7.3: Réparation par excision de base : voie de synthèse longue
Depuis la découverte des deux voies BER, il y a eu un débat sur la façon dont une cellule choisit une voie par rapport à l'autre et les facteurs déterminant cette sélection. De nombreuses expériences in vitro ont mis en évidence de multiples déterminants pour la sélection de la sous-voie . Ce sont :
- Type de lésion : selon le type de lésion de la base, une ADN glycosylase spécifique - mono ou bifonctionnelle, est recrutée sur le site endommagé. Alors que l'action séquentielle d'une glycosylase monofonctionnelle favorise les événements de réparation de patchs longs, la glycosylase bifonctionnelle entraîne un BER à patch court.
- État du cycle cellulaire : les principaux participants protéiques qui distinguent le BER à patch long de la voie alternative du BER à patch court sont l'antigène nucléaire de prolifération cellulaire (PCNA), le facteur de réplication de la protéine C ( RF-C), et l'endonucléase 1 spécifique à la structure du volet (FEN1). Le PCNA est particulièrement reconnu comme le pivot de cette voie. Il agit à la fois comme l'échafaudage pour ancrer la polymérase sur le site endommagé et se lie à FEN-1 pour faciliter son activité nucléase. De plus, RF-C est nécessaire pour charger le PCNA sur l'ADN. Toutes ces protéines sont également nécessaires lors de la réplication de l'ADN, ce qui suggère que le BER à patch long répare les dommages causés à l'ADN de réplication tandis que le patch court est utilisé pour réparer l'ADN au repos.
- Pénurie d'ATP : il a également été observé que, alors que le BER à nucléotide unique ou à patch court prédomine dans des conditions physiologiques normales, dans des conditions de pénurie d'ATP, la préférence est déplacée vers le BER à patch long. En effet, le poly(ADP-ribose) peut servir de source unique d'ATP pendant l'étape de ligature dans le BER.
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