Overview
此视频描述了一种传统的基于板的方法,测量 C. elegans的寿命。示例协议测量使用 RNAi 治疗的蠕虫的寿命。
Protocol
下列协议是从康威尔等人的摘录,复制集方法:一个高通量的方法,定量测量卡诺哈布迪炎优雅寿命,J.Vis.Exp。 (2018).
1. 通过添加5-氟-2'-脱氧尿素(FUdR)来防止后代生产
- 在 20 °C 下种植动物直到 L4 阶段。 检查播种后同步动物是否发展到L4约40小时(步骤2.1.7)。
注:C. elegans的发育时间会因温度而异,且尚未具有特征的突变动物的生长速度必须经过经验测试。- 在每块 6 厘米的盘子中加入 160μL 的 50 倍 FUdR,并配上 L4 动物。
注: 在 L4 阶段添加 FUdR 至关重要。为了方便起见,通过将 1 g FUdR 溶解为 10 mL 超纯 H2O.过滤消毒库存 FUdR,使用 0.2μm 过滤器和 10 cc 注射器,使 FUdR 库存达到 1,000 倍。阿里报价~1 mL库存成无菌1.5 mL管。冻结并存储在-20°C。
- 在每块 6 厘米的盘子中加入 160μL 的 50 倍 FUdR,并配上 L4 动物。
- 检查盘子中男性C.伊莱甘人的存在。删除所有男性。
注:寿命通常是为母马罗狄蒂而不是男性测量的。交配的赫马赫罗狄蒂比未驯养的动物活得短,即使在FUdR的存在。雄性比母体更小、更薄,很容易被独特的钩尾识别出来。 - 将盒子放回拉链锁袋中。返回到20°C孵化器。
2. 评分可行性
- 每天用铂金线或睫毛轻轻触摸动物头部,以得分生存能力。得分动物未能移动作为死亡,并删除他们从板(图1A)。记录每个观察时间点每个情况观察到的死亡人数。
注: 为了降低评分偏差的风险,实验者必须对实验条件视而不见,同样不得在评分过程中引用以前计分的结果。 - 检查破裂、死于其他明显发育缺陷的动物,或爬到菜的一侧:取出这些动物,并在每个观察到的时间点记录数量,以便在统计分析中考虑。此外,如果发现雄性,删除它们并记录观察到的数字。
- 每天重复2.1步,直到没有动物存活。
注: 如果大肠杆菌的草坪显著减少或真菌开始生长在盘子上,则用适当的RNAi和FUdR将所有剩余的动物转移到新鲜的盘子中。
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Representative Results
图1:传统和复制套装方法,用于评分C.elegans寿命(A)。给C. elegans寿命打分的传统方法。随着时间的推移,每个条件的同源动物的几个小同步种群被跟踪。在整个研究过程中,遵循相同的动物种群。可行性通过运动来评估,运动可能受到温柔刺激的刺激。未能移动的动物被打分为死亡,并被移除(愿望显示),直到没有可行的动物留下。(B)。得分C. 电子人寿命的复制集方法。大量年龄同步的同源动物分布在许多相同的复制板上。在每个时间点,都会进行单次复制:添加温和的缓冲解决方案 (M9),从而刺激运动。洪水井后不能自发移动的动物也通过触摸刺激进行评估。实验的评分时间在开始之前确定。每种动物只得分一次,而大种群的寿命来自许多独立的观察。(C)。复制集方法是一种高吞吐量方法,可以定量测量C.elegans的寿命。可以同时跟踪 100 个或更多独立的 RNAi 克隆。显示给定RNAi克隆的HT115大肠杆菌表达dsRNA。实际上,96井板中每24个样本被分成一个24井板。每个生成的 24 井板都有负值(即空矢量、红井)和正控制(绿井)随机分布在 RNAi 克隆(黄井)集合内。通常,集合中的第一口井 (A1) 包含一个空矢量。 请单击此处查看此图的更大版本。
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Materials
Name | Company | Catalog Number | Comments |
FuDR (5-Fluoro-2'-deoxyuridine) | Alfa Aesar | L16497 | |
24 Well Culture Plates | Greiner Bio-One | #662102 | |
600 µL 96-well plates | Greiner Bio-One | #786261 | |
2mL 96-well plates | Greiner Bio-One | #780286 | |
96-pin plate replicator | Nunc | 250520 | |
C. elegans RNAi clone library in HT115 bacteria- Ahringer | Source Bioscience | C. elegans RNAi Collection (Ahringer) | See also Kamath et. al, Nature 2003. |
C. elegans RNAi clone library in HT115 bacteria- Vidal | Source Bioscience | C. elegans ORF-RNAi Resource (Vidal) | See also Rual et. al, Genome Research 2004. This library is also available from Dharmacon. |
L4440 Empty Vector Plasmid | Addgene | 1654 | https://www.addgene.org/1654/ |