21.6: Acides aminés
Les acides aminés sont les monomères qui forment les protéines. Chaque acide aminé a la même structure fondamentale, qui consiste en un atome de carbone central, ou le carbone alpha (α), lié à un groupe aminé (NH2), un groupe carboxyle (COOH) et à un atome d'hydrogène. Chaque acide aminé possède également un autre atome ou groupe d'atomes liés à l'atome central appelé le groupe R. Il y a 20 acides aminés communs présents dans les protéines, chacun avec un groupe R différent. La variation de la séquence des acides aminés est responsable de l'énorme variation de la structure et de la fonction des protéines.
Les scientifiques utilisent le nom d'acide aminé parce que ces acides contiennent à la fois des groupes aminé et des groupes acide carboxylique dans leur structure de base. Une seule lettre majuscule ou une abréviation de trois lettres représente les acides aminés. Par exemple, la lettre V ou le symbole de trois lettres val représentent la valine.
Groupes R
Le groupe R (ou chaîne latérale) est différent pour chaque acide aminé. La nature chimique de la chaîne latérale détermine la nature de l'acide aminé (c'est-à-dire qu'il est acide, basique, polaire ou apolaire). Par exemple, l'acide aminé glycine a un atome d'hydrogène en tant que groupe R. Les acides aminés comme la valine, la méthionine et l'alanine sont de nature apolaire ou hydrophobe, tandis que les acides aminés comme la sérine, la thréonine et la cystéine sont polaires et ont des chaînes latérales hydrophiles. Les chaînes latérales de la lysine et de l'arginine sont chargées positivement, et par conséquent ces acides aminés sont aussi des acides aminés basiques. La proline a un groupe R qui est lié au groupe aminé, formant une structure de type cyclique. La proline est une exception à la structure standard des acides aminés puisque son groupe aminé n'est pas séparé de la chaîne latérale.
Ce texte est adapté de Openstax, Biologie 2e, Chapitre 3.4 : Protéines.
