Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove

33.1: Fylogenetische bomen
INHOUDSOPGAVE

JoVE Core
Biology

A subscription to JoVE is required to view this content.

Education
Phylogenetic Trees
 
TRANSCRIPT

33.1: Fylogenetische bomen

Fylogenetische bomen zijn er in vele vormen. De volgorde waarin de organismen van onder naar boven in de boom zijn gerangschikt is belangrijk, maar de takken kunnen op hun knooppunten gedraaid worden zonder de informatie te veranderen. De lijnen die individuele knooppunten met elkaar verbinden, kunnen recht, hoekig of zelfs gebogen zijn.

De lengte van de takken kan de tijd of de relatieve hoeveelheid verandering tussen organismen weergeven. De lengte van de takken kan bijvoorbeeld het aantal aminozuurveranderingen aangeven in de sequentie die ten grondslag ligt aan de fylogenetische boom. De exacte betekenis moet duidelijk worden weergegeven in de legende van de fylogenetische boom. Als zo'n legenda niet aanwezig is, is de lengte van de tak willekeurig en mag de lezer hier geen informatie uit afleiden.

Bomen kunnen al dan niet een wortel hebben. De boom heeft geen wortel als de meest recente gemeenschappelijke voorouder van alle organismen van belang onbekend is. In dit geval lijkt de afbeelding van de fylogenetische relaties op een sneeuwvlok, niet op een boom. De wetenschapper kan de boom wortels geven een outgroup in de analyse op te nemen. Een outgroup is een organisme dat niet nauw verwant is aan een van de organismen die de wetenschapper in de boom wil rangschikken.


Aanbevolen Lectuur

Tags

Phylogenetic Trees Evolutionary Relationships Tree Structure Extant Taxa Branches Nodes Root DNA Sequence Characteristics Sister Taxa Closest Relatives Basal Node Common Ancestor Clade Monophyletic Group Paraphyletic Group Polyphyletic Group Morphological Features Genetic Features

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter