Abstract
Гем служит простетической группы для широкого спектра белков, известных как гемопротеинов, таких как гемоглобин, миоглобин и цитохромы. Он участвует в различных молекулярных и клеточных процессах, таких как генной транскрипции, трансляции, клеточной дифференцировке и пролиферации клеток. Уровни биосинтеза гема варьироваться в зависимости от различных тканей и типов клеток и изменяется в болезненных состояниях, таких как анемия, невропатии и рака. Эта методика использует [4- 14С] 5-аминолевулиновой кислоты ([14С] 5-АЛК), один из ранних предшественников в пути биосинтеза гема, чтобы измерить уровни синтеза гема в клетках млекопитающих. Этот анализ включает в себя инкубации клеток с [14 C] 5-ALA с последующим экстрагированием гема и измерения радиоактивности, включенного в гема. Эта процедура является точной и быстрой. Этот метод измеряет относительные уровни гем биосинтеза, а не общее содержание гема. Чтобы продемонстрировать использование этого технIQUE уровни биосинтеза гема были измерены в нескольких клеточных линий млекопитающих.
Introduction
Гем, комплекс двухвалентного железа и протопорфирина IX является центральным молекула для транспортировки и использования кислорода практически во всех живых организмах 1-3. Уникальная структура гема позволяет ему функционировать в качестве носителя двухатомных газов и электронов, а также для выполнения других функций 1-5. Например, гем связывается с кислородом гемоглобина и миоглобина для передачи и хранения кислорода 6,7. Она также работает в качестве носителя электронов в цитохромов при дыхании и действует в качестве донора электронов для окислительно-восстановительных реакций, катализируемых ферментов цитохрома P450 8,9. Одним из наиболее важных особенностей является то, что гема, он может играть регуляторную роль в клеточных и молекулярных процессов, таких как транскрипции генов, синтез белка и РНК микро-биогенезе 4. Например, он влияет на транскрипцию многих генов, контролируя активность млекопитающих репрессор транскрипции Bach1 и млекопитающих ядерного RECeptor Rev-erbα 10-15. Гем регулирует активацию гема активатора протеина (НАР) 1, который играет важную роль в активации генов, участвующих в дыхании и контроля окислительного повреждения, в ответ на гема или кислорода 16. Гем также регулирует транскрипцию генов в нервных клетках через фактор роста нервов (ФРН) сигнализации 3,17-20. Он также регулирует синтез белка в эритроидных клетках млекопитающих путем модулирования активности гема регулируется eIF2α киназы (HRI) 21-24. Кроме того, гем влияет на активность ключевых сигнальных белков, таких как тирозин-киназы Jak2 и Src, которые имеют важное значение для нормального функционирования клеток и роста клеток 4,20,25. Было обнаружено, что в клетках HeLa клетки ингибирования гема вызывает остановку клеточного цикла и активацию маркеров, связанных со старением и апоптозом 26. И дефицит Гем или повышенные уровни гема связаны с тяжелыми последствиями для здоровья человека в 27. Последние молекулярнойй эпидемиологические исследования показали положительную ассоциацию высоким потреблением гема и повышенный риск заболеваний, таких как сахарный диабет 2-го типа, ишемической болезни сердца и некоторых форм рака, включая рак легких, колоректальный рак и рак поджелудочной железы 27,28. Используя согласованную пару лаборатории нормальными и раковыми клетками легких авторов показали, что раковые клетки имеют повышенный уровень потребления кислорода, синтеза гема и белков, участвующих в поглощения гема и кислорода утилизации 28. Интересно, что ингибирование синтеза гема уменьшилось потребление кислорода, пролиферацию, миграцию и образование колоний раковых клеток 28. Таким образом, колебание уровней эндогенного гема играет важную роль в регуляции молекулярных и клеточных процессов 3,4,28,29.
У млекопитающих, биосинтез гема происходит в восьми шагов, с участием ферментов, расположенных в митохондриях и цитозоле 4 (рисунок 1). Гем Биосинетезис начинается в матрице митохондрий с конденсацией глицина и сукцинил-КоА с образованием 5-аминолевулиновой кислоты (5-АЛК), катализируемой ALA-синтетазы (увы) 4,31. Это скорость шаг в гем биосинтеза в клетках nonerythroid ограничения. 5-АЛК затем экспортируется в цитозоль, где в ближайшие четыре шага произойти, чтобы сформировать coproporphyrinogen III (CPgenIII), который затем импортировать обратно в митохондрии, где он превращается в протопорфирина IX (PPIX). Наконец, одна молекула железа включена в протопорфирина IX (PPIX) для получения гем, реакции, катализируемой феррохелатазы (FECH) 2,4.
Уровень биосинтеза гема, зависит прежде всего от уровня ALAS фермента, который жестко контролируется внутриклеточного железа гема и 4. Биосинтез гема могут быть затронуты генетических дефектов, наличие определенных витаминов и минералов (например, рибофлавин, цинк), воздействие токсинов (например, алюминия, свинца), Аноксии, лихорадка, и уровни некоторых стероидов (например, эстроген) 32-35. Уровень синтеза гема изменяется в различных болезненных состояниях. Снижение гем биосинтеза может привести к анемии, а также неврологических заболеваний 3,36. Кроме того, увеличилась гема биосинтеза играет важную роль в прогрессировании некоторых видов рака 28,37. Гем было показано, является критическим для роста, дифференцировки и выживания жировой млекопитающих, эритроидных и нервных клеток 4,38-41. Например, дефицит гема приводит к повреждению нейритов в первичной мыши корковых нейронов через ингибирование глутамата NMDA (N-метил-D-аспартат) рецепторов 17. Кроме того, ингибирование синтеза гема вызывает запрограммированную гибель клеток в человеческой эпителиальной карциномы шейки HeLa клетки 26,41. Таким образом, измерение уровней гема биосинтеза в различных клетках при различных условиях является важным для изучения этиологии и progressiна многих заболеваний.
Здесь мы опишем быстрый и чувствительный метод для измерения уровня внутриклеточного синтеза гема с помощью [4- 14 C] 5-aminolevulic кислоты. Это альтернативный метод с другими методами с использованием 55 или 59 Fe Fe. Мы предпочитаем использовать 14 C, потому что его излучение очень слабое. В отличие от этого, сильная защита требуется для работы с Fe изотопов. Кроме того, этот метод предназначен для измерения и сравнения синтез гема в разных клетках параллельно в быстрой манере. Для того чтобы измерить абсолютные уровни гема, можно использовать ранее установленную способ, включающий использование ВЭЖХ 42,43.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
ВНИМАНИЕ: При работе с радиоактивностью, принять соответствующие меры предосторожности, чтобы избежать загрязнения экспериментатора и окрестностях. Утилизировать все отходы от следующей местными правилами радиационной безопасности.
1. Подготовка клеток
- Семенной клеток в 3,5 см пластинах таким образом, что конфлюентности достигает 80% -90% в день анализа.
- Следует отметить, что посев слияния для клеток зависит от типа клеток и скорости их роста. При лечении клеток с реагентом в течение определенного количества дней, семена клетки таким образом, что конфлюентности в 80% -90% в день измерения гема. Если количество клеток, полученных из пластин 3,5 см недостаточна, используют 6 см пластины с таким же количеством радиоактивного ALA, как в следующем шаге.
Примечание: Использование отдельных пластин рекомендуется, потому что это проще в обращении отдельных пластин.
- Следует отметить, что посев слияния для клеток зависит от типа клеток и скорости их роста. При лечении клеток с реагентом в течение определенного количества дней, семена клетки таким образом, что конфлюентности в 80% -90% в день измерения гема. Если количество клеток, полученных из пластин 3,5 см недостаточна, используют 6 см пластины с таким же количеством радиоактивного ALA, как в следующем шаге.
- Накануне измерения гема, добавить 0,1-0,3 мкКи [14 C] 5-ALA и холодной ALA, чтобы достичь окончательного грoncentration 20 мкМ общего ALA к каждой культуре блюдо в рабочей области, пригодный для работы с радиоактивными материалами и поставить пластины обратно в инкубатор. В идеале, инкубировать с радиоактивным ALA в течение 16 часов.
Примечание: с радиоактивной 5-АЛК необходимости может варьироваться от клеточных линий. Радиоактивный значение в минуту (CPM) по меньшей мере 100 требуется, чтобы свести к минимуму ошибку, связанную с подсчетом. Желательно, чтобы определить минимальное количество [14 C] 5-АЛК, необходимое для клеточных линий при исследовании. Для большинства экспериментов 0,1-0,3 мкКи достаточно, чтобы получить хорошее измерение. Добавление холодного ALA является обязательным.
2. Гем Добыча
- Поместите культуры клеток блюда на льду и принять их в район, пригодный для работы радиоактивности.
- Выполните всю добычу и процесс испарения в взрывозащищенном капотом. Потому что хранится эфир может взорваться, использовать эфир в бутылочках и испарится оставшиеся жидкостей, не храните эфир воткрытая бутылка для более чем одного месяца. Не используйте ацетон вблизи открытого огня и нагревательных как это является легковоспламеняющимся. Магазин ацетон, содержащий реагенты в стеклянных бутылках, как она растворяется культуры ткани пластмасс.
- Аспирируйте от среды с использованием пипетки. Вымойте клеток один раз 1 мл PBS 1x холодной. Аспирируйте от PBS.
- Добавить 1 мл холодного PBS 1x на пластины и сбора клеток в нижней части пластины с помощью резинового шпателя. Передача собранных клеток из каждой пластины с меченым предварительно охлажденные 2 мл пробирку. Собирают все клетки в 2 мл пробирки.
Примечание: Используйте свежий резиновый полицейский для каждой пластины для соскабливания клеток из каждой пластины. Для каждой пластины вам потребуется четыре 2 мл пробирки, 1,5 мл трубки и сцинтилляционный флакон. - Спин при 15000 х г в течение 1 мин при 4 ° С.
- Выньте PBS с помощью пипетки, дать краткий спина и удаления остатков PBS. Ресуспендируют клеток в 100 мкл 1х PBS. Вихрь ресуспендировать клетки и держать на льду.
- Возьмите 10 &# 956; л из стадии 5 и переносят в 1,5 мл микроцентрифужных трубки и хранить на льду для измерения концентрации белка.
Примечание: Сотовый буфера для лизиса должны быть добавлены к клеткам и выдерживали на льду для измерения концентрации белка позже. - Спин оставшиеся 90 мкл шаг 5 при 5000 х г в течение 30 сек при 4 ° С; удалить PBS полностью используя пипетки 200 мкл.
- Добавить 300 мкл буфера для экстракции гема (см список материалов) в каждую пробирку. Затем вихрь в течение 15 сек, чтобы смешать и поставить на льду в течение 1 мин, повторить это 3 раза.
- Добавить буфер для экстракции гема (Евр) и вихрь трубку быстро ресуспендируют осадок, сделать только один или два тюбика на время, потому что осадок должен быть быстро ресуспендировали без слева в СЭП слишком долго. После Древнеевр добавляется всех труб и осадок ресуспендировали затем следуйте 15 сек вихрь и 1 мин на цикл льда, как на стадии 8. Обратите внимание, что осадок не может полностью перейти в СЭП, если осадок остается в буфере ВЭП для дольшевремя и не ресуспендировали быстро.
- Добавить 1,2 мл диэтилового эфира в каждую пробирку и вихря в течение 30 сек. Спин при 15000 х г в течение 5 мин при 4 ° С.
Примечание: диэтиловый эфир заканчивается наконечники пипеток быстро. Для управления этим, пипетки диэтиловый эфир вверх и вниз один или два раза, это помогает держать диэтиловый эфир в пипетку. Повторите это каждый раз свежий пипетки используется. - Перевести верхний (эфир) фазы с 1 мл пипетки на новый микроцентрифужных трубки. Добавить 0,5 мл 2 N HCl, вихря, чтобы смешивать и спина, как в шаге 9.
Примечание: Это трудно увидеть разделение между эфиром и HCl фаз. Поэтому, добавьте небольшое количество трипанового синего в 2 раствора HCl, чтобы использовать во время эксперимента, достаточно, чтобы дать ему бледно-голубой цвет. Это поможет различать две фазы. Нижняя фаза будет синим, а фаза верхнего эфир будет бесцветным. Передача верхний бесцветный эфирную фазу в новую пробирку и отбросить нижнюю HCl (синий) фазу. - Повторите шаг 10 дванесколько раз, чтобы промыть эфирную фазу с помощью 2N HCl. Передача только верхний эфирную фазу в новую пробирку при каждом повторении и выбросить нижнюю фазу HCl.
- После третьей промывки HCl, передавать верхнюю фазу с 1 мл пипетки в сцинтилляционный флакон. Высушите образцы путем испарения диэтилового эфира, сохраняя образцов в химической капот O / N.
