Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Biology

Generasjon, rensing og karakterisering av Cell-invasive Disc1 Protein Arter

Published: August 30, 2012 doi: 10.3791/4132

Summary

Produksjon, rensing og celle invasjon av intracellulære, cytoplasmatiske full lengde Disc1 protein aggresomes fra cellekulturer og en merket, multimeric rekombinant DISC1 protein fragment i

Abstract

Proteinaggregering ses som en generell kjennetegn av kroniske, degenerative hjernen forhold som for eksempel i de neurodegenerative sykdommer Alzheimers sykdom (Aβ, tau), Parkinsons sykdom (α-synuclein), Huntingtons sykdom (polyglutamine, huntingtin), og andre. Proteinaggregering antas å oppstå på grunn av forstyrret proteostasis, dvs. ubalanse mellom oppstår og nedbrytning av misfolded proteiner. Av notatet, er de samme proteinene funnet aggregert i sporadiske former av disse sykdommene som er mutant i sjeldne varianter av familiære former.

Schizofreni er en kronisk progressiv hjernen tilstand som i mange tilfeller går sammen med en permanent og irreversibel kognitiv underskudd. I en kandidat genet tilnærming, undersøkte vi hvorvidt Forstyrret-in-schizofreni 1 (DISC1), et gen klonet i en skotsk familie med ledd til kronisk mental sykdom 1, 2, kan bli funnet som uoppløselige aggregater i Brain av sporadiske tilfeller av schizofreni 3. Bruke SMRI CC, identifiserte vi i ca 20% av tilfellene med CMD, men ikke normale kontrollpersoner eller pasienter med nevrodegenerative sykdommer sarkosyl-uløselig DISC1 immunoreaktivitet etter biokjemisk fraksjonering. Senere studier in vitro viste at aggregering tilbøyelighet DISC1 ble påvirket av sykdomsassosierte polymorfisme S704C 4, og at Disc1 aggresomes generert in vitro var celle-invasiv 5, i likhet med hva hadde blitt vist for Aβ 6, 7-9 tau, α 10-synuclein, 11 polyglutamine eller SOD1 aggregater 12. Disse funnene bedt oss om å foreslå at minst en undergruppe av tilfellene med CMD, kan de med aggregert DISC1 være protein konformasjonsforandringer lidelser.

Her beskriver vi hvordan vi genererer Disc1 aggresomes i pattedyrceller, rense dem på en sukrosegradient og bruke dem for celle-invasivitet studies. Tilsvarende beskriver vi hvordan vi genererer en utelukkende multimeric C-terminal DISC1 fragment, etikett og rense det for celle invasivitet studier. Bruke rekombinante multimerer av DISC1 oppnår vi lignende celle invasivitet som for en tilsvarende merket syntetisk α-synuclein fragment. Vi viser også at dette fragment blir tatt opp i vivo når stereotactically injisert i hjernen mottakerland dyr.

Protocol

1. Utarbeidelse av Aggresome Donor Cells: Transfeksjon monomere Red fluorescerende protein (mRFP) eller Enhanced grønt fluorescerende protein (eGFP)-merket Humant full lengde (FL) DISC1

  1. Seed 1.5 x 10 6/10 cm parabol menneskelig neuroblastom NLF (NLF, Children Hospital of Philadelphia, Philadelphia, Pennsylvania) celler i ti 10 cm retter og vokse over natten. NLF celler dyrket i RPMI-1640 medium supplert med 10% FBS, penicillin / Strepomycin, L-Glutamin. Neste dag, bør cellene være på 70-80% sammenflyting.
  2. Forbigående transfektere hver 10 cm tallerken med 15 mikrogram plasmid DNA og Metafectene transfeksjon reagens (Biontex, Martinsried, Tyskland). I korthet, for en 10 cm parabol, ble 15 ug plasmid-DNA og 30 pl tilsatt til Metafectene 750 pl Opti-MEM, blandet og inkubert ved RT i 20 min. 5 retter ble tilført pcDNA3.1 mRFP / eGFP-merket Human (FL) Disc1 og 5 retter med eGFP-plasmid alene.

2. AggresomeRensing fra transfekterte Donor Cells

Protokollen er beskrevet her er en kombinasjon av en fremgangsmåte for å rense Lewy-organer fra hjernevev 13 og en protokoll for å isolere store aggregater og aggresomes 14. Siden allerede eksisterende metoder er basert på bruken av vaskemidler, isolering av vaskemiddel-fri protein for anvendelse i celle-invasivitet analysene er kritisk.

  1. 48 hr etter transfeksjon, overvåke ekspresjon av eGFP og mRFP/eGFP-DISC1 og bekrefte dannelsen av aggresomes under et fluorescensmikroskop (Figur 1).
  2. Vask cellene med PBS pH 7,4, skrape med 400 pl PBS hver, legge 1X Protease Inhibitor cocktail (Roche, Indianapolis, IN) og forstyrre cellene ved hjelp av en Precellys24 homogenisator (Bertin Technologies, Frankrike). Kort, tilsett 1 ml cellesuspensjon til en 2 ml lysis rør og tilsett 10 keramiske perler. Lysere cellene med 3 x 60 sek pulser. Den mekaniske kraft-prosessen kanøke temperaturen i prøven over 37 ° C slik at forsiktighet bør tas til chill prøven på isen etter lysis prosedyren.
  3. Avkjøl cellene på is og tilsett 10 mM 2 MgCl, 40 U / ml DNase A og inkuber i 60 min ved 37 ° C
  4. Forbered løsninger av 80%, 50%, 20% sukrose (vekt / volum) i PBS pH 7,4 (10 ml hver gang).
  5. Klargjør sukrosegradient i et 15 ml falk tube, som starter med 2 ml 80% sukrose, etterfulgt av 50% og 20%. Hell gradient langsomt og være forsiktig for ikke å forstyrre allerede strømmet lag. Lag fordøyd lysatet på toppen av gradienten og sentrifuger i 15 minutter ved 1000 xg ved 4 ° C.
  6. Nøye samle interfase mellom 50-80% sukrose laget med en pipette og bland med 5 volumdeler PBS pH 7,4. Sentrifuger i 15 minutter ved 1000 xg ved 4 ° C. Gjenta vaske ytterligere to ganger. I denne interfase, aggresomes er fluorescerende og kan visualiseres i et mikroskop under UV lys.
  7. Kast supernatanten ogresuspender pelleten i 250-500 pl PBS pH 7,4. En slik pellet inneholder rensede aggresomes (figur 2).

3. Behandling av Mottaker SH-SY5Y Cells med mRFP/eGFP-DISC1 Aggresomes

  1. Seed 5 x 10 4 mottaker SH-SY5Y humane neuroblastom celler konstitutivt uttrykker GFP-DISC1 (598-854) på sterile glass dekkglass i hver brønn av en 24 brønns plate. SH-SY5Y celle dyrkes i DMEM/F-12 medium supplert med penicillin / streptomycin, ikke-essensielle aminosyrer (NEAA) og 10% FBS.
  2. 24 hr senere, tilsett 10 pl til hver brønn og inkuberes i 48 til 72 timer.
  3. Vask cellene 3 x med PBS pH 7,4 og slukke ekstracellulær fluorescens med 0,04% Trypan Blue for 5 min.
  4. Fikser cellene med 4% PFA i PBS pH 7,4 i 10 min på is, vaskes én gang med sterilt H2O og montere dekkglass på glassplater med forlenge Gull med DAPI monteringsmedium (Invitrogen, USA).
  5. Bekreft opptak /invasjon av eksogent anvendt aggresomes av colocalization med rekruttert proteiner uttrykt av mottaker celler i Z-stack bilder.

Likevel, kanskje opptak / invasjon av eksogene protein ikke vesentlig bli oppdaget parallelt med rekruttering av vertscellen protein. I vårt eksempel mRFP-merket DISC1 aggresomes rekruttere løselig GFP-merket DISC1 (598-854) protein uttrykt av vertscellen (se figur 3). Bildene ble tatt på en Zeiss LSM 510 confocal-eller Zeiss Axiovision Apotome2 mikroskop.

4. Generasjon av rekombinant DISC1 (598-785)

I en tidligere publikasjon analyserte vi muligheten av ulike Disc1 proteinfragmenter til selv-samhandle basert på tilstedeværelsen av selv-forening domener. Blant alle protein fragmenter testet menneskelig DISC1 (598-785) som viste sterkest multimerization tilbøyelighet 4 (figur 4). Derfor ble menneske DISC1 (598-785) klonet inn pET15b (NoVågen, Madison, Wisconsin) inneholdende et N-terminal 6-histidin tag, uttrykt i E. coli BL21-(lDE3) Rosetta (Novagen, USA), og renset i henhold denaturing forhold i 8 mol / l urea som beskrevet fire. Kort sagt, er protokollen som er beskrevet nedenfor.

  1. BL21-(IDE3) Rosetta E. coli ble dyrket i 2 x 500 ml 2YT inneholdende 5 mM-arginin-HCl, 5 mM MgSO4, 100 ug / ml carbencillin, 35 ug / ml kloramfenikol opptil en OD 600: 0,6 til 0,8 og DISC1 (598-785) uttrykk ble indusert med 1 mM IPTG.
  2. DISC1 (598-785) ble uttrykt i 4 timer ved 37 ° C ble uttrykket terminert ved å høste bakteriene ved sentrifugering.
  3. Den bakterielle pellet ble resuspendert i 50 ml TE-buffer (50 mM Tris-HCl pH 8,0, 5 mM EDTA) pluss 2 mM PMSF, 1% TX-100, 250 pg / ml lysozym, 20 mM MgCl 2 og 400 U/50 ml DNase I. For å sikre fullstendig lysis, ble reaksjonsblandingen inkubert i 30 minutter ved RT med forsiktig omrøring.
  4. Tilsett 10 mM β-mercaptoethanol (ME) og 500 mM NaCl og inkuber for en annen 30 min.
  5. Spinne ned bakterielle inklusjonslegemer ved 20,000 g i 30 minutter ved 4 ° C.
  6. Gjensuspender pellet i 50 ml utvinning buffer inneholdende 50 mM Tris pH 8,0, 5 mM imidazol, 500 mM NaCl, 8 M urea og 10 mM β-ME og fjerne rusk ved sentrifugering ved 20,000 g i 30 minutter ved 4 ° C.
  7. Vask Ni-NTA agarose matrise med utvinning buffer. Inkuber resuspenderte, precleared proteinekstrakt med Ni-NTA matrise i 2 timer ved RT.
  8. Vask Ni-NTA-matrise med utvinning buffer inneholdende 12 mM imidazol.
  9. Eluer proteinet langsomt med 15 ml elueringsbuffer inneholdende 50 mM Tris, 500 mM NaCl, 300 mM imidazol, 8 M urea, 1 mM PMSF, 5 mM EDTA og 10 mM β-ME.
  10. Dialyser proteinet trinnvis til PBS pH 7,4 inneholdende 10 mM β-ME.

Fra 1 L bakteriell start kultur er det mulig å isolere opp til 50 mg rekombinant DISC1 (598-785) ProtEin.

α-synuclein refolding

For eksperimenter med α-synuclein, 500 ug av det rekombinante protein (Sigma-Aldrich, USA) ble oppløst i PBS ved en konsentrasjon på 1 mg / ml. For å oppnå oligomerer, er refolding utført over natten ved 37 ° C som beskrevet i en tidligere publikasjon 10.

5. Merking av rekombinant DISC1 (598-785) med DyLight594

  1. Før den påfølgende merking prosessen, DISC1 (598-785) protein har bli frigjort fra β-ME. Derfor er proteinet dialysert 3 ganger til PBS pH 7,4 ved en fortynning på 1:2,000.
  2. Etiketten 1 mg DISC1 (598-785) med DyLight 594 maleimid (Thermo Scientific, USA) i henhold til produsentens instruksjoner. Kort sagt, oppløse 1 mg / ml protein i PBS pH 7,4 og tilsett 5 mM TCEP å gjenopprette frie tiolgrupper. Tilsett 20 pl av DMF oppløst fargestoff til reaksjonsblandingen og inkuber i 2 timer ved romtemperatur.
  3. Dialyser proteinet 3 x til PBS pH7,4 i et forhold på 1:2000 i 2 timer hver.

For ytterligere å øke renheten av den merkede protein en sin 6-tagget baserte affinitet-rensing på en Ni-NTA kolonne utføres.

  1. Vask 1 ml Ni-NTA-matrise (Qiagen, Tyskland) med 10 ml PBS pH 7,4.
  2. Påfør merket, dialyserte protein til kolonnen og la den gå over kolonnen sakte.
  3. Vask proteinet med 3 x 20 ml PBS pH 7,4
  4. Eluer proteinet med PBS pH 7,4, 500 mM imidazol dråpevis mens overvåke farget bånd på Ni-NTA-kolonnen for å redusere eluatet volum.
  5. Dialyser eluatet 3 x til 10 mM NaPi, pH 7,4 ved en fortynning på 1:2000 i 2 timer hver.
  6. Bruk en steril 0,45 mikrometer sprøyte filter for å filtrere eluatet, alikvoter i 5 x 100 ul prøver og snap fryse i flytende nitrogen. Den totale mengden av protein bør være 0,5 til 1 pg / ml i hver 100 pl alikvot.

valgfri konsentrasjonerasjon trinn

  1. For stereotactical rotte injeksjoner, ble proteinet konsentrert 10-fold i en speed-vac (Eppendorf konsentrator 5301). Den endelige buffer tilstand var 100 mM NaPi.

α-synuclein Merking

Merking og rensing (Ni-NTA kolonne) av det rekombinante α-synuclein ble utført parallelt med DISC1 (598-785). Den totale utgangsmateriale var 500 ug i stedet for 1 mg for DISC1 (598-785).

6. Behandling av Mottaker SH-SY5Y Cells med Merket Rekombinant DISC1 (598-785) Protein

  1. Seed 5x10 4 mottaker SH-SY5Y humane neuroblastom celler konstitutivt uttrykker GFP-DISC1 (598-854) på sterile glass dekkglass i hver brønn av en 24 brønns plate.
  2. Legg merket protein til cellekulturmediet i en konsentrasjon på 5-10 ug / ml og inkuberes i 48 til 72 timer.
  3. Vask cellene 3 x med PBS pH 7,4 og slukke utsuellular fluorescens med 0,04% Trypan Blue for 5 min.
  4. Fikser cellene med 4% PFA i PBS pH 7,4 i 10 min på is, vaskes én gang med sterilt H2O og montere dekkglass på glassplater med forlenge Gull med DAPI monteringsmedium (Invitrogen, USA).
  5. Bekreft opptak / invasjonen av eksogent påført rekombinant protein av colocalization med rekruttert proteiner uttrykt av mottaker celler i Z-stack bildene som genereres av laserskanning konfokalmikroskopi. Likevel kan rekruttering av endogent protein ikke vesentlig påvises parallelt med invasjon av vertscelle protein, kan Z-stack bildene fortsatt bekrefte invasiv natur av proteinet.

I vårt eksempel rec. DISC1 (598-785) * i det minste delvis rekrutter løselig GFP-merket DISC1 (598-854) protein uttrykt av vertscellen (se figur 5A). For rekombinant α-synuclein invasjon men ingen rekruttering vises (fig. 5B). Bildene ble tattpå en Zeiss LSM 510 confocal-eller Zeiss Axiovision Apotome2 mikroskop.

