Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove

33.1: Fylogenetische bomen
INHOUDSOPGAVE

JoVE Core
Biology

A subscription to JoVE is required to view this content. You will only be able to see the first 20 seconds.

Education
Fylogenetische bomen
 
Deze voice-over is door de computer gegenereerd
TRANSCRIPT
* De tekstvertaling is door de computer gegenereerd

33.1: Fylogenetische bomen

Fylogenetische bomen zijn er in vele vormen. Het maakt uit in welke volgorde de organismen van onder naar boven in de boom zijn gerangschikt, maar de takken kunnen op hun knooppunten draaien zonder de informatie te veranderen. De lijnen die individuele knooppunten met elkaar verbinden, kunnen recht, hoekig of zelfs gebogen zijn.

De lengte van de takken kan de tijd of de relatieve hoeveelheid verandering tussen organismen weergeven. De vertakkingslengte kan bijvoorbeeld het aantal aminozuurveranderingen aangeven in de sequentie die ten grondslag ligt aan de fylogenetische boom. De exacte betekenis moet duidelijk worden weergegeven op een legende bij de fylogenetische boom. Als zo'n legenda niet aanwezig is, is de vertakkingslengte willekeurig en mag de lezer geen informatie afleiden.

Bomen kunnen al dan niet een wortel hebben. De boom is onbeworteld als de meest recente gemeenschappelijke voorouder van alle interessante organismen onbekend is. In dit geval lijkt de afbeelding van de fylogenetische relaties op een sneeuwvlok, niet op een boom. De wetenschapper kan de boom rooten by het opnemen van een outgroup in de analyse. Een outgroup is een organisme dat niet nauw verwant is aan een van de organismen die de wetenschapper in de boom wil rangschikken.


Aanbevolen Lectuur

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
simple hit counter