3. Измерение радиоактивности
- На следующий день, добавить 5 мл сцинтилляционной жидкости для высушенных образцов, начиная с шага 2.12.
- Хорошо встряхните, чтобы перемешать. Измерение радиоактивности с помощью сцинтилляционного счетчика.
4. Расчеты
- Лизировать клетки, полученные на стадии 2.6, используя равные количества CelLytic М буфера (см Материалы список) и спина при 14000 мкг в течение 5 мин при 4 ° С.
- Возьмем аликвоту супернатанта и измерить концентрацию белка использованием BCA комплект для анализа белка.
Общее количество белка в мг (TP) = (90 мкл * конц. Белка в81 г / мкл) / 1000
Уровень синтеза Гем (радиоактивность / TP) = пмоль / мг белка.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
Этот метод был использован для сравнения уровней синтеза гема в нормальном (HBEC30KT) против раковых (HCC4017) легочных клеток. Рисунок 2 показывает более высокий уровень синтеза гема в раковых клетках (HCC4017), чем нормальные клетки легких (HBEC30KT). Уровень синтеза гема также измеряли в нормальных и раковых клеток в присутствии митохондрий разобщитель карбонилцианид 3-хлорфенилгидразона (СССР). Клетки обрабатывали 10 мкМ CCCP в течение 24 часов перед измерением уровней синтеза гема. Как и ожидалось, уровни синтеза гема (Рисунок 2) уменьшается в присутствии CCCP в нормальных, так и раковых клеток. Было показано, что ранее синтеза гема может быть ингибирован сукцинил ацетона (SA), мощный и специфический ингибитор дегидратазе 5-аминолевулиновой кислоты (ALAD), который является вторым ферментом биосинтеза гема 41. С помощью этого метода, уровни синтеза гема были измерены в HeLa клетками в присутствии и абсENCE 0,5 мм SA. Рисунок 3 показывает, что уровни синтеза гема сократились более чем на 10-складок в присутствии SA. Для дальнейшей демонстрации использования этой техники, уровни синтеза гема были измерены и сравнены в 4 рака и в клеточных линиях HEK293T, как показано на рисунке 4.
Рисунок 1. гем биосинтеза в организме человека, увы, 5-аминолевулиновой кислоты синтазы. 5-АЛК, 5-аминолевулиновой кислоты; ДАЛК АЛК дегидратазы; PBG, порфобилиногена; HMBS, гидроксиметилбилан синтазы; HMB, гидроксиметилбилан; UROS, uroporphyrinogen III синтазы; UPgenIII, uroporphyrinogen III; УБОД, uroporphyrinogen декарбоксилазы; CPgenIII, coproporphyrinogen III; CPOX, coproporphyrinogen III оксидазы; PPgenIX, протопорфириноген IX; PPOX, протопорфириноген IX оксидазы; PPIX, протопорфирин IX; FECH, Феррохелатазы. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 2. Уровни гема биосинтеза в обычном (HBEC30KT) и рак (HCC4017) клеточные линии, в отсутствие и в присутствии 10 мкМ митохондриальной разобщающий CCCP. Фоновый уровень был похож на уровне пустой образца (сцинтилляционный жидкости в одиночку), и это было меньше, чем 2% от контроля. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 3. Уровни гема биосинтеза в клетках HeLa в абсENCE и присутствии 0,5 мМ ингибитора синтеза гема сукцинил ацетона (SA). Клетки обрабатывали SA в течение 3 дней перед измерением гема. Фоновый уровень был похож на уровне пустой образца (сцинтилляционный жидкости в одиночку), и это было меньше, чем 2% от контроля. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 4. Сравнение уровней биосинтеза гема в 4 рака и HEK293T клеточных линий. Анализ проводили в соответствии с протоколом. HCC4017 выращивали в ACL4 медиа, А549 и H1395 в RPMI1640 с добавлением 5% FBS, HEK293T и HeLa в DMEM с добавлением 10% FBS. Для статистического анализа, уровни синтеза гема в раковых клетках и клетках HEK293T были по сравнению с уровнем синтеза гема в HCC4017 клетки, используя Welch 2-образец Т-тест. ** Значение р <0,005. Фоновый уровень был похож на уровне пустой образца (сцинтилляционный жидкости в одиночку), и это было меньше, чем 2% от контроля. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
Гем играет ключевую роль в генерации клеточной энергии через дыхание 26. Altered метаболизма гема, как известно, связаны с различными заболеваниями, включая рак 28,41. Ингибирование синтеза гема, как известно, вызывают остановку клеточного цикла и апоптоз клеток HeLa в 26,41. Было показано, что уровень синтеза гема высокой связан с прогрессированием клеток рака легких 28. Таким образом, было бы большое значение для измерения уровней гема биосинтеза в клетках при различных условиях. Способ обсуждаться здесь не количественно общее количество гема, следовательно, она не обеспечивает абсолютную величину гема в клетках. Существуют различные колориметрических методов и комплектов, доступных для измерения общей суммы гема в клетках. Например, гем могут быть извлечены из клеток и митохондрий в смеси ацетона и НСl и смешивают с 50% (об / об) ацетонитрила. Затем смесь может быть примененв 3,9 х 300 мм колонку С18 Bondclone последующим элюированием гема в градиенте ацетонитрила, содержащего 0,05% (об / об) трифторуксусной кислоты и идентификации соединений гема при 400 нм 44,45.