Injeksjon av den konsentrerte (ca. 4 pl 2,5 ug / ul), merket DISC1 (598-785) * i mPFC resultater i spredning av proteinet rundt injeksjonsstedet som kan detekteres selv etter perfusjon av dyret med 4% PFA i PBS pH 7,4 med en rhodamin filterset. I vårt eksempel DISC1 (598-785) er tatt opp av en distinkt antall nevroner og kan overvåkes med Z-stack bildebehandling (figur 6).

Generelt, gjør injeksjon av proteiner andre da de brukes her ikke nødvendigvis føre til celle-invasjonen. Invasjonen arrangementet er svært avhengig av arten av protein, er likevel en ren rensing en forutsetning for videre analyse.

7. Representant Resultater

Aggresomes bestående av rekombinant FL DISC1-eGFP renset fra NLF celler invadert mottaker SH-SY5Y ceLLS ved lav effektivitet (ca 0,3% 5) som sett av colocalization med konfokalmikroskopi (figur 3). Som tidligere rapportert, DISC1 (598-785) uttrykt og renset fra E. coli dannet multimerer 4 var like celle-invasiv ved en effektivitet på ca 20% 5 (figur 5A) lik som α-synuclein som ble brukt i parallell som positiv kontroll (figur 5B). Merket rekombinant DISC1 (598-785) uttrykt og renset fra E. coli var også celle-invasiv til nevroner i vivo når multimeric protein ble stereotactically injiseres i mediale prefrontal cortex av en rotte (figur 6, Pum, Bader, Huston, Korth, upublisert).

Figur 1
Figur 1. NLF neuroblastom celler forbigående uttrykk FP-DISC1 (rød). Røde fluorescerende aggresomes kan være Detected i cellene.

Figur 2
Figur 2. Renset mRFP-merket Disc1 aggresomes etter rensing i en sukrosegradient.

Figur 3
Figur 3. Fluorescent bilde av invaderte aggresomes. mRFP-merket flDISC1 aggresomes ble renset og inkubert med SH-SY5Y neuroblastom celler overekspresjon løselig GFP-merket DISC1 (598-854). Et opptak av merket aggresomes overvåkes av Z-stack bildebehandling på en Laser-Scan mikroskop (Zeiss LSM 510).

Figur 4
Figur 4. SEC-profilen rec. DISC1 (598-785) som inneholder S704 og C704 single nukleotid polymorfismer (SNP). Begge variantene viser en forstyrrelse av bestilte oligomerisering og dannelsen av høy molekylvekt multimers (rød pil). Dette bildet er endret fra og med publiseringen av Leliveld et al., 2009 biokjemi.

Figur 5
Figur 5. Fluorescent Z-stack bilde av invasiv DyLight-merket rekombinant DISC1 (598-785). SH-SY5Y neuroblastom celler uttrykker oppløselig GFP-DISC1 (598-854) ble inkubert med merket, rekombinant protein ved en konsentrasjon på 5 ug / ml. (A) Red aggregater viser invasjonen av rec. DISC1 (598-785) protein og gule prikkene indikerer en rekruttering av løselig GFP-DISC1 (598-854) i aggregater. (B) Rekombinant α-synuclein (rød) invaderer celler uten rekruttering med en frekvens på ca 20%. Klikk her for å se større figur .

Figur 6
Figur 6. Immunofluorescerende bilde avinjisert merket, rekombinant DISC1 (598-785) protein. Z-stack bildebehandling bekrefter tilstedeværelsen av rec. DISC1 (598-785) protein i rotte kortikale nevroner farget med et antistoff mot neuronal kjerner (Neun, grønn).

Discussion

I denne studien vil vi beskrive rensing av mRFP/eGFP-DISC1 aggresomes fra en transfekterte neuroblastom celle linje, forberedelse og merking av et rekombinant Disc1 protein arter og deres anvendelse i celle-invasjon eksperimenter mottakerlandenes celler in vitro og in vivo.

Rensing av native mRFP/eGFP-DISC1 aggresomes ble utviklet fra protokoller å isolere Lewy body-lignende strukturer og større aggregater 13, 14, men modifisert for å unngå bruk av vaskemidler og for å minimere risikoen for falske positive celle-invasjon som kan oppstå på grunn av vaskemiddel-tilrettelagt membran penetrasjon.

En mulig fremtidig forbedring kan være i å ytterligere øke renheten av aggresomes etter sonikering til helt separate gjenværende membraner og cytoskjelettet fra aggresomes. Ved å øke samlet renhet, antall totale invasjon hendelser som registreres for store aggresomes may økes 5. Hvorvidt den begrensede definisjonen av vårt forslag 3-faset sukrose er tilstrekkelig for aggresomes av andre protein arter må prøves, i denne forstand protokollen beskrevet her skal betraktes som et utgangspunkt for individuell optimalisering. Den rensede aggresomes viste seg å være ganske robust i våre hender, ekstra vask trinn (uten vaskemiddel) for å eliminere spor av sukrose ikke signifikant reduserer den totale avkastningen.

I en tidligere publikasjon beskrev vi at oligomer montering av DISC1 avhenger distinkte multimerization domener i C-terminus 4 (figur 4). Vi valgte denne fragment for rekombinant løselig uttrykk i E. coli og påfølgende og Ni-NTA rensing. Å overvåke multimerization og sammenligne sin celle invasivitet med en beskrevet celle-invasiv protein som α-synuclein, merket vi DISC1 (598-785) med fluorescerende fargestoff DyLight594, og sammenlignet sincelle-invasivitet med at av like merket α-synuclein. Cellen-invasivitet av rekombinante DISC1 fragmentet ble dramatisk økt sammenlignet med native, full lengde Disc1 aggresomes, sannsynligvis på grunn av sin mindre størrelse, og mye høyere renhet. Igjen synes renhet til å spille en avgjørende rolle i celle-invasivitet.

I vårt eksempel de invasive aggresomes rekruttert løselig homolog protein av målet cellelinje som ble rekombinant uttrykt i en løselig, dvs. celle-dispergert form. Uttrykk for en fluorescerende protein (f.eks GFP eller RFP) i mottakeren cellelinjen er en fordel siden den tillater colocalization av invasive aggresomes og rekombinante proteiner innenfor mottakercellen grensen via Z-stack bildebehandling.

Cell-invasive Disc1 aggresomes og multimeric fragmenter uttrykt og renset fra E. coli kan være et definerende trekk av et protein konformasjonsforandringer sykdommer knyttet til DISC1, DISC1opathies 15.

FEILSØKING:

Lav aggresome yield etter sukrosegradient rensing:

Den sukrosegradient introdusert i denne protokollen fungerer godt med eGFP/mRFP-DISC1 (FL) aggresomes. Aggresomes bestående av andre proteiner kan være av variable dimensjoner derfor sukrosen konsentrasjoner bør optimaliseres av andre brukere.

Utilstrekkelig rensing av rekombinant protein:

Eventuelle bakterielle forurensninger i renseprosessen av det rekombinante protein vil også merkes i senere trinn av protokollen. Å unngå forurensninger, kjøre protein på en SDS-PAGE og bekreft at det rekombinante protein er minst 95% rent ved farging med Coomassie-blå. For å sikre høy kvalitet og kapasitet, har protokollen for å være optimalisert for hver enkelt protein.

Lav merking efficiency av rekombinante proteiner:

Eventuelle forurensninger som inneholder frie SH-grupper vil redusere effektiv merking av proteinet. Derfor er omfattende dialyse og Ni-NTA basert rensing obligatorisk.

Disclosures

Ingen interessekonflikter erklært.

Acknowledgments

Dette arbeidet ble finansiert av Neuron-Eranet oppdage (BMBF 01EW1003) til CK og JPH, DFG (Ko 1679/3-1, GRK1033) til CKVB er støttet av en bevilgning på Forschungskommission av Det medisinske fakultet ved Universitetet i Düsseldorf.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
RPMI 1640 Invitrogen 11875-093 Medium is dependent on the host cell line. The optimal recipient cell line should be determined by the user.
DMEM/F-12 Invitrogen 11320-033 Medium is dependent on the recipient cell line. The optimal recipient cell line should be determined by the user.
PBS Invitrogen 14190-250
Metafectene Biontex T020-1.0 Other transfection reagents might work as well but were not tested with our protocol.
Ni-NTA agarose Qiagen 30210 The experiments were done with Ni_NTA agarose from Qiagen, other suppliers should work as well.
DNase I Roche 04716728001 There is no need for RNase free DNase in the process of aggresomes purification.
Sucrose Sigma-Aldrich S0389
Opti-MEM Invitrogen 31985-062 Serum-free medium works as well
Penicillin/Streptomycin Invitrogen 15140122 Supplement for SH-SY5Y and NLF medium
Non-essential-amino-acids (NEAA) Sigma-Aldrich M7145 Supplement for SH-SY5Y medium
Trypan Blue 0.4% Sigma-Aldrich T8154 Toxic reagent
DyLight 594 Maleimide Thermo-Fisher Scientific 46608 Reduced cysteine reactive dye to form stable thi–ther bonds. Also available in other colors.
ProLong Gold with DAPI Invitrogen P36935 This antifade liquid mountant gave superior results in our hands.
Protease Inhibitor cocktail Roche 11873580001 Dissolve 1 table in 500 μl H2O for 100X solution.
Synthetic a-synuclein Sigma S7820 Refold as described in text.
Table of specific reagents.
Precellys 24 Bertin Technologies 03119.200.RD000 We have not tested other mechanical homogenizers other than this. Other detergent free homogenization method might work as well, but have not been tested for this protocol.
5301 Concentrator (speedvac) Eppendorf 5301 000.210 Only necessary if protein has to be concentrated.
LSM 510 and Axiovision Apotome2 Zeiss See manufacturers catalog Both microscopes harbor the ability to perform Z-stack imaging. This is a prerequisite for solid and serious evaluation of invasion events.
Cell culture plastic material Nunc 10 cm dishes #172958, 24-well plates #142475 The use of different plastic material might influence the interaction of recombinant proteins or aggresomes and the plastic surfaces. We have not tested materials other than the ones described here.
Table of specific material and equipment.
Number Buffer name content Comments
1. Bacterial growth medium 16 g/l Bacto Tryptone, 10 g/l Bacto Yeast extract, 5 g/l NaCl, 5 mM-arginine-HCl, 5mM MGSO4, 100 μg/ml carbencillin, 35 μg/ml chloramphenicol Grow bacteria to OD600: 0.6-0.8 induce expression with 1 mM IPTG.
2. Bacterial resuspension buffer 50 mM TRIS-HCl pH 8.0, 5 mM EDTA, 2 mM PMSF, 1% TX-100, 250 μg/ml lysozyme, 20 mM MgCl2 and 400 U/50 ml DNase I Resupend bacterial pellet from 1 L overnight culture in 50 ml resuspension buffer.
3. Protein extraction buffer 50 mM Tris pH 8.0, 5 mM imidazole, 500 mM NaCl, 8 M urea and 10 mM b-ME
4. Ni-NTA column wash buffer 50 mM Tris pH 8.0, 5 mM imidazole, 500 mM NaCl, 8 M urea and 10 mM b-ME, 12 mM imidazole Modified extraction buffer with 12 mM imidazole added.
5. Ni-NTA column elution buffer 50 mM Tris, 500 mM NaCl, 300 mM imidazole, 8 M urea, 1 mM PMSF, 5 mM EDTA and 10 mM b -ME The elution buffer contains 10 mM b -ME, which is dialyzed later on.
6. PBS 8 g/l NaCl, 0.2 g/l KCl, 1.44 g/l Na2HPO4, 0.24 g/l KH2PO4, adjust to pH 7.4
7. Labeling buffer PBS containing 5 mM TCEP
Table of recipes.

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Millar, J. K. Disruption of two novel genes by a translocation co-segregating with schizophrenia. Hum. Mol. Genet. 9, 1415-1423 (2000).
  2. St Clair, D. Association within a family of a balanced autosomal translocation with major mental illness. Lancet. 336, 13-16 (1990).
  3. Leliveld, S. R. Insolubility of disrupted-in-schizophrenia 1 disrupts oligomer-dependent interactions with nuclear distribution element 1 and is associated with sporadic mental disease. J. Neurosci. 28, 3839-3845 (2008).
  4. Leliveld, S. R. Oligomer assembly of the C-terminal DISC1 domain (640-854) is controlled by self-association motifs and disease-associated polymorphism S704C. Biochemistry. 48, 7746-7755 (2009).
  5. Ottis, P. Convergence of two independent mental disease genes on the protein level: recruitment of dysbindin to cell-invasive disrupted-in-schizophrenia 1 aggresomes. Biol. Psychiatry. 70, 604-610 (2011).
  6. Meyer-Luehmann, M. Exogenous induction of cerebral beta-amyloidogenesis is governed by agent and host. Science. 313, 1781-1784 (2006).
  7. Frost, B., Jacks, R. L., Diamond, M. I. Propagation of tau misfolding from the outside to the inside of a cell. J. Biol. Chem. 284, 12845-12852 (2009).
  8. Frost, B., Ollesch, J., Wille, H., Diamond, M. I. Conformational diversity of wild-type Tau fibrils specified by templated conformation change. J. Biol. Chem. 284, 3546-3551 (2009).
  9. Clavaguera, F. Transmission and spreading of tauopathy in transgenic mouse brain. Nat. Cell Biol. 11, 909-913 (2009).
  10. Desplats, P. Inclusion formation and neuronal cell death through neuron-to-neuron transmission of alpha-synuclein. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 106, 13010-13015 (2009).
  11. Ren, P. H. Cytoplasmic penetration and persistent infection of mammalian cells by polyglutamine aggregates. Nat. Cell Biol. 11, 219-225 (2009).
  12. Munch, C., O'Brien, J., Bertolotti, A. Prion-like propagation of mutant superoxide dismutase-1 misfolding in neuronal cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 108, 3548-3553 (2011).
  13. Iwatsubo, T. Purification and characterization of Lewy bodies from the brains of patients with diffuse Lewy body disease. Am. J. Pathol. 148, 1517-1529 (1996).
  14. Meriin, A. B., Wang, Y., Sherman, M. Y. Isolation of aggresomes and other large aggregates. Curr. Protoc. Cell Biol. Chapter 3, 1-9 (2010).
  15. Korth, C. DISCopathies: brain disorders related to dysfunctional DISC1. Rev. Neurosci. 20, 321-330 (2009).

Tags

Molecular Biology nevrovitenskap medisin genetikk Protein samlet aggresome celle invasivitet protein konformasjonsforandringer sykdom DISC1 DISC1opathy rensing rekombinant protein multimerization protein merking hjerne rotte nevrovitenskap
Generasjon, rensing og karakterisering av Cell-invasive Disc1 Protein Arter
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Bader, V., Ottis, P., Pum, M.,More

Bader, V., Ottis, P., Pum, M., Huston, J. P., Korth, C. Generation, Purification, and Characterization of Cell-invasive DISC1 Protein Species. J. Vis. Exp. (66), e4132, doi:10.3791/4132 (2012).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter