16.6: Virale Recombinatie
Cellen worden soms door meer dan één virus tegelijk geïnfecteerd. Wanneer twee virussen uiteenvallen om hun genomen bloot te stellen voor replicatie in dezelfde cel, kunnen vergelijkbare regio's van hun genomen aan elkaar paren en sequenties uitwisselen in een proces dat recombinatie wordt genoemd. Als alternatief kunnen virussen met gesegmenteerde genomen segmenten verwisselen in een proces dat herschikking wordt genoemd.
Virale recombinatie kan nieuwe ziekten veroorzaken
Sommige ziekten kunnen meerdere soorten infecteren. Varkens kunnen bijvoorbeeld worden geïnfecteerd door bepaalde menselijke en vogelvirussen, naast de virussen die varkens gewoonlijk infecteren. Omdat virussen kunnen recombineren wanneer ze dezelfde cel samen infecteren, kunnen varkens zich gedragen als "mengvaten" die virussen van andere soorten recombineren om nieuwe virussen te creëren die soms mensen kunnen infecteren. Dit zorgwekkende fenomeen vertegenwoordigt een route waardoor besmettelijk materiaal van andere soorten de menselijke populatie kan binnendringen. Ziekten die van dier op mens overgaan, worden zoönosen genoemd. Mensen kunnen zijnzeer vatbaar voor dergelijke virussen omdat we geen geschiedenis van blootstelling hebben die immuniteit zou hebben gegenereerd.
Influenza A is een goed voorbeeld van de “mengvat” -theorie van virale ziekten. Onderzoek heeft aangetoond dat varkens-, vogel- en menselijke influenza A-virussen opnieuw zijn gerangschikt in varkensgastheren. Deze gebeurtenissen leverden "dubbel reassortante" virussen op die genen bevatten van menselijke en vogelvirussen en "drievoudige reassorterende" virussen die genen bevatten van menselijke, vogel- en varkensvirussen. In Nederland werd een reassortant virus bestaande uit menselijke en vogelgriepgenen overgedragen van varkens op mensen.