Summary
במאמר זה אנו מציגים את פרוטוקול כללי למדידת אורך החיים של נמטודות שמרו על התקשורת עם מזון מוצק-UV הרג חיידקים.
Abstract
הזדקנות היא תהליך ניוונית המאופיינת הידרדרות מתקדמת של רכיבים סלולריים האברונים וכתוצאה מכך התמותה. נמטודות
Protocol
חלק 1: הכן את הצמיחה נמטודות מדיה (NGM) צלחות
סעיף זה מתאר את הכנת לוחות NGM מוצק לשימוש בניסוי תוחלת החיים. ניסוי בסיסי תוחלת החיים מחייבת שני סוגים של לוחות: לוחות NGM סטנדרטיים, אשר אינם מכילים תוספים Amp / FUDR צלחות, אשר שניהם אמפיצילין (AMP) ו fluorodeoxyuridine (FUDR) הוסיף NGM. אמפיצילין המשמש על מנת למנוע זיהום חיידקי זרים. FUDR מעכב את חלוקת התא, מפחית ייצור ביצים, ומונע ביצים הבקיעה. השימוש FUDR לניתוח אריכות ימים אינו משפיע על תוחלת החיים הבוגרים ומסיר את הצורך להעביר תולעים כל כמה ימים על מנת להפריד אותם מן הזחל גדל. שני הסוגים של צלחות הם זורעים עם E. coli OP50 חיידקים, אשר נהרגה לאחר מכן ע"י חשיפה UV.
- הכן NGM (ראה סעיף 5 למתכון והערות אחסון) ו צלחות פטרי התווית. יהיה עליך 1 60 מ"מ צלחת פטרי לכל 10 מ"ל של NGM. אם אתה מתחיל עם NGM מוצק מוכן בעבר, המשך לשלב 1.2. אם אתה מתחיל עם NGM autoclaved טרי, דלג לשלב 1.4.
- להמיס לחלוטין NGM מוצק על ידי במיקרוגל גבוה 30 פולסים השני. מערבולת התקשורת בין פולסים כדי למנוע בועות גז בלחץ מהבניין למעלה.
- המקום NGM נוזלי 55 ° C אמבט מים או על הספסל להתקרר.
- לאחר NGM מגיע 55 ° C להוסיף 33 μL FUDR של 150 מ"מ ו 100 μL של אמפיצילין 100 מ"ג / מ"ל ל -100 מ"ל NGM (עבור מגבר / FUDR צלחות) ו מערבולת לערבב. עבור צלחות NGM ללא תרופות נוספות להמשיך ישירות לשלב 1.5.
- באמצעות טכניקה סטרילית, פיפטה 10 מ"ל NGM לתוך כל צלחת פטרי 60 מ"מ. הימנע ויוצרים בועות אם זה אפשרי. אם הבועות לעשות טופס, הם יכולים להיות צץ באמצעות קצה פיפטה.
- השאירו צלחות על הספסל עם מכסים על מנת לאפשר NGM לחזק ויבש. במידת האפשר, לצאת צלחות על הספסל במשך 2 ימים לפני הוספת חיידקים, אבל יום 1 יעבוד אם צלחות נחוצים מוקדם יותר.
- ביום שלפני צלחות הסיום ייבוש, נוזל זרע תרבות LB עם מושבת יחיד מתוך קו חדש של E. coli OP50 חיידקים על אגר LB. אתה צריך להכין לפחות 1 מ"ל של תרבות OP50 לילה לכל צלחת 60 מ"מ.
- OP50 המקום והתרבות 37 ° C שייקר ולאפשר לחיידקים לגדול בין לילה (תרבות צריכה להגיע הרוויה).
- גלולה OP50 על ידי חיידקים גרם ספינינג ב 3500 במשך 10 דקות.
- הסרה של 90% של חיידקים supernatant ו resuspend להתרכז תרבות 10x.
- פיפטה 100 μL של התרבות 10x OP50 מרוכזת למרכז צלחות NGM הקרושה. צלחות מערבולת בעדינות להתפזר התרבות חיידקים אם יש צורך (רצוי חיידקים אמור לכסות את האזור המרכזי של NGM מבלי להתקרב לחומות צלחת). נסו להימנע מלגעת קצה פיפטה אל פני השטח של NGM, כמו פגמים על פני השטח של התקשורת לאפשר תולעים להתחפר לתוך NGM.
- השאירו צלחות על הספסל לילה כדי לאפשר התרבות חיידקים להתייבש על NGM מוצק (בדרך כלל לוקח בערך 24 שעות).
- יבש פעם, לחשוף את פני השטח של הלוחות למינון UV מספיק כדי לעצור את הצמיחה של החיידקים. אם אתה משתמש Stratalinker UV Stratagene 2400:
- המקום צלחות Stratalinker ולהסיר העפעפיים
- סגור את הדלת ולהדליק Stratalinker
- לחצו על "אנרגיה"
- הזן "'9999 באמצעות לוח המקשים
- לחץ "התחל"
- הצלחות יהיו חשופים UV למשך כ 5 דקות
- צלחות עם חיידקים-UV נהרגו ניתן לאחסן במהופך על 4 מעלות צלזיוס עד חודש 1.
חלק 2: ביצוע ביצה מתוזמן הנחת לרכוש גיל מסונכרן האוכלוסייה של חיות
בסעיף זה אנו ליצור אוכלוסייה של תולעים עם תאריך לבקוע נפוץ. מטרה זו מושגת על ידי מתן מבוגרים פעיל reproductively להטיל ביצים על צלחת לתקופה מוגדרת של זמן המאפשר ביצים אלה להתפתח.
- (אופציונאלי) העברה של כ 20 תולעים בוגרות צעירות צלחת NGM טריים ללא FUDR. השאירו צלחות של 25 ° C על מנת לאפשר תולעים להפיץ ולאכול את כל האוכל חיידקי. אחרי האוכל חיידקי כבר צרכו תולעים שזה עתה בקעו ייכנסו צמיחה נעצר בשלב dauer. תתחיל לראות את הזחל dauer סביב בתוך שבוע, תלוי איך אתה מעביר תולעים רבים הצלחת בתחילה. הזחל Dauer יכול לשמש את הצעדים הבאים במשך חודש עד 1.
- (אופציונלי) 20-30 העברת dauer הזחל לצלחת NGM טריים ללא FUDR. בנוכחות של הזחל מזון dauer יהפכו למבוגרים פעיל reproductively בתוך 2 ימי ולהישאר פעיל reproductively במשך כמה ימים לאחר מכן ב 25 ° C.
- העברת 10-15 מבוגרים פעיל reproductively לצלחת NGM טריים ללא FUDR. צלחת זו נקראת הנחת ביצה מתוזמן (תל) צלחת.
- השאירו את הצלחת תל במהירות של 25 מעלות צלזיוס במשך 6 שעות על מנת לאפשר tהוא זמן תולעים להטיל ביצים.
- הסר תולעים בוגרות מהצלחת טל. פלייט יכולה להיבדק חזותית לביצים לפני הסרת מבוגרים. אם התולעים לא הניחו מספר מספיק של ביצים בצלחת תל ניתן להשאיר על 25 מעלות צלזיוס עד לסך של 24 שעות לפני הסרת תולעים בוגרות.
- המקום תל צלחת ב 20 ° C עד הביצים יש בקעו והתולעים פיתחו בשלב הזחל L4 (זה בדרך כלל לוקח 2 ימים בטבע סוג C. elegans, אבל יכול להימשך זמן רב יותר עבור זנים עם פנוטיפים התפתחות איטית).
חלק 3: בעלי חיים ציון על תוחלת החיים
בסעיף זה נעקוב אחרי גיל מסונכרן אוכלוסיית תולעים מן חלק 2 עד שהם מתים. תולעים מתוחזקים על מגבר / FUDR צלחות כדי למנוע ייצור ביצה זיהום חיידקי ונחשבים מתים כאשר הם אינם מגיבים לגירויים חיצוניים.
