Summary
kisspeptin受体(KISS1R)的突变与患者的生殖系统紊乱。在这里,我们描述如何引入利益的突变的KISS1R富含GC的序列以及使用KISS1R结构特点免疫沉淀和免疫印迹的受体的降解途径
Abstract
kisspeptin受体(KISS1R)确认为青春期的触发和生殖能力的成年 1,2,3调节G蛋白偶联受体。已与iodiopathic hypogonadotropic性腺功能低下症(IHH)1,2和性早熟4的患者确定KISS1R失活的突变。这些突变体的功能研究为我们理解再生产的这种受体的调节,以及背后的机制是至关重要的那些塑造的疾病结果,导致异常KISS1R信令和功能。然而,的高度富含GC序列的KISS1R基因,使得它相当困难的引入突变或扩增PCR这种受体的基因编码。
在这里,我们描述了一种方法,引入利益的突变,这种高度富含GC的序列,已成功地用于产生超过十几KISS1R突变体在我们的实验室。我们已经优化了PCR反应条件,以方便KISS1R包括在KISS1R序列的替换,删除或插入的突变体,放大。的另外一个PCR增强剂解决方案,以及二甲基亚砜的一个很小的比例,尤其是有利于提高放大。这种优化过程可能是有用的,以及其他富含GC的模板。
表达载体编码KISS1R是被用来描述这种受体的信号和功能,以了解如何突变可能会改变KISS1R功能,导致生殖相关的表型。因此,定点突变产生KISS1R的突变体的潜在应用1,4,5,6,7,8许多研究可以说明。作为一个例子,在KISS1R(Arg386Pro),这是与性早熟有关,获得性功能突变已被证明延长受体的反应配体刺激4以及改变的降解率KISS1R 9 。有趣的是,我们的研究表明,KISS1R被蛋白酶体降解,而不是大多数G蛋白偶联受体 9所描述的经典的溶酶体降解。在这里介绍的例子,KISS1R退化是在人胚胎肾细胞(HEK - 293)瞬时表达Myc基因标记KISS1R(MycKISS1R)调查和与蛋白酶或溶酶体抑制剂治疗。使用琼脂糖标记的抗myc抗体免疫印迹分析免疫沉淀的细胞裂解液。使用LI - COR的奥德赛红外线系统进行检测和定量上的污点MycKISS1R。这种方法可能是有用的,以及其他感兴趣的蛋白质降解的研究。
Protocol
1。定点突变的基因序列高度富含GC KISS1R
- 模板:Myc基因标记与融合其N -末端的人类KISS1R完整的cDNA序列。这个序列克隆到的pCS2 +的表达载体,这是其后用于转染哺乳动物细胞线兼容。这表达载体被称为本pCS2 + Myc基因KISS1R。
- 引物设计:引物设计进行所需的突变,根据Quikchange定点突变试剂盒(Stratagene公司)的说明。总结:
- 两者(正向和反向引物)必须包含所需的突变和退火对面链的质粒以相同的顺序(如正向和反向引物的互补性)
- 底漆应25至45个碱基长,最终在一个或多个C或G基地
- 引入的突变(S)应在底漆中,正确的顺序〜10-15基地两侧两侧
- 引物的熔点温度(TM)应等于或大于78 ° C。使用下列公式来估算的Tm:
- 当引入突变:TM = 81.5 + 0.41(%GC) - 675 / N - %的失配(N是在基地的引物长度)
- 当引入插入或缺失:TM = 81.5 + 0.41(%GC) - 675 / N(n不包括基地正在插入或删除)
- 使用脱盐引物(没有必要的进一步纯化)。
- 两者(正向和反向引物)必须包含所需的突变和退火对面链的质粒以相同的顺序(如正向和反向引物的互补性)
- 最好的扩增条件包括除PCRx增强解决方案(Invitrogen公司)和DMSO。至少有2浓度的DMSO,如4%和8%,应进行测试。我和图1和一个有代表性的PCR扩增的pCS2 + MycKISS1R的结果,如图2所示,PCR条件列于表。
- 消除父母的DNA甲基化的DNA与DpnI消化扩增产物为1小时30分钟在37 ° C:2μL10X NEBuffer 4 DpnI0.5μL(10U; New England Biolabs公司)的PCR产物的离心管17.5μl混合。
- 变换DpnI处理的PCR产物:XL10金Ultracompetent大肠杆菌45μlDpnI处理的DNA混合2μL 大肠杆菌中预冷15 ml细胞培养管(Stratagene公司)。 β-巯基乙醇添加2μL,并按照Stratagene公司的指示。板100 -400μl转化菌在LB琼脂板含100μg/ml氨苄青霉素和孵化,在37 ° C。
- 小量2至4个单个菌落分离质粒DNA。确认成功引进孤立的DNA测序和分析所需的突变。
2。 MycKISS1R到HEK - 293细胞的瞬时转染
- 以下实验进行人类胚胎肾细胞(HEK - 293)中的CO 2培养箱(5%CO 2)培养37 ° C的10%胎牛血清(FBS)和1%青霉素/链霉素的DMEM补充。
- 种子的HEK - 293细胞在6孔板在2.5 × 10 5细胞/ ml,让他们成长在37℃过夜°转染前彗星。注:(i)使用一式三份每个实验条件下的井;(二)在转染时的理想的细胞汇合30%-50%。
- 转染的HEK - 293细胞使用的GenePorter转染试剂(Genlantis),根据制造商的指示:将一半的无血清DMEM0.5μgpCS2 + MycKISS1R加0.5μg控制(空)向量总和的DNA /1μg。每转微克的DNA加入10μl转染试剂混合的另一半。注意:理想的质粒DNA的浓度可能会有所不同。
3。细胞治疗和裂解
- 转染24小时后,细胞培养基取代1毫升DMEM培养液含2.5%胎牛血清(降低细胞代谢)。注意:这可能有助于减少血清中和/或放大的检测结果。
- 直接添加到每一个完整的6孔板以及溶酶体抑制剂(100μg/孔的亮肽素)。孵育37℃,6或16 h(或其他所需的时间)
- 直接添加到所有井的两个整个6孔板新鲜准备的蛋白酶抑制剂(10μM/的MG132)。孵育于37℃,2,4,6或16小时(或所需的时间)。新增车辆的第四次6孔板(0时间点)的所有水井和37 ° C为16H
- 当孵化结束后,移动板冰,冰,以防止蛋白质的降解和执行整个裂解过程:
- 为了增加蛋白质的产量,结合在一个单一的CENTR 6孔板一式三份ifuge管
- 吸冰冷的磷酸1毫升中期和洗细胞一次缓冲液(PBS)
- 添加含有蛋白酶抑制剂(1X鸡尾酒含有100MM AEBSF盐酸,80μm的抑肽酶,5MM bestatin冰冷的裂解液100μL(20MM HEPES,pH值7.4,1%NP - 40,150mm的氯化钠,为1mM EDTA,0.25%脱氧胆酸钠), 1.5MM E - 64,0.5M EDTA,2MM亮肽素和胃酶抑素一个1MM,加上2mm的PMSF),每孔
- 与取出一个细胞刮刀和转移细胞,细胞裂解液离心管
- 细胞通过20号针头传递〜10倍。注意:不要超声用于膜蛋白免疫印迹检测的样品。超声导致膜蛋白的聚集,不会在电泳迁移
- 细胞裂解液在4 ° C孵育一个摇摆的平台上为1h
- 离心机细胞裂解液4 ° C为10分钟10,000 × RPM和上清转移到新管。注意:请勿打扰颗粒在此步骤
- 确定使用的BCA法的上清中加入10μl的蛋白浓度(皮尔斯)
- 稀释裂解液中含有蛋白酶抑制剂的裂解缓冲1mg/ml的。
4。免疫沉淀和Western blot检测的MycKISS1R
- 执行以下冰免疫步骤(或在4 ° C):
- 冰冷PBS洗两次琼脂糖标记的抗myc抗体(2.5μg/样品)适量添加裂解液蛋白400μg。
- 免疫沉淀裂解液的MycKISS1R一夜之间在4 ° C在一个轻轻摇动摇椅平台。
- 离心脉冲离心琼脂糖珠在4 ° C(高达10,000 × RPM)
- 吸并丢弃上清液(不扰民的颗粒)
- 一次用冰冷的裂解液和两次冰冷PBS清洗珠。纺前,轻轻地反转管
- 在2X上样缓冲液含10%β-巯基乙醇含有抗体的约束MycKISS1R Ressuspend珠。
- MycKISS1R免疫复合物的免疫印迹:
- 热样品,30分钟在37 ° C。 注意 :不要煮沸用于膜蛋白免疫印迹检测的样品。如超声,煎煮,也导致这些蛋白质的聚集
- 5分钟立即移动到冰管
- 经SDS - PAGE分离蛋白在4-15%梯度凝胶。
- 在25V的Immobilon - FL PVDF膜(红外线检测)30分钟传输缓冲区使用Bio - Rad公司的半干转移(Tris碱48MM,39mm的甘氨酸,1.2mm的SDS,20%甲醇,pH值9.2)仪器
- 洗膜在室温下5分钟的TRIS缓冲液(TBS)和1H块在室温阻断上的摇摆平台(或者可用于阻止非特异性结合,5%的牛奶的TBS)与Licor奥德赛。
- 在4℃过夜孵育膜° C的兔抗Myc抗体阻断含有0.1%Tween - 20的解决方案(1:500)
- 删除的主要抗体,洗膜5分钟3次用TBS含有0.1%Tween - 20的(TBST)
- 在室温与山羊红外线RedDye ® 800CW标记的抗兔IgG(1:10,000)在封闭液含0.1%Tween - 20的0.01%SDS孵育1h后膜
- 删除第二抗体,洗膜5分钟3次的TBS(删除剩余的吐温20)用TBST和最后一次
- 使用LI - COR的奥德赛红外线成像仪成像和定量MycKISS1R:
- 膜MycKISS1R将使用LI - COR的奥德赛红外线成像仪成像。首先,放置在底部左上角奥德赛扫描器膜,使其与电网。封面用的橡胶垫,理顺与滚子的气泡,并盖上盖子
- 在计算机上创建一个新的项目文件。命名该文件,点击“完成”,然后进入扫描仪“扫描”登录。尺寸扫描仪控制台框,以适应你的膜,然后选择169μm分辨率和图像质量中等
- 选择强度设置为700(红色)和800(绿色)通道,根据每个信号的强度预计。这是信号可视化的目的,并不会影响量化。点击“开始扫描”。
- 名称和保存的扫描,然后点击“确定”,打开一个新窗口定量。 MycKISS1R单体应该是可见的的,在约43kD
- 使用的“盒子”的工具(左侧侧边栏上),一个盒子周围绘制的第一个乐队。拖动框周围,以确保所有频段适合,然后“复制”和“粘贴”框中的所有频段
- 选择所有盒使用“Ctrl + A键”,然后选择选项减去中位数的背景。点击顶部菜单上的“报告”,并与量化值的电子表格将出现。这里显示的代表结果是represented倍以上未经处理的细胞增加(零时间)
5。代表性的成果:
- 定点突变的基因序列高度富含GC KISS1R:
表1显示的试剂组合,以提高KISS1R放大效率。这种组合被成功地用于引进几个突变针对KISS1R cDNA序列不同的区域,以及为这个高度富含GC的基因扩增。图1显示了KISS1R诱变骑自行车和扩增条件。这些条件已被修改,从QuikChange定点突变试剂盒(Stratagene公司)。
图2显示了一个代表性的结果,使用这种优化的协议。另外4%或8%DMSO结合PCRx增强,显着提高富含GC KISS1R的cDNA含有质粒的扩增产量。在此代表的实验,提供4%DMSO扩增条件稍微好一点,比8%DMSO。 DpnI处理的扩增产物转化大肠杆菌ultracompetent 大肠杆菌通常产量100 1000多个殖民地,并成功引进所需的突变率是80-90%,通过DNA测序确定。 - MycKISS1R结构,来研究受体生理:
在此代表的实验中,野生型pCS2 + MycKISS1R扩增根据优化的协议,这里描述的是用来研究在体内KISS1受体的退化有关的细胞株中瞬时表达MycKISS1R(HEK - 293)。治疗溶酶体(亮肽素)或蛋白酶(MG132)抑制剂的方法中所描述的协议,转染HEK - 293细胞后,细胞裂解和免疫印迹处理。图3顶部面板显示扫描MycKISS1R单体,而底部面板中显示的顶部面板上显示的频段的量化。定量分析表明,既不6H也不亮肽素治疗16H影响MycKISS1R蛋白水平的乐队。相反,治疗与MG132在MycKISS1R蛋白在这些细胞中的时间依赖性增加,这与孵化后16H受体的45倍,与MG132积累高潮。这些观测结果表明,不同于大多数G蛋白偶联受体,KISS1R退化的蛋白酶体(而非溶酶体)。
二甲基亚砜 | |||
试剂 | 0 | 4% | 8% |
水 | 35 | 33 | 31 |
10X PFU超Taq酶缓冲 | 5 | 5 | 5 |
dNTP混合液(10MM) | 1 | 1 | 1 |
引物感(25pmol/μl) | 1 | 1 | 1 |
引物反义(25pmol/μl) | 1 | 1 | 1 |
10X PCRx增强解决方案 | 5 | 5 | 5 |
二甲基亚砜 | 0 | 2 | 4 |
PFU超Taq DNA聚合酶(2.5U/μl) | 1 | 1 | 1 |
质粒DNA(20ng/μl) | 1 | 1 | 1 |
表1。试剂组合,成功地用于变异和放大GC 丰富 KISS1R
图1。骑自行车成功的突变和扩增GC丰富KISS1R条件:一个2分钟的热启动18秒30的融化周期在95 ° C,1分钟退火,在55 ° C和6时68分延长° C。额外的10的68分钟延长° C被添加在最后一个周期的结束。这些设置进行了调整,从原诱变QuikChange II XL -定点突变试剂盒(Stratagene公司)的协议。
图2。富含GC pCS2 + Myc基因KISS1R DMSO的存在或缺乏扩增的可视化:五pCS2μL等份+ Myc基因扩增在0存在KISS1R,4个或8%DMSO被装在此代表的1%琼脂糖凝胶与乙锭染色溴化物和可视化使用紫外线灯。 6KB质粒带装载在4%存在PCR产物和8%DMSO两个车道上可见,但不是在第一线,这是用PCR加载二甲基亚砜的情况下扩增的产品。
图3。亮肽素或MG132对HEK - 293细胞中的MYC KISS1R蛋白水平:HEK - 293细胞表达Myc基因KISS1R分别用100μg/ml亮肽素或10μMMG132在37 ° C时指定的时间。 Myc基因细胞裂解液400μgKISS1R是2.5μg琼脂糖标记的抗myc抗体免疫沉淀和免疫印迹分析。 (一)LI - COR的奥德赛Myc基因KISS1R用兔抗- Myc基因标记抗体的检测与IRDye 800CW标记的抗兔孵化后免疫印迹孵化;(二)Myc基因KISS1R频带的量化所示: (一)使用LI - COR的奥德赛量化软件。结果表示为倍,增加了未经处理的细胞(时间0)。
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Discussion
定点突变已被用于研究蛋白质的功能,通过引进超过三十年的靶基因的编码序列的核苷酸变化。原来的技术是于1978年由英国加拿大化学家和诺贝尔经济学奖得主迈克尔史密斯10。迈克尔史密斯分享1993年诺贝尔化学奖与雨霏,美国生物化学家穆利斯是谁发明的聚合酶链式反应(PCR)11。迈克尔史密斯所描述的原始方法多年来已改善。此过程中的高精确度和成功率,以及在一个相对较短的时间内生产的突变引入所需的基因序列,在一个单一的PCR反应的突变,插入或删除的能力作出了贡献。
尽管所有的技术改进,突变和放大KISS1R如基因序列高度富含GC都是特别麻烦。高GC含量序列突变设计引物的大小必须调整,以适应GC含量的熔化温度,使推荐的范围内。因此,引物中KISS1R引入突变的大小有一个78 ° -86 ° C。之间的熔点一些KISS1R基因地区有一个GC含量85%以上。旨在介绍这些地区的突变引物的大小必须进行调整,以满足上述的熔点范围。这一限额以上的熔化点的引物可能不会单独在95℃,损害放大。另一方面,引物与TM降低超过78 ° C时更容易结合并扩大非特异性序列。
同样,扩增条件和试剂KISS1R高GC含量序列优化。 4%DMSO和Invitrogen公司(见表1和图2)的PCR增强解决方案的结合是增加放大KISS1R效率。另外,其他试剂,如甜菜碱已经成功地用于改善其他 GC 12,13丰富序列的扩增。然而,有KISS1R放大甜菜碱在我们手中没有明显的积极效果。此外,从其他供应商提供的PCR增强剂的解决方案可能同样能够提高富含GC序列的扩增。
使用这里所描述的优化设置,我们已经成功推出一些突变在KISS1R的cDNA,其中包括一次6个核苷酸的变化(由相同的引物进行)和高达27个核苷酸的缺失不同的区域。这些突变体的转变产生具有高(80-90%)含有正确突变序列测序证实的殖民地率数百成千上万的殖民地。
定点突变也可以用来添加如Myc基因或标志的蛋白质的氨基或羧基端抗原标记。这些标签允许选择性免疫和/或蛋白质的检测,是特别有帮助时对感兴趣的蛋白质的可靠抗体不KISS1R。在这里介绍的例子,表达载体KISS1R,这是融合在其氨基端(我的cKISS1R)11个氨基酸的Myc的标签,是用来研究在HEK - 293细胞的KISS1R的降解途径。 HEK - 293使用这里介绍的方法与我cKISS1R细胞的转染效率为25-30 %。因此,免疫是用于集中从而提高了检测和可视化的受体从细胞裂解液我cKISS1R。这种方法经常被用来促进蛋白质的可视化表达水平低, 以及 14自身。
更重要的是,G蛋白偶联受体,如KISS1R,以及其他膜蛋白,不应该被匀浆超声或凝胶装载前煮沸。虽然这些程序通常用于免疫或免疫印迹,超声和膜蛋白的聚集沸腾导致处理的样品 ,15电泳过程中损害其应有的迁移。事实上,更换这些程序与较温和的同质化,如针道,并降低样品加热,如37 ° C为30分钟(而不是沸腾)KISS1R单体的检测要求。
免疫沉淀我cKISS1R奥德赛成像仪(LI - COR的生物系统公司)使用的红外染料标记的二抗杂交孵化后检测。该系统的优点包括一个持续的强烈的信号,具有精度高,可以检测到几个月,而不是短命的化学发光发出的信号。此外,奥德赛成像的量化软件提供了更大的检测的灵敏度和线性时相比,以下发光的扫描X光片的传统量化。然而,辣根过氧化物酶(HRP)标记抗体化学发光法检测可作为。
古典溶酶体退化和KISS1R蛋白酶体降解的检测的情况下描述HEK - 293细胞中也一直在观察的COS - 7 9具有相同MycKISS1R的表达载体转染的细胞。虽然不寻常,G蛋白偶联受体的蛋白酶体降解先前已报道文献 16,17 。
综上所述,本手稿演示了如何调查在KISS1R基因,这是一个高度富含GC序列的基因突变的影响,以了解如何在这种受体的突变可以导致生殖障碍,如hypogonadotropic性腺功能低下或性早熟的表型。
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Disclosures
没有利益冲突的声明。
Acknowledgments
这项工作是部分资金由国家儿童健康和人类发展研究所(NICHD的 - R21 HD059015)的生殖科和查尔斯H.胡德基金会青年研究者儿童健康研究奖(马萨诸塞州波士顿)。
Materials
Name | Company | Catalog Number | Comments |
10x PCRx Enhancer Solution | Invitrogen | 52391 | |
PfuUltra High-fidelity DNA Polymerase Alternative Detergent | Stratagene, Agilent Technologies | 600385 | |
Dpn-I | New England Biolabs | R0176 | |
XL10-Gold Ultracompetent E. coli cells | Stratagene, Agilent Technologies | 200314 | |
DMEM | Cellgro | 10-013-CV | |
Fetal bovine serum | Atlanta Biologicals | S11550 | |
Geneporter Transfection Reagent | Genlantis | T201007 | |
Leupeptin | Calbiochem | 108975 | |
MG132 | Calbiochem | 47491 | |
10xPBS | Ambion | AM9625 | |
Protease inhibitor cocktail and PMSF | Santa Cruz Biotechnology, Inc. | Sc-24948 | |
Pierce BCA Protein Assay Kit | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 23225 | |
anti-Myc tag (clone 4A6) agarose conjugate | EMD Millipore | 16-219 | |
2x loading buffer | Bio-Rad | 161-0737 | |
Criterion Tris-HCl precast gel, 4-15% gradient | Bio-Rad | 345-0028 | |
Immobilon-FL PVDF membrane | EMD Millipore | IPFL00010 | |
Odyssey Blocking Buffer | LI-COR Biosciences | 927-40000 | |
10xTBS | Bio-Rad | 170-6435 | |
Rabbit anti-myc antibody | Cell Signaling Technology | 2272 | |
Goat anti-rabbit IRDye 800CW | LI-COR Biosciences | 926-32211 | |
Odyssey Imaging Infrared System | LI-COR Biosciences | ||
Halt Protease Inhibitor Cocktail (100x) | Thermo Fisher Scientific, Inc. | 78430 |
References
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