Раньше, чтобы измерить уровни гем биосинтеза в тканях млекопитающих и клеточных экстрактов [14 С] глицина и [14 С] 5- АЛК были использованы 46,47. Хотя помечены глицин входит в путь биосинтеза гема на первом этапе, но сливают другими метаболическими путями, в результате его включения в ограниченном гема. Глицин не конкретных метаболит для биосинтеза гема 48. С другой стороны, помечены 5-АЛК является специфическим для биосинтеза гема. Эта функция дает количественную преимущество, используя 5-ALA через глицина 46,48,49. Таким образом, использование радиоактивного 5-АЛК является более конкретным и точным методом для измерения и сравнения уровней гема биосинтеза.
Самые Critical шаги, чтобы получить достоверные результаты, являются: 1) убедитесь, что ячейки конфлюентности не пойти выше, чем 100% и не ниже 70% всей различных условиях; 2) количество радиоактивности добавляют на пластины должны быть одинаковыми, так как этот способ очень чувствителен; 3) экстракционный буфер гем не должно быть старым, это рекомендуется делать каждый раз свежий. Объем радиоактивности, необходимого на пластине очень мала, и трудно поддерживать одинаковое количество поперек образцов. Поэтому, рекомендуется, чтобы рабочий маточного раствора в культуральной среде, при использовании же среду для всех образцов, то PBS (забуференный фосфатом физиологический раствор) может быть использован. Работа маточный раствор можно приготовить таким образом, что объем обойтись в пластина до 10 мкл. Кроме того, чтобы быть более точным, среда из одинаковых образцов для одного состояния может быть вынут в 50 мл пробирку и соответствующие количества радиоактивности могут быть добавлены из рабочего раствора, а затем снова выдавать еQual количество средних и пластин. Если количество клеток ограничено, например, в первичных культурах, 12-а и 24-луночные планшеты могут быть использованы для культуры клеток и уменьшить количество радиоактивности на лунку пропорционально.
Этот протокол является простым, простым и обеспечивает точные меры уровней синтеза гема. Иногда это может быть трудно ресуспендируют осадок клеток в буфере для экстракции гема (шаг 2,8), полностью. Чтобы избежать этого быть быстрым на этапе 2.8, добавить гем буфер для экстракции до 1-2 образцов на времени, вихря и положить их на льду. Убедитесь, что экстракционный буфер гем не слишком старый. Если стандартное отклонение среди образцов повторных слишком высокая, обратите внимание на следующие шаги: 1) PBS, был полностью удалены на стадии 2.7; 2) избежать разлива образец, когда в диэтиловый эфир фазе, выполните кончик в шаге 2.9; 3) убедитесь, что радиоактивность добавил в тарелку и конфлюентности из повторных проб были одинаковыми.
28 в нормальном незлокачественной (HBEC) против рака (HCC) клеток, разработанные из того же пациента. Техника, описанная здесь требуется использование [14 C] 5-АЛК, предшественника гема в пути биосинтеза (рис 1), и измеряет радиоактивность, включенную в гем. В этой технике, порфирины, в том числе гема, были извлечены из клеток, в смеси ацетона, концентрированной НСl и водой 50,51. Гем был дополнительно отделен от порфиринов путем извлечения в диэтиловом эфире и промывки эфирную фазу с помощью 2N HCl 50,51. Затем радиоактивность, включенную в гем определяли с помощью сцинтилляционного счетчика. Результаты могут быть нормализованы на общее количество белка или количества клеток. Синтез Гем в HeLa клеток ингибируется с помощью сукцинил ацетона (SA) и снижение уровня синтеза гема наблюдалось предварительно, как показаноviously 26 (Рисунок 3).
Этот метод является очень полезным для сравнения уровней синтеза гема в разных условиях или между клеточными линиями (рис 4). Это требует небольшого количества клеток и обеспечивает определенную измерение и сравнение уровней синтеза гема в разных клетках. Она не предназначена для точного измерения абсолютных уровней гема в клетках. Лучше всего использовать для сравнения уровней синтеза гема в клетках с различными свойствами, такими как различные раковые клетки. Из кобальта, а не из железа, могут быть включены в гем на последней стадии синтеза гема и извлечь 51, этот метод не может дать точное сравнение синтеза гема, если средства роста содержат различные уровни кобальта или других ионов металлов. Тем не менее, гем путь синтеза из 5-аминолевулиновой кислоты, чтобы порфиринов и гема очень специфична, измерения потока уровни всей рathway, вероятно, будет более отражающей метаболических мероприятий, связанных с гема, независимо от ионов металлов. В противоположность этому, метод с использованием 59 Fe обнаруживает только часть пути, включающего Fe, чтобы сформировать гем 52. Хотя это более конкретно, в присутствии значительных количеств ионов металлов, обнаруженные уровни синтеза гема, возможно, не отражают метаболический потенциал определенных клеток, таких как раковые клетки. Кроме того, Fe может быть наложен арест в других клеточных митохондрий местах рядом, чтобы гем. По большому счету, мы считаем, что использование [4- 14 C] 5-АЛК является более практичным способом для измерения уровня гема при сравнении различных клеток с изменяющимися свойствами.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
Мы не имеем ничего раскрывать.
Acknowledgments
Клеточные линии HCC4017 и HBEC30KT были любезно предоставлены лаборатории доктора Джона Минны. Эта работа была поддержана за счет средств Сесил Х. и Ида Зеленые доктору Ли Чжан.
Materials
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Acetone | Sigma | 650501 | |
Diethy ether | Sigma | 296082 | |
HCl (Hydrochloric acid) | Fisher | A481-212 | |
Liquid Scintillation cocktail | MP Biomedicals | 882470 | |
Trypan blue | Gibco | 15250 | |
Radiolabeled 4-14C aminolevulinic acid | Perkin-Elmer life sciences | Store at -80 °C | |
CelLytic M | Sigma | C2978 | Mammalian cell lysis reagent |
Pierce BCA Protein Assay Kit | Thermo Scientific | 23227 | |
Specific reagent | Component | Dispense | |
Heme extraction buffer: Acetone:HCl:Water (25:1.3:5) |
Acetone Concentrated HCl Water |
25 ml 1.3 ml 5 ml |
References
- Furuyama, K., Kaneko, K., Vargas, P. D. Heme as a magnificent molecule with multiple missions: heme determines its own fate and governs cellular homeostasis. Tohoku J Exp Med. 213, 1-16 (2007).
- Hamza, I., Dailey, H. A. One ring to rule them all: trafficking of heme and heme synthesis intermediates in the metazoans. Biochim Biophys Acta. 1823, 1617-1632 (2012).
- Zhu, Y., Hon, T., Ye, W., Zhang, L. Heme deficiency interferes with the Ras-mitogen-activated protein kinase signaling pathway and expression of a subset of neuronal genes. Cell Growth Differ. 13, 431-439 (2002).
- Zhang, L. HEME BIOLOGY: The Secret Life of Heme in Regulating Diverse Biological Processes. Singapore: World Scientific Publishing Company. , (2011).
- Mense, S. M., Zhang, L. Heme: a versatile signaling molecule controlling the activities of diverse regulators ranging from transcription factors to MAP kinases. Cell Res. 16, 681-692 (2006).
- Ingram, D. J., Kendrew, J. C. Orientation of the haem group in myoglobin and its relation to the polypeptide chain direction. Nature. 178, 905-906 (1956).
- Perutz, M. F. X-ray analysis of hemoglobin. Science. 140, 863-869 (1963).
- Chance, B. The nature of electron transfer and energy coupling reactions. FEBS Lett. 23, 3-20 (1972).
- Guengerich, F. P., MacDonald, T. L. Mechanisms of cytochrome P-450 catalysis. Faseb J. 4, 2453-2459 (1990).
- Igarashi, K., et al. Multivalent DNA binding complex generated by small Maf and Bach1 as a possible biochemical basis for beta-globin locus control region complex. J Biol Chem. 273, 11783-11790 (1998).
- Ogawa, K., et al. Heme mediates derepression of Maf recognition element through direct binding to transcription repressor Bach1. Embo J. 20, 2835-2843 (2001).
- Oyake, T., et al. Bach proteins belong to a novel family of BTB-basic leucine zipper transcription factors that interact with MafK and regulate transcription through the NF-E2 site. Mol Cell Biol. 16, 6083-6095 (1996).
- Snyder, S. H., Jaffrey, S. R., Zakhary, R. Nitric oxide and carbon monoxide: parallel roles as neural messengers. Brain Res Brain Res Rev. 26, 167-175 (1998).
- Sun, J., et al. Hemoprotein Bach1 regulates enhancer availability of heme oxygenase-1 gene. Embo J. 21, 5216-5224 (2002).
- Zhang, L., Guarente, L. Heme binds to a short sequence that serves a regulatory function in diverse proteins. Embo J. 14, 313-320 (1995).
- Hon, T., Lee, H. C., Hu, Z., Iyer, V. R., Zhang, L. The heme activator protein Hap1 represses transcription by a heme-independent mechanism in Saccharomyces cerevisiae. Genetics. 169, 1343-1352 (2005).
- Chernova, T., et al. Neurite degeneration induced by heme deficiency mediated via inhibition of NMDA receptor-dependent extracellular signal-regulated kinase 1/2 activation. J Neurosci. 27, 8475-8485 (2007).
- Chernova, T., et al. Early failure of N-methyl-D-aspartate receptors and deficient spine formation induced by reduction of regulatory heme in neurons. Mol Pharmacol. 79, 844-854 (2011).
- Sengupta, A., Hon, T., Zhang, L. Heme deficiency suppresses the expression of key neuronal genes and causes neuronal cell death. Brain Res Mol Brain Res. 137, 23-30 (2005).
- Smith, A. G., Raven, E. L., Chernova, T. The regulatory role of heme in neurons. Metallomics. 3, 955-962 (2011).
- Raghuram, S., et al. Identification of heme as the ligand for the orphan nuclear receptors REV-ERBalpha and REV-ERBbeta. Nat Struct Mol Biol. 14, 1207-1213 (2007).
- Wu, N., Yin, L., Hanniman, E. A., Joshi, S., Lazar, M. A. Negative feedback maintenance of heme homeostasis by its receptor Rev-erbalpha. Genes Dev. 23, 2201-2209 (2009).
- Yin, L., et al. Rev-erbalpha, a heme sensor that coordinates metabolic and circadian pathways. Science. 318, 1786-1789 (2007).
- Zhu, Y., Hon, T., Zhang, L. Heme initiates changes in the expression of a wide array of genes during the early erythroid differentiation stage. Biochemical and biophysical research communications. 258, 87-93 (1999).
- Yao, X., Balamurugan, P., Arvey, A., Leslie, C., Zhang, L. Heme controls the regulation of protein tyrosine kinases Jak2 and Src. Biochemical and biophysical research communications. 402, 30-35 (2010).
- Ye, W., Zhang, L. Heme controls the expression of cell cycle regulators and cell growth in HeLa cells. Biochem and biophys res comm. 315, 546-554 (2004).
- Hooda, J., Shah, A., Zhang, L. Heme, an essential nutrient from dietary proteins, critically impacts diverse physiological and pathological processes. Nutrients. 6, 1080-1102 (2014).
- Hooda, J., et al. Enhanced heme function and mitochondrial respiration promote the progression of lung cancer cells. PloS one. 8, e63402 (2013).
- Atamna, H., Walter, P. B., Ames, B. N. The role of heme and iron-sulfur clusters in mitochondrial biogenesis, maintenance, and decay with age. Arch Biochem Biophys. 397, 345-353 (2002).
- Atamna, H., Killilea, D. W., Killilea, A. N., Ames, B. N. Heme deficiency may be a factor in the mitochondrial and neuronal decay of aging. Proc Natl Acad Sci U S A. 99, 14807-14812 (2002).
