7.15: Rétro-transposons non-LTR
Comme son nom l'indique, les rétrotransposons non-LTR n'ont pas les longues répétitions terminales caractéristiques des rétrotransposons LTR. De plus, les rétrotransposons LTR et non-LTR utilisent des mécanismes de mobilisation distincts. Les rétrotransposons non-LTR sont divisés en deux classes - Les longs éléments nucléaires intercalés (LINE) et les petits éléments nucléaires intercalés (SINE), tous deux présents en abondance chez la plupart des mammifères, y compris les humains. Certains des rétrotransposons actifs non LTR chez l'homme sont les éléments L1 (LINE) et les éléments Alu (SINE). ).
La transposition est généralement un événement fortuit, ce qui signifie que l'emplacement où l'élément transposable est inséré est aléatoire. Les transposons insérés au hasard dans les gènes peuvent interférer avec l'expression génique et provoquer des dysfonctionnements génétiques. Un exemple classique est l'insertion du rétrotransposon L1 dans le gène du facteur VIII qui cause l'hémophilie. L'intégration de L1 dans le gène suppresseur de tumeur Adenomatous polyposis coli (APC) a également été trouvée chez des patients atteints de cancer du côlon. L'élément SINE Alu provoque des aberrations chromosomiques et a également été lié à des anomalies congénitales comme la neurofibromatose.
Le mécanisme cellulaire de répression des rétrotransposons implique des modifications chimiques telles que la méthylation des éléments LINE ou la production de rétrotransposons tronqués. La grande majorité des éléments LINE et SINE dans le génome humain sont tronqués à leur extrémité 5’ en raison d'une transcription inverse erronée. Ces rétrotransposons sont généralement silencieux, ce qui signifie qu'ils n'affectent pas l'expression des gènes après l'insertion.
La présence de rétrotransposons dans les cellules cancéreuses a été exploitée pour développer des rétrotransposons comme L1, en tant que biomarqueurs du cancer. Il a été observé que la méthylation de L1 est significativement réduite dans les cellules cancéreuses. Ce type d'hypométhylation conduit à une instabilité génomique. Les niveaux de L1 hypométhylés ont été étudiés en tant que biomarqueurs de tumeurs malignes comme le cancer du sein, du côlon et de la peau.
