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Biology

Inactivation génique médiée par ARNi et Published: July 14, 2012 doi: 10.3791/3479

Summary

Dans ce protocole, nous combinons silencing RNAi-médiée avec un gène

Abstract

Ce protocole vidéo montre une technique efficace pour effet de choc d'un gène particulier dans un insecte et de mener un essai biologique roman pour mesurer le taux d'excrétion. Cette méthode peut être utilisée pour obtenir une meilleure compréhension du processus de la diurèse chez les insectes et est particulièrement utile dans l'étude de la diurèse dans le sang d'alimentation arthropodes qui sont en mesure de prendre d'énormes quantités de liquide dans un repas de sang unique.

Cette inactivation génique médiée par ARNi combiné avec un test in vivo diurèse a été développé par le laboratoire Hansen pour étudier les effets de l'ARNi à médiation knockdown de gènes d'aquaporines sur moustique Aedes aegypti diurèse 1.

Le protocole est configuré en deux parties: la première démonstration illustre comment construire un dispositif simple moustique injection et comment préparer et injecter ARNdb dans le thorax de moustiques pour inactivation génique médiée par ARNi. La deuxième démonstration illustre comment déterminerles taux d'excrétion chez les moustiques en utilisant un dosage biologique in vivo.

Protocol

Partie I - inactivation génique médiée par ARNi dans les moustiques adultes, Aedes aegypti. Pour un aperçu expérience voir la figure 1.

1. Synthèse ARNdb

  1. Synthétiser ARNdb spécifiques contre les gènes de ARNdb d'intérêt et de contrôle. Remarque: Nous recommandons amorces développement pour les fragments PCR de l'ordre de 300 à 500 paires de bases situées à l'extrémité 3 'de la 2 ADNc spécifique et avec la séquence d'amorce T7 attaché à l'extrémité 5' (5'-TAA TAC GAC TCA CTA TAG GG-3 '). Unicité des fragments doivent être confirmés par l'analyse BLASTN 3.
  2. Utilisez le Ambion Megascript T7 Kit Haut Rendement de transcription (Ambion, la table des réactifs) qui utilise la T7 RNA polymérase pour la réaction de transcription de synthétiser ARNdb. Remarque: réactifs et des kits similaires sont disponibles nulle part ailleurs.
  3. Pour purifier ARNdb, précipiter avec du chlorure de lithium suivant les instructions fournies avec le kit Megascript.
  4. Après purificatd'ions, dissoudre le culot ARNdb dans l'eau stérile. Afin d'assurer une viscosité adéquate pour la microinjection, la concentration ARNdb ne doit pas dépasser 2 g / ul.

2. Préparation à l'injection

  1. Un simple micro injecteur peut être construit en utilisant des tubes, des ciseaux, une aiguille en métal, une seringue de 1 ml, 1 ml et un embout de pipette en plastique (voir figure 2). Le tube doit être coupé à environ 40 cm de longueur. Alternativement, un système automatisé micro injecteur peut être utilisé comme Drummond Nanojet II 4.
    1. Couper l'extrémité de la seringue (moyeu de l'aiguille) à 2 ml graduation et de supprimer la tête de piston en caoutchouc du plongeur.
    2. Percer un trou à l'aide d'une aiguille métallique dans la tête piston en caoutchouc et le lieu de la tête en caoutchouc piston dans le moyeu de l'aiguille.
    3. Placez le moyeu de l'aiguille à une extrémité du tube et placer un embout 1 ml en plastique de la pipette dans l'autre extrémité, qui sera utilisé comme pièce d'embouchure (alternativement, un 10 ml syringe peut être utilisé pour produire la pression de l'air nécessaire pour l'injection).
  2. Placer une aiguille capillaire en verre dans le trou dans le piston en caoutchouc tête et briser la pointe de l'aiguille hors de sorte que la largeur est suffisamment grand pour le liquide à s'écouler à travers. Remarque: La taille optimale de la pointe de l'aiguille doit être déterminé de manière empirique - si la largeur de l'aiguille est trop grosse cela se traduira par un traumatisme et un taux élevé de mortalité des moustiques, si la largeur de l'aiguille est trop petite, il sera impossible de pénétrer l'exosquelette des moustiques.
  3. Submerger l'aiguille d'injection dans l'échantillon préparé ARNdb et aspirer l'échantillon liquide dans l'aiguille d'injection en aspirant le liquide avec la pièce de bouche (ou une seringue). Remarque: Cette étape est identique pour tous les réactifs liquides qui sont injectés dans les moustiques, y compris du tampon PBS, qui est utilisé dans le test in vivo dans le protocole diurèse (voir ci-dessous).

3. Recueillir et Anesthésier moustiques

  1. Collecmoustiques t avec un aspirateur à piles dans un flacon de collecte. Placer un bouchon sur le flacon de collecte et de placer le flacon sur une CO 2 tampon propre à anesthésier les moustiques. Remarque: vous pouvez les moustiques peuvent être anesthésiés sur la glace.

4. Injection Mosquito

  1. Ouvrez le flacon de collecte et de placer les moustiques directement sur ​​le CO 2 pad et attendre jusqu'à ce que les moustiques sont anesthésiés.
  2. Jeter tous les hommes.
  3. Alignez les moustiques sur le côté pour permettre un accès plus facile pour l'injection.
  4. Prenez les moustiques par les jambes ou les ailes pour éviter les blessures. Vous pouvez également utiliser un pinceau fin ou de la plume de manipuler les moustiques.
  5. Lorsque vous êtes prêt à injecter le moustique d'abord, doucement soutenir d'un côté du thorax avec des pinces et insérez la pointe de l'aiguille de l'autre côté du thorax (Figure 2). Il est préférable d'injecter dans une partie fine de la cuticule et éviter de pousser l'aiguille ào profondément dans le thorax.
  6. Une fois que l'aiguille est en place, faire sauter le liquide dans le moustique. La quantité désirée peut être déterminée en contrôlant le ménisque du liquide dans l'aiguille. Le nombre de millimètres nécessaires pour un volume spécifique peut être déterminée en calculant le volume du cylindre de l'aiguille capillaire en verre (πr 2 h). La quantité efficace d'ARNdb qui est généralement utilisé pour l'injection est de 1 mg.
  7. Une fois que le liquide est injecté dans des moustiques, soigneusement retirer l'aiguille. Si quelques grandes formes de gouttelettes liquides à l'extérieur du thorax, le moustique doit être jeté. Ensuite, répéter ce processus avec le prochain moustique.

5. Récupération Mosquito et le stockage

  1. Après l'injection, placez les moustiques dans un conteneur pour le stockage. Par exemple, une cire pinte bordée tasses en carton (tasses à soupe) d'un filet de recouvrement fixé avec le couvercle en carton. Le couvercle comporte une partie découpée pour le maillage couvrant d'être exposés. Une fois tous les moissquitoes sont placés dans le conteneur, placez le récipient dans une chambre à environnement contrôlé pour l'incubation et de fournir les moustiques avec une source de nourriture, tels que des billes de saccharose 20% coton imbibés placés au-dessus du revêtement en maille. Avant d'effectuer le dosage in vivo la diurèse, priver les moustiques ARNdb injecté d'une source d'eau pendant 12 heures pour normaliser l'état d'hydratation de chaque moustique.
  2. L'efficacité de inactivation génique ARNdb médiation peut être variable. Gene silencing pourrait commencer un jour après l'injection et cela pourrait durer jusqu'à 6 jours après l'injection 4. Le moment optimal pour atteindre inactivation génique maximale doit être déterminée empiriquement pour chaque gène utilisé. En général, nous attendre 3 jours après l'injection ARNdb avant que nous procédions.

Partie II - En test in vivo chez l'adulte diurèse moustiques du genre Aedes aegypti

Remarque: Ce protocole a été développé par les auteurs etutilisé pour l'ARNi à médiation knockdown de protéines aquaporines dans le moustique de la fièvre jaune Aedes aegypti 1. Pour éviter la variabilité entre les moustiques individuels, les moustiques devraient être analysées dans les groupes. Pour des raisons techniques, nous vous recommandons des groupes de 5 moustiques par traitement - il ya une quantité limitée de temps pour effectuer la mesure du poids d'abord avant de commencer à excréter les moustiques d'urine après l'injection.

6. Recueillir et Anesthésier moustiques

  1. Avant la collecte des moustiques, enregistrer le poids d'un flacon de prélèvement vide avec un bouchon en utilisant une balance de précision analytique. Ce flacon sera utilisé pour toutes les mesures ultérieures.
  2. Collecter 5 moustiques femelles dans le flacon de collecte pesé avec un aspirateur. Placez le capuchon sur le flacon de collecte et laissez-le reposer sur le CO 2 pad pendant plusieurs secondes pour anesthésier les moustiques.

7. Mesure du poids initial

  1. Prenez til la mesure du poids initial des 5 moustiques en plaçant le flacon collection contenant les moustiques avec le couvercle sur la balance de précision.
  2. Calculer le poids du groupe de 5 moustiques en prenant le poids des moustiques et le flacon de collecte avec bouchon et en soustrayant le poids du flacon avec bouchon collection vide.
  3. Ouvrir le flacon de collecte et de placer les moustiques directement sur ​​le coussin de CO 2 après l'enregistrement des poids des moustiques. Si les moustiques commencent à se réveiller pendant les mesures de poids, mettre le flacon sur le CO 2 pad pendant plusieurs secondes avant de l'ouvrir et en plaçant les moustiques sur le pavé.

8. Préparation à l'injection

  1. Mettre en place l'injecteur micro en suivant les instructions données dans le protocole ARNi médiée par des gènes knockdown.
  2. Placer une aiguille capillaire en verre dans l'injecteur micro et briser la pointe de l'aiguille de sorte que la largeur est assez grand pour LIQuid de s'écouler à travers.
  3. Immerger l'aiguille dans du tampon PBS et d'en tirer la mémoire tampon dans l'aiguille d'injection, la quantité désirée à utiliser pour ce protocole est de 1,25 l de PBS pour chaque moustique. Remarque: Ce montant imite le montant moyen du plasma sanguin qui est repris par un moustique femelle 5.

9. Injection Mosquito

  1. Alignez les moustiques afin de permettre un accès plus facile avec l'injecteur micro.
  2. Une fois que l'aiguille est en place, sauter tampon PBS dans le moustique.
  3. Une fois que le liquide est injecté dans le moustique, une gouttelette peut former à l'extérieur du thorax. Cette gouttelette doit être soigneusement enlevé avant l'étape suivante.
  4. Répétez ce processus d'injection avec le prochain moustique. Avec l'expérience, le taux de survie des moustiques sera près de 100% après l'injection.

10. Les moustiques de pesage

  1. Après l'injection, placez doucement les moustiques dans le flacon de collecteet le bouchon. Prendre la mesure du poids d'abord les 5 moustiques en plaçant le flacon collection contenant les moustiques avec le couvercle sur la balance de précision.
  2. Calculer le poids du groupe de 5 moustiques en prenant le poids des moustiques et le flacon de collecte avec bouchon et soustraire le poids du flacon avec bouchon collection vide. Remarque: les moustiques commencent à excréter l'urine dans les 2 minutes après le retrait du CO 2 pad anesthésie, il est donc important de prendre la mesure du poids avant qu'ils ne commencent à excréter.
  3. Placez les moustiques dans un petit récipient où ils commencent à excréter l'urine.

11. Mesures deuxième poids et la suite

Remarque: Les mesures de poids des moustiques doivent être prises à intervalles de 30 minutes, mais cela peut être ajusté à intervalles plus courts ou plus selon les taux d'excrétion.

  1. Après 30 minutes, recueillir le Group 5 moustiques avec un aspirateur dans le flacon même collection, avec bouchon. Prendre la mesure du poids à côté des moustiques en plaçant le flacon collection contenant les moustiques avec le couvercle sur la balance de précision.
  2. Après la mesure, placez les moustiques dans le conteneur même exploitation pour les 30 prochaines minutes.
  3. Répétez cette procédure pour un montant de temps désirée.

12. Détermination Taux d'excrétion Mosquito

  1. La quantité totale de liquide qui a été injecté dans le groupe de 5 moustiques peut être calculée en soustrayant le poids initial des moustiques du poids immédiatement après l'injection.
  2. La quantité d'urine qui a été éliminée par le groupe de moustiques à un moment spécifique peut être calculée en soustrayant le poids initial des moustiques de la masse des moustiques au point de temps spécifique.
  3. Le taux d'excrétion à un moment spécifique peut être calculée par divisionding la quantité d'urine excrétée à ce point de temps de la quantité totale de liquide injecté (Tableau 1).

13. Les résultats représentatifs

ARNi médiée par inactivation génique et en test in vivo la diurèse ont été utilisés par le laboratoire Hansen pour étudier les effets de aquaporines dans moustique Aedes aegypti diurèse. Trois aquaporines qui sont exprimées dans les tubules de Malpighi Aedes aegypti ont été renversés avec des effets significatifs sur les taux d'excrétion par rapport à lutter contre les moustiques 1. La figure 4 montre des résultats représentatifs d'une expérience où le dosage a une diurèse été utilisée pour comparer les taux d'excrétion entre Aedes aegypti et Culex quinquefasciatus à des températures différentes.

Figure 1
Figure 1. Organigramme de l'essai ARNi / diurèse. 5 groupes de 10 moustiques each sont injectés avec ARNdb pour un gène spécifique, et cinq autres groupes de dix moustiques sont injectés avec un contrôle ARNdb. Un autre groupe de moustiques injectés avec 200 uM dans du PBS HgCl 2 est utilisé comme contrôle positif. Ces moustiques sont pesés avant l'injection, et après l'injection dans les trente minutes d'intervalle pendant 3 heures.

Figure 2
Figure 2. Un dispositif d'injection simple micro pour la inactivation génique médiée par ARNi et test in vivo la diurèse. A. Les aiguilles de verre capillaires utilisés pour l'injection. Le triangle gris représente les incréments millimétriques tirés sur l'aiguille pour indiquer la quantité de liquide injecté dans le moustique. B. 1 seringue ml utilisée pour construire l'injecteur micro. Le triangle blanc représente le moyeu d'aiguille et le triangle noir représente la tête du piston en caoutchouc fixé sur le piston dans la seringue. C. Le tube utilisé pour fixer l'embout buccal pourl'injecteur. D. 1 ml embout jetable de pipette (pointe bleue) qui est utilisé comme porte-parole de l'appareil micro-injection. E. Le dispositif de micro-injection qui intègre des parties AD. Cliquez ici pour agrandir la figure .

Figure 3
Figure 3. Optimale au site d'injection moustiques. A. Femme moustique Aedes aegypti injecté avec une aiguille capillaire en verre entre les grandes échelles sur le thorax. La barre noire indique 1 mm pour comparaison de taille. B. Un dessin du thorax moustique femelle et les taches blanches représentent les écailles blanches dans l'exosquelette des moustiques. L'aiguille d'injection doit percer le moustique entre les taches afin de minimiser le taux de mortalité lors de l'injection.

Figure 4
Figure 4. Effets de la températureture sur Culex quinquefasciatus et Aedes aegypti diurèse. Le test a été réalisé avec la diurèse deux espèces de moustiques, Aedes aegypti et Culex quinquefasciatus, à différentes températures. Le taux d'excrétion au cours de la première heure après l'injection est donnée en pour cent.

Groupe TARA
(G)
ne pas injecter
(G)
après l'injection
(G)
1h après l'injection
(G)
poids moyen (mg) quantité injectée
(Pl)
quantité excrétée
(Pl)
% Excrété
1 7,5938 7,6057 7,6104 7,6096 2,38 0,94 0,16 17,0
2 7,8252 7,8349 7,8415 7,8403 1,94 1,32 0,24 18,2
3 7,8896 7,9026 7,9077 7,906 2.6 1,02 0,34 33,3

Tableau 1. Aedes aegypti dans les résultats in vivo de dosage Diurèse. Les données brutes provenant de la diurèse dans le test in vivo réalisées avec les moustiques Aedes aegypti femelles à 4 ° C.

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Discussion

Le protocole utilisé ARNi a été développé dans le laboratoire d'Alexandre Raikhel à l'Université de Californie Riverside 6,7 et est semblable à un protocole publié par Garver et Dimopoulos 4. L'approche expérimentale montré dans ce protocole vidéo peut être utilisée pour étudier les gènes impliqués dans la diurèse des insectes dans un cadre en vivo. Les organes excréteurs des insectes, les tubes de Malpighi, ont attiré l'intérêt des générations de chercheurs en tant que système modèle «simple» pour la diurèse. Cet organe est impliqué dans la clairance des xénobiotiques 8 et le travail chez la drosophile a identifié de nombreux gènes impliqués dans la physiologie des tubules de Malpighi 9,10 qui peut maintenant être étudiée dans d'autres espèces d'insectes avec des méthodes inverses génétiques comme l'ARNi. De nombreux gènes homologues peuvent être facilement identifiés dans les séquences génomiques publiées de diverses espèces d'insectes 11. Trois jours moustiques anciens ont été utilisés dans ce protocole, car à ce moment point, ils soient capables de prendre un repas de sang.

Plusieurs tests d'excrétion d'autres ont été signalés. Le test classique Ramsay a été utilisée pour étudier la diurèse dans les tubules de Malpighi isolés in vitro 12. Dans ce test tubules uniques sont isolés et la partie distale est placé dans une goutte de solution saline tandis que la partie proximale est ouvert. Activité diurétique est calculée en mesurant la taille de l'gouttelettes d'urine qui forme à l'extrémité de la partie proximale. En utilisant le test Ramsay, on peut mesurer les quantités de la production d'urine par les différents tubes de Malpighi. Notre test permet de mesurer la diurèse de l'ensemble des taux d'excrétion-moustiques et, par conséquent, pas une alternative à l'essai Ramsay. Au lieu de cela, les deux tests peuvent fournir des informations complémentaires si elles sont utilisées ensemble.

Autre dans les essais in vivo l'excrétion ont été développés pour Musca domestica et Aedes aegypti. Le M. domestica étude impliquentd la mesure de la perte d'eau par un compteur d'humidité écoulement à 13. Une technique similaire a été utilisée pour étudier Aedes aegypti diurèse en mesurant les taux d'excrétion en utilisant un taux d'humidité de précision chambre 14. Le dosage de la diurèse vivo présenté ici n'est pas aussi techniquement exigeant que les techniques mentionnées ci-dessus et n'en produit pas moins des données très précises sur les taux d'excrétion dans le contexte d'un organisme complet.

Il ya un large éventail d'applications futures pour le dosage diurèse vivo présentées ici. En plus de revenir sur les méthodes de génétique comme ARNi il peut être utilisé pour étudier l'effet de la drogue, par exemple des inhibiteurs de transduction du signal, etc sur la diurèse des insectes. Il est également une épreuve puissant pour étudier le processus de dédouanement des xénobiotiques chez les insectes cibles.

Problèmes que nous aborderons tout en développant ce test sont les suivants: A) La concentration et la composition du tampon d'injection. Nousutilisé pour les expériences PBS nous avons effectuées jusqu'à présent tampons, mais d'autres comme Aedes sérum physiologique 15 pourrait se révéler plus approprié pour les moustiques et autres insectes. B) En appliquant cette méthode à d'autres espèces, notamment des insectes suceurs de sang non-. Les montants de tampon qui peuvent être injectés dans ces espèces doit être déterminé de manière empirique pour chaque espèce. C) Réduire au minimum l'erreur expérimentale. Nous allons optimiser notre injection et les techniques de mesure.

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Disclosures

Nous n'avons rien à communiquer.

Acknowledgments

Les auteurs tiennent à remercier Victoria Carpenter pour ses commentaires critiques de ce protocole.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
MEGAscript T7 High Yield Kit Ambion AM1334
PBS buffer Sigma-Aldrich P4417
Plastic tubing Local Supplier PVC
1 ml plastic pipette tip VWR international 83007-376 Blue tip
1 ml syringe BD Biosciences 309602
Scissors Local Supplier
Metal needle Carolina Biological 654307 Size 5
Fly pad Genesee Scientific 789060
Battery-powered aspirator w/ collection vial UPMA Labs IPMM 2000
Fine tip forceps World Precision Instruments, Inc. 14095
Glass capillary needles World Precision Instruments, Inc. 1B200-6
Stereo dissection microscope Leica Microsystems S6D
Analytical precision balance Mettler Toledo AB54S
Sucrose Sigma-Aldrich 84097
One pint waxed lined cardboard cups Local Supplier Manufactured soup cups
Mesh net Local Supplier plastic fly gauze

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References

  1. Drake, L. L., et al. The Aquaporin gene family of the yellow fever mosquito, Aedes aegypti. PloS one. 5, e15578 (2010).
  2. Shepard, A. R., Jacobson, N., Clark, A. F. Importance of quantitative PCR primer location for short interfering RNA efficacy determination. Analytical biochemistry. 344, 287-288 (2005).
  3. Altschul, S. F., et al. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic acids research. 25, 3389-3402 (1997).
  4. Garver, L., Dimopoulos, G. Protocol for RNAi Assays in Adult Mosquitoes (A. gambiae). J. Vis. Exp. (5), e230 (2007).
  5. Clements, A. N. Volume 1 Development, Nutrition, and Reproduction. The Biology of Mosquitoes. 2, Chapman & Hall. London. (1992).
  6. Hansen, I. A., Attardo, G. M., Park, J. H., Peng, Q., Raikhel, A. S. Target of rapamycin-mediated amino acid signaling in mosquito anautogeny. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 101, 10626-10631 (2004).
  7. Hansen, I. A., Attardo, G. M., Roy, S. G., Raikhel, A. S. Target of rapamycin-dependent activation of S6 kinase is a central step in the transduction of nutritional signals during egg development in a mosquito. The Journal of biological chemistry. 280, 20565-20572 (2005).
  8. Pannabecker, T. Physiology of the Malpighian Tubule. Annual review of entomology. 40, 493-510 (1995).
  9. Dow, J. New insights into Malpighian tubule function from functional genomics. Comp Biochem Phys A. 150, S135 (2008).
  10. Dow, J. A. T. Insights into the Malpighian tubule from functional genomics. Journal of Experimental Biology. 212, 435-445 (2009).
  11. Lawson, D., et al. VectorBase: a data resource for invertebrate vector genomics. Nucleic acids research. 37, 583-587 (2009).
  12. Beyenbach, K. W. Transport mechanisms of diuresis in Malpighian tubules of insects. J. Exp. Biol. 206 (Pt 21), 3845-3856 (2003).
  13. Coast, G. M. Continuous recording of excretory water loss from Musca domestica using a flow-through humidity meter: hormonal control of diuresis. Journal of insect physiology. 50, 455-468 (2004).
  14. Kersch, C. N., Pietrantonio, P. V. Mosquito Aedes aegypti (L.) leucokinin receptor is critical for in vivo fluid excretion post blood feeding. FEBS letters. 585, 3507-3512 (2011).
  15. Hays, A. R., Raikhel, A. S. A novel protein produced by the vitellogenic fat body and accumulated in mosquito oocytes. Development Genes and Evolution. 199, 114-121 (1990).

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Génétique Numéro 65 biologie moléculaire des infections la diurèse tubes de Malpighi l'interférence ARN, Aquaporine
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Drake, L. L., Price, D. P., Aguirre, S. E., Hansen, I. A. RNAi-mediated Gene Knockdown and In Vivo Diuresis Assay in Adult Female Aedes aegypti Mosquitoes. J. Vis. Exp. (65), e3479, doi:10.3791/3479 (2012).

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