- העברת L4 זחל אל צלחות seeded Amp / FUDR. עבור כל מתח או מצב שנבדק, הוא אופייני להקים 2-3 צלחות עם 25-30 תולעים לכל צלחת. תמונות של ג בשלבים elegans החיים ניתנים לעיון (איור 1). 1
- המקום Amp / FUDR צלחות על 20 מעלות צלזיוס למשך 24 שעות.
- לאחר 24 שעות חזותית להעריך תולעים, מדיה, וחיידקים. העברת תולעים Amp / FUDR צלחות טרי אם כל אחד מאלה הוא ציין:
- תולעים אוכלים את רוב האוכל חיידקי. בתחילת את תוחלת החיים תולעים הניסוי יצטרכו להיות מועברים 1-2 פעמים בשבוע כדי למנוע מחיידקים מתרוקן.
- מספר לא מבוטל של הזחלים נמצאים. זה בדרך כלל אינדיקציה כי תולעים הועברו Amp / FUDR צלחות כמבוגרים במקום L4s צעירים הצליחו יטילו ביצים לפני FUDR לתוקף. FUDR בדרך כלל למנוע את הזחלים מן גדל לתוך מבוגרים מלא, אבל מדי פעם כמה יגדל מבוגרים להתבלבל עם חיות הניסוי.
- החיידק חי / גידול הם נצפו. בדרך כלל, שילוב של מגבר ו-UV הרג תבטיח כי אין חיידקים חיים לזהם את הניסוי, אבל מדי פעם זה קורה.
- צמיחת הפטרייה הוא ציין על התקשורת. אם נתפס מוקדם מספיק, צמיחה פטרייתית בדרך כלל ניתן לגזור בעזרת קצה פיפטה או מרית. לאחר שהוא גדל להיות גדול יותר מאשר כמה מילימטרים קוטרו זה בדרך כלל קל יותר להעביר את התולעים לצלחת חדשה.
- שימוש היקף לנתיחה, לקבוע אם התולעת כל חי או מת.
- לטפוח בעדינות את הצלחת. התולעת היא חיה אם היא נעה בתגובה הקשה.
- אם התולעת אינו מגיב הקשה על הזום, צלחת על אזור הראש.
- לטפוח בעדינות את ראש התולעת עם לבחור להעביר פלטינה. ציון התולעת כמו מת אם זה לא מגיב על ידי הזזת הראש.
- תולעים המלח ניתן להסיר מן הצלחת.
- תעדו את התאריך ואת מספר תולעים, כי הם חיים ומתים.
- חזור צלחות עד 20 ° C.
- חזור על שלבים 3.3 עד 3.6 בכל 2 עד 3 ימים עד תולעים כל מתו.
חלק 4: תוצאות נציג.
הנתונים הגולמיים המיוצר על ידי ניסוי תוחלת החיים נמטודות רשימה של תאריכים עם מספרים המקביל תולעים, כי הם חיים ומתים עבור כל זן נבדק. מספר ותולעים למות בכל יום הוא בדרך כלל הפוך כדי לחשב את שיעור תולעים חי בכל יום (איור 2 א), אשר זממו גרפית כמו עקומת ההישרדות (תרשים 2B, יום הנחת ביצה מתוזמן נחשב היום 0 ). תוחלת החיים של התולעת בנפרד במחקר ניתן לחשב מהסכום של תולעים שמתים על כל יום המשמשים לחישוב תוחלת החיים החציונית מתכוון להשוואה בין זנים. ספירה של מספר תולעים חי בכל יום אינו משמש ישירות ניתוח תוחלת החיים. תולעים שמרו על התקשורת מוצק מדי פעם "לברוח", או לזחול או לטפס על הקירות של הצלחת או למטה מתחת התקשורת. מספר תולעים חי בכל יום ניתן להשתמש כדי לקבוע כיצד תולעים רבים ברחו במהלך כל הניסוי. תולעים זה לברוח מוסרים בדרך כלל מהניתוח. כאמת מידה, את אורך החיים הטיפוסי החציוני N2, ג elegans wild-type זן, שמרו על הרג חיידקים-UV ב 20 ° C הוא כ 25 ימים, כפי שהיא נמדדת מן הביצה.
חלק 5: פתרונות
| צמיחה נמטודות מדיה (NGM), 100 מ"ל: | |
| שלב: | |
| 0.3 גרם | NaCl |
| 0.25 גר ' | Peptone |
| 2 גרם | אגר |
| החיטוי במשך 40 דקות ולתת להתקרר 55 מעלות צלזיוס, ולאחר מכן להוסיף: | |
| 100 μL | 1 מ 4 MgSO |
| 100 μL | 5 מ"ג / מ"ל כולסטרול |
| 100 μL | 1 M CaCl2 |
| 1.625 מ"ל | 1.5 מ KPI-pH 6.0 |
| NGM נוזלי ניתן להשתמש מיד לשפוך צלחות או מותר לחזק ומאוחסנים לטווח ארוך בטמפרטורת החדר | |
| מרק לוריא (LB), 1 ליטר: | |
| 10 גרם | BactoTryptone |
| 5 גרם | תמצית שמרים |
| 10 גרם | NaCl |
| 10 מ"ל | 1 M טריס pH 8.0 |
| 1 ליטר | deionized מים |
| החיטוי ולאחסן בטמפרטורת החדר. | |
| 1 M MgSO 4, 300 מ"ל: | |
| 73.95 גרם | MgSO 4 |
| 300 מ"ל | deionized מים |
| החיטוי ולאחסן בטמפרטורת החדר. | |
| 5 מ"ג / מ"ל כולסטרול, 200 מ"ל: | |
| 1 גרם | כולסטרול |
| 200 מ"ל | 100% אתנול |
| סנן לעקר ולאחסן בטמפרטורת החדר. | |
| 1 M CaCl 2, 500 מ"ל: | |
| 27.75 גרם | CaCl 2 |
| 500 מ"ל | deionized מים |
| סנן לעקר ולאחסן בטמפרטורת החדר. | |
| 1.5 מ KPI pH 6.0, 1 ליטר: | |
| שלב: | |
| 31.4 גרם | KPI dibasic |
| 179.6 גרם | KPI monobasic |
| 850 מ"ל | deionized מים |
| מחממים תוך ערבוב, כדי לאפשר KPI להתמוסס אל תוך פתרון. התאם ל-pH 6.0 עם 10 N NaOH. | |
| מוסיפים מים עד 1 ל deionized | |
| החיטוי ולאחסן בטמפרטורת החדר. | |
| 1 M טריס, pH 8.0: | |
| 60.57 גרם | טריס |
| 400 מ"ל | deionized מים |
| התאם ל-pH 8.0 עם HCl. | |
| מוסיפים מים deionized 500 מ"ל. | |
| סנן לעקר ולאחסן בטמפרטורת החדר. | |
| 150 מ"מ Fluorodeoxyuridine (FUDR), 10 מ"ל: | |
| 0.3693 גרם | FUDR |
| 10 מ"ל | deionized מים סטריליים |
| חנות ב -20 ° C. | |
| 100 מ"ג / מ"ל אמפיצילין (AMP), 10 מ"ל: | |
| 1 גרם | אמפיצילין |
| 10 מ"ל | deionized מים סטריליים |
| חנות ב -20 ° C. | |
| 50 מ"ג / מ"ל Carbenicillin (פחמימות), 10 מ"ל: | |
| 500 מ"ג | Carbenicillin |
| 10 מ"ל | deionized מים סטריליים |
| חנות ב -20 ° C. | |
| 1 M איזופרופיל β-D-Thiogalactopyranoside (IPTG), 10 מ"ל: | |
| 2.38 גר ' | IPTG |
| 10 מ"ל | deionized מים סטריליים |
| חנות ב -20 ° C. | |
באיור 1. בשדה תמונות מוארת של C. elegans שלבי החיים, כולל ביצה, ארבעה שלבים הזחל (L1 - L4), וכן למבוגרים. לוחות כל להראות הרמפרודיטים למעט הימנית התחתונה, אשר מראה זכר בוגר (תמונה מתוך ווד (1988)).
איור 2. הנציג נובע ג תוחלת החיים elegans הניסוי השוואת N2 זן פראי סוג למתח המכילה מוטציה בגן daf-2. (א) טבלה המציגה נתונים שנאספו, כולל מספר ימים מאז תולעים היו ביצים, מספר תולעים מת נצפתה בכל יום, ואחוז המדגם המקורי שנותרו בחיים בכל יום (כפי שחושב מן ספירות יומי של תולעים מתות) . (ב) הישרדות עקומות המתאים את תוחלת החיים נתונים שסופקו (A).
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
הבקרה הגנטית של אריכות ימים, נחקרה בהרחבה ב C. elegans, בעיקר בשל הקלות ואת המהירות שבה תוחלת החיים ניתן לקבוע. פרוטוקול שנדונו במאמר זה מתאר המסגרת הבסיסית להשגת לשחזור נתונים תוחלת החיים ב C. elegans והוא יכול לחול גם על מינים relatednematode. 2 על ידי ביצוע כמה שינויים פשוטים הליכים אלה ניתן להתאים מדד תוחלת החיים תחת מגוון של תנאים. כאן נדון וריאציות משותף, ובהם חיידקים חיים, התערבות RNA (RNAi), הגבלה תזונתית על ידי מניעת חיידקים ללא שימוש בסמים NGM.
כנראה וריאציה הנפוצה ביותר של פרוטוקול זה הוא אחזקה של תולעים על חיידקים חיים. ניתן להשיג זאת על ידי ביצוע שינויים קלים. ראשית, לשנות את הליך זריעת הצלחות עם חיידקים (1.7 באמצעות צעדים 1.13). במקום גדל OP50 תרבויות כדי רוויה, לגדול לשלב יומן אמצע פיפטה 200 μL לצלחות ישירות מן התרבות נוזלי. אפשר החיידק לגדול על הצלחות לאורך הלילה להשמיט חשיפה UV. אמפיצילין צריך להיות גם מחוץ צלחות עם FUDR. יתרון באמצעות חיידקים חיים היא כי תולעים לא צריכים להיות מועברים לעתים קרובות על לוחות חדשים, מאז מזון חיידקי חי וצומח. החיסרון של חיידקי מזון לחיות היא OP50 הוא פתוגניים אל C. elegans. 3 תולעים גדל על חיידקים חיים יש תוחלת חיים קצרה יותר תולעים גדל ב-UV הרג חיידקים, 3 אשר עלול להסוות תוחלת החיים פנוטיפים הקשורים להזדקנות. תוחלת החיים החציונית על חיידקים חיים הוא כ 20 ימים.
ג'ין להפיל על ידי RNAi מושגת בקלות ב C. elegans ידי שינוי מזון חיידקי שלהם, כך היא מייצרת פעמיים תקועים RNA המתאים הגן להיות הפילו. שתי ספריות RNAi חיידקי זמינים שמכסים יותר מ 90% של מסגרות קריאה פתוחות ג הגנום elegans. 4-9 כדי לנצל RNAi בהקשר של תוחלת החיים, להחליף את OP50 חיידקים עם המשובט RNAi עניין ובצע את השינויים דנו בסעיף הקודם למדידת תוחלת החיים על חיידקים חיים. ספריות RNAi להשתמש במערכת פלסמיד הביטוי מבוסס. הפלסמיד הוא נבחר באמצעות קלטת התנגדות carbenicillin וביטוי של גדילי RNA כפולים הוא המושרה על ידי איזופרופיל β-D-thiogalactopyranoside (IPTG). שני carbenicillin ו IPTG צריכים להיכלל צלחות NGM. שינוי צעד 1.4 ידי הוספת 100 μL 1 M IPTG ו 50 μL 50 מ"ג / מ"ל carbenicillin לכל NGM 100 מ"ל לשני סוגים של צלחות. אמפיצילין לא צריך להוסיף גם סוג של צלחת, מאז carbenicillin ממלא את תפקיד זהה.
הגבלה תזונתיים היא התערבות ביותר למד נרחב האטת הזדקנות פני זנים חריגים מבחינה אבולוציונית. ב ג elegans, הארכת תוחלת החיים המקסימלית על התקשורת מוצק הוא ציין כאשר מקור מזון חיידקי נמחק לחלוטין במהלך הבגרות, סוג של מגבלה תזונתיים כינה קיפוח חיידקי (BD). 9, 10 כדי למדוד את אורך החיים בהקשר של BD, לעשות שני שינויים בפרוטוקול לעיל. ראשית, להכין סוג שלישי של צלחת. הצלחות אלה צריכים להיות זהים Amp / FUDR צלחות פרט חסר מקור מחיידקים שבמזון. שנית, לשנות חלק 3 לכלול צעד נוסף בין 3.2 צעד צעד 3.3. ביום 4 של הבגרות (4 ימים לאחר העברת זחלים L4 כדי Amp / FUDR) להעביר תולעים BD כדי Amp / FUDR צלחות חסר חיידקים. אחד הסיבוכים הקשורים בצורה זו של הגבלה תזונתית היא הנטייה של תולעים לברוח. בהעדר מזון התולעים לא יישאר ליד במרכז הצלחת, אך יגדיל באזורם של חקר בחיפוש אחר מזון. כתוצאה מכך, חלק גדול יותר של התולעים יזחלו את קירות הצלחת ליבש. לעתים קרובות אנו רואים 50% עד 70% של בעלי החיים לברוח לאחר שהועבר צלחות BD. כדי לטפל בבעיה זו, להתחיל עם שלוש פעמים כמו תולעים רבים על מנת לקבל מספר משמעותי שנותר על הצלחות שלאחר הטיסה. BD גם יכול להיות בשילוב עם חיידקי מזון לחיות ללא שינויים נוספים, או RNAi עם שינוי אחד נוסף. עבור BD עם RNAi, אנטיביוטיקה נוספים יש להוסיף את הצלחות בלי חיידקים כדי למנוע חיידקים שהועברו עם תולעים לצמוח ולספק מקור מזון בלתי רצויים. שתי דוגמאות הן טטרציקלין ו kanamycin, או אשר ניתן להוסיף את הצלחות FUDR ללא מזון חיידקי במהלך שלב 1.4. BD יכול להיות גם יזם מוקדם ככל 2 ימים הבגרות או מאוחר ככל 14 ימים של הבגרות, ללא השפעה משמעותית על תוחלת החיים. 10
שינוי אחרון זה נדון היא מדידת תוחלת החיים על צלחות NGM ללא תרופות נוספות (כגון אמפיצילין או FUDR). ניתן להשיג זאתלא פשוט על ידי הוספת תרופות NGM במהלך שלב 4 והוספת צעד אחד נוסף בחלק 3. ללא תולעים FUDR תמשיך להטיל ביצים והפקת הזחל. במהלך שלב הרבייה שלהם (בערך בשבוע הראשון של הבגרות) כל התולעים הניסוי יצטרכו להיות מועברים צלחות טריים כל 2 ימים כדי להפריד בינם לבין צאצאיהם.
סי אלגנס הם hermaphroditic בעיקר נדיר של זכרים. תוחלת החיים נמדדת בדרך כלל על הרמפרודיטים בלבד, אבל גם יכול להיות נמדד בקרב הזכרים. ישנם שני אתגרים הקשורים בעבודה עם ג זכר elegans. הראשונה היא לרכוש כמות גדולה של תולעים זכר, כמו אנדרוגינוס עצמית הפריה מייצרת חלק קטן מאוד של צאצאים זכרים (0.1%). 11 לאחר אוכלוסייה המכיל תולעים מושגת זכר, נקבה / אנדרוגינוס ההזדווגות מייצר מספרים שווה של זכרים הרמפרודיטים עוד תולעים נשמרים בנוכחות מזון. 12 מניות זכר ניתן להזמין מן המרכז לגנטיקה Caenorhabditis או שנוצר על ידי הקרנת חזותית לזכרים המייסדים המופק אנדרוגינוס הפריה עצמית. האתגר השני הוא התנהגות גברית הדחה. בהיעדר מזון או בני זוג פוטנציאליים (הרמפרודיטים), תולעים זכר להזין מצב התנהגותי חיפוש המערבת מגוון רחב של תנועה. 13 כאשר שמרו על צלחות זה תוצאות התנהגות חלק גדול של תולעים הנמלטים את קירות צלחת desiccating . השיטה הכללית להתמודדות עם קושי זה פשוט להתחיל עם גברים מספיק כי חלק ניכר ביותר להישאר אחרי נמלטו.
מלבד תוחלת החיים, גיל משותף הקשורים פנוטיפ הוא הצטברות lipofuscin. Lipofuscin הוא בזבוז הסלולר מורכב שלא ניתן מושפל שמצטבר בתאים עם הגיל והוא משמש סמן ביולוגי של הזדקנות ב C. elegans. 14, 15 ו - מאיר Lipofuscin ניתן דמיינו בקלות ב C. elegans באמצעות ערוץ DAPI של מיקרוסקופ פלואורסצנטי (איור 3). Lipofuscin הצטברות ניתן דמיינו בתולעים להיות הבקיע עבור תוחלת החיים ישירות על צלחות NGM, המאפשר איסוף פנוטיפ משנית שימושי במקביל תוחלת החיים.
בנוסף תוחלת החיים, הפרוטוקול המתואר במאמר זה יכול לשמש גם להבקיע התקדמות פנוטיפי של שיתוק בגיל הקשורים ב C. מודלים elegans של המחלה proteotoxicity. 16 כאשר תולעת הופך משותק הוא הופך להיות מסוגל לזחול על פני הצלחת, אבל עדיין יכול להזיז את הראש. תולעת הוא הבקיע משותק, כאילו הוא נכשל לעבור יחסית NGM בתגובה צלחת הקשה עם דרבון או לבחור להעביר פלטינה, אבל זז ראשו. תולעים זה למות בדרך כלל לשמור את הציון שיתוק (משותק או לא משותק) כי הם קיבלו במהלך התצפית לחיות האחרונה. סוג חשוב לציין, אפילו בר ג elegans להיות משותק עם הגיל המתקדם. בשביל זה שיתוק הסיבה היא בדרך כלל לא הבקיע עבור תולעים מבוגר כ 20 ימים, כמו מעבר לנקודה זו הוא הופך להיות קשה להבדיל בין שיתוק הנגרם על ידי שיתוק הזדקנות נורמלית הנגרמת על ידי התקדמות המחלה proteotoxicity.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Acknowledgments
עבודה זו נתמכה על ידי פריצות דרך גלן / מרחוק פרס גרונטולוגיה ו-NIH גרנט 1R01AG031108-01 ל MKGS נתמך על ידי NIH הכשרה מענק P30AG013280. ח"כ הוא רפואי אליסון קרן מלומד חדש הזדקנות.
Materials
| Name | Type | Company | Catalog Number | Comments |
| Agar | Reagent | Fisher Scientific | DF0145-17-0 (214530) | |
| Ampicillin | Reagent | MidSci | 0339 | |
| BactoTryptone | Reagent | Fisher Scientific | DF0123-17-3 (211705) | |
| BactoPeptone | Reagent | Fisher Scientific | DF0118-17-0 (211677) | |
| CaCl2 | Reagent | Fisher Scientific | NC9699248 (1332-01) | |
| Carbenicillin | Reagent | Gold Biotechnology | C0109 | |
| Cholesterol | Reagent | Sigma-Aldrich | C75209 | |
| Fluorodeoxyuridine (FUDR) | Reagent | Sigma-Aldrich | F0503 | |
| Isopropyl β-d-Thiogalactopyranoside (IPTG) | Reagent | Gold Biotechnology | I2481C5 | |
| KPi Dibasic | Reagent | Fisher Scientific | 5087862 (3252-01) | |
| KPi Monobasic | Reagent | Fisher Scientific | 5087861 (3246-01) | |
| MgSO4 | Reagent | Fisher Scientific | NC9561800 (2500-01) | |
| NaCl | Reagent | Fisher Scientific | S251 | |
| Tris | Reagent | Sigma-Aldrich | T1503 | |
| Yeast Extract | Reagent | Fisher Scientific | DF0886-17-0 (288620) |
References
- Wood, W. B. The Nematode Caenorhabditis elegans. Wood, W. B. , Cold Spring Harbor Laboratory Press. Cold Spring Harbor, NY. 1-16 (1988).
- Sutphin, G. L., Kaeberlein, M. Dietary restriction by bacterial deprivation increases life span in wild-derived nematodes. Exp Gerontol. 43, 130-135 (2008).
- Garigan, D. Genetic analysis of tissue aging in Caenorhabditis elegans: a role for heat-shock factor and bacterial proliferation. Genetics. 161, 1101-1112 (2002).
- Chen, D., Pan, K. Z., Palter, J. E., Kapahi, P. Longevity determined by developmental arrest genes in Caenorhabditis elegans. Aging Cell. 6, 525-523 (2007).
- Curran, S. P., Ruvkun, G. Lifespan regulation by evolutionarily conserved genes essential for viability. PLoS Genet. 3, e56-e56 (2007).
- Dillin, A. Rates of behavior and aging specified by mitochondrial function during development. Science. 298, 2398-2401 (2002).
- Hamilton, B. A systematic RNAi screen for longevity genes in C. elegans. Genes Dev. 19, 1544-1555 (2005).
- Hansen, M., Hsu, A. L., Dillin, A., Kenyon, C. New genes tied to endocrine, metabolic, and dietary regulation of lifespan from a Caenorhabditis elegans genomic RNAi screen. PLoS Genet. 1, 119-128 (2005).
- Lee, S. S. A systematic RNAi screen identifies a critical role for mitochondria in C. elegans longevity. Nat Genet. 33, 40-48 (2003).
- Smith, E. D. Age- and calorie-independent life span extension from dietary restriction by bacterial deprivation in Caenorhabditis elegans. BMC Dev Biol. 8, 49-49 (2008).
- Hodgkin, J., Horvitz, H. R., Brenner, S. Nondisjunction Mutants of the Nematode CAENORHABDITIS ELEGANS. Genetics. 91, 67-94 (1979).
- Emmons, S. W., Sternberg, P. W. C. ELEGANS II. Riddle, D. L., Blumenthal, T., Meyer, B. J., Priess, J. R. , Cold Spring Harbor Laboratory Press. Cold Springs Harbor, NY. (1997).
- Lipton, J., Kleemann, G., Ghosh, R., Lints, R., Emmons, S. W. Mate searching in Caenorhabditis elegans: a genetic model for sex drive in a simple invertebrate. J Neurosci. 24, 7427-7434 (2004).
- Davis, B. O., Anderson, G. L., Dusenbery, D. B. Total luminescence spectroscopy of fluorescence changes during aging in Caenorhabditis elegans. Biochemistry. 21, 4089-4095 (1982).
- Klass, M. R. Aging in the nematode Caenorhabditis elegans: major biological and environmental factors influencing life span. Mech Ageing Dev. 6, 413-429 (1977).
- Steinkraus, K. A. Dietary restriction suppresses proteotoxicity and enhances longevity by an hsf-1-dependent mechanism in Caenorhabditis elegans. Aging Cell. 7, 394-404 (2008).
