Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove

33.1: Arbres phylogéniques
TABLE DES
MATIÈRES

JoVE Core
Biology

A subscription to JoVE is required to view this content.

Education
Phylogenetic Trees
 
TRANSCRIPTION

33.1: Arbres phylogéniques

Les arbres phylogénétiques se présentent sous de nombreuses formes. L’ordre dans lequel les organismes sont disposés du bas vers le haut de l’arbre est important, mais les branches peuvent pivoter à leurs nœuds sans modifier l’information. Les lignes reliant les nœuds individuels peuvent être droites, inclinées ou même courbées.

La longueur des branches peut représenter le temps ou la quantité relative de changement entre les organismes. Par exemple, la longueur de la branche peut indiquer le nombre de changements d’acides aminés dans la séquence qui sous-tend l’arbre phylogénétique. La signification exacte doit être clairement indiquée sur une légende accompagnant l’arbre phylogénétique. Si une telle légende n’est pas présente, la longueur de la branche est arbitraire, et le lecteur ne doit pas déduire d’informations.

Les arbres peuvent avoir ou non une racine. L’arbre n’est pas enraciné si l’ancêtre commun le plus récent de tous les organismes d’intérêt est inconnu. Dans ce cas, la représentation des relations phylogénétiques ressemble à un flocon de neige, pas à un arbre. Le scientifique peut enraciner l’arbre en incluant un groupe externe dans l’analyse. Un groupe externe est un organisme qui n’est pas étroitement lié à l’un des organismes que le scientifique souhaite disposer sur l’arbre.


Lecture suggérée

Tags

Phylogenetic Trees Evolutionary Relationships Tree Structure Extant Taxa Branches Nodes Root DNA Sequence Characteristics Sister Taxa Closest Relatives Basal Node Common Ancestor Clade Monophyletic Group Paraphyletic Group Polyphyletic Group Morphological Features Genetic Features

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter