Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove

11.6: mRNA Stabilitesi ve Gen Ekspresyonu
İÇİNDEKİLER

JoVE Core
Molecular Biology

A subscription to JoVE is required to view this content.

Education
mRNA Stability and Gene Expression
 
TRANSKRİPT

11.6: mRNA Stabilitesi ve Gen Ekspresyonu

mRNA moleküllerinin yapısı ve stabilitesi, gen ekspresyonunu düzenler, çünkü mrRNA'lar genden proteine giden yolda önemli bir adımdır. Ökaryotlarda, mRNA'nın yarı ömrü birkaç dakikadan birkaç güne kadar değişir. mRNA stabilitesi büyüme ve gelişmede çok önemlidir. Farelerde tristetraprolin gibi stabilitesini düzenleyen proteinlerin yokluğu, kemik iliği aşırı büyümesi, iltihaplanma ve otoimmünite gibi sistemik sorunlara neden olabilir.

Cis-mRNA Stabilitesinde Rol Oynayan Elemanlar

Bir mRNA dizisi sadece proteinleri kodlamakla kalmaz, aynı zamanda tek başına veya trans etkili proteinlerin yardımıyla mRNA stabilitesini düzenleyen çeşitli Cis etkili bölgeleri de içerir. Bir mRNA'nın 5' ucu 7-metilguanilat (m7G) kapağına sahiptir ve 3' ucu, her ikisi de mRNA'yı eksonükleazlardan koruyan bir poli-A kuyruğuna sahiptir. 15-20 nükleotidden daha kısa bir poli-kuyruk, mRNA'nın dekapajına ve daha sonra bozulmasına neden olabilir; bu nedenle, poli-A kuyruğunun uzunluğu mRNA'nın stabilitesi için önemlidir. 5' ve 3' mRNA'nın çevrilmemiş bölgeleri (UTR), mRNA bozunması ve stabilitesinde rol oynayan proteinler için bağlanma bölgeleri olarak işlev gören çeşitli sekanslar içerir. 5' UTR, 5' m7G kapağının dekapajını veya çıkarılmasını teşvik eden proteinler için bağlayıcı bölgeler içerir. 3' bazı mRNA'larda UTR, özellikle yarılanma ömrü olanlar  daha az 30 dakika, taşır  çoklu “ auuua” tekrarlar, AU-zengin dizileri olarak bilinen. mRNA-destabilize edici proteinler bu AU-zengin dizilere bağlandığında, mRNA'nın hızlı deadenilasyonunu ve bozulmasını teşvik ederler. Öte yandan, mRNA stabilize edici proteinler mevcut olduğunda, AU bakımından zengin dizilere bağlanmak için destabilize edici proteinlerle rekabet ederler ve mRNA'nın bozunma oranını azaltırlar. Diğer bazı mRNA'lar ayrıca endonükleazlar için spesifik tanıma dizileri taşırlar.

m-RNA Degradasyonunun Ana Yolları

mRNA bozulmasının en yaygın mekanizmaları, 3' uç poli-A kuyruğunun ve 5' m7G kapağının çıkarılmasını içerir. Deadenilasyon, adeninlerin poli-A kuyruğundan çıkarılması, mRNA'nın iki farklı mekanizma ile bozulmasına neden olabilir. İlk mekanizma, poli-kuyruğun 15-20 nükleotidden daha azına kısaltılmasını içerir, bu da mRNA ve bağlayıcı proteinleri arasındaki ilişkiyi dengesizleştirir.  Bu, 5' m7G kapağını dekapaj enzimlerine, DCP1 ve DCP2'ye maruz bırakır. Kesik ve korumasız 5' mRNA'nın sonu daha sonra 5' ila 3' eksonükleaz, XRN1 ile bozulabilir. Başka bir bozunma mekanizması, 3' poli-A kuyruğunun deadenilazlarla tamamen çıkarılmasını ve daha sonra korunmasız 3' ucunun 3' ila 5' yönündeki sitoplazmik eksozom kompleksi tarafından bozulmasını içerir. 5' ila 3' mRNA degradasyonu mayada önemli bir yoldur, 3' ila 5' mRNA degradasyonu memeli hücrelerinde önemli bir yoldur; bununla birlikte, mRNA aynı anda her iki mekanizma tarafından da bozulabilir. Bazı mRNA'larda, deadenilasyon bozulma için bir ön koşul değildir.  Bir mekanizma dekapaj içerir 5' son ardından 5' için 3' eksonükleaz XRN1 kullanılarak mRNA bozulması. Daha az gözlenen diğer bozunma yolu, endonükleazlar kullanılarak mRNA'nın iç bölünmesini içerir. Kırık mRNA'nın yeni ortaya çıkan korunmasız uçları, sırasıyla XRN1 ve eksozom kompleksi yardımıyla 5' ila 3' ve 3' ila 5' yönünde kolayca bozunabilir.


Önerilen Okuma

Tags

MRNA Stability Gene Expression Half-life Protein Synthesis Transcription Degradation Pathways Deadenylation Dependent Pathway Poly-A Tail Adenines Nuclease Complex Exosome Complex Cap Protection Loop Formation Decapping Enzymes

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter