Overview
이 비디오는 선충 C. elegans에 있는 화학 요법을 소개하고 구리 황산염에 화학 전술 혐오를 시험하는 견본 프로토콜을 보여줍니다.
Protocol
다음 프로토콜은 캠벨 외에서 발췌, A Caenorhabditis elegans 영양 상태 기반 구리 혐오 분석, J. Vis. Exp. (2017).
- 실험 유기체의 준비
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시험할 때 유기체가 젊은 성인이 되도록 분석서를 시작되기 전에 균주 당 10 L4 단계선 24 시간 선택하십시오. 테스트된 각 돌연변이 또는 제어 선충에 대해 10L4s(컨트롤용 10개, 분석용 10개)를 선택합니다.
- OP50 에슈리치아 대장균으로시드된 표준 한천 플레이트에서 24h표준 방법을 사용하여 L4 유기체를 유지한다. 후속 세척 단계에서 유기체가 분실되는 경우, 시료 크기를 증가시킴으로써보상한다(즉, 10개가 아닌 20개의 벌레를 선택하십시오).
참고: 동작은 선천적으로 가변 표현형입니다. 3일 동안 각 변형에 대해 트리플리케이트로 메서드를 수행합니다. 토론 섹션에서 강조 표시된 대로 새로운 균주에 대한 추가 제어 균주와 조건을 포함합니다.
- OP50 에슈리치아 대장균으로시드된 표준 한천 플레이트에서 24h표준 방법을 사용하여 L4 유기체를 유지한다. 후속 세척 단계에서 유기체가 분실되는 경우, 시료 크기를 증가시킴으로써보상한다(즉, 10개가 아닌 20개의 벌레를 선택하십시오).
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분석 직전에 실험 유기체를 박테리아가없는 천창 판에 옮기고 선충이 1 분 동안 자유롭게 이동하여 과도한 박테리아를 제거 할 수 있습니다.
- 실험 유기체가 분석 전에 24 시간 동안 오염 조건을 경험한 경우 폐기하십시오.
- 파이프 1 mL ML M9 박테리아 가 없는 접시에 벌레를 마이크로 센심 분리기 튜브로 씻어.
- 원심 분리기 3,000 x g에서 1 분 동안. 벌레는 튜브 의 바닥에 펠릿을 형성해야합니다. 웜 펠릿을 방해하지 않고 M9 용액을 흡인합니다. 벌레 펠릿에 M9 1mL을 추가하고, 벌레를 용액과 섞어 튜브를 반전시십시오.
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단계를 1.4세 이상 반복합니다.
- 과잉 박테리아가 처음에 벌레로 옮겨진 경우에, 총 5 회 반복하십시오. 어떤 박테리아도 구리 식품 경주 판으로 옮겨서는 안됩니다. 음식이 분석 판으로 전송되면 정확한 데이터 수집을 방해합니다.
- 마지막 세척 후, M9의 100 μL까지 흡인 슈퍼 내역과 벌레 펠릿이 남아 있습니다.
주의: 기아 관련 행동은 30분 후에 명백해집니다. 따라서 세척 단계가 완료되면 웜을 즉시 용액에서 옮겨야 합니다.
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시험할 때 유기체가 젊은 성인이 되도록 분석서를 시작되기 전에 균주 당 10 L4 단계선 24 시간 선택하십시오. 테스트된 각 돌연변이 또는 제어 선충에 대해 10L4s(컨트롤용 10개, 분석용 10개)를 선택합니다.
- 분석 판의 준비
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분석 하기 이틀 전에 표준 NGM 한천 판을 준비 합니다.
- 플레이트가 습한 환경에 보관되면 분석 3일 전에 한천판을 만듭니다. 또는 적절한 건조를 보장하기 위해 플레이트 뚜껑을 3-6시간 동안 제거하여 적절한 건조성을 보장합니다(멸균 환경에서는).
- 두꺼운 영구 마커로, 외부 가장자리를 따라 플레이트의 밑면에 선을 만들고 다른 한 쪽은 중간 선장벽(도 1)을형성한다. 중간 선 장벽은 플레이트의 각 가장자리와 동등해야 합니다. 눈금자를 사용하여 정확한 측정을 보장합니다. 이 라인은 박테리아와 구리 용액을 전송할 때 가이드역할을 할 것입니다. 대장균이 구리 용액 보다 이전에 전달되는 경우, 이러한 라인은 지표역할을 합니다.
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구리 장벽의 한쪽에만 OP50 대장균의 50 μL이 있는 종자 플레이트는 균일한 잔디를 만듭니다(도 2). 세균성 농도는 에세이를 통해 일관되게 유지되어야 합니다. 그러나, 농도의 가벼운 차이에 대 한 응답으로 작은 가변성이 관찰 되었습니다.
- 박테리아가 구리 용액과 접촉하지 않도록 플레이트 밑면의 표시된 선을 사용합니다. 구리 용액이 플레이트의 가장자리를 라인으로 정렬하고 중간 선 장벽을 형성하는 경우, 구리 용액이 식품 공급원과 접촉하지 않도록 박테리아를 이송한다.
- 플레이트의 두 번째 세트를 표시하고 그들에게 OP50 대장균을 전송하지(그림 2). 이 플레이트는 음의 제어를 평가하는 역할을 합니다. 이 플레이트는 또한 초기 전송 기원을 나타내기 위해 플레이트의 절반에 표시가 있어야 합니다.
- 박테리아가 건조한 다음 하룻밤 사이에 37°C에서 플레이트를 배양할 수 있습니다. 37°C 인큐베이터 또는 룸으로 옮길 때 세균 성 패치가 방해되지 않도록 하십시오. 과도한 방해는 음식 패치의 위치 또는 모양을 변경할 수 있습니다.
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분석 하기 이틀 전에 표준 NGM 한천 판을 준비 합니다.
- 화학 요법 분석
- 분석 시작 시간 전에 0.5M 구리(II) 황산염 용액을 신선하게 준비합니다. 용액의 125 μL이 플레이트당 사용되는 경우, 사용되는 분석플레이트(예: 5 분석 플레이트, 625 μL)의 수에 따라 이 부피를 확장합니다.
- 파이펫 100 μL의 구리(II) 황산염 용액이 화서 가장자리에 있는 외부 구리 장벽을 생성합니다. 플레이트의 밑면이 표시된 것은 가이드역할을 해야 합니다.
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구리(II) 황산염 용액의 파이펫 25 μL이 중간선 장벽을 생성합니다.
- 구리(II) 황산염 용액이 세균 성 패치와 접촉하지 않도록 하십시오. 줄무늬가 한천의 들여쓰기/스크래치로 인해 운동에 영향을 줄 수 있는 것으로 점박이 기술을 사용합니다.
- 구리 용액이 접시에 건조하도록 허용합니다. 기간은 플레이트 및 실험실 조건에 따라 다를 수 있습니다. 전송 후 5분마다 건조함을 시각적으로 확인합니다.
참고: 구리 용액은 파란색 색조를 표시하고 쉽게 식별 할 수 있습니다. 실험실 조직을 사용하여 접시 가장자리 근처의 용액을 가볍게 두드려 건조함을 분별하십시오. -
파이프 20 μL의 벌레 펠릿은 튜브 의 바닥에서 분석 플레이트의 박테리아가없는 절반으로.
- 10개의 웜이 분석판으로 이송되는지 확인합니다. 여분의 벌레가 실수로 포함 된 경우, 접시에 박테리아가 추가되지 않도록 할로카본 오일로 따기하여 제거합니다. 각 분석서는 분석 중에 일관된 수의 선충을 가져야 합니다.
참고: 애사 중에 웜이 너무 적으면 초기 샘플 크기를 늘리면 세차 및 전송 중에 잠재적인 손실이 완화됩니다.
- 10개의 웜이 분석판으로 이송되는지 확인합니다. 여분의 벌레가 실수로 포함 된 경우, 접시에 박테리아가 추가되지 않도록 할로카본 오일로 따기하여 제거합니다. 각 분석서는 분석 중에 일관된 수의 선충을 가져야 합니다.
- 실험실 조직으로 접시에서 초과 M9을 제거합니다. M9은 구리(II) 황산염 용액과 접촉해서는 안 됩니다.
주의: 이 단계를 수행하는 동안 웜과 한천 표면이 영향을 받지 않도록 합니다. 너무 가혹하게 사용되는 경우, 실험실 조직은 플레이트의 천 표면에 들여 쓰기를 만들 수 있으며 벌레를 제거 할 수 있습니다. 김슬쩍을 통해 실수로 제거된 웜은 폐기해야 합니다. -
M9 용액이 제거되고 모든 웜이 비액체 운동 패턴을 시작하면 분석 스톱워치를 시작합니다.
- 최적으로 M9 솔루션을 1분 이내에 제거합니다. 필수 매개 변수는 부비동 엽운동의 식별입니다. 웜 은 액체에있을 때 부비동이성보다는 스래싱과 같은 다르게 locomote합니다. 각 실험 유기체가 스래싱을 멈추면 분석 정지 시계를 시작합니다.
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30분마다 분석 접시를 확인하십시오.
- 세균성 패치를 가진 분석 판의 경우, 4 시간 기간 동안 음식 패치에 도달하면 유기체를 긍정적으로 점수. 음의 대조판의 경우, 장벽을 넘으면 유기체를 긍정적으로 점수로 매길 수 있습니다.
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Representative Results
그림 1: 5cm 페트리 접시 의 밑면에 구리 솔루션 배치를 나타내는 표시의 시각적 표현. 이러한 표시는 세균 성 패치를 전송한 다음 구리 용액을 한천 표면으로 옮길 때 플레이트의 단면도를 적절하게 측정하고 지침역할을 하는 데 사용됩니다.
그림 2: 5cm 페트리 접시는 식품 분석 접시 안팎의 두 부분으로 나뉘며, 세균성 잔디는 온 푸드 플레이트섹션 중 하나에 형성된다. 식품 패치는 플레이트의 가장자리를 정렬하고 중간 선 장벽을 형성하는 테스트 화합물과 접촉해서는 안됩니다.
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Materials
Name | Company | Catalog Number | Comments |
M9 Solution [3 g KH2PO4, 6 g Na2HPO4, 5 g NaCl, 1 ml 1 M MgSO4, H2O to 1 litre. Autoclave to sterilize before use.] | Produced in lab | ||
Cupric Sulfate | Sigma | C-1297 | Use water to appropriately suspend to a concentration of 0.5M |