Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove

33.1: Árboles filogenéticos
TABLA DE
CONTENIDO

JoVE Core
Biology

A subscription to JoVE is required to view this content. You will only be able to see the first 20 seconds.

Education
Phylogenetic Trees
 
TRANSCRIPCIÓN

33.1: Phylogenetic Trees

33.1: Árboles filogenéticos

Phylogenetic trees come in many forms. It matters in which sequence the organisms are arranged from the bottom to the top of the tree, but the branches can rotate at their nodes without altering the information. The lines connecting individual nodes can be straight, angled, or even curved.

The length of the branches can depict time or the relative amount of change among organisms. For instance, the branch length might indicate the number of amino acid changes in the sequence that underlies the phylogenetic tree. The exact meaning must be shown clearly on a legend accompanying the phylogenetic tree. If such a legend is not present, the branch length is arbitrary, and the reader should not infer any information.

Trees may or may not have a root. The tree is unrooted if the most recent common ancestor of all organisms of interest is unknown. In this case, the depiction of the phylogenetic relationships resembles a snowflake, not a tree. The scientist can root the tree by including an outgroup into the analysis. An outgroup is an organism that is not closely related to any of the organisms that the scientist wishes to arrange on the tree.

Los árboles filogenéticos vienen en muchas formas. Importa en qué secuencia los organismos están dispuestos desde la parte inferior hasta la parte superior del árbol, pero las ramas pueden girar en sus nodos sin alterar la información. Las líneas que conectan nodos individuales pueden ser rectas, en ángulo o incluso curvas.

La longitud de las ramas puede representar el tiempo o la cantidad relativa de cambio entre los organismos. Por ejemplo, la longitud de la rama podría indicar el número de cambios de aminoácidos en la secuencia que subyace al árbol filogenético. El significado exacto debe mostrarse claramente en una leyenda que acompaña al árbol filogenético. Si dicha leyenda no está presente, la longitud de la rama es arbitraria y el lector no debe inferir ninguna información.

Los árboles pueden o no tener una raíz. El árbol no está rooteado si se desconoce el ancestro común más reciente de todos los organismos de interés. En este caso, la representación de las relaciones filogenéticas se asemeja a un copo de nieve, no a un árbol. El científico puede rootear el árbol incluyendo un grupo de salida en el análisis. Un grupo de salida es un organismo que no está estrechamente relacionado con ninguno de los organismos que el científico desea organizar en el árbol.


Lectura sugerida

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
simple hit counter