数字微流体进行自动蛋白质组学处理

Summary

数字微流体操纵离散液滴（NL – ML）的特点是技术，电气领域的应用电极阵列。它是非常适合进行快速，连续化，小型化自动生化分析。在这里，我们报告的一个平台，能够自动化几个蛋白质组学的处理步骤。

Abstract

临床蛋白质组学研究已成为一个重要的新的学科，有前途的生物标志物，将有助于疾病的早期诊断和预后的发现。临床蛋白质组学方法虽然千差万别，一个共同的特点是：（一）需要极其庞杂的液体（如血清，全血等）和（二）广泛的生化处理，分析前中提取蛋白质。在这里，我们报告一个新的数字微流体（DMF）为基础的方法相结合用于临床蛋白质组学的几个处理步骤。这包括蛋白的提取，resolubilization，还原，烷基化和酶消化。数字微流体是一个微型的流体处理技术，在一个开放的表面上操纵纳升，微升大小的水滴。液滴涂绝缘层的电极阵列上的定位 – 当一个电势应用到液滴，收费积累的介质两侧。收费作为静电处理，可以用来控制液滴的位置，并通过偏置系列电极序列，水滴可以被免除，移动，合并，组合，和表面上的分裂。因此，DMF是一种自然适合进行快速，连续，多步，小型化自动生化分析。这意味着超过常规方法（依靠手动移液器或机器人）的一个显着的进步，并有可能成为一个有用的临床蛋白质组学的新工具。

MAIS研究杰布拉伊尔，利德北鹿，和史蒂夫消委会施同样对这项工作。

塞尔吉奥LS弗莱雷的当前地址是在费城科学大学位于南43街600，费城，PA 19104。

Protocol

第1部分：设备制造食人鱼的解决方案中的清洁玻璃基板（3:1浓硫酸：30％双氧水）。让食人鱼频繁搅拌10分钟的解决方案的基板。 在去离子（DI）水冲洗后干燥与N 2气体的基板，铬沉积（厚度为250 nm）的电子束室里面放置的基板。 脱水铬涂层基板，在异丙醇冲洗，然后在5分钟的热板烘烤在115 ° C。 通过旋涂（30秒，3000转），干与六甲基二硅氮烷（HMDS）的基板?…

Discussion

缺乏规范的样品处理和加工蛋白质组学是该领域的主要的限制。此外，传统的宏观样品处理涉及多个容器和解决方案转移，从而导致样品的损失和污染。这些问题的潜在解决方案是要形成综合系统为依托数字微流体¹甲酰胺（DMF）的样品处理。 ²同样，二甲基甲酰胺被证明是一个集成与整合多级的解决方案相处理（还原，烷基化和消化）兼容在以往的工作，DMF被证明是有效去除不必…