Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove

7.15: Ретротранспозоны без LTR
СОДЕРЖАНИЕ

JoVE Core
Molecular Biology

A subscription to JoVE is required to view this content. You will only be able to see the first 20 seconds.

Education
Non-LTR Retrotransposons
 
ТРАНСКРИПТ

7.15: Ретротранспозоны без LTR

Как следует из названия, ретротранспозоны без LTR не имеют длинных концевых повторов, характерных для LTR-ретротранспозонов. Также LTR-ретротранспозоны и ретротранспозоны, несодержащие LTR, используют разные механизмы мобилизации. Ретротранспозоны без LTR делятся на два класса: длинные диспергированные ядерные элементы (LINE) и короткие диспергированные ядерные элементы (SINE), оба из которых в изобилии встречаются у большинства млекопитающих, включая человека. Некоторые из активных ретротранспозонов без LTR у человека - это элементы L1 (LINE) и Alu-элементы (SINE).

Транспозиция обычно происходит случайно, что означает, что место, куда вставляется транспозон, является произвольным. Транспозоны, которые случайным образом вставляются в гены, могут мешать экспрессии генов и вызывать генетические дисфункции. Классическим примером является вставка ретротранспозона L1 в ген фактора VIII, вызывающая гемофилию. Интеграция L1 в ген-супрессор опухоли Adenomatous polyposis coli (APC) также была обнаружена у пациентов с раком толстой кишки. SINE элемент Alu вызывает хромосомные аберрации, а также связан с врожденными дефектами, такими как нейрофиброматоз.

Клеточный механизм репрессии ретротранспозонов включает химические модификации, такие как метилирование элементов LINE или образование усеченных ретротранспозонов. Подавляющее большинство элементов LINE и SINE в геноме человека усечены на 5’-конце из-за ошибочной обратной транскрипции. Такие ретротранспозоны обычно молчащие, то есть они не влияют на экспрессию генов после вставки.

Наличие ретротранспозонов в раковых клетках было использовано для разработки ретротранспозонов, таких как L1, в качестве биомаркеров рака. Было замечено, что метилирование L1 значительно снижается в раковых клетках. Этот тип гипометилирования приводит к нестабильности генома. Уровни гипометилированного L1 были исследованы как биомаркеры злокачественных новообразований, таких как рак груди, толстой кишки и кожи.


Литература для дополнительного чтения

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter