HeLa клеток. (A) S. стафилококк (Са) связывание с HSV-1 - инфицированных клеток в присутствии C. Albicans ростовых трубок (GT) или дрожжевые формы (YF); (В) С. стафилококк (Са) связывание с HSV 2-инфицированных клеток в присутствии C. Albicans ростовых трубок (GT) или дрожжевые формы (YF); (С) С. Albicans ростовых трубок (GT) связывание с HSV-1 - инфицированных клеток в присутствии S. стафилококк (Sa), (D) C. Albicans ростовых трубок (GT) связывание с HSV 2-инфицированных клеток в присутствии S. стафилококк (Sa); (Е) С. дрожжевые формы Albicans (YF) связывание с HSV-1 - инфицированных клеток в присутствии S. стафилококк (Sa); (F) C. дрожжевые формы Albicans (YF) связывание с HSV 2-инфицированных клеток в присутствии S. стафилококк (Sa). Все точки данных среднее +/- SEM, п = 16 нормированы на безвирусного контроля. * = Значительно отличается (р <0,05) от неинфицированных контроля HeLa клеток. # = Значительно отличается (р <0,05) от парного точки, указанной кронштейном; Шкалы относится ко всем. 38 Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.

Рисунок 3. Отсутствие S. стафилококк и C. Albicans взаимодействий на HSV-1 и HSV-2 инфицированных клеток HeLa. HSV-1 и HSV-2 инфицированных (MOI 50) монослоя клеток HeLa с S. стафилококк и C. Albicans (5: 1 мишень для ячейки). Для получения светлого поля микроскопия, клеточные монослои окрашивали кристаллическим фиолетовым по Граму, затем исследовали с помощью световой микроскопии. Клетки , которые были положительными для Candida или S. стафилококк (100 индивидуальных клеток на сигнал микроба / на покровное) были вторично сканируется на наличие дополнительных сигналов микроб совместной локализации (1,000x начальное увеличение). (A & A1) S. стафилококк (Sa) и C. дрожжевые формы Albicans (YF) или формы росток трубки (GT) совместно локализуются на неинфицированных клеток HeLa; (A2, вставить). Процент HeLa клеток с колокализуются или отдельных микробов; (B - B3) Отсутствие S.. стафилококк и C. Albicans совместная локализация в присутствии HSV-1; (C - C2) Отсутствие S. стафилококк и C. Albicans совместная локализация в присутствии HSV-2. Среднее значение ± SEM; Шкалы относится ко всем. 38rget = "_blank"> Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.

Рисунок 4. Отсутствие совместной локализации S. стафилококк с C. Albicans на HSV-1 или HSV-2 инфицированных клеток HeLa. HSV-инфицированных HeLa клеток монослоев вызов с S. стафилококк и C. Albicans (5: 1 мишень для клетки) окрашивают (FITC-конъюгированные анти ВПГ Б - г антитела, и DAPI). Фотографии являются репрезентативными результатами скрининга клеток , которые были положительный сигнал для HSV затем проверяется на Candida и S. стафилококк (100 индивидуальных клеток на микроба сигнала на покровное) , которые затем были вторично сканируемого на наличие дополнительных сигналов микроб совместной локализации (1,000x начальное увеличение; Nikon). (A - A4) C. Albicans (A2, вставка; DAPI окрашивание) совместно локализуется с HSV-1; (В- B3) C. Albicans колокализуются с HSV-2 (B1, вставка, C. Albicans DAPI окрашивание). Среднее значение ± SEM; Шкалы относится ко всем. 38 Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.
| 1 | 2 | 3 | 4 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | ||||||
| трубы | GT | Ю.Ф. | MSSA | GT / MSSA | YF / MSSA | GT | Ю.Ф. | MSSA | GT / MSSA | YF / MSSA | ||||||
| СМИ | F | F | МИЗ | МИЗ | F | МИЗ | F | F | F | МИЗ | МИЗ | F | МИЗ | F | ||
| В | ||||||||||||||||
| С | ||||||||||||||||
| D | ||||||||||||||||
| Е | ||||||||||||||||
| F | ||||||||||||||||
| г | ||||||||||||||||
| ЧАС |
Таблица 1.
Общие шаблона Определение микробной адгезии в Полимикробные взаимодействий GT = Кандида Albicans фенотип зародышевых трубки. YF = C. Albicans формы дрожжей фенотип; MSSA = метициллин чувствительного золотистого стафилококка; MS = маннитол соли среда; F = Fungisel среда. Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы загрузить этот файл.
| пластина 1 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| только HeLa клетки | HeLa + GT | HeLa + YF | HeLa + Sa | HeLa + GT + Sa | HeLa + YF + Sa | |
| В | ||||||
| С | ||||||
| D | ||||||
| пластина 2 | ||||||
| HSV | HeLa клетки + HSV | HSV + HeLa + GT | >HSV + HeLa + YF | HSV + HeLa + Sa | HSV + HeLa + GT + Sa | HSV + HeLa + YF + Sa |
| В | ||||||
| С | ||||||
| D |
Таблица 2.
Общие Шаблон для визуального анализа Полимикробные взаимодействий с HSV-инфицированных и неинфицированных клеток HeLa GT = Candida Albicans росток трубки фенотип. YF = C. Albicans формы дрожжей фенотип; SA = метициллин чувствительного золотистого стафилококка; HSV = вирус простого герпеса.ve.com/files/ftp_upload/54162/54162table2.xlsx "целевых =" _blank "> Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы загрузить этот файл.
Авторам нечего раскрывать.
Здесь описан метод определения межцарственной ассоциации и конкуренции (бактериальной и грибковой) за адгезию к инфицированным вирусом монослоям клеток HeLa. Этот протокол может быть расширен на несколько комбинаций прокариот, эукариот и вирусов.
Этот проект был поддержан Университетом Среднего Запада, Управлением исследований и спонсируемых программ Иллинойса (ORSP) и Колледжем стоматологической медицины Университета Среднего Запада штата Иллинойс (CDMI).
| C.albicans | |||
| BBL Sabouraud Dextrose | BD | 211584 | |
| Fungisel Agar | Dot Scientific | 7205A | |
| S.aureus | |||
| Mannitol Salt Agar | Troy Biologicals | 7143B | |
| Агар из овечьей крови | Troy Biologicals | 221239 | |
| Hela cells | |||
| 1x DMEM (Dubelcco's Modified Eagle Medium, с 4,5 г/л глюкозы и L-глутамина, без пирувата натрия | Corning | 10-017-CM | |
| Гентамицин 50 мг/мл | Sigma | 1397 | 50 &; г/мл конечная концентрация в полной DMEM |
| Трипсин ЭДТА (0,05% Трипсин, 0,53 М ЭДТА)Раствор 1x | Corning | 25-052-CI | |
| Фетальная сыворотка крупного рогатого скота | Atlanta Biologicals | S11150 | 10% конечная концентрация в полной DMEM |
| сильной>Другой среде и реагентахсильно> | |||
| ONPG | Thermo Scientific | 34055 | |
| Ultra-Pure X gal | Invitrogen | 15520-018 | |
| 1x HBSS (сбалансированный раствор соли Хэнкса) | Corning | 20-021-CV | |
| 1x PBS | Dot Scientific | 30042-500 | |
| RIPA Lysis | Life Technologies | 89901 | |
| <сильно>Окрашиваниесильно> | |||
| метанол | Fisher Scientific | А433П-4 | |
| HSV 1 и 2, специфичный для gD | ViroStat | 196 | |
| DAPI | SIGMA | D8417-5MG | |
| Gram Crystal Violet | Troy Biologicals | 212527 | |
| Supplies | |||
| Petri Dish 100 x 15 | Dot Scientific | 229693 | |
| Чашка Петри 150 x 15 | Kord Valmark | 2902 | |
| 96-луночные пластины | Evergreen Scientific | 222-8030-01F | |
| 24-луночные пластины | Evergreen Scientific | 222-8044-01F | |
| Пробирки для культур 100 x 13 | Thomas Scientific | 9187L61 | |
| Крышка скользящих кругов, 12 мм | Deckglaser | CB00120RA1 |