Summary
ゼブラフィッシュの急速な発展、小型サイズと透明性感染症の自然免疫制御の研究のための途方もない利点があります
Abstract
病原体カンジダ·アルビカンスに起因する播種性カンジダ症は、入院して個人の臨床的に重要な問題であり、30から40パーセント起因する死亡率は6に関連付けられています。全身性カンジダ症は、通常、先天性免疫によって制御され、食細胞NADPHオキシダーゼなどの自然免疫細胞成分の遺伝的欠陥を持つ個人は、カンジダ7月9日に影響を受けやすくなります。非常に小さなCのダイナミクスについてはほとんど知られていないin vivoでの自然免疫細胞とカンジダの相互作用。in vitro試験で広範には、ホストCの外側にあること確立していますカンジダは、マクロファージの内部で発芽し、かつ迅速に好中球10月14日によって破壊されています。in vitro試験において 、有用なものの、サイトカイン、細胞外マトリックスの添付ファイル、および細胞間の接点10の時間依存ダイナミクスを含む生体内環境で複雑 なを再現することはできません15から18
ゼブラフィッシュの幼虫は、感染症の研究のためのユニークで多彩な脊椎動物宿主を提供しています。開発ゼブラフィッシュ幼生の最初の30日間だけ先天性免疫防御2、19-21のような先天性免疫に大きく依存している播種性カンジダ症などの疾患の研究を簡素化しています。ゼブラフィッシュ幼生の小型化と透明性の両方の宿主と病原体の細胞レベルでの感染動態のイメージングを可能にします。生得的な免疫細胞を蛍光トランスジェニック幼虫は感染22から24に関与する特定の細胞型を識別するために使用することができます。変更されたアンチセンスオリゴヌクレオチド(Morpholinos)は、そのような食細胞NADPHオキシダーゼなどの様々な免疫成分をノックダウンするとfungaへの応答の変化を勉強するために使用することができますlの感染5。小さな下の脊椎動物を使用しての倫理的、実用的な利点に加えて、ゼブラフィッシュの幼虫は、イメージの両方intravitallyと色の病原体とホストの間で激戦を特有の可能性を提供しています。
ゼブラフィッシュは、ヒトの病原性細菌の数のモデル感染症に使用されており、マイコバクテリア感染3、25の私たちの理解に大きな進歩に尽力してきました。しかし、ごく最近そのような幼虫5に感染するために使用されて菌類、23、26とはるかに大きいの病原体を持っており、感染の方法論の詳細な視覚的な説明がされていない最新の状態に。ここでは、以前のプロトコルへの私たちの修正を含むプリム25ゼブラフィッシュ後脳の脳室のマイクロインジェクションは、当社の技術を紹介します。真菌感染症のために幼虫のゼブラフィッシュモデルを使用して、我々の所見は、in vitro試験から分岐し、宿主-病原体interaを検討する必要性を強化ホストではなく、ペトリ皿5の簡素化、システムの複雑な環境でction。
Protocol
すべてのゼブラフィッシュのケアのプロトコルや実験は動物実験及び利用委員会(IACUC)プロトコルA2009-11-01の下に行われた。
1。モルホリノおよび幼虫インジェクション料理
実験期間:*(10-15分)
難易度:*
- 卵の注射用滅菌水と電子レンジで2%アガロース溶液を調製。解決策は、それが半分になるまで、余分な深いペトリ皿(フィッシャーサイエンティフィック)にその一部を注ぐ冷却したとき。氷上で冷却し、プレートが水平であることを確認してください。
- 皿を冷却した後、2%アガロース15mlの最上層を注ぐ。スプレーボトルから滅菌水でプラスチック金型(適応科学のツール)を溝卵注入をスプレー。慎重に熱いアガロースに金型の溝側を下に置きます。アガロースが冷却されたとき、AGAから金型を解離する金属フラットへら(VWR Scientific)を使用上昇した。徐々にアガロースからグリッドを削除します。ラップ胚の注入パラフィルムで料理(VWRサイエンティフィック)とストアは、4℃で反転
- 魚の幼虫の注射については、前述のように2%アガロース溶液を調製。標準サイズのペトリ皿(VWRサイエンティフィック)に溶液を注ぎ、それが固化するまで置いておきます。パラフィルムとストア内のラップ幼虫注入皿は4℃で反転
2。真菌培養の準備
実験期間:**(30分)
難易度:**
- 10グラム/リットル、酵母エキス、20g /リットル、ペプトン、20g /リットルデキストロース、および20グラム/リットルの寒天に、オートクレーブ:酵母エキス - ペプトン - デキストロース(YPD)寒天プレートを準備します。 YPD液体のために10グラム/リットル、酵母エキス、20g /リットル、ペプトン、20g /リットル、ブドウ糖、オートクレーブ121℃20〜30分℃を準備する
- 魚の感染症への2日前までは、冷凍からストリークプレートを準備単一のコロニーを得るためにYPD寒天上にカンジダ·アルビカンスの文化を取り揃えております。
- 37℃で一晩インキュベートします。
- 16×150 mmの培養管(VWRサイエンティフィック)に5 mLのYPD培地を入れてください。
- 魚の感染症の前日には、木製のダボ(VWR Scientific)をしたYPD寒天培地上で1つの小さなコロニーを選択します。 YPD液体に再懸濁コロニーの周囲に培養管と渦に棒を入れてください。
- 14インチ試験管ホイール(ニューブランズウィックサイエンティフィック)を搭載したTC-7組織培養ローラードラム上で37°Cで一晩成長する。
- 次の日に、1.7 mlチューブに1分(Axygen)に14000x gで培養液1 mLをスピンダウンする。上清を除去し、ボルテックス(VWRサイエンティフィック)は、ペレットを残液中で再懸濁します。
- 追加1 mLの1×リン酸緩衝生理食塩水(VWRサイエンティフィック)と前述のようにスピン。
- PBS洗浄を3回繰り返します。
- 1X PBSで1:100に希釈液を希釈して(洗浄したC. albicansの10μL990μL1×PにBS)。
- 血球(VWR Scientific)を頼りに。
- 10 7細胞/ mLに希釈する。
3。ゼブラフィッシュ感染
実験期間:****(1-3時間)
難易度:****
- セクション5と卵を水の店、滅菌脱イオン水で60 mg / Lのインスタント海塩(フィッシャーサイエンティフィック)に従って胚を収集します。
- そのようなオリンパスSZ61(オリンパス)、感染症の日dechorionate胚として解剖顕微鏡を使用します。チップの袋を開いたり、穏やかに絨毛膜に閉じた位置にピンセットを突く、その後徐々にそれらを開くように絨毛膜27を引き離すためにデュモンDumoxelピンセット(VWR Scientific)を使用しています。魚は絨毛膜のうち右に表示されるはずです。
- 皿の中心に魚を移動する上で渦蓋付き余分な深いペトリ皿を。ディッシュの蓋に魚を移します。卵水を除去し、新鮮な培地と交換してください。メディアに魚を追加します。
- 28℃インキュベーター内で暖かい幼虫注入料理℃、魚を麻酔では200μg/ mlでtricaineメタンスルホン酸(西洋化学社製)希釈を準備します。
- 感染症(20-50魚)の幼虫の希望数をカウントします。 tricaineメタンスルホン酸溶液中で魚を入れて、彼らは移動を停止するまで1-2分待ちます。
- MPPI-3射出ユニット(応用科学機器)の電源をオンにします。圧力スイッチは、 "パルス"にあり、 "パルス持続時間は、"バックプレッシャ·ユニットの3 PSIを9に設定されていることを確認してください。射出ユニットの圧力が30 PSIを読み取るまで窒素タンクにバルブを開きます。
- 1×10 7細胞/ mlの濃度でボルテックスCandida albicansの5μLで引っ張らマイクロピペット28をロードします。マイクロピペットホルダー(応用科学機器)のマイクロピペットを置きます。水と空の余分な深いペトリ皿を埋める。私は先端まで、マイクロピペットを移動ビュー内のsはちょうど顕微鏡解剖を経由して水の表面に触れると引っ張らピペットの先端から3mm程度の針をクリップするデュモンDumoxelピンセット(VWR Scientific)を使用しています。
- 針が切り取られていることを確認するためのフットスイッチ(応用科学機器)を押します。あなたが成功した場合、液体が分散しているはずです。液体ボーラスの直径は25プリムゼブラフィッシュの幼虫(0.21ミリメートル、容積は4.9 NLの球が得られる)の瞳孔の直径よりも大きくなるべきではありません。液体ボーラスが大きすぎるか小さすぎる場合に応じて圧力を調整します。
- tricaineメタンスルホン酸塩の魚(200μg/ mLの)を麻酔。魚一旦移動、渦巻魚が中心になるまで、上の蓋と皿を停止しました。転送ピペット(フィッシャーサイエンティフィック)を使用して、50魚を集める。先端に向かって魚を解決するためのピペットの側をタップします。できるだけ液として使用して幼虫のアガロースの皿の上にそっとピペット魚。
- 滑らかなガラス棒(それらを粉砕しないように注意してください!)で魚を並べる。料理の可能性からできるだけ液体として吸引します。すべての水分を逃がすためにキムワイプを使用しています。
- あなたが同時に魚や針の良い眺めが得られるまで、顕微鏡下で魚の幼虫のアガロースの皿を置きます。魚に向かってガラス針を移動します。あなたは魚に向かって針を置くと魚と針の両方で拡大します。慎重に第一の魚の耳胞27、29(耳)にガラス針を移動します。あなたは魚に針を移動した後、あなたはフットスイッチ(アプライド·サイエンティフィック·インスツルメンツ)を押したときに、後脳の脳室がわずかに持ち上げますので、あなたは知っているよ。
- フットスイッチ(応用科学機器)を押すと、液体は魚の後脳室27の内部に分散させる監視します。魚から針を撤回し、次の魚に移動します。お皿に魚のすべてを注入するまでの手順を繰り返します。任意のdを削除します。EADの魚(50魚)番号が正しい保つために代替品を注入します。 50魚のグループごとに新しいマイクロインジェクションニードルを準備する必要が注入された、 または C カンジダは、ニードルの底に沈殿し、それを下駄、または注入された濃度をオフにスローされます。
- 皿を釣り、60 mLの卵水を含むきれいな余分な深いペトリ皿に魚の上に卵水を噴霧することにより料理の魚を洗い流してください。それよりも長い15〜20分間アガロース上で魚を残すことは重要ではありませんか、彼らは乾燥して死んでしまう。
- 終了するまで全体の注入プロセスを繰り返します。 PBSおよび非病原性の注入されたコントロールを忘れないでください。
- 終了したら、28で魚を保つ℃に
- 窒素タンクのバルブを閉じます。タンクラインの圧力を緩和するために "連続"に "パルス"から射出装置のスイッチを移動し、圧力は、この時点でゼロに削除する必要があります。 "パルス"に戻って射出装置を切り替えます。射出ユニットの電源をオフにして、作業領域をクリーンアップします。
実験期間:**(30分)
難易度:**
- (200μg/ mL)を以前と同じようにtricaineメタンスルホン酸溶液を調製します。感染した魚を取り出すと、tricaineにそれらを転送します。
- 卵を水に47.9 mLの0.4パーセントの低融点アガロース(VWR Scientific)を準備します。電子レンジでソリューションを加熱する。 37℃まで冷却し、混合物に追加tricaineメタンスルホン酸(200μg/ mL)を
- 一度魚がtricaineメタンスルホン酸塩、0.4%低融点アガロース(VWR Scientific)を含むペトリ皿(VWR Scientific)をピペット個々の魚に固定化されています。
- 次に、イメージングのためのガラスボトムディッシュ(マテック株式会社)の個々のウェルに低融点アガロースから魚を移動します。魚が皿の底に平らになるので、できるだけ少ない低融点アガロースとして使用します。のみを満たすのに十分なtricaine-アガロースを使用しガラスボトムディッシュのNERサークル。
5。 Joveのプロトコルに関連する変更
マイクロインジェクション用マイクロピペット
実験期間:*(10-15分)
難易度:*
- Yuan らによるとザ·フレーミング·ブラウンマイクロピペットプラーモデルP-97(サッター·インスツルメンツ)30を使用して BF120-69-10(サッター·インスツルメンツ)中空ガラス棒を引き出します。以下の条件を熱= 470、ベロシティ= 120時間= 200でプログラム#7を選択してください。その結果、針は8ベベルから先端までmmと、一度は、約10μmの直径を有し、先端から3 mm上でクリッピングされます。
- ブラケットにガラスマイクロピペットをロードします。 "プル"を選択します。加熱フィラメントは、プログラムパラメータとガラス棒に応じて針が2引っ張らマイクロピペットに分離され加熱されます。ピペットの収納ボックス(SuttのストアマイクロピペットERの楽器)。
胚コレクション、モルホリノ注入とメンテナンス
実験期間:***(1-2時間)
難易度:***
- Rosen らの方法に従って胚を収集します31。産卵水槽(水生生息地)から卵を収集するためにプラスチック製のふるい(ナッツの用品)を使用します。余分深いペトリ皿の上に逆さまにふるいを保持し、卵を収集するためにタンクの水で洗い流してください。
- モルホリノの準備のため、モルホリノ、300ナノモル(GeneTools、LLC)を300μLの滅菌水を追加します。これは、1.0 mMの作業用ストックを提供します。
- 光度計(サーモフィッシャーサイエンティフィック)を使用してモルホリノの濃度を確認します。 "核酸と、サンプルの種類を変更する"を選択して265に他の "と波長absorptivitで割った1000モルホリノの分子量を乗じて定数を入力します。yは係数モルホリノオリゴプロパティ·シートに記載されている。
- 2μL0.1 N HClで空白光度計。 0.1 N塩酸(20倍希釈)を95μLにモルホリノ溶液5μLに希釈する。光度計台座をクリックし測定上の希釈の2μLを配置します。希釈率(20)で濃度を乗算します。これは、モルホリノのワーキング濃度を与える。ミリモル濃度を計算するには、モルホリノの分子量によって得られた濃度を割ります。
- Danieauバッファー(58 mM塩化ナトリウム、0.7 mMの塩化カリウム、0.4mMのMgSO 4を 、0.6 mMのカルシウム(NO 3)2、5.0 mMのHEPES、pH7.6)で、0.01%フェノールレッド(VWRサイエンティフィック)にモルホリノの作業用ストックを準備します。
- モルホリノ注入作業のためにローゼンら 31、Yuan ら30に従ってプロトコルに従ってください。 15分間28°Cで卵と水と暖かいとモルホリノ注入料理をすすぎます。注入料理とラインアップ1-Cから水を除去ピペットで注入皿の溝(第1節から調製された)にエルステージの胚。各プレートには約250卵を保持します。モルホリノ1〜2細胞期胚を注入します。卵は15分27の1細胞期のままになります。
- 余分深いペトリ皿に注入し終えた卵と水と卵(60 mg / Lのインスタントオーシャン塩と滅菌脱イオン水)と60 mLの卵水に場所を洗い流す。モルホリノ注入皿を再利用することができます。終了したら卵を水ですすぎ、4℃で保存し反転
- 胚の保存のために60mLの卵を水皿に追加します。 60mLの卵を水で別々の余分な深いペトリ皿に転送ピペットで110の胚をカウントします。 28で微生物の増殖とインキュベートした胚を防ぐために、メチレンブルー℃、0.00003パーセントを追加します。
- 胚の開発をスピードアップするには、胚は頭部に開発することができ、キンメルら 27による24時間のステージに33°Cでの胚の料理を保つ75℃(プリム25ステージ27)のトランク角度。
- 幼虫の感染症の仕事のためにCで注入した後28°Cでの胚を保つカンジダ。
- 毎日、60 mlの新鮮な卵を水で胚の料理を交換してください。
イメージング
実験期間:*****(1-5時間)
難易度:***
- 前述のようにガラス底イメージング料理(マテック株式会社)でtricaineと低融点アガロース(4.2節に従って)で魚を準備します。オリンパスIX-81(オリンパス)倒立顕微鏡ステージ上に皿を置きます。微分干渉コントラスト(DIC)の光の下で4倍の倍率で焦点に魚を持参してください。画像が4X、20X、およびDIC、TRITC(テトラメチルローダミンイソチオシアネート)、及びFITC(フルオレセインイソチオシアネート)フィルタ設定の40倍の倍率でキャプチャすることができます。
- FV-1とオリンパスIX-81倒立顕微鏡を使用します。000レーザー有賀らによると共焦点システムをスキャンする32。 1から1.5μmのスライス感染の時間ごとにZ-スタックを設定することにより、40倍の倍率でのタイムコースを実施しています。
- 2時間以上の長い時間のコースイメージングのために、イメージングの皿の魚2〜3時間おきの上に低融点アガロースの層を配置します。これは乾燥し、それを撮影されている間に魚を粉砕からアガロースを防ぐことができます。魚の数が少ない長い時間のコースでは、感染時に28°Cを維持するために、加熱ステージ(Bioptechs社)を使用します。
6。代表的な結果
成功した後脳室Cの例5時間後の感染症(HPI)と24 HPIにおけるゼブラフィッシュ幼生におけるカンジダ感染症は、( 図1)に示されています。飲み込まCとマクロファージ様細胞カンジダは 5 HPIにおける後脳の心室で見られている。 24 HPI、C.カンジダは、マクロファージ様細胞の内側にある播種性カンジダ症の指標と背尾組織のだ。この感染症の結果は10-15酵母形C.の正確な注入に大きく依存後脳の脳室にカンジダ 。感染した魚のスクリーニングは、直ちに注入後は、これを確保することができます。
図1トランスジェニックFLI1:EGFP 22、33幼虫は、フッ化カルシウム- yCherry カンジダ·アルビカンスに感染し、共焦点顕微鏡によってintravitally結像される。 (AC)5時間感染後、感染部位(後脳室)スケールバー= 100μmのマクロファージ様細胞をEGFP発現した()感染幼虫。同じ魚の(BおよびC)高倍率画像を、C.を示す食細胞内カンジダ 。スケールバー= Bは100μmとC.(DF)フッ化カルシウム- yCherry Cと播種性カンジダ症で24時間感染後(D)感染幼虫のためには10μm EGFP MAC内部のカンジダ背尾組織のrophage様細胞。スケールバー= 100μmである。同じ魚の(EおよびF)高倍率画像を、C.を示す尾部組織におけるカンジダ 。スケールバー= 100μmである。
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Discussion
ここで紹介するゼブラフィッシュマイクロインジェクション法は、Gutzman らとは異なります。ここではその34我々は36から48 HPF幼虫の後脳室に耳胞を介して注入を示しています。我々は記述方法が減少し組織の損傷と後脳の脳室に10月15日酵母の一貫性の注入を可能にします。このプロトコルは、24 HPI( 図1)と有意な死亡率/罹病率5の結果から、体全体に広がり、最初にローカル感染を生成します。後脳の心室は完全に48 HPF 27日、29日まで封印されていません。開発マクロファージおよび好中球のこの初期段階で感染部位、貪食Cに移行するカンジダ 、ボディ5の他の部分に移動する可能性があります。
このシステムの真のパワーは、蛍光タンパク質を発現する微生物とゼブラフィッシュのトランスジェニックを結合する能力から来ています。我々は、enを持っているCの野生型および変異体の汚れをgineered カンジダは、恒常的にmCherry、dTomato、とeqFP650を表現する。酸化ストレス応答性プロモーターと、これらの発現構築物を組み合わせることで、ライブのゼブラフィッシュの幼虫5内の酸化ストレスのレシオメトリック定量化を可能にします。変異菌や魚morphantのコンテキスト内で蛍光菌、蛍光生得的な免疫細胞の in vivoイメージングのデュアルも確実にそのような感染部位への移行、病原体の貪食、菌類の発芽の防止等の変更の免疫応答を定量化するために使用することができます、および5を殺害。
このプロトコルの初心者ユーザーに問題が発生する可能性があり、いくつかの技術に関連する問題があります。まず、針が適切に切り取られることが重要であると Cの射出圧力が正しく設定されているので、5 nLのalbicansの懸濁液をマイクロインジェクションされています。この1つはボーラスが出てくるかどうかを確認できるようにするには3.8節で説明したように針は、プリムの25ゼブラフィッシュ幼生の瞳孔の大きさです。それは、ゼブラフィッシュ幼虫は後脳の脳室内に存在する10月15日酵母が存在することを確認するには落射蛍光ですぐに感染後をスクリーニングすることによって確認することができます注入物質と同じ量を受信することが重要です。注入された魚はまた、初期のコロニー形成ユニット5の検証のための均質化とめっきすることができる。これは幼虫の時期尚早の死を引き起こすとして、第二に、それは、後脳の心室の血管を穿刺しないようにすることが重要です。それは後脳の脳室への直接マイクロインジェクションを確保し、約45度の角度で耳胞に注入することが重要です。第三に、病原体感染の独立している感染サイトへの増加した炎症につながることができる、耳胞組織を引き裂くか、破損しないように十分注意してください。幼虫はアガロースinjecti上に配置された後第四に、注射はすぐに実行する必要があります。皿の上。皿の上に長すぎると左の幼虫は乾燥され、これが発生した場合、PBS注入魚の死亡率があるでしょう。 15分以内に感染症を完了し、魚に感染しながら皿に水の残量を残すことで、この問題を改善することができます両方。しかし、皿の上にあまりにも多くの水を残しては、幼虫を漂流した注射はより困難にすることができます。古い(4 DPF)より複雑であるが、空気中に幼虫をさらすことを避けるための魚のために説明した注射の代替方法がコセンティーノら28によって提供されています。
ゼブラフィッシュの幼虫は、細菌、真菌およびウイルス性病原体5、26、35から46に先天性免疫応答をモデル化するために使用されて今日までする必要があります。これらの画期的な研究では、宿主と病原体の両方に新たな細胞および分子メカニズムを発見するため、このモデルシステムの有用性を確立しています。この記述されているプロトコルと一緒に、これらの他の公開作品は他のlaboratoの基礎を提供するそのままホストのコンテキストのホスト抗真菌作用を検討するリース。
これらの実験で有用ですが、FLI1:EGFPトランスジェニックラインはここで説明するには限界を持っています。 FLI1遺伝子はマクロファージ様細胞に加えて22に内皮血管系で表されます。しばしば血管系のEGFP蛍光は難しいCを検出することができますマクロファージ様細胞におけるカンジダ 。さらに、マクロファージ様細胞におけるEGFPの発現が困難検出すること18〜24時間感染後の周り削減になります。最近公開されたマクロファージ特異的トランスジェニックゼブラフィッシュラインはマクロファージの研究23のモデルとして多くの利点があります。
説明した感染手法は、ゼブラフィッシュで利用可能な強力な遺伝的および蛍光顕微鏡ツールの数にアントレを提供しています。それは、適切なトランスジェニック魚と人工C.と組み合わせることができますカンジダ Cを含む好中球とマクロファージの数を含む、宿主-病原体相互作用の多くの側面の定量化を有効にするアルビカンス、C.の周波数albicansの消化、 および Cの除算自然免疫細胞内のカンジダ 5。一つは、また感染5で個々の自然免疫系遺伝子の役割をテストするモルホリノアンチセンスオリゴヌクレオチドの使用で、このプロトコルを組み合わせることができます。
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Disclosures
利害の衝突が宣言されません。
Acknowledgments
著者らは、機器の胚の開発と利用をスピードアップについてのアドバイスのためにマイクロインジェクショントレーニング、クラリッサ·ヘンリー博士のキャロル·キムの研究室に感謝したい、とFLI1貢献するためのネイサンローソンう:EGFP魚。私たちは、原稿の重要な読書のためにウィーラーラボとショーン壁のメンバーに感謝します。また、このプロジェクトの技術的助言のために魚のケアとアドバイスをマークNilan、とライアンPhennicieとクリスティンガボールに感謝します。この作品は、K.ブラザーズ、MAFESハッチ助成E08913-08、およびR.ウィーラーにNIH NCRR賞P20RR016463にMAFES研究アシスタントシップによって資金を供給された。
Materials
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Spawning tanks | Aquatic habitats | 2L | |
1.7 mL tubes | Axygen | MCT-175-C | |
Instant Ocean | Fisher Scientific | S17957C | |
Extra deep Petri dishes | Fisher Scientific | 08-757-11Z | |
Standard Petri dishes | VWR Scientific | 25384-302 | |
Transfer pipettes | Fisher Scientific | 13-711-7M | |
Yeast Extract | VWR Scientific | 90000-726 | |
Peptone | VWR Scientific | 90000-264 | |
Dextrose | Fisher Scientific | D16-1 | |
Agar | VWR Scientific | 90000-760 | |
Disposable Hemocytometer | VWR Scientific | 82030-468 | |
Phosphate Buffered Saline | VWR Scientific | 12001-986 | |
Dumont Dumoxel Tweezers | VWR Scientific | 100501-806 | |
Wooden Dowels | VWR Scientific | 10805-018 | |
KimWipes | VWR Scientific | 300053-964 | |
Low Melt Agarose | VWR Scientific | 12001-722 | |
Agarose for injection dishes | VWR Scientific | 12002-102 | |
Flaming Brown Micropipette Puller | Sutter Instruments | P-97 | |
Hollow glass rods | Sutter Instruments | BF120-69-10 | For glass rods smooth glass by heating over bunsen burner |
Pipette Storage Box | Sutter Instruments | BX10 | |
MPPI-3 Injection system | Applied Scientific Instrumentation | MPPI-3 | |
Back Pressure Unit | Applied Scientific Instrumentation | BPU | |
Micropipette Holder kit | Applied Scientific Instrumentation | MPIP | |
Foot Switch | Applied Scientific Instrumentation | FSW | |
Micromanipulator | Applied Scientific Instrumentation | MM33 | |
Magnetic Base | Applied Scientific Instrumentation | Magnetic Base | |
Tricaine methane sulfonate | Western Chemical Inc. | MS-222 | |
Dissecting Scope | Olympus | SZ61 top SZX-ILLB2-100 base | |
Confocal Microscope | Olympus | IX-81 with FV-1000 laser scanning confocal system | |
TC-7 Tissue Culture Roller drum with 14 inch test tube wheel | New Brunswick Scientific | TC-7 | |
Imaging Dishes | MatTek Corporation | P24G-1.0-10-F | |
Pipette tips for loading needles | Eppendorf | 930001007 | |
Plate pouring grids | Adaptive Science Tools | TU-1 | |
Heated Stage | Bioptechs Inc. | Delta T-5 | |
Flat Spatula | VWR Scientific | 82027-486 | |
Plastic Sieves | Wares of Knutsford Online | 12 cm | |
Parafilm | VWR Scientific | 52858-000 | |
Vortex Genie | VWR Scientific | 14216-184 | |
16 x 150 mm Culture tubes | VWR Scientific | 60825-435 | |
Nanodrop | Thermo Scientific | ND 2000 | |
Phenol Red | VWR Scientific | 97062-478 | |
HCl | VWR Scientific | 87003-216 | |
NaCl | VWR Scientific | BDH4534-500GP | |
KCl | VWR Scientific | BDH4532-500GP | |
MgSO4 | VWR Scientific | BDH0246-500GP | |
Ca(NO3)2 | VWR Scientific | BDH0226-500GP | |
HEPES | VWR Scientific | BDH4520-500GP | |
Morpholinos | GeneTools, LLC |
References
- Trede, N. S., Langenau, D. M., Traver, D., Look, A. T., Zon, L. I. The use of zebrafish to understand immunity. Immunity. 20, 367-379 (2004).
- Kanther, M., Rawls, J. F. Host-microbe interactions in the developing zebrafish. Curr. Opin. Immunol. 22, 10-19 (2010).
- Meeker, N. D., Trede, N. S. Immunology and zebrafish: spawning new models of human disease. Dev Comp Immunol. 32, 745-757 (2008).
- Tobin, D., May, R. C., Wheeler, R. T. Zebrafish: a see-through host and fluorescent toolbox to probe host-pathogen interaction. PLoS Pathog. , (2011).
- Brothers, K. M., Newman, Z. R., Wheeler, R. T. Live imaging of disseminated candidiasis in zebrafish reveals role of phagocyte oxidase in limiting filamentous growth. Eukaryot. Cell. 10, 932-944 (2011).
- Pfaller, M. A., Diekema, D. J. Epidemiology of invasive candidiasis: a persistent public health problem. Clin. Microbiol. Rev. 20, 133-163 (2007).
- Ashman, R. B. Innate versus adaptive immunity in Candida albicans infection. Immunol. Cell Biol. 82, 196-204 (2004).
- de Repentigny, L. Animal models in the analysis of Candida host-pathogen interactions. Curr. Opin. Microbiol. 7, 324-329 (2004).
- Rogers, T. J., Balish, E. Immunity to Candida albicans. Microbiol. Rev. 44, 660-682 (1980).
- Calderone, R., Sturtevant, J. Macrophage interactions with Candida. Immunol. Ser. 60, 505-515 (1994).
- Frohner, I. E., Bourgeois, C., Yatsyk, K., Majer, O., Kuchler, K. Candida albicans cell surface superoxide dismutases degrade host-derived reactive oxygen species to escape innate immune surveillance. Mol. Microbiol. 71, 240-252 (2009).
- Kumamoto, C. A., Vinces, M. D. Contributions of hyphae and hypha-co-regulated genes to Candida albicans virulence. Cell Microbiol. 7, 1546-1554 (2005).
- Lorenz, M. C., Bender, J. A., Fink, G. R. Transcriptional response of Candida albicans upon internalization by macrophages. Eukaryot. Cell. 3, 1076-1087 (2004).
- Rubin-Bejerano, I., Fraser, I., Grisafi, P., Fink, G. R. Phagocytosis by neutrophils induces an amino acid deprivation response in Saccharomyces cerevisiae and Candida albicans. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 100, 11007-11012 (2003).
- Behnsen, J. Environmental dimensionality controls the interaction of phagocytes with the pathogenic fungi Aspergillus fumigatus and Candida albicans. PLoS Pathog. 3, e13 (2007).
- Lavigne, L. M. Integrin engagement mediates the human polymorphonuclear leukocyte response to a fungal pathogen-associated molecular pattern. J. Immunol. 178, 7276-7282 (2007).
- Newman, S. L., Bhugra, B., Holly, A., Morris, R. E. Enhanced killing of Candida albicans by human macrophages adherent to type 1 collagen matrices via induction of phagolysosomal fusion. Infect. Immun. 73, 770-777 (2005).
- Netea, M. G., Brown, G. D., Kullberg, B. J., Gow, N. A. An integrated model of the recognition of Candida albicans by the innate immune system. Nat. Rev. Microbiol. 6, 67-78 (2008).
- Lam, S. H., Chua, H. L., Gong, Z., Lam, T. J., Sin, Y. M. Development and maturation of the immune system in zebrafish, Danio rerio: a gene expression profiling, in situ hybridization and immunological study. Dev. Comp. Immunol. 28, 9-28 (2004).
- Magnadottir, B. Innate immunity of fish (overview). Fish Shellfish Immunol. 20, 137-151 (2006).
- Sullivan, C., Kim, C. H. Zebrafish as a model for infectious disease and immune function. Fish Shellfish Immunol. 25, 341-350 (2008).
- Lawson, N. D., Weinstein, B. M. In vivo imaging of embryonic vascular development using transgenic zebrafish. Dev. Biol. 248, 307-318 (2002).
- Ellett, F., Pase, L., Hayman, J. W., Andrianopoulos, A., Lieschke, G. J. mpeg1 promoter transgenes direct macrophage-lineage expression in zebrafish. Blood. 117, e49-e56 (2011).
- Renshaw, S. A. A transgenic zebrafish model of neutrophilic inflammation. Blood. 108, 3976-3978 (2006).
- Lesley, R., Ramakrishnan, L. Insights into early mycobacterial pathogenesis from the zebrafish. Curr Opin. Microbiol. 11, 277-283 (2008).
- Chao, C. C. Zebrafish as a model host for Candida albicans infection. Infect. Immun. 78, 2512-2521 (2010).
- Kimmel, C. B., Ballard, W. W., Kimmel, S. R., Ullmann, B., Schilling, T. F. Stages of embryonic development of the zebrafish. Dev Dyn. , 203-253 (1995).
- Cianciolo Cosentino, C., Roman, B. L., Drummond, I. A., Hukriede, N. A. Intravenous Microinjections of Zebrafish Larvae to Study Acute Kidney Injury. J. Vis. Exp. (42), e2079 (2010).
- Haddon, C., Lewis, J. Early ear development in the embryo of the zebrafish, Danio rerio. J. Comp. Neurol. 365, 113-128 (1996).
- Yuan, S., Sun, Z. Microinjection of mRNA and Morpholino Antisense Oligonucleotides in Zebrafish Embryos. J. Vis. Exp. (27), e1113 (2009).
- Rosen, J. N., Sweeney, M. F., Mably, J. D. Microinjection of Zebrafish Embryos to Analyze Gene Function. J. Vis. Exp. (25), e1115 (2009).
- Ariga, J., Walker, S. L., Mumm, J. S. Multicolor Time-lapse Imaging of Transgenic Zebrafish: Visualizing Retinal Stem Cells Activated by Targeted Neuronal Cell Ablation. J. Vis. Exp. (43), e2093 (2010).
- Redd, M. J., Kelly, G., Dunn, G., Way, M., Martin, P. Imaging macrophage chemotaxis in vivo: studies of microtubule function in zebrafish wound inflammation. Cell Motil. Cytoskeleton. 63, 415-422 (2006).
- Gutzman, J. H., Sive, H. Zebrafish Brain Ventricle Injection. J. Vis. Exp. (26), e1218 (2009).
- Davis, J. M. Real-time visualization of mycobacterium-macrophage interactions leading to initiation of granuloma formation in zebrafish embryos. Immunity. 17, 693-702 (2002).
- Meijer, A. H. Identification and real-time imaging of a myc-expressing neutrophil population involved in inflammation and mycobacterial granuloma formation in zebrafish. Dev. Comp. Immunol. 32, 36-49 (2008).
- Mathias, J. R. Live imaging of chronic inflammation caused by mutation of zebrafish Hai1. J. Cell Sci. 120, 3372-3383 (2007).
- Hall, C., Flores, M. V., Storm, T., Crosier, K., Crosier, P. The zebrafish lysozyme C promoter drives myeloid-specific expression in transgenic fish. BMC Dev. Biol. 7, 42 (2007).
- Vergunst, A. C., Meijer, A. H., Renshaw, S. A., O'Callaghan, D. Burkholderia cenocepacia creates an intramacrophage replication niche in zebrafish embryos, followed by bacterial dissemination and establishment of systemic infection. Infect Immun. 78, 1495-1508 (2010).
- Le Guyader, D. Origins and unconventional behavior of neutrophils in developing zebrafish. Blood. 111, 132-141 (2008).
- Clatworthy, A. E. Pseudomonas aeruginosa infection of zebrafish involves both host and pathogen determinants. Infect. Immun. 77, 1293-1303 (2009).
- Brannon, M. K. Pseudomonas aeruginosa Type III secretion system interacts with phagocytes to modulate systemic infection of zebrafish embryos. Cell Microbiol. 11, 755-768 (2009).
- Levraud, J. P. Real-time observation of listeria monocytogenes-phagocyte interactions in living zebrafish larvae. Infect. Immun. 77, 3651-3660 (2009).
- van der Sar, A. M. Zebrafish embryos as a model host for the real time analysis of Salmonella typhimurium infections. Cell Microbiol. 5, 601-611 (2003).
- Phennicie, R. T., Sullivan, M. J., Singer, J. T., Yoder, J. A., Kim, C. H. Specific resistance to Pseudomonas aeruginosa infection in zebrafish is mediated by the cystic fibrosis transmembrane conductance regulator. Infect Immun. 78, 4542-4550 (2010).
- Prajsnar, T. K., Cunliffe, V. T., Foster, S. J., Renshaw, S. A. A novel vertebrate model of Staphylococcus aureus infection reveals phagocyte-dependent resistance of zebrafish to non-host specialized pathogens. Cell Microbiol. 10, 2312-2325 (2008).