- Ponka, P. Cell biology of heme. Am J Med Sci. 318, 241-256 (1999).
- Brawer, J. R., Naftolin, F., Martin, J., Sonnenschein, C. Effects of a single injection of estradiol valerate on the hypothalamic arcuate nucleus and on reproductive function in the female rat. Endocrinol. 103, 501-512 (1978).
- Daniell, W. E., et al. Environmental chemical exposures and disturbances of heme synthesis. Environ Health Perspect. 105, Suppl 1. 37-53 (1997).
- Kihara, T., et al. Hepatic heme metabolism in rats with fever induced by interleukin 1beta. Res Commun Mol Pathol Pharmacol. 104, 115-126 (1999).
- Vijayasarathy, C., Damle, S., Prabu, S. K., Otto, C. M., Avadhani, N. G. Adaptive changes in the expression of nuclear and mitochondrial encoded subunits of cytochrome c oxidase and the catalytic activity during hypoxia. Eur J Biochem. 270, 871-879 (2003).
- Anderson, K. E. S. S., Bishop, D. F., Desnick, R. J. Disorders of heme biosynthesis: X-linked sideroblastic anemia and the porphyrias. The Metabolic and Molecular Bases of Inherited Disease. , The McGraw-Hill Companies, Inc. New York. 1-53 (2009).
- Salvo, M. L., Contestabile, R., Paiardini, A., Maras, B. Glycine consumption and mitochondrial serine hydroxymethyltransferase in cancer cells: the heme connection. Med Hypotheses. 80, 633-636 (2013).
- Ishii, D. N., Maniatis, G. M. Haemin promotes rapid neurite outgrowth in cultured mouse neuroblastoma cells. Nature. 274, 372-374 (1978).
- Padmanaban, G., Venkateswar, V., Rangarajan, P. N. Haem as a multifunctional regulator. Trends Biochem Sci. 14, 492-496 (1989).
- Rutherford, T. R., Clegg, J. B., Weatherall, D. J. K562 human leukaemic cells synthesise embryonic haemoglobin in response to haemin. Nature. 280, 164-165 (1979).
- Ye, W., Zhang, L. Heme deficiency causes apoptosis but does not increase ROS generation in HeLa cells. Biochemical and biophysical research communications. 319, 1065-1071 (2004).
- Bonkovsky, H. L., et al. High-performance liquid chromatographic separation and quantitation of tetrapyrroles from biological materials. Anal Biochem. 155, 56-64 (1986).
- Sinclair, P. R., Gorman, N., Jacobs, J. M. Measurement of heme concentration. Curr Protoc Toxicol. 8, Unit 8.3 (2001).
- Barros, M. H., Carlson, C. G., Glerum, D. M., Tzagoloff, A. Involvement of mitochondrial ferredoxin and Cox15p in hydroxylation of heme O. FEBS Lett. 492, 133-138 (2001).
- Shinjyo, N., Kita, K. Up-regulation of heme biosynthesis during differentiation of Neuro2a cells. J Biochem. 139, 373-381 (2006).
- Israels, L. G., Yoda, B., Schacter, B. A. Heme binding and its possible significance in heme movement and availability in the cell. Ann N Y Acad Sci. 244, 651-661 (1975).
- Yannoni, C. Z., Robinson, S. H. Early-labelled haem in erythroid and hepatic cells. Nature. 258, 330-331 (1975).
- Robinson, S. H. Formation of bilirubin from erythroid and nonerythroid sources. Semin Hematol. 9, 43-53 (1972).
- Granick, S., Granick, D. Nucleolar necklaces in chick embryo myoblasts formed by lack of arginine. J Cell Biol. 51, 636-642 (1971).
- Morell, D. B., Barrett, J., Clezy, P. S. The prosthetic group of cytochrome oxidase. 1. Purification as porphyrin alpha and conversion into haemin alpha. Biochem J. 78, 793-797 (1961).
- Sinclair, P., Gibbs, A. H., Sinclair, J. F., de Matteis, F. Formation of cobalt protoporphyrin in the liver of rats. A mechanism for the inhibition of liver haem biosynthesis by inorganic cobalt. Biochem J. 178, 529-538 (1979).
- Chung, J., Haile, D. J., Wessling-Resnick, M. Copper-induced ferroportin-1 expression in J774 macrophages is associated with increased iron efflux. Proc Natl Acad Sci U S A. 101, 2700-2705 (2004).