Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove

8.4: Bakteriyel RNA Polimeraz ve Transkripsiyon
İÇİNDEKİLER

JoVE Core
Molecular Biology

A subscription to JoVE is required to view this content. You will only be able to see the first 20 seconds.

Education
Bacterial RNA Polymerase
 
TRANSKRİPT

8.4: Bakteriyel RNA Polimeraz ve Transkripsiyon

Evrim sırasında, organizmalar bir RNA genomundan bir DNA genomuna geçerken, iki acil şartın yerine getirilmesi gerekiyordu. Birincisi, retrovirüslerde ana replikasyon biçimini oluşturan ve insanlarda geri dönüştürülebilir elementlerde hala gözlemlenen RNA-şablonuna bağımlı DNA sentezi. İkincisi, hem bakteri hem de ökaryotlarda RNA polimeraz (RNAP) tarafından gerçekleştirilen DNA şablonuna bağlı RNA sentezi.

Transkripsiyon, her biri polimerazı yönlendirmek için farklı DNA dizilerini içeren üç ana aşamaya bölünebilir. Bunlar:

  1. Başlatma, promoter adı verilen, genin 10 ve 35 baz çiftinin akış yukarı iki özel dizisini içerir.
  2. Polimerazın DNA şablonu ile birlikte ilerlediği, mRNA'yı 5′ 3′ yönünde sentezlediği uzama.
  3. Polimerazın, C–G nükleotidleri açısından zengin bir bölgeyle karşılaştığı ve mRNA sentezini durdurduğu sonlandırma.

Bakteriyel RNAP, diğer yardımcı proteinlerle birlikte üç adımı da gerçekleştirir. Viral T7 ve N4 polimerazlar gibi bazı RNA polimerazlar tek bir polipeptit zincirinden oluşurken, hücresel genomlu tüm organizmalar, genomun yapısına bağlı olarak boyut ve karmaşıklık açısından değişen multisubunit polimerazlara sahiptir. Bakteriyel RNAP'nin multisubunit yapısı, enzimin katalitik işlevi sürdürmesine, montajı kolaylaştırmasına, DNA ve RNA ile etkileşime girmesine ve aktivitesini kendi kendine düzenlemesine yardımcı olur. Katalitik olarak verimli bir enzim olmasına rağmen, spesifik olarak DNA dizilerini tanımaz. RNAP'nin yüksek afiniteli DNA dizilerini tanımasına yardımcı olmak için, transkripsiyon faktörleri adı verilen özel proteinler, transkripsiyonu başlatmak ve sonlandırmak için DNA'nın belirli bölgelerine bağlanır. RNAP'a yardımcı olan tüm özelleşmiş proteinlerden sadece biri, üç yaşam alanında -bakteriler, arkeler ve ökaryotlar- korunur. Bu transkripsiyon faktörüne bakterilerde NusG, arkelerde Spt5 ve ökaryotlarda SPT5 denir.   NusG, σ faktör ayrıştıktan sonra başlatma sırasında RNA polimeraza bağlanır. Polimeraz duraklamasını kontrol ederek transkripsiyon sürecini düzenler. NusG'nin kapsamlı korunması, uzama sırasında polimeraz aktivitesinin düzenlenmesinin, transkripsiyon başlangıcının düzenlenmesinden önce olduğunu gösterir.


Önerilen Okuma

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter