Summary
Transparente sebrafisk embryoer har vist seg nyttige modell verter å visualisere og funksjonelt studere samspillet mellom medfødte immunceller og intracellulære bakterier, for eksempel
Abstract
Sebrafisk (Danio rerio) embryoer blir stadig mer brukt som modell for å studere funksjonen av virveldyr medfødte immunforsvaret i host-patogen interaksjoner 1. De viktigste celletyper i det medfødte immunforsvaret, makrofager og nøytrofile, utvikler i løpet av de første dagene av embryogenese før modningen av lymfocytter som er nødvendige for adaptive immunresponser. Den enkle å skaffe store mengder embryoer, deres tilgjengelighet på grunn av ytre utvikling, optiske åpenhet av embryonale og larvestadiet, et bredt spekter av genetiske verktøy, omfattende mutante ressurser og samlinger av transgene reporter linjer, alle legge til allsidighet av sebrafisk modell. Salmonella enterica serovar Typhimurium (S. typhimurium) og Mycobacterium marinum kan ligge intracellulært i makrofager og er ofte brukt for å studere host-patogen interaksjoner i sebrafisk embryoer. De infeksjon prosesser av disse tobakterielle patogener er interessant å sammenligne fordi S. typhimurium infeksjon er akutt og dødelig i løpet av en dag, mens M. marinum infeksjon er kronisk og kan avbildes opp til larvestadiet 2, 3. Stedet for mikro-injeksjon av bakterier inn i embryoet (Figur 1) avgjør om smitten vil raskt bli systemisk eller vil i utgangspunktet forbli lokalisert. En rask systemisk infeksjon kan etableres ved mikro-injisere bakterier direkte inn i blodsirkulasjonen via kaudal blodåre i bakre blod øya eller via Duct av Cuvier, et bredt sirkulasjon kanal på plommesekken kobler hjertet til stammen blodkar. På en DPF, når embryo på dette stadiet har phagocytically aktive makrofager men nøytrofile har ennå ikke modnet, injisere inn i blodet øya foretrekkes. For injeksjoner med 2-3 DPF, når embryo også har utviklet funksjonelle (myeloperoxidase-produserende) nøytrofile, den Duct av Cuvier foretrekkes som than injeksjonsstedet. Å studere rettet migrering av myeloide celler mot lokale infeksjoner, kan bakterier bli injisert i halen muskelen, otic vesikkel, eller hindbrain ventrikkel 4-6. I tillegg ryggstreng, en struktur som synes å være normalt utilgjengelig for myeloide celler, er svært utsatt for lokal infeksjon 7. Et nyttig alternativ for høy gjennomstrømning er injeksjon av bakterier i plommen av befruktede egg innen de første timene etter befruktning 8. Kombinere fluorescerende bakterier og transgene sebrafisk linjer med selvlysende makrofager eller nøytrofile skaper ideelle forhold for multi-farge avbildning av host-patogen interaksjoner. Denne videoen artikkelen vil beskrive detaljerte protokoller for intravenøs og lokal infeksjon av sebrafisk embryoer med S. typhimurium eller M. marinum bakterier og for påfølgende fluorescens avbildning av interaksjonen med cellene i det medfødte immunsystemet.
Protocol
1. Forbered injeksjonsnåler
- Forbered borsilikatglass microcapillary injeksjonsnåler (Harvard Apparatus, 300038, 1 mm OD × 0,78 mm ID) ved hjelp av en mikropipette avtrekker enhet (Sutter Instruments Inc., Flaming / Brown p-97 med følgende innstillinger for en lengre tips: lufttrykk 400; varme 610, pull 40; hastighet 50; tid 30 og med følgende innstillinger for en kortere tips: lufttrykket 500, varme 510, pull 100; hastighet 200; tid 60).
- Bryt av nålespissen med fine pinsett for å få et tips åpning diameter på 5-10 mikrometer. Det er tilrådelig å bevel nålespissen åpningen i en 45 graders vinkel med en microgrinder (Narishige Inc., EG-400) for å gi et skarpere tips. Dette vil lette punktering av epidermal laget og dermed resultere i mer reproduserbar injeksjoner med mindre vevsskade enn med butte nåler. Lengre tipped nåler er å foretrekke for kaudal vene (trinn 5) og Duct av Cuvier (trinn 6,1) injeksjoner og kortere tipped nålerer foretrukket for de andre injeksjon protokoller (trinn 6.2-6.6).
2. Forbered S. typhimurium podestoff
- Plate ute S. typhimurium fra en -80 ° C glyserol lager på LB agar plater (med passende antibiotika å velge for fluorescens uttrykk vektorer) og inkuber natten ved 37 ° C.
- Plukk individuelle fluorescently positive kolonier og resuspender dem til ønsket konsentrasjon (se protokoller 5 og 6) i sterile fosfat-bufret saltvann (PBS), eventuelt som inneholder 0,085% (v / v) fenol rødt (Sigma-Aldrich) for å hjelpe visualisering av injeksjon prosess. Direkte bruke fersk suspensjon for injeksjon eller forberede glyserol aksjer. For å forberede glyserol aksjer, spinne ned nystekte injeksjon lager med ønsket konsentrasjon av bakterier og konsentrere aksjen ved resuspending pelleten i halve start volumet i sterile 20% (v / v) glyserol (Sigma-Aldrich) i PBS. Oppbevar glyserol aksje på -80 ° C. Fortynn glyserol lager 1:1 (v / v) før injeksjon i steril PBS, eventuelt som inneholder 0,17% fenol rødt.
- Vortex bakteriell suspensjon godt for å unngå klumper.
- Legg podestoff i microcapillary nålen med en microloader tips (Eppendorf, 5242956.003).
- På grunn av den relativt store størrelsen S. Typhimurium bakterier og deres lyse DS-RED fluorescens når du bruker pGMDs3 uttrykk vektor 3 (belastning tilgjengelig på forespørsel), kan individuelle bakterieceller lett bli regnet med en fluorescens stereomikroskop for å sette injeksjonen dose. For dette formål, injisere en nL inn en dråpe PBS på en agar plate, telle fluorescerende bakterier, og beregne injeksjonsvolum som kreves for å oppnå den ønskede bakteriell dose (fortrinnsvis holde injeksjonsvolum mellom 1-2 NL). Injiser embryoene med S. typhimurium via den valgte ruten (se protokoller 5 og 6).
3. Forbered 4. Forbered sebrafisk Embryoer til injeksjonsvæsker 5. Intravenøs injeksjon av bakterier i en-dags gamle embryo 6. Alternative Ruter på infeksjon 7. Stereo Imaging av infeksjonen 8. Confocal Imaging av infeksjonen 9. Representative Resultater Injeksjon av Salmonella typhimurium eller Mycobacterium marinum bakterier i blodet øya embryoer ved 1 DPF resultater i rask fagocytose av makrofager. Den MPEG1 genet er nylig blitt identifisert som en trofast markør av embryonale makrofager, colocalizing med den veletablerte macrophage markør csf1r (FMS) og ikke overlapper med nøytrofile markører som MPX (MPO) og 4 lyz, 14. For levende bilder av bakteriell fagocytose brukte vi transgene linjer der MPEG1 arrangøren driver fluorescerende protein uttrykk i makrofager 14. Disse transgene linjer enten ha MPEG1 promoter fbrukes direkte til GFP-genet, eller ansette en to-komponent system der MPEG1 promoter driver uttrykk av gjær Gal4 transkripsjonsfaktor som aktiverer en andre transgene med Gal4 anerkjennelse sekvensen (UAS, oppstrøms aktivere sekvens) smeltet til Kaede genet. Når blodet øya injeksjon (protokoll 5, figur 1A) er utført korrekt, vil bakteriene umiddelbart strømme gjennom blodsirkulasjonen og spredt over hele embryoet. Formidling av den relativt store og lyst fluorescerende DS-RED merket S. Typhimurium bakterier kan avbildes direkte med en stereo fluorescens mikroskop (figur 3A), og confocal bildebehandling ved 2 HPI viser at mange bakterier er phagocytosed av fluorescerende makrofager (Figur 3B-C). Injeksjon av så lite som 25 cfu av villtype S. Typhimurium bakterier vil resultere i en dødelig infeksjon, mens en tilsvarende dose av bakterier av en avirulent stog, slik som Ra, kan slettes ved embryonale immunsystemet tre. En injeksjon dose av 250 cfu ble brukt til å bestemme transcriptional svar på S. typhimurium infeksjon i sebrafisk embryo og demonstrerte induksjon av en sterk proinflammatorisk genuttrykk respons 15. I kontrast, intravenøs injeksjon av M. marinum bakterier ikke framprovosere ikke en sterk pro-inflammatorisk respons, men fører til en vedvarende infeksjon der infiserte makrofager danner tette aggregater som regnes som de første stadiene av granulomer, som er kjennemerket på tuberkulose to. Confocal avbildning av en slik granulom-lignende aggregat i Tg (MPEG1: EGFP) gl22 linje 14 på 5 dpi viser den intracellulære veksten av mCherry-merket M. marinum bakterier inne de grønne fluorescerende makrofagene (Figur 3D-E). Othennes ruter på infeksjon er nyttige for ulike formål. Bakterier kan bli injisert i hindbrain ventrikkelen ved 32 HPF (figur 1C), som er en kupé blottet for makrofager. Injeksjon av 20-100 mCherry-merket M. marinum bakterier inn i denne avdelingen fører til rask infiltrasjon av makrofager som phagocytose bakterier (figur 4a). En annen metode for å studere rettet migrering av medfødte immunceller er injeksjon av bakterier i halen muskelen (figur 1D). Men hale muskel injeksjoner også forårsake vevsskade som i seg selv utløser noen tiltrekning av leukocytter. Et slikt sår respons kan unngås når nøye injisere et lite volum (0,5-1 nL) i otic vesikkel (figur 1E). Som vist her ved hjelp av Tg (MPX: EGFP) i114 linje 16, injeksjon av ca 20 cfu av S. typhimurium i otic vesicle fører til tiltrekningen av nøytrofile på tre HPI ( (Figur 4E). Den ryggstreng, som synes å være motstandsdyktig mot infiltrasjon av leukocytter, er en ettergivende rom for vekst av M. marinum mutanter som er sterkt svekket når injiseres i andre vev 7, (Figur 4F). Til slutt, tidlig injeksjon av M. marinum inn eggeplomme av befruktede egg gir en alternativ metode for å oppnå en systemisk infeksjon. Vi generelt utføre disse injeksjonene rundt 16 celle stadiet (figur 1G), men bakterielle injeksjoner i eggeplomme kan også utføres på senere stadier (opp til 1000 cellen scenen), eller tidligere (1 til 8 cellers stadiet) for co-injeksjoner med morpholinos 8. Etter eggeplomme injeksjon av en dose på 20-40 CFU, M. marinum bakterier spres over flere dager inn i embryonale vev og danner granulom-lignende aggregater ligner de som ble observert ved den konvensjonelleintravenøs injeksjon metode 8; (figur 4G). Den eggeplomme injeksjon metode er ikke egnet for S. typhimurium infeksjon, fordi den raske veksten i eggeplomme forårsaker tidlig dødelighet. Den eggeplomme infeksjon metode for M. marinum infeksjon vil være nyttig for høy gjennomstrømning ettersom det kan automatiseres ved hjelp av en injeksjon robot 8.
Figur 1. Oversikt over injeksjon metoder som brukes for å etablere systemiske eller lokale infeksjoner i sebrafisk embryoer. (AB) intravenøse injeksjoner for å etablere en rask systemisk infeksjon er utført i kaudal blodåre i bakre blodet øya på en DPF (A) eller i Duct av Cuvier på 2-3 DPF (B). (CE) Lokale injeksjoner for å studere macrophage og nøytrofile chemotaxis utføres i hindbrain ventrikkelen ved en DPF (C), Halen muskel 1-2 DPF (D) eller otic vesikkel på 2-3 DPF (E). (F) Injeksjoner med å skape en infeksjon tilsynelatende utilgjengelige for fagocytter er utført i ryggstreng på 1-2 DPF. (G) injeksjoner for å skape en tidlig systemisk infeksjon med langsom voksende bakterier som M. marinum kan utføres i eggeplomme på 16-1000 cellen scenen. Alle bildene ble tatt med en Leica M165C, PLANAPO 1.0x koblet til et Leica DFC420 kamera (Leica 10446307 0,8 x).
Figur 2. Hair sløyfe verktøy. Et stykke av menneskehår settes inn som en sløyfe inn i åpningen på en Pasteur pipette og festes med superlim eller med Tipp-Ex. Dette gir et praktisk verktøy for forsiktig manipulere skjøre sebrafisk embryoer.
Figur 3. Intravenøse injeksjoner avrød fluoriserende Salmonella typhimurium og Mycobacterium marinum. DS-RED-merket S. typhimurium SL1027 bakterier (AC) og mCherry-merket M. marinum Mma20 bakterier (DE) ble injisert i blodet øya Tg (MPEG1: Gal4-VP16) gl24; Tg (UAS-E1b: Kaede) s1999t (AC) eller Tg (MPEG1: EGFP) gl22 (DE) sebrafisk embryoer ved 28 HPF. (A) Stereo-fluorescens og lyse-feltet overleggsbildet viser spredning av S. typhimurium i blodsirkulasjonen ved 2 HPI (Leica MZ16FA mikroskopet med Leica DFC420C kamera). (BC) confocal z-stack framskrivinger som viser rødt S. Typhimurium bakterier phagocytosed av grønne makrofager ved 2 HPI (Leica TCS SPE, HCX APO objektiv 40x 0,8 NA). Bakterier som fortsatt ekstracellulært kan også observeres. (D) confocal z-stack projeksjon viser en granulom-lignende tilslag inneholder M. marinum Mma20-infiserte og ikke-infiserte makrofager ved 5 dpi (Leica TCS SPE, HCX APO 40x0,8 NA). Makrofager i grønt og bakterier i rødt. (E) confocal z-stack projeksjon av en individuell makrofag (grønn) med intracellulære M. marinum bakterier (rød). Området avbildet i D av den hvite rektangelet ble fotografert med en høyere forstørrelse objektiv (Leica TCS SPE, HCX PL APO 63x 1,2 NA). Scalebars: 20 mikrometer.
Figur 4. Alternative ruter for infeksjon av sebrafisk embryoer. (A) mCherry-merket M. marinum Mma20 bakterier ble injisert i hindbrain ventrikkelen ved 32 HPF. Fluorescens og overføring overleggsbildet viser mCherry-merkede bakterier phagocytosed av makrofager ved 5 HPI (Leica TCS SPE, HCX PL FLUO TAR 40.0x 0,7 NA). (B) S. typhimurium ble sprøytet inn i halen muskelen på en DPF. Attraksjon av myeloide celler til injeksjonsstedet (hvit sirkel) er vist på tre HPI ved fluorescent in situ hybridisering 4, (C), mens i uninjected embryoer er det normalt ingen myeloide celler på dette morfologiske nettstedet. Selv om embryoene ikke inneholder modne nøytrofile på dette stadiet, kan to populasjoner av myeloide celler skilles, en uttrykker macrophage markør mfap4 (rød) og en uttrykker nøytrofile markør MPX (grønn) (Leica TCS SPE, HC PL FLUOTAR 10.0x 0,3 NA). Fluorescens av bakteriene er tapt etter at in situ hybridisering prosedyre. (D) DS-RED-merket S. Typhimurium bakterier ble injisert i otic vesicle av Tg (MPX: EGFP) i114 sebrafisk ved 2 DPF. Stereo-fluorescens og lyse-feltet overleggsbilder viser at MPX: EGFP merket nøytrofile celler er tiltrukket til den infiserte otic vesikkel (stiplet ellipse) på 3 HPI, (E), mens kontroll injeksjon av PBS i otic vesicle av Tg (MPX: EGFP ) i114 sebrafisk viser ikke tiltrekning av nøytrofile til infisert otic vesicle (stiplet ellipse) (Leica MZ16FA med Leica DFC420C kamera). (F) mCherry-merket M. marinum bakterier av svekket E11 eccCb1 :: tn mutert stamme 17 ble injisert i ryggstreng på en DPF. Proliferation inni ryggstreng ble fotografert på 5 dpi (Leica MZ16FA mikroskop med DC500 kamera). (G) mCherry-merket M. marinum E11 bakterier ble injisert i plommen av 16-celle stadium sebrafisk embryoer av TG (fli1a: EGFP) linje som uttrykker GFP i endotelceller i blod og lymfeårer. Dannelse av granulom-lignende aggregater av infiserte celler i halen regionen er observert ved 5 dpi (Leica MZ16FA mikroskopet med Leica DFC420C kamera; bilde fra 8).
Discussion
De infeksjon metodene som beskrives i denne artikkelen er ofte brukt for å studere funksjonen til verten medfødt immunitet gener eller bakteriell virulens gener 1. De intravenøse mikro-injeksjon metoder (protokoller 5 og 6.1) brukes oftest for slike studier. Den kaudal blodåre i bakre blodet øya er den mest passende sted for intravenøs injeksjon av 1-dag-gamle embryoer. Som kaudal venen blir vanskeligere å trenge gjennom på senere stadier, foretrekker vi Duct av Cuvier som intravenøs injeksjon området for embryoer med 2-3 DPF. I alle tilfeller er det avgjørende å injisere embryoer med konsekvente antall bakterier, som bør sjekkes av platekledning injeksjon inocula for cfu telling. Følgende forhold må vurderes for å oppnå reproduserbare injeksjoner. For det første er det viktig å ha høy kvalitet glass microcapillary injeksjonsnåler. Hvis nålen spissen er for stor, vil injeksjonen skape en punktering hull stort nok for blødninger kan forekomme ogden injiserte bakteriene vil strømme ut av blodsirkulasjonen. Dernest må bakterier injiseres direkte inn i blodsirkulasjonen. Hvis nålen spissen er ikke inne i venen eller om sprøyterom væske sprer inn plommesekken forlengelse, må embryoet kastes fra forsøket. For det tredje, ved hjelp PVP40 som en transportør for å injisere M. marinum vil bistå i å hindre bakterier fra å synke i glasset nål. PVP40 forbedrer homogenitet av suspensjonen, noe som resulterer i mer reproduserbar inocula hele varigheten av injeksjoner. PVP40 kan også brukes til S. Typhimurium injeksjoner, men her er det mindre viktig fordi større og lyse fluorescens av bakteriene gir en visuell kontroll over injeksjonen podestoff under eksperimenter. For å praktisere injeksjoner anbefaler vi bruk av fenol rødt fargestoff (1% v / v) eller 1 mikrometer fluoriserende kuler tilgjengelig i forskjellige farger (Invitrogen). Når teknikken er mestret, tar det ca 30 minutes å injisere 50-100 embryoer, inkludert tiden som kreves for å justere de embryoene på agarose plater og justering av bakteriell injeksjonsvolum.
Mens intravenøse injeksjoner i blodet øya (protokoll 5) eller i kanalsystem av Cuvier (protokoll 6.1) er mest brukt, har de alternative rutene for infeksjon er beskrevet i denne videoen artikkelen vist seg nyttig å studere macrophage og nøytrofile chemotaxis (protokoller 6.2, 6.3 og 6.4), for å studere vekst av svekkede bakteriestammer (protokoll 6.5), og å tilpasse sebrafisk smitte modell for høy gjennomstrømning (protokoll 6.6) 4-8. De beskrevne mikro-injeksjon metoder kan også brukes til injeksjon av virus 18, 19, soppsporer 14, 20 eller protozo parasitter (Maria Forlenza, personlig kommunikasjon). Et nyttig tillegg til de injeksjonsprosedyrer beskrevet i denne videoen artikkelen er en nylig beskrevet prosedyre for subkutan injeksjon av bakterier i zebrafish embryoer 21. Denne prosedyren ble brukt til å studere fagocytose av bakterier ved nøytrofile, som ble funnet å effektivt sluker bakterier på vev flater, men i motsetning til makrofager, var praktisk talt ikke phagocytose bakterier ved injeksjon i blodet eller i væskefylte kroppens hulrom. For subkutane injeksjoner embryoer er plassert tilsvarende som for de halen muskel injeksjoner beskrevet i denne videoen artikkel, men nålen er satt inn like under huden for å injisere bakterier over en somitt.
Det er viktig å tenke på at mikro-injeksjon er egentlig en kunstig smitteveien. Men tidlige embryoer er svært motstandsdyktig mot ytre eksponering for bakterier. Faktisk, nedsenking analyser, hvor embryo er badet i en bakteriell suspensjon, er ikke reproduserbare i våre hender 22. Mens noen embryoer kan bli smittet ved nedsenkning, har vi observert en stor variasjon i dødelighet og i den uttrykteion av inflammatoriske markører gener mellom individuelle embryo i slike analyser. Mikro-injeksjon metodene som beskrives i denne artikkelen oppnå reproduserbare infeksjoner og er spesielt nyttig å studere bakterielle interaksjoner med verten medfødte immunceller. En effektiv tilnærming til å kvantifisere bakteriell infeksjon i enkelte embryoer er å analysere de selvlysende bilder av infiserte fostre med skreddersydd, dedikert pixel kvantifisering programvare 17, 23. Denne tilnærmingen har vist seg å korrelere godt med resultatene fra cfu teller etter plating av infiserte embryoer. Tilsvarende har relative endringer i leukocytter numre per embryoet blitt kvantifisert ved digital bildeanalyse i transgene leukocytter fluoroforen reporter linjer; denne tilnærmingen ville være aktuelt å kvantifisere verten leukopoietic respons på infeksjon 24.
Funksjonen vert medfødte immunsystemet gener kan undersøkes effektivt in vivo ved å kombinere de beskrevne infeksjon modellenemed Morpholino knockdown. Morpholinos er syntetiske antisens oligonukleotider som er rettet mot spesifikke RNA og redusere uttrykket av genet produktene når de blir sprøytet inn i en celle trinns sebrafisk embryoer som vist i andre video artikler i denne 10 tidsskriftet, 25. I Morpholino knockdown studier, er det av stor betydning at alle embryo gruppene som sammenlignes er iscenesatt riktig før bakterielle injeksjoner. Dette er spesielt viktig fordi embryoene har et utviklingsland immunsystem som blir stadig mer kompetente over tid.
Det er flere transgene reporter linjer som er tilgjengelige for å skille de store medfødte immunsystemet undergrupper, makrofager og nøytrofile, i sebrafisk embryoer. MPX og lyz arrangører har blitt brukt til å generere nøytrofile reporter linjer 16, 26, 27, og csf1r (FMS) og MPEG1 arrangører ble brukt til å produsere macrophage reportere 14, 28. Mens CSF1R (FMS) er i tillegg uttrykt i xanthophores, er MPEG1 uttrykk utelukkende i makrofager. Som vist i denne videoen artikkelen, den nylig utviklede MPEG1 reporter linjene er svært nyttig for bildebehandling bakteriell fagocytose av makrofager.
Disclosures
Forfatterne har ikke noe å avsløre.
Acknowledgments
Forfatterne ønsker å takke Chao Cui, Floor de Kort, Esther Stoop og Ralph Carvalho for bilder i figur 4, Ulrike Nehrdich og Davy de Witt for fisk omsorg og andre lab medlemmer for nyttige diskusjoner. Dette arbeidet støttes av Smart Mix Program av Nederland Ministry of Economic Affairs og Kunnskapsdepartementet, Kultur og vitenskap, EU-kommisjonen 7. rammeprogram prosjekt ZF-HELSE (HELSE-F4-2010-242048), den europeiske Marie-Curie Initial Training Network FishForPharma (PITN-GA-2011-289209), og av den australske NHMRC (637 394). Den australske regenerativ medisin Institute er støttet med tilskudd fra staten regjering Victoria og den australske regjeringen.
Materials
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Phenol Red | Sigma-Aldrich | P0290 | |
Glycerol | Sigma-Aldrich | 228210 | |
Difco Middlebrook 7H10 agar | BD Biosciences | 262710 | |
BBL Middlebrook OADC Enrichment | BD Biosciences | 211886 | |
Difco Middlebrook 7H9 Broth | BD Biosciences | 271310 | |
BBL Middlebrook ADC Enrichment | BD Biosciences | 211887 | |
Tween 80 | Sigma-Aldrich | P1754 | |
Polyvinylpyrrolidone (PVP40) | Calbiochem | 529504 | |
N-Phenylthiourea (PTU) | Sigma-Aldrich | P7629 | |
Ethyl 3-aminobenzoate methanesulfonate salt (Tricaine) | Sigma-Aldrich | A5040 | |
Methyl cellulose | Sigma-Aldrich | M0387 | |
SeaPlaque Agarose (low melting point agarose) | Lonza Inc. | 50100 | |
FluoSpheres (1.0 μm, red fluorescent (580/605)) | Invitrogen | F8821 | |
FluoSpheres (1.0 μm, yellow-green fluorescent (505/515)) | Invitrogen | F8823 |
References
- Meijer, A. H., Spaink, H. P. Host-pathogen interactions made transparent with the zebrafish model. Curr. Drug Targets. 12, 1000-1017 (2011).
- Davis, J. M. Real-time visualization of mycobacterium-macrophage interactions leading to initiation of granuloma formation in zebrafish embryos. Immunity. 17, 693-702 (2002).
- vander Sar, A. M. Zebrafish embryos as a model host for the real time analysis of Salmonella typhimurium infections. Cell Microbiol. 5, 601-611 (2003).
- Zakrzewska, A. Macrophage-specific gene functions in Spi1-directed innate immunity. Blood. 116, 1-11 (2010).
- Le Guyader, D. Origins and unconventional behavior of neutrophils in developing zebrafish. Blood. 111, 132-141 (2008).
- Herbomel, P., Thisse, B., Thisse, C. Ontogeny and behaviour of early macrophages in the zebrafish embryo. Development. 126, 3735-3745 (1999).
- Alibaud, L. A Mycobacterium marinum TesA mutant defective for major cell wall-associated lipids is highly attenuated in Dictyostelium discoideum and zebrafish embryos. Mol. Microbiol. 80, 919-934 (2011).
- Carvalho, R. A high-throughput screen for tuberculosis progression. PLoS One. 6, 16779-16779 (2011).
- van der Sar, A. M., Spaink, H. P., Zakrzewska, A., Bitter, W., Meijer, A. H. Specificity of the zebrafish host transcriptome response to acute and chronic mycobacterial infection and the role of innate and adaptive immune components. Mol. Immunol. 46, 2317-2332 (2009).
- Rosen, J. N., Sweeney, M. F., Mably, J. D. Microinjection of Zebrafish Embryos to Analyze Gene Function. J. Vis. Exp. (25), e1115-e1115 (2009).
- Kimmel, C. B., Ballard, W. W., Kimmel, S. R., Ullmann, B., Schilling, T. F. Stages of embryonic development of the zebrafish. Dev. Dyn. 203, 253-310 (1995).
- Westerfield, M. The Zebrafish Book. A Guide for the Laboratory Use of Zebrafish (Brachydanio rerio). , The University of Oregon Press. Eugene. (1993).
- Gutzman, J. H., Sive, H. Zebrafish Brain Ventricle Injection. J. Vis. Exp. (26), e1218-e1218 (2009).
- Ellett, F., Pase, L., Hayman, J. W., Andrianopoulos, A., Lieschke, G. J. mpeg1 promoter transgenes direct macrophage-lineage expression in zebrafish. Blood. 117, 49-56 (2011).
- Stockhammer, O. W., Zakrzewska, A., Hegedus, Z., Spaink, H. P., Meijer, A. H. Transcriptome profiling and functional analyses of the zebrafish embryonic innate immune response to Salmonella infection. J. Immunol. 182, 5641-5653 (2009).
- Renshaw, S. A. A transgenic zebrafish model of neutrophilic inflammation. Blood. 108, 3976-3978 (2006).
- Stoop, E. J. Zebrafish embryo screen for mycobacterial genes involved in the initiation of granuloma formation reveals a newly identified ESX-1 component. Dis. Model Mech. 4, 526-536 (2011).
- Levraud, J. P. Identification of the zebrafish IFN receptor: implications for the origin of the vertebrate IFN system. Journal of Immunology. 178, 4385-4394 (2007).
- Levraud, J. P., Colucci-Guyon, E., Redd, M. J., Lutfalla, G., Herbomel, P. In vivo analysis of zebrafish innate immunity. Methods Mol. Biol. 415, 337-363 (2008).
- Brothers, K. M., Newman, Z. R., Wheeler, R. T. Live imaging of disseminated candidiasis in zebrafish reveals role of phagocyte oxidase in limiting filamentous growth. Eukaryot. Cell. 10, 932-944 (2011).
- Colucci-Guyon, E., Tinevez, J. Y., Renshaw, S. A., Herbomel, P. Strategies of professional phagocytes in vivo: unlike macrophages, neutrophils engulf only surface-associated microbes. J. Cell Sci. 124, 3053-3059 (2011).
- van Soest, J. J. Comparison of static immersion and intravenous injection systems for exposure of zebrafish embryos to the natural pathogen Edwardsiella tarda. BMC Immunology. 12, 58-58 (2011).
- Adams, K. N. Drug tolerance in replicating mycobacteria mediated by a macrophage-induced efflux mechanism. Cell. 145, 39-53 (2011).
- Ellett, F. L., Lieschke, G. J. Computational quantification of fluorescent leukocyte numbers in zebrafish embryos. Methods in Enzymology. , (2011).
- Yuan, S., Sun, Z. Microinjection of mRNA and Morpholino Antisense Oligonucleotides in Zebrafish Embryos. J. Vis. Exp. (27), e1113-e1113 (2009).
- Mathias, J. R. Resolution of inflammation by retrograde chemotaxis of neutrophils in transgenic zebrafish. J. Leukoc. Biol. 80, 1281-1288 (2006).
- Hall, C., Flores, M. V., Storm, T., Crosier, K., Crosier, P. The zebrafish lysozyme C promoter drives myeloid-specific expression in transgenic fish. BMC Dev. Biol. 7, 42-42 (2007).
- Gray, C. Simultaneous intravital imaging of macrophage and neutrophil behaviour during inflammation using a novel transgenic zebrafish. Thromb. Haemost. 105, 811-819 (2011).